MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 1337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009443	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	146322039
2	NC_009443	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	146322039
3	NC_009443	GTACA	2	10	2390	2399	40 %	20 %	20 %	20 %	146319851
4	NC_009443	CATAT	2	10	2806	2815	40 %	40 %	0 %	20 %	146319853
5	NC_009443	AAACA	2	10	5719	5728	80 %	0 %	0 %	20 %	146319858
6	NC_009443	TGTCT	2	10	6110	6119	0 %	60 %	20 %	20 %	146319858
7	NC_009443	GAGAT	2	10	6828	6837	40 %	20 %	40 %	0 %	146319859
8	NC_009443	TGAAA	2	10	9965	9974	60 %	20 %	20 %	0 %	146319861
9	NC_009443	CTATT	2	10	11202	11211	20 %	60 %	0 %	20 %	146319864
10	NC_009443	CTTTG	2	10	13431	13440	0 %	60 %	20 %	20 %	146319866
11	NC_009443	AACAG	2	10	13875	13884	60 %	0 %	20 %	20 %	146319867
12	NC_009443	CTTGT	2	10	15031	15040	0 %	60 %	20 %	20 %	146319867
13	NC_009443	AATGC	2	10	25402	25411	40 %	20 %	20 %	20 %	146319872
14	NC_009443	CTACG	2	10	30756	30765	20 %	20 %	20 %	40 %	146319878
15	NC_009443	GAACG	2	10	33042	33051	40 %	0 %	40 %	20 %	146319879
16	NC_009443	AAACC	2	10	33178	33187	60 %	0 %	0 %	40 %	146319879
17	NC_009443	ATTCT	2	10	34525	34534	20 %	60 %	0 %	20 %	146319879
18	NC_009443	GCCAT	2	10	35000	35009	20 %	20 %	20 %	40 %	146319879
19	NC_009443	AAATG	2	10	36086	36095	60 %	20 %	20 %	0 %	146319880
20	NC_009443	AGCAG	2	10	38717	38726	40 %	0 %	40 %	20 %	146319883
21	NC_009443	CTATT	2	10	38942	38951	20 %	60 %	0 %	20 %	146319883
22	NC_009443	CTATT	2	10	41504	41513	20 %	60 %	0 %	20 %	146319885
23	NC_009443	GAAGC	2	10	42683	42692	40 %	0 %	40 %	20 %	146319886
24	NC_009443	AGCGG	2	10	45790	45799	20 %	0 %	60 %	20 %	146319889
25	NC_009443	TTAGT	2	10	47406	47415	20 %	60 %	20 %	0 %	146319891
26	NC_009443	GAAGT	2	10	48053	48062	40 %	20 %	40 %	0 %	146319892
27	NC_009443	TTATC	2	10	48183	48192	20 %	60 %	0 %	20 %	146319892
28	NC_009443	TAATC	2	10	48291	48300	40 %	40 %	0 %	20 %	146319892
29	NC_009443	TCAAT	2	10	48550	48559	40 %	40 %	0 %	20 %	146319893
30	NC_009443	TTATT	2	10	48803	48812	20 %	80 %	0 %	0 %	146319893
31	NC_009443	GAGAA	2	10	52302	52311	60 %	0 %	40 %	0 %	146319897
32	NC_009443	GCAGA	2	10	53783	53792	40 %	0 %	40 %	20 %	146319899
33	NC_009443	GGGCT	2	10	54254	54263	0 %	20 %	60 %	20 %	146319899
34	NC_009443	TGAAT	2	10	55877	55886	40 %	40 %	20 %	0 %	146319901
35	NC_009443	AGCAG	2	10	60018	60027	40 %	0 %	40 %	20 %	146319905
36	NC_009443	GCCCT	2	10	62839	62848	0 %	20 %	20 %	60 %	146319909
37	NC_009443	TTGCT	2	10	65938	65947	0 %	60 %	20 %	20 %	146319911
38	NC_009443	GTATC	2	10	69225	69234	20 %	40 %	20 %	20 %	146319914
39	NC_009443	TGGAT	2	10	71219	71228	20 %	40 %	40 %	0 %	146319918
40	NC_009443	AAATT	2	10	72321	72330	60 %	40 %	0 %	0 %	146319919
41	NC_009443	TGGCG	2	10	73329	73338	0 %	20 %	60 %	20 %	146319922
42	NC_009443	AAAAC	2	10	73889	73898	80 %	0 %	0 %	20 %	146319923
43	NC_009443	TACAC	2	10	74303	74312	40 %	20 %	0 %	40 %	146319924
44	NC_009443	GAAAA	2	10	75182	75191	80 %	0 %	20 %	0 %	162139885
45	NC_009443	GTCTT	2	10	75470	75479	0 %	60 %	20 %	20 %	146319926
