MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009443	TCAA	2	8	149182	149189	50 %	25 %	0 %	25 %	146320013
2502	NC_009443	TGA	2	6	149195	149200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
2503	NC_009443	TTG	2	6	149203	149208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320013
2504	NC_009443	CTGG	2	8	149261	149268	0 %	25 %	50 %	25 %	146320013
2505	NC_009443	GA	3	6	149303	149308	50 %	0 %	50 %	0 %	146320013
2506	NC_009443	GCC	2	6	149506	149511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146320013
2507	NC_009443	GAT	2	6	149550	149555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
2508	NC_009443	GACC	2	8	149594	149601	25 %	0 %	25 %	50 %	146320013
2509	NC_009443	AGG	2	6	149653	149658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320013
2510	NC_009443	CTT	2	6	149669	149674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320013
2511	NC_009443	GGC	2	6	149682	149687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320013
2512	NC_009443	CTG	2	6	149702	149707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320013
2513	NC_009443	ACG	2	6	149776	149781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320013
2514	NC_009443	GTGG	2	8	149805	149812	0 %	25 %	75 %	0 %	146320013
2515	NC_009443	GAA	2	6	149817	149822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320013
2516	NC_009443	TAT	2	6	149855	149860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320013
2517	NC_009443	GATT	2	8	149861	149868	25 %	50 %	25 %	0 %	146320013
2518	NC_009443	TTC	2	6	149901	149906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320013
2519	NC_009443	AAG	2	6	149974	149979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320013
2520	NC_009443	TAA	2	6	150014	150019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320013
2521	NC_009443	AGT	2	6	150059	150064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
2522	NC_009443	TCT	2	6	150097	150102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320013
2523	NC_009443	CGA	2	6	150122	150127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320013
2524	NC_009443	ACC	2	6	150183	150188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320013
2525	NC_009443	TGA	2	6	150228	150233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
2526	NC_009443	GAT	2	6	150287	150292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320014
2527	NC_009443	GGTT	2	8	150335	150342	0 %	50 %	50 %	0 %	146320014
2528	NC_009443	CCA	2	6	150344	150349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320014
2529	NC_009443	CG	3	6	150355	150360	0 %	0 %	50 %	50 %	146320014
2530	NC_009443	ATA	2	6	150361	150366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320014
2531	NC_009443	GCA	2	6	150385	150390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320014
2532	NC_009443	GTA	2	6	150473	150478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320014
2533	NC_009443	CTTT	2	8	150485	150492	0 %	75 %	0 %	25 %	146320014
2534	NC_009443	TGG	2	6	151126	151131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
2535	NC_009443	T	6	6	151208	151213	0 %	100 %	0 %	0 %	146320016
2536	NC_009443	GTGGCG	2	12	151296	151307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146320016
2537	NC_009443	TGG	2	6	151345	151350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
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2539	NC_009443	TGG	2	6	151396	151401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
2540	NC_009443	CCG	2	6	151418	151423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146320016
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2543	NC_009443	ACG	2	6	151776	151781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320017
2544	NC_009443	CAGT	2	8	151876	151883	25 %	25 %	25 %	25 %	146320017
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2548	NC_009443	ACT	2	6	152136	152141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320017
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2550	NC_009443	TGA	2	6	152185	152190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320017
2551	NC_009443	AGAT	2	8	152192	152199	50 %	25 %	25 %	0 %	146320017
2552	NC_009443	CCT	2	6	152218	152223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320018
2553	NC_009443	GCCA	2	8	152283	152290	25 %	0 %	25 %	50 %	146320018
2554	NC_009443	GCCA	2	8	152295	152302	25 %	0 %	25 %	50 %	146320018
2555	NC_009443	TGG	2	6	152312	152317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320018
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2560	NC_009443	GCT	2	6	152475	152480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320018
2561	NC_009443	GGC	2	6	152546	152551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320018
2562	NC_009443	GCGG	2	8	152552	152559	0 %	0 %	75 %	25 %	146320018
