MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009443	ACGAAT	2	12	59091	59102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146319904
1002	NC_009443	TTTC	2	8	59116	59123	0 %	75 %	0 %	25 %	146319904
1003	NC_009443	AGA	2	6	59190	59195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319904
1004	NC_009443	GCT	2	6	59218	59223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319904
1005	NC_009443	TCA	2	6	59227	59232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319904
1006	NC_009443	T	6	6	59268	59273	0 %	100 %	0 %	0 %	146319904
1007	NC_009443	AGG	2	6	59483	59488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319905
1008	NC_009443	TCAT	2	8	59603	59610	25 %	50 %	0 %	25 %	146319905
1009	NC_009443	C	6	6	59699	59704	0 %	0 %	0 %	100 %	146319905
1010	NC_009443	CAGC	2	8	59739	59746	25 %	0 %	25 %	50 %	146319905
1011	NC_009443	CAA	2	6	59878	59883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319905
1012	NC_009443	TAG	2	6	59897	59902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319905
1013	NC_009443	GGA	2	6	59914	59919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319905
1014	NC_009443	TTA	2	6	59992	59997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319905
1015	NC_009443	AGCAG	2	10	60018	60027	40 %	0 %	40 %	20 %	146319905
1016	NC_009443	GTC	2	6	60058	60063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319905
1017	NC_009443	CTGG	2	8	60214	60221	0 %	25 %	50 %	25 %	146319905
1018	NC_009443	AAG	2	6	60230	60235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319905
1019	NC_009443	CAA	2	6	60313	60318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319905
1020	NC_009443	TGGA	2	8	60383	60390	25 %	25 %	50 %	0 %	146319905
1021	NC_009443	AAG	2	6	60440	60445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319905
1022	NC_009443	ATT	2	6	60504	60509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319905
1023	NC_009443	AGA	2	6	60510	60515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319905
1024	NC_009443	ATG	2	6	60557	60562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319905
1025	NC_009443	AGA	2	6	60624	60629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319905
1026	NC_009443	AGCA	2	8	60640	60647	50 %	0 %	25 %	25 %	146319905
1027	NC_009443	CT	4	8	60669	60676	0 %	50 %	0 %	50 %	146319905
1028	NC_009443	TCG	2	6	60693	60698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319905
1029	NC_009443	A	6	6	60706	60711	100 %	0 %	0 %	0 %	146319905
1030	NC_009443	ATGGCA	2	12	61145	61156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319907
1031	NC_009443	TTA	2	6	61199	61204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319907
1032	NC_009443	TACT	2	8	61208	61215	25 %	50 %	0 %	25 %	146319907
1033	NC_009443	GGA	2	6	61235	61240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319907
1034	NC_009443	TCC	2	6	61260	61265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319907
1035	NC_009443	GT	3	6	61436	61441	0 %	50 %	50 %	0 %	146319908
1036	NC_009443	TGA	2	6	61476	61481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319908
1037	NC_009443	TATT	2	8	61571	61578	25 %	75 %	0 %	0 %	146319908
1038	NC_009443	ATT	2	6	61620	61625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319908
1039	NC_009443	TCT	2	6	61644	61649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319908
1040	NC_009443	TTA	2	6	61668	61673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319908
1041	NC_009443	CAA	2	6	61708	61713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319908
1042	NC_009443	CTAT	2	8	61752	61759	25 %	50 %	0 %	25 %	146319908
1043	NC_009443	TTTC	2	8	61832	61839	0 %	75 %	0 %	25 %	146319908
1044	NC_009443	TAT	2	6	61874	61879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319908
1045	NC_009443	TAT	2	6	61905	61910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319908
1046	NC_009443	TTC	2	6	61943	61948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319908
1047	NC_009443	TGA	2	6	61989	61994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319908
1048	NC_009443	AGA	2	6	62001	62006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319908
1049	NC_009443	CGT	2	6	62023	62028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319908
1050	NC_009443	TTCT	2	8	62032	62039	0 %	75 %	0 %	25 %	146319908
1051	NC_009443	TAT	2	6	62061	62066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319908
1052	NC_009443	TGA	2	6	62139	62144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319908
1053	NC_009443	ACAA	2	8	62145	62152	75 %	0 %	0 %	25 %	146319908
1054	NC_009443	ATA	2	6	62180	62185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319908