46	NC_009443	TTTGG	2	10	75601	75610	0 %	60 %	40 %	0 %	146319926
47	NC_009443	AGAAT	2	10	83721	83730	60 %	20 %	20 %	0 %	146319941
48	NC_009443	GAAAA	2	10	86047	86056	80 %	0 %	20 %	0 %	146319946
49	NC_009443	TGACT	2	10	86442	86451	20 %	40 %	20 %	20 %	146319946
50	NC_009443	TGTGA	2	10	94295	94304	20 %	40 %	40 %	0 %	146319950
51	NC_009443	TGCTT	2	10	95859	95868	0 %	60 %	20 %	20 %	146319954
52	NC_009443	TTGTT	2	10	97064	97073	0 %	80 %	20 %	0 %	146319956
53	NC_009443	TTTCA	2	10	99323	99332	20 %	60 %	0 %	20 %	146319959
54	NC_009443	CTTCG	2	10	99566	99575	0 %	40 %	20 %	40 %	146319959
55	NC_009443	AAAAT	2	10	99700	99709	80 %	20 %	0 %	0 %	146319959
56	NC_009443	TTTTC	2	10	100487	100496	0 %	80 %	0 %	20 %	146319960
57	NC_009443	TTTGG	2	10	102781	102790	0 %	60 %	40 %	0 %	146319963
58	NC_009443	ATTGC	2	10	103246	103255	20 %	40 %	20 %	20 %	146319963
59	NC_009443	GCTTT	2	10	103477	103486	0 %	60 %	20 %	20 %	146319964
60	NC_009443	AGAAA	2	10	103935	103944	80 %	0 %	20 %	0 %	146319964
61	NC_009443	GACTT	2	10	105514	105523	20 %	40 %	20 %	20 %	146319965
62	NC_009443	CTGGG	2	10	109734	109743	0 %	20 %	60 %	20 %	146319970
63	NC_009443	AAGAA	2	10	114386	114395	80 %	0 %	20 %	0 %	146319972
64	NC_009443	CCGTT	2	10	115429	115438	0 %	40 %	20 %	40 %	146319972
65	NC_009443	GGCCT	2	10	118969	118978	0 %	20 %	40 %	40 %	146319975
66	NC_009443	GTCAA	2	10	119066	119075	40 %	20 %	20 %	20 %	146319975
67	NC_009443	GCTTG	2	10	120917	120926	0 %	40 %	40 %	20 %	146319977
68	NC_009443	TGGTT	2	10	121046	121055	0 %	60 %	40 %	0 %	146319978
69	NC_009443	GGTCA	2	10	121345	121354	20 %	20 %	40 %	20 %	146319978
70	NC_009443	AAGGA	2	10	122435	122444	60 %	0 %	40 %	0 %	146319981
71	NC_009443	GGCAA	2	10	122993	123002	40 %	0 %	40 %	20 %	146319983
72	NC_009443	TTGGT	2	10	125380	125389	0 %	60 %	40 %	0 %	146319986
73	NC_009443	GAAAA	2	10	125842	125851	80 %	0 %	20 %	0 %	146319987
74	NC_009443	CCTTG	2	10	125895	125904	0 %	40 %	20 %	40 %	146319987
75	NC_009443	CTGGA	2	10	126783	126792	20 %	20 %	40 %	20 %	146319988
76	NC_009443	AGCAG	2	10	127139	127148	40 %	0 %	40 %	20 %	146319988
77	NC_009443	GCTCA	2	10	127247	127256	20 %	20 %	20 %	40 %	146319988
78	NC_009443	AATCA	2	10	127761	127770	60 %	20 %	0 %	20 %	146319989
79	NC_009443	AGGTG	2	10	128449	128458	20 %	20 %	60 %	0 %	146319989
80	NC_009443	ACTTT	2	10	132155	132164	20 %	60 %	0 %	20 %	146319995
81	NC_009443	TAGCG	2	10	135251	135260	20 %	20 %	40 %	20 %	146320001
82	NC_009443	ATCAA	2	10	136412	136421	60 %	20 %	0 %	20 %	146320003
83	NC_009443	CGTAT	2	10	137684	137693	20 %	40 %	20 %	20 %	146320004
84	NC_009443	ATCCA	2	10	137775	137784	40 %	20 %	0 %	40 %	146320004
85	NC_009443	CAAGA	2	10	138551	138560	60 %	0 %	20 %	20 %	146320004
86	NC_009443	AAGCT	2	10	138981	138990	40 %	20 %	20 %	20 %	146320004
87	NC_009443	AAGAA	2	10	141241	141250	80 %	0 %	20 %	0 %	146320006
88	NC_009443	GCAGT	2	10	141531	141540	20 %	20 %	40 %	20 %	146320006
89	NC_009443	ATCCA	2	10	141642	141651	40 %	20 %	0 %	40 %	146320006
90	NC_009443	TACGA	2	10	142143	142152	40 %	20 %	20 %	20 %	146320006
