MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009443	TGCCTA	2	12	9000	9011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146319860
2	NC_009443	TAAAGC	2	12	14175	14186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319867
3	NC_009443	CTTGGC	2	12	28851	28862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319875
4	NC_009443	TGGAAG	2	12	32000	32011	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146319879
5	NC_009443	GTGGAT	2	12	32347	32358	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146319879
6	NC_009443	GATGCG	2	12	39003	39014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146319883
7	NC_009443	CCTAGA	2	12	42060	42071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319886
8	NC_009443	AATATG	2	12	47096	47107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146319891
9	NC_009443	GCGGAC	2	12	53708	53719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146319898
10	NC_009443	CAAAAC	2	12	54008	54019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319899
11	NC_009443	ACGAAT	2	12	59091	59102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319904
12	NC_009443	ATGGCA	2	12	61145	61156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319907
13	NC_009443	CAGGGA	2	12	63143	63154	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146319909
14	NC_009443	TGAGAA	2	12	70469	70480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146319917
15	NC_009443	AGCTAA	2	12	72637	72648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319920
16	NC_009443	TAAAGG	2	12	72767	72778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146319920
17	NC_009443	TGCAAC	2	12	73607	73618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319922
18	NC_009443	CGCAAT	2	12	75510	75521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319926
19	NC_009443	TCAACA	2	12	75910	75921	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146319927
20	NC_009443	ATCGAA	2	12	75922	75933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319927
21	NC_009443	ACATCA	2	12	76058	76069	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146319927
22	NC_009443	AGTTAA	2	12	76797	76808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146319928
23	NC_009443	ATCGTT	2	12	78656	78667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146319933
24	NC_009443	CCAACA	2	12	80511	80522	50 %	0 %	0 %	50 %	146319935
25	NC_009443	ACTTGG	2	12	81719	81730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146319938
26	NC_009443	GCGGTG	2	12	82087	82098	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146319939
27	NC_009443	ATGGTA	2	12	82946	82957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319940
28	NC_009443	ATTGAA	2	12	84602	84613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146319943
29	NC_009443	GTAAAG	2	12	85288	85299	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146319944
30	NC_009443	GTTAAA	2	12	86662	86673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146319946
31	NC_009443	ATCCTT	2	12	99290	99301	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146319959
32	NC_009443	GATTTA	2	12	100607	100618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146319960
33	NC_009443	ATGAAA	2	12	103691	103702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146319964
34	NC_009443	TTGAAA	2	12	105718	105729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146319967
35	NC_009443	CTTGGA	2	12	105774	105785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146319967
36	NC_009443	TGGAAT	2	12	110841	110852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319971
37	NC_009443	CGCAGC	2	12	114184	114195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146319971
38	NC_009443	ATGGTT	2	12	114891	114902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146319972
39	NC_009443	GTGAAG	2	12	115935	115946	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146319972
40	NC_009443	GGCGAA	2	12	117404	117415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146319972
41	NC_009443	ATGACA	2	12	119955	119966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319976
42	NC_009443	TCCATT	2	12	126236	126247	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146319987
43	NC_009443	GAAAAA	2	12	129630	129641	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146319990
44	NC_009443	TTGAGT	2	12	130322	130333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146319992
45	NC_009443	GCAAGA	2	12	137458	137469	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320004
46	NC_009443	TATCAC	2	12	137476	137487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320004
47	NC_009443	TTCGAG	2	12	138857	138868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320004
48	NC_009443	GTTCCA	2	12	143430	143441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320007
49	NC_009443	CCAGAA	2	12	147381	147392	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320012
50	NC_009443	AGCACC	2	12	148088	148099	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320012
51	NC_009443	GTGGCG	2	12	151296	151307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146320016
52	NC_009443	GGCTGT	2	12	152417	152428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146320018
53	NC_009443	GGAGTT	2	12	152564	152575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320018
54	NC_009443	GTTATA	2	12	154217	154228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320020
55	NC_009443	TGGGGA	2	12	155661	155672	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	146320021
56	NC_009443	ATTTTA	2	12	156150	156161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320021
57	NC_009443	TTTTGA	2	12	158391	158402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320023
58	NC_009443	AAACAG	2	12	163321	163332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320028
59	NC_009443	ACTGAT	2	12	163668	163679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146320028
