MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009443	TCA	2	6	179301	179306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320041
3002	NC_009443	TCTGG	2	10	179332	179341	0 %	40 %	40 %	20 %	146320041
3003	NC_009443	GATG	2	8	179493	179500	25 %	25 %	50 %	0 %	146320041
3004	NC_009443	CATG	2	8	179532	179539	25 %	25 %	25 %	25 %	146320041
3005	NC_009443	CTT	2	6	179648	179653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320041
3006	NC_009443	TGA	2	6	179655	179660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320041
3007	NC_009443	ATT	2	6	179694	179699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320041
3008	NC_009443	A	7	7	179754	179760	100 %	0 %	0 %	0 %	146320041
3009	NC_009443	TAT	2	6	179817	179822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320041
3010	NC_009443	CTT	2	6	179856	179861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320041
3011	NC_009443	TTC	2	6	179864	179869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320041
3012	NC_009443	TTCAA	2	10	179872	179881	40 %	40 %	0 %	20 %	146320041
3013	NC_009443	CGA	2	6	179888	179893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320041
3014	NC_009443	GAA	2	6	179995	180000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320041
3015	NC_009443	TGC	2	6	180020	180025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320041
3016	NC_009443	ATC	2	6	180040	180045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320041
3017	NC_009443	ACA	2	6	180050	180055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320041
3018	NC_009443	GACC	2	8	180057	180064	25 %	0 %	25 %	50 %	146320041
3019	NC_009443	GGA	2	6	180078	180083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320041
3020	NC_009443	T	6	6	180233	180238	0 %	100 %	0 %	0 %	146320042
3021	NC_009443	GTC	2	6	180311	180316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320042
3022	NC_009443	AGC	2	6	180419	180424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320042
3023	NC_009443	CAT	2	6	180476	180481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320042
3024	NC_009443	TCA	2	6	180493	180498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320042
3025	NC_009443	AGA	2	6	180783	180788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320043
3026	NC_009443	TAT	2	6	180807	180812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320043
3027	NC_009443	GGAA	2	8	180848	180855	50 %	0 %	50 %	0 %	146320043
3028	NC_009443	A	6	6	180884	180889	100 %	0 %	0 %	0 %	146320043
3029	NC_009443	ATCA	2	8	180906	180913	50 %	25 %	0 %	25 %	146320043
3030	NC_009443	GTT	2	6	180937	180942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320043
3031	NC_009443	TTG	2	6	180968	180973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320043
3032	NC_009443	GCA	2	6	181141	181146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320043
3033	NC_009443	CTC	2	6	181330	181335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320043
3034	NC_009443	TCT	2	6	181337	181342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320043
3035	NC_009443	AAG	2	6	181355	181360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320043
3036	NC_009443	GCT	2	6	181366	181371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320043
3037	NC_009443	GGT	2	6	181477	181482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320043
3038	NC_009443	CAG	2	6	181529	181534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320043
3039	NC_009443	CAC	2	6	181559	181564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320043
3040	NC_009443	TCA	2	6	181592	181597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320043
3041	NC_009443	ATG	2	6	181652	181657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320043
3042	NC_009443	AGC	2	6	181740	181745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320043
3043	NC_009443	TAT	2	6	181830	181835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320043
3044	NC_009443	CAA	2	6	181851	181856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320043
3045	NC_009443	GTG	2	6	181897	181902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320043
3046	NC_009443	ATC	2	6	181912	181917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320043
3047	NC_009443	A	6	6	182080	182085	100 %	0 %	0 %	0 %	146320044
3048	NC_009443	CGA	2	6	182183	182188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320044
3049	NC_009443	GAA	2	6	182233	182238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3050	NC_009443	ATT	2	6	182315	182320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320044
3051	NC_009443	ATA	2	6	182366	182371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320044
3052	NC_009443	GAAA	2	8	182492	182499	75 %	0 %	25 %	0 %	146320044
3053	NC_009443	ATA	2	6	182510	182515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320044
3054	NC_009443	GAA	2	6	182524	182529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3055	NC_009443	TAGC	2	8	182567	182574	25 %	25 %	25 %	25 %	146320044
3056	NC_009443	AAC	2	6	182669	182674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320044
3057	NC_009443	CCAGCT	2	12	182698	182709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320044
3058	NC_009443	GAA	2	6	182719	182724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3059	NC_009443	AGG	2	6	182741	182746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320044
3060	NC_009443	CAGCTC	2	12	182771	182782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146320044
3061	NC_009443	CTCCAA	2	12	182804	182815	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320044
3062	NC_009443	AGA	2	6	182928	182933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3063	NC_009443	AGA	2	6	182955	182960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3064	NC_009443	AGA	2	6	182979	182984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3065	NC_009443	AACTCC	2	12	182985	182996	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146320044
3066	NC_009443	GAA	2	6	183073	183078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3067	NC_009443	AGA	2	6	183195	183200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3068	NC_009443	AGG	2	6	183209	183214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320044
3069	NC_009443	CAG	2	6	183263	183268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320044
3070	NC_009443	CAA	2	6	183317	183322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320044
3071	NC_009443	AGA	2	6	183336	183341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3072	NC_009443	AGA	2	6	183357	183362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3073	NC_009443	ATG	2	6	183371	183376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320044
3074	NC_009443	CTT	2	6	183403	183408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320044
