MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	TAAA	2	8	130	137	75 %	25 %	0 %	0 %	148244140
2	NC_009477	GAA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
3	NC_009477	GCA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
4	NC_009477	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	148244140
5	NC_009477	AGA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
6	NC_009477	GCA	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
7	NC_009477	TGT	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
8	NC_009477	AGA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
9	NC_009477	AGC	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
10	NC_009477	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
11	NC_009477	AACA	2	8	408	415	75 %	0 %	0 %	25 %	148244140
12	NC_009477	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244140
13	NC_009477	TGG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244140
14	NC_009477	TTG	2	6	628	633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
15	NC_009477	AGA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
16	NC_009477	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
17	NC_009477	TGA	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244140
18	NC_009477	AGC	2	6	695	700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
19	NC_009477	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244140
20	NC_009477	AATT	2	8	759	766	50 %	50 %	0 %	0 %	148244141
21	NC_009477	GAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244141
22	NC_009477	TCAA	2	8	909	916	50 %	25 %	0 %	25 %	148244141
23	NC_009477	AGCA	2	8	924	931	50 %	0 %	25 %	25 %	148244141
24	NC_009477	CAA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
25	NC_009477	GAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244141
26	NC_009477	TTAT	2	8	977	984	25 %	75 %	0 %	0 %	148244141
27	NC_009477	TTA	2	6	1022	1027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244141
28	NC_009477	AAC	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
29	NC_009477	AGT	2	6	1111	1116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244141
30	NC_009477	CAG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244141
31	NC_009477	GTTT	2	8	1173	1180	0 %	75 %	25 %	0 %	148244141
32	NC_009477	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244141
33	NC_009477	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
34	NC_009477	AAT	2	6	1262	1267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244141
35	NC_009477	TAT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244142
36	NC_009477	GGA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244142
37	NC_009477	A	7	7	1501	1507	100 %	0 %	0 %	0 %	148244142
38	NC_009477	TCAA	2	8	1519	1526	50 %	25 %	0 %	25 %	148244142
39	NC_009477	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244142
40	NC_009477	AGA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244142
41	NC_009477	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244142
42	NC_009477	GGT	2	6	1649	1654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244142
43	NC_009477	ATA	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244142
44	NC_009477	T	7	7	1938	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
45	NC_009477	T	6	6	1982	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
46	NC_009477	GAT	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
47	NC_009477	ATT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244143
48	NC_009477	TAA	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244143
49	NC_009477	TAA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244143
50	NC_009477	TGAT	2	8	2209	2216	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
51	NC_009477	T	6	6	2224	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
52	NC_009477	ATGT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
53	NC_009477	CG	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	148244143
54	NC_009477	AT	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
55	NC_009477	TCA	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244143
56	NC_009477	T	6	6	2341	2346	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
57	NC_009477	T	6	6	2350	2355	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
58	NC_009477	ATG	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
59	NC_009477	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
60	NC_009477	TAG	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
61	NC_009477	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
62	NC_009477	CTA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
63	NC_009477	AT	3	6	3163	3168	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
64	NC_009477	GTG	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244144
65	NC_009477	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
66	NC_009477	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244144
67	NC_009477	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
68	NC_009477	A	6	6	3273	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
69	NC_009477	TAT	2	6	3282	3287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244144
70	NC_009477	TGA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244144
71	NC_009477	AT	3	6	3308	3313	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
72	NC_009477	GTG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244144
73	NC_009477	CG	3	6	3345	3350	0 %	0 %	50 %	50 %	148244144
74	NC_009477	ACAT	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	148244144
75	NC_009477	TTAAAC	2	12	3520	3531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244144
76	NC_009477	AAGA	2	8	3599	3606	75 %	0 %	25 %	0 %	148244144
77	NC_009477	TA	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
78	NC_009477	CAT	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
79	NC_009477	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	148244145
80	NC_009477	TAA	3	9	3998	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
81	NC_009477	TAA	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
82	NC_009477	ACA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244145
83	NC_009477	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244145
84	NC_009477	ACA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244145
85	NC_009477	CATT	2	8	4236	4243	25 %	50 %	0 %	25 %	148244145
86	NC_009477	A	6	6	4245	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
87	NC_009477	TA	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
88	NC_009477	ATTAT	2	10	4343	4352	40 %	60 %	0 %	0 %	148244145
89	NC_009477	TAC	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244145
90	NC_009477	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
91	NC_009477	TA	3	6	4411	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
92	NC_009477	TAA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
93	NC_009477	AAAAG	2	10	4442	4451	80 %	0 %	20 %	0 %	148244145
94	NC_009477	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
95	NC_009477	A	6	6	4578	4583	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
96	NC_009477	ATA	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
97	NC_009477	TTG	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244146
98	NC_009477	AAT	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
99	NC_009477	TAA	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
100	NC_009477	AGA	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244146
101	NC_009477	ATG	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244146
102	NC_009477	ACAAT	2	10	4816	4825	60 %	20 %	0 %	20 %	148244146
103	NC_009477	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
104	NC_009477	AAT	2	6	4871	4876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
105	NC_009477	TAA	2	6	4917	4922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
106	NC_009477	CTTT	2	8	4944	4951	0 %	75 %	0 %	25 %	148244146
107	NC_009477	T	6	6	4949	4954	0 %	100 %	0 %	0 %	148244146
108	NC_009477	TAA	2	6	5008	5013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
109	NC_009477	ACA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244146
110	NC_009477	ATTCA	2	10	5139	5148	40 %	40 %	0 %	20 %	148244146
111	NC_009477	ATAGAT	2	12	5171	5182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244146
112	NC_009477	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
113	NC_009477	AT	3	6	5210	5215	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
114	NC_009477	A	7	7	5277	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
115	NC_009477	TGA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244146
116	NC_009477	AATA	2	8	5419	5426	75 %	25 %	0 %	0 %	148244146
117	NC_009477	ATA	2	6	5442	5447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
118	NC_009477	AGTAAA	2	12	5501	5512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148244146
119	NC_009477	AAAG	2	8	5578	5585	75 %	0 %	25 %	0 %	148244146
120	NC_009477	AT	4	8	5593	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
121	NC_009477	A	7	7	5641	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
122	NC_009477	AAC	2	6	5693	5698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244146
123	NC_009477	AT	4	8	5720	5727	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
124	NC_009477	CAA	2	6	5743	5748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244146
125	NC_009477	TAG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244146
126	NC_009477	T	6	6	5871	5876	0 %	100 %	0 %	0 %	148244147
127	NC_009477	TAC	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244147
128	NC_009477	AT	5	10	5992	6001	50 %	50 %	0 %	0 %	148244147
129	NC_009477	AT	3	6	6030	6035	50 %	50 %	0 %	0 %	148244147
130	NC_009477	TAC	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244147
131	NC_009477	TCA	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244147
132	NC_009477	ATTT	2	8	6103	6110	25 %	75 %	0 %	0 %	148244147
133	NC_009477	TCT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244147
134	NC_009477	TGT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244147
135	NC_009477	TAT	2	6	6280	6285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244147
136	NC_009477	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244148
137	NC_009477	AACTA	2	10	6507	6516	60 %	20 %	0 %	20 %	148244148
138	NC_009477	TAA	2	6	6632	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244148
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