60	NC_009443	AGATGC	2	12	165025	165036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320029
61	NC_009443	AAAACA	2	12	167226	167237	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146320031
62	NC_009443	GATTTG	2	12	170576	170587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320035
63	NC_009443	CAGCAA	2	12	172308	172319	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320036
64	NC_009443	GATTGA	2	12	174173	174184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320037
65	NC_009443	TAAGTC	2	12	175686	175697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146320040
66	NC_009443	CATTGC	2	12	178632	178643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320041
67	NC_009443	TTGATT	2	12	178912	178923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320041
68	NC_009443	CCAGCT	2	12	182698	182709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320044
69	NC_009443	CAGCTC	2	12	182771	182782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320044
70	NC_009443	CTCCAA	2	12	182804	182815	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320044
71	NC_009443	AACTCC	2	12	182985	182996	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320044
72	NC_009443	TCGTAG	2	12	189215	189226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320048
73	NC_009443	GAAAAA	2	12	192394	192405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320050
74	NC_009443	GTCAAG	2	12	194502	194513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320052
75	NC_009443	AAAATC	2	12	195337	195348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320054
76	NC_009443	TTGATT	2	12	195407	195418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320054
77	NC_009443	TTAATA	2	12	198010	198021	50 %	50 %	0 %	0 %	146320057
78	NC_009443	TTTTGA	2	12	198414	198425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320058
79	NC_009443	TGTGAA	2	12	199219	199230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320058
80	NC_009443	GATAAA	2	12	202595	202606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146320059
81	NC_009443	TAGAAT	2	12	204633	204644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146320061
82	NC_009443	GATGAA	2	12	205048	205059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320062
83	NC_009443	ATTGCC	2	12	209060	209071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320066
84	NC_009443	CATTGC	2	12	210388	210399	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320068
85	NC_009443	TCCACG	2	12	218465	218476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320074
86	NC_009443	AAAGTC	2	12	218725	218736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320074
87	NC_009443	TGGCTA	2	12	224945	224956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320079
88	NC_009443	TGAGTT	2	12	225687	225698	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320079
89	NC_009443	AACAGA	2	12	231374	231385	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320086
90	NC_009443	TTATGG	2	12	234013	234024	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320089
91	NC_009443	TTTTAT	2	12	238605	238616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	146320094
92	NC_009443	GTAACA	2	12	238741	238752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320094
93	NC_009443	TTTTCC	2	12	246652	246663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320101
94	NC_009443	GAATAA	2	12	249996	250007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146320103
95	NC_009443	TAGGGT	2	12	250126	250137	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320104
96	NC_009443	AAAGAT	2	12	253797	253808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146320109
97	NC_009443	AGGTGT	2	12	256375	256386	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320111
98	NC_009443	CAAAAA	2	12	260083	260094	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146320114
99	NC_009443	AACCAA	2	12	261644	261655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320116
100	NC_009443	CGACAA	2	12	266013	266024	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320121
101	NC_009443	GGCGAC	2	12	269947	269958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146320123
102	NC_009443	TTGCGG	2	12	273020	273031	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146320127
103	NC_009443	GATTGT	2	12	276376	276387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320130
104	NC_009443	AAAAAG	2	12	279843	279854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320133
105	NC_009443	GCGCTT	2	12	279986	279997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320133
106	NC_009443	TTCTTG	2	12	285780	285791	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146320137
107	NC_009443	GACCAT	2	12	288578	288589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320140
108	NC_009443	CTTTGA	2	12	289676	289687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146320141
109	NC_009443	TCGACA	2	12	292390	292401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320143
110	NC_009443	CCAAGC	2	12	292652	292663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320143
111	NC_009443	AAGCCC	2	12	292744	292755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320143
112	NC_009443	CTATCC	2	12	298181	298192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146320149
113	NC_009443	GAAGAT	2	12	301346	301357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320152
114	NC_009443	CAACTG	2	12	303987	303998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320156
115	NC_009443	ATTACC	2	12	305009	305020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320159
116	NC_009443	GTTTTG	2	12	310804	310815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320165
117	NC_009443	ACTTGG	2	12	315484	315495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320171
118	NC_009443	CTATCT	2	12	318604	318615	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146320174