2563	NC_009443	GGAGTT	2	12	152564	152575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320018
2564	NC_009443	GAT	2	6	152667	152672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320018
2565	NC_009443	GGGTC	2	10	152699	152708	0 %	20 %	60 %	20 %	146320018
2566	NC_009443	TTTC	2	8	152815	152822	0 %	75 %	0 %	25 %	146320018
2567	NC_009443	CAG	2	6	152865	152870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320018
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2570	NC_009443	GCGG	2	8	152991	152998	0 %	0 %	75 %	25 %	146320018
2571	NC_009443	GCT	2	6	153033	153038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320018
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2574	NC_009443	TTGG	2	8	153303	153310	0 %	50 %	50 %	0 %	146320019
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2580	NC_009443	AGT	2	6	153446	153451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
2581	NC_009443	ATC	2	6	153480	153485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320019
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2583	NC_009443	T	6	6	153641	153646	0 %	100 %	0 %	0 %	146320019
2584	NC_009443	GAT	2	6	153647	153652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
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2587	NC_009443	CCTG	2	8	153742	153749	0 %	25 %	25 %	50 %	146320019
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2593	NC_009443	A	6	6	154152	154157	100 %	0 %	0 %	0 %	146320020
2594	NC_009443	GTTATA	2	12	154217	154228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320020
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2597	NC_009443	TAT	2	6	154275	154280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320020
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2600	NC_009443	CTG	2	6	154327	154332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
2601	NC_009443	AGT	2	6	154378	154383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
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2603	NC_009443	TGAA	2	8	154682	154689	50 %	25 %	25 %	0 %	146320020
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2606	NC_009443	GAT	2	6	154795	154800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
2607	NC_009443	AAG	2	6	154823	154828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320020
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2610	NC_009443	TATC	2	8	154911	154918	25 %	50 %	0 %	25 %	146320020
2611	NC_009443	TGG	2	6	154923	154928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320020
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2613	NC_009443	TGA	2	6	154941	154946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
2614	NC_009443	TAC	2	6	154993	154998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320020
2615	NC_009443	A	6	6	155015	155020	100 %	0 %	0 %	0 %	146320020
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2617	NC_009443	TGC	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
2618	NC_009443	CAAA	2	8	155357	155364	75 %	0 %	0 %	25 %	146320020
2619	NC_009443	TGG	2	6	155393	155398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320020
2620	NC_009443	AAC	2	6	155427	155432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320020
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2745	NC_009443	GAT	2	6	162921	162926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320028
2746	NC_009443	CACCT	2	10	162950	162959	20 %	20 %	0 %	60 %	146320028
2747	NC_009443	CTTA	2	8	162970	162977	25 %	50 %	0 %	25 %	146320028
2748	NC_009443	CA	3	6	163004	163009	50 %	0 %	0 %	50 %	146320028
2749	NC_009443	GTC	2	6	163060	163065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320028
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2763	NC_009443	CTTA	2	8	163773	163780	25 %	50 %	0 %	25 %	146320028
2764	NC_009443	TTG	2	6	163918	163923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320028
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2766	NC_009443	CT	3	6	163993	163998	0 %	50 %	0 %	50 %	146320028
2767	NC_009443	ATC	2	6	164033	164038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320028
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2778	NC_009443	GCT	2	6	164691	164696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320028
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2989	NC_009443	TTC	2	6	178936	178941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320041
2990	NC_009443	ATTT	2	8	178978	178985	25 %	75 %	0 %	0 %	146320041
2991	NC_009443	TGGT	2	8	179074	179081	0 %	50 %	50 %	0 %	146320041
2992	NC_009443	AGG	2	6	179112	179117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320041
2993	NC_009443	CTT	2	6	179165	179170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320041
2994	NC_009443	CTGG	2	8	179172	179179	0 %	25 %	50 %	25 %	146320041
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