91	NC_009443	GTTTA	2	10	146140	146149	20 %	60 %	20 %	0 %	146320010
92	NC_009443	GCATG	2	10	147662	147671	20 %	20 %	40 %	20 %	146320012
93	NC_009443	AAAAT	2	10	148075	148084	80 %	20 %	0 %	0 %	146320012
94	NC_009443	GGGTC	2	10	152699	152708	0 %	20 %	60 %	20 %	146320018
95	NC_009443	TTTCA	2	10	153669	153678	20 %	60 %	0 %	20 %	146320019
96	NC_009443	AAAAG	2	10	154262	154271	80 %	0 %	20 %	0 %	146320020
97	NC_009443	TGGTC	2	10	156855	156864	0 %	40 %	40 %	20 %	146320022
98	NC_009443	GTCTT	2	10	157810	157819	0 %	60 %	20 %	20 %	146320023
99	NC_009443	TTGGA	2	10	160326	160335	20 %	40 %	40 %	0 %	146320025
100	NC_009443	TCATC	2	10	161199	161208	20 %	40 %	0 %	40 %	146320027
101	NC_009443	CTTGG	2	10	161368	161377	0 %	40 %	40 %	20 %	146320027
102	NC_009443	TTTTC	2	10	162387	162396	0 %	80 %	0 %	20 %	146320028
103	NC_009443	CACCT	2	10	162950	162959	20 %	20 %	0 %	60 %	146320028
104	NC_009443	AGACT	2	10	167736	167745	40 %	20 %	20 %	20 %	146320031
105	NC_009443	ATACA	2	10	172863	172872	60 %	20 %	0 %	20 %	146320037
106	NC_009443	GGTTT	2	10	175022	175031	0 %	60 %	40 %	0 %	146320038
107	NC_009443	TTATC	2	10	175898	175907	20 %	60 %	0 %	20 %	146320040
108	NC_009443	TCTGG	2	10	179332	179341	0 %	40 %	40 %	20 %	146320041
109	NC_009443	TTCAA	2	10	179872	179881	40 %	40 %	0 %	20 %	146320041
110	NC_009443	TGATT	2	10	184503	184512	20 %	60 %	20 %	0 %	146320045
111	NC_009443	GAAGC	2	10	186620	186629	40 %	0 %	40 %	20 %	146320046
112	NC_009443	GGAAA	2	10	191989	191998	60 %	0 %	40 %	0 %	146320049
113	NC_009443	CTGGT	2	10	192485	192494	0 %	40 %	40 %	20 %	146320050
114	NC_009443	CCAGA	2	10	192538	192547	40 %	0 %	20 %	40 %	146320050
115	NC_009443	AGCAG	2	10	194587	194596	40 %	0 %	40 %	20 %	146320052
116	NC_009443	TTTTG	2	10	196118	196127	0 %	80 %	20 %	0 %	146320056
117	NC_009443	GAACA	2	10	196153	196162	60 %	0 %	20 %	20 %	146320056
118	NC_009443	AAAAT	2	10	196971	196980	80 %	20 %	0 %	0 %	146320057
119	NC_009443	TTTTA	2	10	197342	197351	20 %	80 %	0 %	0 %	146320057
120	NC_009443	TGAAA	2	10	198507	198516	60 %	20 %	20 %	0 %	146320058
121	NC_009443	AAGGA	2	10	199159	199168	60 %	0 %	40 %	0 %	146320058
122	NC_009443	AGTAA	2	10	199630	199639	60 %	20 %	20 %	0 %	146320058
123	NC_009443	CAAGT	2	10	201387	201396	40 %	20 %	20 %	20 %	146320059
124	NC_009443	ATGGA	2	10	202057	202066	40 %	20 %	40 %	0 %	146320059
125	NC_009443	TTTGG	2	10	205174	205183	0 %	60 %	40 %	0 %	146320062
126	NC_009443	TCTAC	2	10	205954	205963	20 %	40 %	0 %	40 %	146320063
127	NC_009443	AATGT	2	10	206101	206110	40 %	40 %	20 %	0 %	146320063
128	NC_009443	AGCAG	2	10	210241	210250	40 %	0 %	40 %	20 %	146320068
129	NC_009443	GACCA	2	10	213070	213079	40 %	0 %	20 %	40 %	146320069
130	NC_009443	GTTTT	2	10	214180	214189	0 %	80 %	20 %	0 %	146320070
131	NC_009443	CCATA	2	10	214282	214291	40 %	20 %	0 %	40 %	146320071
132	NC_009443	ATGAC	2	10	215670	215679	40 %	20 %	20 %	20 %	146320072
133	NC_009443	AGCTC	2	10	217352	217361	20 %	20 %	20 %	40 %	146320073
134	NC_009443	TCCAA	2	10	219889	219898	40 %	20 %	0 %	40 %	146320075