119	NC_009443	ATCACT	2	12	320910	320921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320174
120	NC_009443	CATCGT	2	12	323635	323646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229577512
121	NC_009443	GCAAAA	2	12	324811	324822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320177
122	NC_009443	CTTGAC	2	12	325024	325035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320177
123	NC_009443	TAAGGC	2	12	332242	332253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320180
124	NC_009443	CATGCG	2	12	337061	337072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146320185
125	NC_009443	CTGAAG	2	12	341624	341635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320192
126	NC_009443	GATTGA	2	12	343693	343704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320194
127	NC_009443	TGTGAT	2	12	348099	348110	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320198
128	NC_009443	CCGAGT	2	12	348919	348930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146320199
129	NC_009443	TTTTGG	2	12	350552	350563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320200
130	NC_009443	GGATGA	2	12	352317	352328	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146320203
131	NC_009443	AGGAAA	2	12	357122	357133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320211
132	NC_009443	ATGAGA	2	12	362630	362641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320214
133	NC_009443	TCTGGC	2	12	363427	363438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320215
134	NC_009443	AACCCA	2	12	368424	368435	50 %	0 %	0 %	50 %	146320220
135	NC_009443	CAGGTA	2	12	369314	369325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320220
136	NC_009443	AATACC	2	12	370174	370185	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146320220
137	NC_009443	CAGTTG	2	12	373553	373564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320224
138	NC_009443	TAACGG	2	12	374441	374452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320224
139	NC_009443	TTGGTA	2	12	374881	374892	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320226
140	NC_009443	GAACCA	2	12	376600	376611	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320227
141	NC_009443	TCAAAC	2	12	381927	381938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146320231
142	NC_009443	CATCAC	2	12	383617	383628	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320233
143	NC_009443	TGTGAT	2	12	389182	389193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320241
144	NC_009443	AGGGTG	2	12	390340	390351	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	146320242
145	NC_009443	TCCAGC	2	12	392680	392691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320245
146	NC_009443	AAAGAA	2	12	403653	403664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320257
147	NC_009443	CGGGCT	2	12	405150	405161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146320258
148	NC_009443	CTACCA	2	12	406124	406135	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320258
149	NC_009443	AGCGAC	2	12	410615	410626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320262
150	NC_009443	AACCAG	2	12	411332	411343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320262
151	NC_009443	CAAGTA	2	12	411370	411381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320262
152	NC_009443	AACGGA	2	12	412902	412913	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320265
153	NC_009443	AGAAAA	2	12	414996	415007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320267
154	NC_009443	CAAAAC	2	12	415354	415365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320267
155	NC_009443	ACTTGA	2	12	427774	427785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146320277
156	NC_009443	CCTTAT	2	12	431615	431626	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146320283
157	NC_009443	CTCTAT	2	12	433742	433753	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146320284
158	NC_009443	TTAGTA	2	12	436163	436174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320289
159	NC_009443	AGGCTG	2	12	438269	438280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146320291
160	NC_009443	CCAATC	2	12	440617	440628	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320294
161	NC_009443	AGGATG	2	12	441170	441181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146320294
162	NC_009443	CAACCT	2	12	441272	441283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320294
163	NC_009443	GAAAAA	3	18	442417	442434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320294
164	NC_009443	TTCAAC	2	12	442948	442959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320295
165	NC_009443	AAAATC	2	12	443491	443502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320295
166	NC_009443	GAAGAG	2	12	447870	447881	50 %	0 %	50 %	0 %	146320298
167	NC_009443	GTATCG	2	12	454163	454174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320304
168	NC_009443	ACAATA	2	12	456845	456856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320309
169	NC_009443	TGGATA	2	12	456896	456907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320309
170	NC_009443	AAGCAG	2	12	461192	461203	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320312
171	NC_009443	GACAAC	2	12	465635	465646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320316
172	NC_009443	TGAGCA	2	12	466741	466752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320317
173	NC_009443	GTATCG	2	12	471013	471024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320322
174	NC_009443	CAGAAG	2	12	471151	471162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320322
175	NC_009443	AAGGCG	2	12	475105	475116	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146320329
176	NC_009443	TGGTCA	2	12	475814	475825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320330