3075	NC_009443	AAG	2	6	183410	183415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3076	NC_009443	A	6	6	183427	183432	100 %	0 %	0 %	0 %	146320044
3077	NC_009443	CAAC	2	8	183476	183483	50 %	0 %	0 %	50 %	146320044
3078	NC_009443	TAT	2	6	183485	183490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320044
3079	NC_009443	TGT	2	6	183498	183503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320044
3080	NC_009443	GAA	2	6	183546	183551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3081	NC_009443	AGA	2	6	183552	183557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320044
3082	NC_009443	AAC	2	6	183564	183569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320044
3083	NC_009443	CAAA	2	8	183620	183627	75 %	0 %	0 %	25 %	146320044
3084	NC_009443	TAG	2	6	183671	183676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320044
3085	NC_009443	A	6	6	183727	183732	100 %	0 %	0 %	0 %	146320044
3086	NC_009443	T	6	6	184144	184149	0 %	100 %	0 %	0 %	146320045
3087	NC_009443	CAC	2	6	184204	184209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320045
3088	NC_009443	TCA	2	6	184221	184226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320045
3089	NC_009443	CCA	2	6	184299	184304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320045
3090	NC_009443	T	6	6	184378	184383	0 %	100 %	0 %	0 %	146320045
3091	NC_009443	TGATT	2	10	184503	184512	20 %	60 %	20 %	0 %	146320045
3092	NC_009443	TGG	2	6	184535	184540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320045
3093	NC_009443	TCT	2	6	184574	184579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320045
3094	NC_009443	GTC	2	6	184661	184666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320045
3095	NC_009443	TGT	2	6	184683	184688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320045
3096	NC_009443	GTT	2	6	184717	184722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320045
3097	NC_009443	AGT	2	6	184733	184738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320045
3098	NC_009443	CTGA	2	8	184741	184748	25 %	25 %	25 %	25 %	146320045
3099	NC_009443	GTT	2	6	184789	184794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320045
3100	NC_009443	GAA	2	6	184819	184824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320045
3101	NC_009443	CTT	2	6	184831	184836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320045
3102	NC_009443	TAGG	2	8	184845	184852	25 %	25 %	50 %	0 %	146320045
3103	NC_009443	ACC	2	6	184916	184921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320045
3104	NC_009443	ATTG	2	8	184971	184978	25 %	50 %	25 %	0 %	146320045
3105	NC_009443	GCA	2	6	185003	185008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320045
3106	NC_009443	GCT	2	6	185036	185041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320045
3107	NC_009443	GGA	2	6	185049	185054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320045
3108	NC_009443	CCA	2	6	185123	185128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320045
3109	NC_009443	GTA	2	6	185155	185160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320045
3110	NC_009443	GAT	2	6	185191	185196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320045
3111	NC_009443	GTT	2	6	185219	185224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320045
3112	NC_009443	CGT	2	6	185263	185268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320045
3113	NC_009443	AGCG	2	8	185306	185313	25 %	0 %	50 %	25 %	146320045
3114	NC_009443	CGAG	2	8	185459	185466	25 %	0 %	50 %	25 %	146320045
3115	NC_009443	AGT	2	6	185469	185474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320045
3116	NC_009443	CAGG	2	8	185526	185533	25 %	0 %	50 %	25 %	146320045
3117	NC_009443	TGA	2	6	185660	185665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320045
3118	NC_009443	GGA	2	6	185715	185720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320045
3119	NC_009443	TCTG	2	8	185738	185745	0 %	50 %	25 %	25 %	146320045
3120	NC_009443	ACC	2	6	185783	185788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320045
3121	NC_009443	GAA	2	6	185836	185841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320045
3122	NC_009443	TCAA	2	8	185888	185895	50 %	25 %	0 %	25 %	146320045
3123	NC_009443	GAG	2	6	185923	185928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320045
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3130	NC_009443	GAAA	2	8	186271	186278	75 %	0 %	25 %	0 %	146320045
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3134	NC_009443	AGA	2	6	186547	186552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320046
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3137	NC_009443	A	6	6	186775	186780	100 %	0 %	0 %	0 %	146320046
3138	NC_009443	CTTT	2	8	186820	186827	0 %	75 %	0 %	25 %	146320046
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3230	NC_009443	TA	3	6	192170	192175	50 %	50 %	0 %	0 %	146320049
3231	NC_009443	GAA	2	6	192220	192225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320049
3232	NC_009443	GCCA	2	8	192358	192365	25 %	0 %	25 %	50 %	146320050
3233	NC_009443	GAAAAA	2	12	192394	192405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146320050
3234	NC_009443	GCAG	2	8	192424	192431	25 %	0 %	50 %	25 %	146320050
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3237	NC_009443	CCAGA	2	10	192538	192547	40 %	0 %	20 %	40 %	146320050
3238	NC_009443	ATT	2	6	192600	192605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320050
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3240	NC_009443	TCAG	2	8	192687	192694	25 %	25 %	25 %	25 %	146320050
3241	NC_009443	TAT	2	6	193001	193006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320051
3242	NC_009443	TCA	2	6	193061	193066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320051
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3490	NC_009443	ATT	2	6	205484	205489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320062
3491	NC_009443	AGC	2	6	205513	205518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320062
3492	NC_009443	TAT	2	6	205585	205590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320062
3493	NC_009443	AAC	2	6	205624	205629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320062
3494	NC_009443	AGC	2	6	205636	205641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320062
3495	NC_009443	ATTG	2	8	205732	205739	25 %	50 %	25 %	0 %	146320062
3496	NC_009443	AGTT	2	8	205764	205771	25 %	50 %	25 %	0 %	146320062
3497	NC_009443	A	8	8	205812	205819	100 %	0 %	0 %	0 %	146320062
3498	NC_009443	GTT	2	6	205873	205878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320063
3499	NC_009443	AAAT	2	8	205889	205896	75 %	25 %	0 %	0 %	146320063
3500	NC_009443	GTT	2	6	205927	205932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320063

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