MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 608

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009477	TA	3	6	26157	26162	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
502	NC_009477	TTC	2	6	26190	26195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244166
503	NC_009477	ACT	2	6	26260	26265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244166
504	NC_009477	TAT	2	6	26309	26314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
505	NC_009477	ATTT	2	8	26324	26331	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
506	NC_009477	AT	3	6	26338	26343	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
507	NC_009477	TATT	2	8	26369	26376	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
508	NC_009477	ATT	3	9	26403	26411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
509	NC_009477	TAT	2	6	26426	26431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
510	NC_009477	T	8	8	26434	26441	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
511	NC_009477	T	6	6	26466	26471	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
512	NC_009477	TCT	2	6	26517	26522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244166
513	NC_009477	ATT	2	6	26523	26528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
514	NC_009477	TGT	2	6	26559	26564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244166
515	NC_009477	TTC	2	6	26586	26591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244166
516	NC_009477	TAA	2	6	26618	26623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244166
517	NC_009477	AT	3	6	26632	26637	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
518	NC_009477	T	8	8	26705	26712	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
519	NC_009477	AGTA	2	8	26763	26770	50 %	25 %	25 %	0 %	148244166
520	NC_009477	AT	3	6	26879	26884	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
521	NC_009477	TTG	2	6	26887	26892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244166
522	NC_009477	TCT	3	9	26986	26994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244166
523	NC_009477	TTTA	2	8	27015	27022	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
524	NC_009477	CAG	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244166
525	NC_009477	ATT	2	6	27064	27069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
526	NC_009477	A	6	6	27132	27137	100 %	0 %	0 %	0 %	148244166
527	NC_009477	AAT	2	6	27160	27165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244166
528	NC_009477	T	6	6	27186	27191	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
529	NC_009477	TTG	2	6	27249	27254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244166
530	NC_009477	TAA	2	6	27309	27314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244166
531	NC_009477	TACTT	2	10	27324	27333	20 %	60 %	0 %	20 %	148244166
532	NC_009477	TTC	2	6	27339	27344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244166
533	NC_009477	TTA	2	6	27470	27475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244166
534	NC_009477	ATG	2	6	27476	27481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244166
535	NC_009477	TG	4	8	27577	27584	0 %	50 %	50 %	0 %	148244167
536	NC_009477	AC	3	6	27587	27592	50 %	0 %	0 %	50 %	148244167
537	NC_009477	TAG	2	6	27688	27693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244167
538	NC_009477	ACG	2	6	27748	27753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244167
539	NC_009477	TAA	3	9	27804	27812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244167
540	NC_009477	ATT	2	6	27828	27833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244167
541	NC_009477	T	6	6	27851	27856	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
542	NC_009477	TCGC	2	8	27937	27944	0 %	25 %	25 %	50 %	148244167
543	NC_009477	AT	3	6	27991	27996	50 %	50 %	0 %	0 %	148244167
544	NC_009477	T	6	6	28010	28015	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
545	NC_009477	TTC	2	6	28023	28028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244167
546	NC_009477	TTA	2	6	28030	28035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244167
547	NC_009477	TTC	2	6	28086	28091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244167
548	NC_009477	ATGAA	2	10	28100	28109	60 %	20 %	20 %	0 %	148244167
549	NC_009477	CAG	2	6	28199	28204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244167
550	NC_009477	T	6	6	28214	28219	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
551	NC_009477	CTA	2	6	28220	28225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244167
552	NC_009477	ATT	2	6	28233	28238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244167
553	NC_009477	TAA	2	6	28347	28352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244167
554	NC_009477	TCA	2	6	28358	28363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244167
555	NC_009477	ATGT	2	8	28453	28460	25 %	50 %	25 %	0 %	148244167
556	NC_009477	TAT	2	6	28520	28525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244167
557	NC_009477	CTT	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244167
558	NC_009477	CAC	2	6	28580	28585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244167
559	NC_009477	CGA	2	6	28639	28644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244167
560	NC_009477	ACC	2	6	28668	28673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244167
561	NC_009477	ATC	4	12	28686	28697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244167
562	NC_009477	AGT	2	6	28708	28713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244167
563	NC_009477	ATC	2	6	28750	28755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244167
564	NC_009477	AT	3	6	28815	28820	50 %	50 %	0 %	0 %	148244167
565	NC_009477	ATT	2	6	28860	28865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244167
566	NC_009477	CTA	2	6	28870	28875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244167
567	NC_009477	ACCTAA	2	12	28935	28946	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148244167
568	NC_009477	T	6	6	29020	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	148244168
569	NC_009477	TTGA	2	8	29092	29099	25 %	50 %	25 %	0 %	148244168
570	NC_009477	AAG	2	6	29147	29152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244168
571	NC_009477	TTC	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
572	NC_009477	AAC	2	6	29197	29202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244168
573	NC_009477	CCA	2	6	29216	29221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244168
574	NC_009477	TAA	2	6	29233	29238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244168
575	NC_009477	TCA	2	6	29267	29272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244168
576	NC_009477	TCT	2	6	29318	29323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
577	NC_009477	GAT	2	6	29346	29351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244168
578	NC_009477	AAC	2	6	29359	29364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244168
579	NC_009477	ACG	2	6	29380	29385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244168
580	NC_009477	CTT	2	6	29388	29393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
581	NC_009477	AATG	2	8	29408	29415	50 %	25 %	25 %	0 %	148244168
582	NC_009477	AGT	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244168
583	NC_009477	AAT	2	6	29483	29488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244168
584	NC_009477	CCA	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244168
585	NC_009477	TA	3	6	29562	29567	50 %	50 %	0 %	0 %	148244168
586	NC_009477	TTG	2	6	29580	29585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244168
587	NC_009477	TCT	2	6	29606	29611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
588	NC_009477	AGA	2	6	29620	29625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244168
589	NC_009477	TGC	2	6	29644	29649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244168
590	NC_009477	ATC	3	9	29654	29662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244168
591	NC_009477	TAA	2	6	29695	29700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244168
592	NC_009477	CAG	2	6	29706	29711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244168
593	NC_009477	CAT	2	6	29736	29741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244168
594	NC_009477	TGT	2	6	29809	29814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244168
595	NC_009477	T	6	6	29827	29832	0 %	100 %	0 %	0 %	148244168
596	NC_009477	CTT	3	9	29835	29843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
597	NC_009477	CTG	2	6	29889	29894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244168
598	NC_009477	CTA	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244168
599	NC_009477	TGA	2	6	29980	29985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244168
600	NC_009477	ATT	2	6	30022	30027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244168
601	NC_009477	AGC	2	6	30058	30063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244168
602	NC_009477	CCA	2	6	30083	30088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244168
603	NC_009477	AAC	2	6	30097	30102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244168
604	NC_009477	CTT	2	6	30159	30164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244168
605	NC_009477	ACCCA	2	10	30188	30197	40 %	0 %	0 %	60 %	148244168
606	NC_009477	TCC	2	6	30220	30225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244168
607	NC_009477	TGT	2	6	30263	30268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244168
608	NC_009477	A	6	6	30286	30291	100 %	0 %	0 %	0 %	148244168

< Previous 12Next >