177	NC_009443	TCAGGG	2	12	483046	483057	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146320336
178	NC_009443	TACGAT	2	12	487444	487455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146320341
179	NC_009443	ATGCCC	2	12	491256	491267	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320346
180	NC_009443	GTAGTC	2	12	501504	501515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320358
181	NC_009443	CCTTAC	2	12	502637	502648	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146320358
182	NC_009443	CGATTG	2	12	504339	504350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320361
183	NC_009443	CCAGAA	2	12	514104	514115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320371
184	NC_009443	AAATCG	2	12	514228	514239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320371
185	NC_009443	ACGAAT	2	12	521232	521243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320379
186	NC_009443	GATATT	3	18	524901	524918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320384
187	NC_009443	AGCCTT	2	12	525950	525961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320384
188	NC_009443	TCTTTG	2	12	526336	526347	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146320384
189	NC_009443	GAAACT	2	12	531892	531903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320393
190	NC_009443	GAAACT	2	12	532063	532074	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320393
191	NC_009443	GAAACT	2	12	532234	532245	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320393
192	NC_009443	AGAAGT	2	12	532722	532733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320393
193	NC_009443	TTGAAA	2	12	537601	537612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	146320397
194	NC_009443	GCTCTT	2	12	539452	539463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146320400
195	NC_009443	AAATGA	2	12	545870	545881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146320405
196	NC_009443	CCATTG	2	12	545884	545895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320405
197	NC_009443	AACAGG	2	12	547275	547286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320406
198	NC_009443	TTTTCC	2	12	549079	549090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320408
199	NC_009443	AAATTC	2	12	552677	552688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146320414
200	NC_009443	ACAGGA	2	12	553693	553704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320415
201	NC_009443	AATCGA	2	12	553862	553873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320416
202	NC_009443	CAAAAT	2	12	562241	562252	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320424
203	NC_009443	CTTTAT	2	12	568210	568221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146320428
204	NC_009443	TTTGAA	2	12	570204	570215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320429
205	NC_009443	TTGAAG	2	12	580999	581010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320444
206	NC_009443	TATTTG	2	12	582493	582504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320446
207	NC_009443	TCAATT	2	12	582949	582960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146320446
208	NC_009443	ACCTAA	2	12	586880	586891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146320450
209	NC_009443	TAGCAG	2	12	588270	588281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320451
210	NC_009443	GGCAAG	2	12	595099	595110	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146320461
211	NC_009443	TCGGTA	2	12	596258	596269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320461
212	NC_009443	GTAGGT	2	12	597804	597815	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320464
213	NC_009443	GAAAAT	2	12	605779	605790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146320472
214	NC_009443	AGCAGA	2	12	606546	606557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320473
215	NC_009443	TGATGG	2	12	612974	612985	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320476
216	NC_009443	CAAAAG	2	12	616594	616605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320479
217	NC_009443	AAATCA	2	12	616817	616828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320479
218	NC_009443	TATTCA	2	12	616839	616850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146320479
219	NC_009443	TCATCC	2	12	617852	617863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146320481
220	NC_009443	CAGATT	2	12	621361	621372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146320485
221	NC_009443	GAAGAG	2	12	632057	632068	50 %	0 %	50 %	0 %	146320497
222	NC_009443	AACAAT	2	12	641959	641970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320506
223	NC_009443	AGGATG	2	12	641978	641989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146320506
224	NC_009443	TGCCAA	2	12	647768	647779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320514
225	NC_009443	TGCTAG	2	12	649867	649878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320517
226	NC_009443	GTTGGG	2	12	651938	651949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320520
227	NC_009443	TTTTGG	2	12	654087	654098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320521
228	NC_009443	AAGGAT	2	12	657360	657371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320524
229	NC_009443	AGCGAA	2	12	657588	657599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320524
230	NC_009443	CTGAGT	2	12	658191	658202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320525
231	NC_009443	ACAGAA	2	12	663098	663109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320532
232	NC_009443	CAACAC	2	12	666195	666206	50 %	0 %	0 %	50 %	146320534
233	NC_009443	TGCATC	2	12	666619	666630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320534
234	NC_009443	GACTGG	2	12	673089	673100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146320540
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237	NC_009443	GAAATG	2	12	687184	687195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146320557