135	NC_009443	AAAGA	2	10	222794	222803	80 %	0 %	20 %	0 %	146320077
136	NC_009443	AGGGC	2	10	226322	226331	20 %	0 %	60 %	20 %	146320080
137	NC_009443	AGCAG	2	10	226355	226364	40 %	0 %	40 %	20 %	146320080
138	NC_009443	ATCAA	2	10	227178	227187	60 %	20 %	0 %	20 %	146320081
139	NC_009443	CCTTG	2	10	228745	228754	0 %	40 %	20 %	40 %	146320082
140	NC_009443	ACCAA	2	10	229754	229763	60 %	0 %	0 %	40 %	146320083
141	NC_009443	TAATG	2	10	232241	232250	40 %	40 %	20 %	0 %	146320086
142	NC_009443	ATTTT	2	10	233503	233512	20 %	80 %	0 %	0 %	146320089
143	NC_009443	TTGGA	2	10	236746	236755	20 %	40 %	40 %	0 %	146320092
144	NC_009443	CTACT	2	10	237847	237856	20 %	40 %	0 %	40 %	146320093
145	NC_009443	TGGGC	2	10	237942	237951	0 %	20 %	60 %	20 %	146320093
146	NC_009443	GTTAA	2	10	238027	238036	40 %	40 %	20 %	0 %	146320093
147	NC_009443	AAACC	2	10	239995	240004	60 %	0 %	0 %	40 %	146320095
148	NC_009443	TGAAC	2	10	240391	240400	40 %	20 %	20 %	20 %	146320095
149	NC_009443	GGCTT	2	10	241096	241105	0 %	40 %	40 %	20 %	146320096
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151	NC_009443	TCCAT	2	10	244618	244627	20 %	40 %	0 %	40 %	146320099
152	NC_009443	CTTGG	2	10	245070	245079	0 %	40 %	40 %	20 %	146320099
153	NC_009443	GAGAA	2	10	246035	246044	60 %	0 %	40 %	0 %	146320101
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155	NC_009443	ATCAT	2	10	246794	246803	40 %	40 %	0 %	20 %	146320101
156	NC_009443	ACTCT	2	10	248578	248587	20 %	40 %	0 %	40 %	146320103
157	NC_009443	TGGCA	2	10	248834	248843	20 %	20 %	40 %	20 %	146320103
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160	NC_009443	AGTTG	2	10	251621	251630	20 %	40 %	40 %	0 %	146320105
161	NC_009443	AGTTG	2	10	255778	255787	20 %	40 %	40 %	0 %	146320111
162	NC_009443	ATTGA	2	10	256343	256352	40 %	40 %	20 %	0 %	146320111
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165	NC_009443	TGACC	2	10	264505	264514	20 %	20 %	20 %	40 %	146320120
166	NC_009443	AGGCA	2	10	270016	270025	40 %	0 %	40 %	20 %	146320123
167	NC_009443	AGCTG	2	10	270609	270618	20 %	20 %	40 %	20 %	146320124
168	NC_009443	AGAAA	2	10	271220	271229	80 %	0 %	20 %	0 %	146320125
169	NC_009443	GGGCT	2	10	271467	271476	0 %	20 %	60 %	20 %	146320126
170	NC_009443	CAGGG	2	10	272326	272335	20 %	0 %	60 %	20 %	146320126
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172	NC_009443	TTTGC	2	10	273032	273041	0 %	60 %	20 %	20 %	146320127
173	NC_009443	TCTTG	2	10	274242	274251	0 %	60 %	20 %	20 %	146320127
174	NC_009443	CTATT	2	10	275357	275366	20 %	60 %	0 %	20 %	146320129
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176	NC_009443	TATCG	2	10	278944	278953	20 %	40 %	20 %	20 %	146320132
177	NC_009443	CCTAG	2	10	279460	279469	20 %	20 %	20 %	40 %	146320132
178	NC_009443	TTGGC	2	10	281810	281819	0 %	40 %	40 %	20 %	146320135
179	NC_009443	CCTTT	2	10	281945	281954	0 %	60 %	0 %	40 %	146320135
180	NC_009443	TGGTC	2	10	283735	283744	0 %	40 %	40 %	20 %	146320136
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198	NC_009443	CATTT	2	10	308205	308214	20 %	60 %	0 %	20 %	146320162