238	NC_009443	TCAGGT	2	12	688746	688757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320559
239	NC_009443	GGGATG	2	12	689657	689668	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	146320560
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256	NC_009443	GATTGA	2	12	750337	750348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320614
257	NC_009443	CAAGTC	2	12	750754	750765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320614
258	NC_009443	AGCTGC	3	18	754575	754592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146320618
259	NC_009443	TCATTG	2	12	754816	754827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146320618
260	NC_009443	TGACCG	2	12	758719	758730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146320623
261	NC_009443	GTACAG	2	12	758999	759010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320623
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299	NC_009443	CATGGT	2	12	858598	858609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146320736
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330	NC_009443	AAGACC	2	12	961643	961654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320844
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333	NC_009443	CTAGCT	2	12	968358	968369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320852
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337	NC_009443	TGCAAC	2	12	985426	985437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320872
338	NC_009443	GTTTGA	2	12	993835	993846	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320882
339	NC_009443	CTTGAC	2	12	1001817	1001828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320885
340	NC_009443	TACCAG	2	12	1003103	1003114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320885
341	NC_009443	CAATGG	2	12	1006843	1006854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320888
342	NC_009443	TTCAAA	2	12	1012631	1012642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146320894
343	NC_009443	AACGAG	2	12	1016611	1016622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146320898
344	NC_009443	CTACAT	2	12	1019255	1019266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320903
345	NC_009443	TCTTGC	2	12	1027094	1027105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146320915
346	NC_009443	AATCAA	2	12	1028113	1028124	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320915
347	NC_009443	GATGCA	2	12	1035980	1035991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320923
348	NC_009443	TTCAAA	2	12	1042422	1042433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146320933
349	NC_009443	TGCTTA	2	12	1044594	1044605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146320934
350	NC_009443	TTGCAC	2	12	1045250	1045261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320934
351	NC_009443	TAAACC	2	12	1058063	1058074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146320951
352	NC_009443	TTTTTG	2	12	1058621	1058632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146320951
353	NC_009443	ATTTTG	2	12	1059510	1059521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320952
354	NC_009443	CTCAAT	2	12	1061276	1061287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320955
355	NC_009443	ACCAGA	2	12	1063685	1063696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320957
356	NC_009443	AAAATC	2	12	1066319	1066330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146320961
357	NC_009443	GCTACT	2	12	1067001	1067012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320963
358	NC_009443	CTTGAC	2	12	1072489	1072500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320972
359	NC_009443	CCACAT	2	12	1074367	1074378	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320977
360	NC_009443	CTTGGT	2	12	1076766	1076777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146320983
361	NC_009443	TCCTTA	2	12	1077304	1077315	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146320983
362	NC_009443	TTCCCG	2	12	1077363	1077374	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146320983
363	NC_009443	GAGAAA	2	12	1082477	1082488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320990
364	NC_009443	AGCTTT	2	12	1086588	1086599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146320996
365	NC_009443	TATCGC	2	12	1086945	1086956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320997
366	NC_009443	CAAAAT	2	12	1088493	1088504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321000
367	NC_009443	ATTTAT	2	12	1093769	1093780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321009
368	NC_009443	CCAGCA	2	12	1095650	1095661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146321013
369	NC_009443	GGGTCA	2	12	1096374	1096385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146321013
370	NC_009443	GTTGCA	2	12	1108092	1108103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321022
371	NC_009443	CCAAAA	2	12	1113483	1113494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321030
372	NC_009443	TTATCC	2	12	1115002	1115013	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146321032
373	NC_009443	GTAATC	2	12	1115633	1115644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146321033
374	NC_009443	AATATC	2	12	1116737	1116748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321034
375	NC_009443	GAATAA	2	12	1121815	1121826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	146321039
376	NC_009443	CTTTCC	2	12	1121912	1121923	0 %	50 %	0 %	50 %	146321040
377	NC_009443	AAGGGT	2	12	1122608	1122619	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146321041
378	NC_009443	TTTGGC	2	12	1124215	1124226	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146321044
379	NC_009443	TTTTCC	2	12	1127785	1127796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321047
380	NC_009443	CCGCAC	2	12	1131523	1131534	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	146321051
381	NC_009443	CGACCA	3	18	1137516	1137533	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146321055
382	NC_009443	CTTGTC	2	12	1138729	1138740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146321056
383	NC_009443	TTCTGT	2	12	1141260	1141271	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146321058
384	NC_009443	TGATAT	2	12	1144018	1144029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146321060
385	NC_009443	ACCTGG	2	12	1144237	1144248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321060
386	NC_009443	CAACTG	2	12	1144848	1144859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321060
387	NC_009443	AGAGAT	2	12	1145912	1145923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146321061
388	NC_009443	AGCAAC	2	12	1146962	1146973	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146321061
389	NC_009443	GATATG	2	12	1154935	1154946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321069
390	NC_009443	GTCGTT	2	12	1161299	1161310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146321075
391	NC_009443	CGAACA	2	12	1163111	1163122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146321077
392	NC_009443	CACCAA	2	12	1165513	1165524	50 %	0 %	0 %	50 %	146321080
393	NC_009443	TCAATA	2	12	1170964	1170975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321087
394	NC_009443	CAAAAT	2	12	1172744	1172755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321088
395	NC_009443	AGACCG	2	12	1175287	1175298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321092
396	NC_009443	TCCTCA	2	12	1175872	1175883	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146321093
397	NC_009443	ACTTGG	2	12	1178052	1178063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321099
398	NC_009443	GCACGG	2	12	1179093	1179104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146321099
399	NC_009443	AAATCC	2	12	1180851	1180862	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146321100
400	NC_009443	CATAGA	2	12	1185876	1185887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321106
401	NC_009443	TCATGG	2	12	1196677	1196688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321117
402	NC_009443	CCGCTT	2	12	1200649	1200660	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146321121
403	NC_009443	AGCAAT	2	12	1200752	1200763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321121
404	NC_009443	TGTTTC	2	12	1213505	1213516	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146321133
405	NC_009443	CAATTT	2	12	1214259	1214270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146321135
406	NC_009443	TTCCGG	2	12	1215990	1216001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321138
407	NC_009443	ACCATC	2	12	1216260	1216271	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146321138
408	NC_009443	TCAAAA	2	12	1221714	1221725	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321142
409	NC_009443	TCGTCT	2	12	1221849	1221860	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146321142
410	NC_009443	TTCAAA	2	12	1222575	1222586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321143
411	NC_009443	ATATTG	2	12	1224443	1224454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146321145
412	NC_009443	TATAGC	2	12	1225723	1225734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146321147
413	NC_009443	ACATCA	2	12	1225947	1225958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146321147
414	NC_009443	ATCCGA	2	12	1232954	1232965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321154
415	NC_009443	CACCTG	2	12	1234680	1234691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321156
416	NC_009443	CACCTG	2	12	1234980	1234991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321156
417	NC_009443	CACCTG	2	12	1235280	1235291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321156
418	NC_009443	CACCTG	2	12	1235880	1235891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321156
419	NC_009443	TTGCCT	2	12	1237032	1237043	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146321157
420	NC_009443	GTAATG	2	12	1237547	1237558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321157
421	NC_009443	TTCATG	2	12	1240316	1240327	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146321161
422	NC_009443	CAAATG	2	12	1242636	1242647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321165
423	NC_009443	GCCCCT	2	12	1243518	1243529	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146321166
424	NC_009443	ATTTCA	2	12	1244995	1245006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146321168
425	NC_009443	AATTCT	2	12	1248307	1248318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146321172
426	NC_009443	ATATAA	2	12	1250961	1250972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321173
427	NC_009443	TCTGTC	2	12	1251120	1251131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146321173
428	NC_009443	GTTCTT	2	12	1259030	1259041	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146321179
429	NC_009443	TTCTTT	2	12	1267171	1267182	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146321189
430	NC_009443	TCATAA	2	12	1269822	1269833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321191
431	NC_009443	TAGCTG	2	12	1271810	1271821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321194
432	NC_009443	TTTAGC	2	12	1271823	1271834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146321194
433	NC_009443	AAAGAA	2	12	1273294	1273305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146321196
434	NC_009443	ATCTGC	2	12	1274423	1274434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146321198
435	NC_009443	CTCTTC	2	12	1275836	1275847	0 %	50 %	0 %	50 %	146321198
436	NC_009443	TTGATA	2	12	1277278	1277289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146321199