199	NC_009443	CAAGG	2	10	308617	308626	40 %	0 %	40 %	20 %	146320163
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201	NC_009443	AGAGC	2	10	309703	309712	40 %	0 %	40 %	20 %	146320164
202	NC_009443	GATTT	2	10	310032	310041	20 %	60 %	20 %	0 %	146320164
203	NC_009443	TTCCT	2	10	312520	312529	0 %	60 %	0 %	40 %	146320167
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205	NC_009443	GTTTT	2	10	317291	317300	0 %	80 %	20 %	0 %	146320173
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213	NC_009443	ATTGG	2	10	334838	334847	20 %	40 %	40 %	0 %	146320181
214	NC_009443	GTTTT	2	10	335141	335150	0 %	80 %	20 %	0 %	146320182
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223	NC_009443	TTATC	2	10	361868	361877	20 %	60 %	0 %	20 %	146320214
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229	NC_009443	AACAG	2	10	370029	370038	60 %	0 %	20 %	20 %	146320220
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231	NC_009443	GAATG	2	10	371588	371597	40 %	20 %	40 %	0 %	146320222
232	NC_009443	CAAAT	2	10	375370	375379	60 %	20 %	0 %	20 %	146320226
233	NC_009443	GGCTG	2	10	380367	380376	0 %	20 %	60 %	20 %	146320230
234	NC_009443	AAATC	2	10	382645	382654	60 %	20 %	0 %	20 %	146320231
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236	NC_009443	GAACA	2	10	383545	383554	60 %	0 %	20 %	20 %	146320233
237	NC_009443	TTTGG	2	10	386100	386109	0 %	60 %	40 %	0 %	146320237
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239	NC_009443	TTCTT	2	10	386170	386179	0 %	80 %	0 %	20 %	146320237
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244	NC_009443	CATTC	2	10	392817	392826	20 %	40 %	0 %	40 %	146320245
245	NC_009443	ACAAA	2	10	395359	395368	80 %	0 %	0 %	20 %	146320248
246	NC_009443	GTTGG	2	10	400680	400689	0 %	40 %	60 %	0 %	146320254
247	NC_009443	TTGAT	2	10	404029	404038	20 %	60 %	20 %	0 %	146320258
248	NC_009443	GCAGA	2	10	404253	404262	40 %	0 %	40 %	20 %	146320258
249	NC_009443	TTGGA	2	10	406191	406200	20 %	40 %	40 %	0 %	146320258
250	NC_009443	CTTCT	2	10	406722	406731	0 %	60 %	0 %	40 %	146320259
251	NC_009443	GTTGG	2	10	407943	407952	0 %	40 %	60 %	0 %	146320260
252	NC_009443	TAAAC	2	10	408164	408173	60 %	20 %	0 %	20 %	146320260
253	NC_009443	GATTT	2	10	409500	409509	20 %	60 %	20 %	0 %	146320262
254	NC_009443	AGAGA	2	10	410106	410115	60 %	0 %	40 %	0 %	146320262
255	NC_009443	CAGGT	2	10	411037	411046	20 %	20 %	40 %	20 %	146320262
256	NC_009443	GGTTT	2	10	412198	412207	0 %	60 %	40 %	0 %	146320263
257	NC_009443	AGCCT	2	10	412715	412724	20 %	20 %	20 %	40 %	146320265
258	NC_009443	AAAGA	2	10	415952	415961	80 %	0 %	20 %	0 %	146320268
259	NC_009443	TCCTG	2	10	416443	416452	0 %	40 %	20 %	40 %	146320269
260	NC_009443	TGGAT	2	10	416472	416481	20 %	40 %	40 %	0 %	146320269
261	NC_009443	AGCAG	2	10	417479	417488	40 %	0 %	40 %	20 %	146320270
262	NC_009443	TGTAT	2	10	420215	420224	20 %	60 %	20 %	0 %	146320273
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264	NC_009443	CTTGA	2	10	427974	427983	20 %	40 %	20 %	20 %	146320277
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