437	NC_009443	TCCAAG	2	12	1281958	1281969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321204
438	NC_009443	TCTAGT	2	12	1284358	1284369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146321207
439	NC_009443	ATCACT	2	12	1285248	1285259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321208
440	NC_009443	TTCTGC	2	12	1293280	1293291	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146321213
441	NC_009443	AGGAAA	2	12	1297384	1297395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321218
442	NC_009443	CAGCTC	2	12	1301908	1301919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321223
443	NC_009443	TCCGGA	2	12	1302689	1302700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321224
444	NC_009443	AATATC	2	12	1307677	1307688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321229
445	NC_009443	GTATGA	2	12	1309618	1309629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321231
446	NC_009443	ACGTAA	2	12	1312923	1312934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321233
447	NC_009443	AACTGA	2	12	1315077	1315088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321235
448	NC_009443	CTGTCG	2	12	1315283	1315294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321235
449	NC_009443	ACCGTA	2	12	1315731	1315742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321236
450	NC_009443	AACCAT	2	12	1322858	1322869	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146321241
451	NC_009443	TTGGGC	2	12	1326253	1326264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146321242
452	NC_009443	CTGAGC	2	12	1326385	1326396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321242
453	NC_009443	GCAATG	2	12	1329541	1329552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146321247
454	NC_009443	CCCGCT	2	12	1334043	1334054	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146321249
455	NC_009443	TTTCTT	2	12	1336460	1336471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146321252
456	NC_009443	CTTCCG	2	12	1338397	1338408	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146321252
457	NC_009443	CGCATC	2	12	1341335	1341346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146321255
458	NC_009443	CTTGAC	2	12	1342932	1342943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146321257
459	NC_009443	ATAATC	2	12	1350746	1350757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321264
460	NC_009443	CAATAA	2	12	1354353	1354364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321266
461	NC_009443	GCAATA	2	12	1359219	1359230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146321271
462	NC_009443	ATTTCA	2	12	1360216	1360227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146321272
463	NC_009443	GCTCAG	2	12	1361275	1361286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321274
464	NC_009443	ACTAGC	2	12	1363730	1363741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321277
465	NC_009443	ATACCG	2	12	1364693	1364704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321278
466	NC_009443	CCGCAA	2	12	1365744	1365755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146321278
467	NC_009443	TCCTTC	2	12	1366617	1366628	0 %	50 %	0 %	50 %	146321279
468	NC_009443	GCCAAT	2	12	1372938	1372949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321288
469	NC_009443	TTTTCA	2	12	1376541	1376552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	146321291
470	NC_009443	TTTACG	2	12	1376895	1376906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146321292
471	NC_009443	TAATGG	2	12	1379653	1379664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321296
472	NC_009443	GGACAT	2	12	1384926	1384937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146321300
473	NC_009443	TTCTCT	2	12	1391575	1391586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321309
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475	NC_009443	AAATCA	2	12	1393473	1393484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321313
476	NC_009443	TTGCCA	2	12	1395814	1395825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146321314
477	NC_009443	ACAAAA	2	12	1397937	1397948	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	146321315
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479	NC_009443	TCTGCC	2	12	1399323	1399334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146321316
480	NC_009443	CCAAAT	2	12	1403335	1403346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146321321
481	NC_009443	ACTTGA	2	12	1403460	1403471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146321321
482	NC_009443	GGTCCA	2	12	1404108	1404119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321321
483	NC_009443	CATCCA	2	12	1407904	1407915	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146321327
484	NC_009443	TTTTGT	2	12	1410855	1410866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	146321329
485	NC_009443	TCAATC	2	12	1411387	1411398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321329
486	NC_009443	GGTTTA	2	12	1412385	1412396	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146321330
487	NC_009443	GGCAAT	2	12	1414471	1414482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146321332
488	NC_009443	CAATGG	2	12	1417423	1417434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146321336
489	NC_009443	CAGTGT	2	12	1417805	1417816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321336
490	NC_009443	ATCAAA	2	12	1420017	1420028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146321339
491	NC_009443	CACTTT	2	12	1421938	1421949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146321340
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499	NC_009443	ACCAAG	2	12	1440434	1440445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146321359
500	NC_009443	ACTTCA	2	12	1440549	1440560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321359

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