1055	NC_009443	ATCT	2	8	62194	62201	25 %	50 %	0 %	25 %	146319908
1056	NC_009443	CTG	2	6	62219	62224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319908
1057	NC_009443	TAC	2	6	62232	62237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319908
1058	NC_009443	GAC	2	6	62260	62265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319908
1059	NC_009443	GTC	2	6	62317	62322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319908
1060	NC_009443	GAAT	2	8	62418	62425	50 %	25 %	25 %	0 %	146319908
1061	NC_009443	ATG	2	6	62542	62547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319909
1062	NC_009443	ATT	2	6	62554	62559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319909
1063	NC_009443	CCAG	2	8	62614	62621	25 %	0 %	25 %	50 %	146319909
1064	NC_009443	TGG	2	6	62636	62641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319909
1065	NC_009443	TGA	2	6	62742	62747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319909
1066	NC_009443	CCG	2	6	62763	62768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319909
1067	NC_009443	CCA	2	6	62774	62779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319909
1068	NC_009443	A	6	6	62787	62792	100 %	0 %	0 %	0 %	146319909
1069	NC_009443	GCCCT	2	10	62839	62848	0 %	20 %	20 %	60 %	146319909
1070	NC_009443	GTCA	2	8	62860	62867	25 %	25 %	25 %	25 %	146319909
1071	NC_009443	GGT	2	6	62926	62931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319909
1072	NC_009443	GTC	2	6	62957	62962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319909
1073	NC_009443	ATTT	2	8	62990	62997	25 %	75 %	0 %	0 %	146319909
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1080	NC_009443	T	6	6	63327	63332	0 %	100 %	0 %	0 %	146319909
1081	NC_009443	AG	3	6	63616	63621	50 %	0 %	50 %	0 %	146319909
1082	NC_009443	TAT	2	6	63631	63636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319909
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1087	NC_009443	TATT	2	8	63907	63914	25 %	75 %	0 %	0 %	146319909
1088	NC_009443	AG	3	6	63963	63968	50 %	0 %	50 %	0 %	146319909
1089	NC_009443	TAC	2	6	63982	63987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319909
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1091	NC_009443	GAA	2	6	64120	64125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319909
1092	NC_009443	GAAG	2	8	64170	64177	50 %	0 %	50 %	0 %	146319909
1093	NC_009443	TCAA	2	8	64237	64244	50 %	25 %	0 %	25 %	146319909
1094	NC_009443	CAT	2	6	64266	64271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319909
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1096	NC_009443	GAT	2	6	64312	64317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319909
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1098	NC_009443	A	6	6	64421	64426	100 %	0 %	0 %	0 %	146319909
1099	NC_009443	AAG	2	6	64645	64650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319910
1100	NC_009443	TCA	2	6	64664	64669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319910
1101	NC_009443	CAA	2	6	64765	64770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319910
1102	NC_009443	TAT	2	6	64781	64786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319910
1103	NC_009443	TGA	2	6	64793	64798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319910
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1105	NC_009443	TACC	2	8	64838	64845	25 %	25 %	0 %	50 %	146319910
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1108	NC_009443	CAA	2	6	64941	64946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319910
1109	NC_009443	GAA	2	6	64977	64982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319910
1110	NC_009443	TGA	2	6	65101	65106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319910
1111	NC_009443	TAA	2	6	65109	65114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319910
1112	NC_009443	CAA	2	6	65862	65867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319911
1113	NC_009443	ATG	2	6	65888	65893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319911
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1115	NC_009443	TTGCT	2	10	65938	65947	0 %	60 %	20 %	20 %	146319911
1116	NC_009443	T	6	6	66015	66020	0 %	100 %	0 %	0 %	146319911
1117	NC_009443	CAT	2	6	66090	66095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319911
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1121	NC_009443	CTGT	2	8	66314	66321	0 %	50 %	25 %	25 %	146319911
1122	NC_009443	TGAA	2	8	66353	66360	50 %	25 %	25 %	0 %	146319911
1123	NC_009443	GAA	2	6	66364	66369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319911
1124	NC_009443	GAAA	2	8	66383	66390	75 %	0 %	25 %	0 %	146319911
1125	NC_009443	GAGC	2	8	66408	66415	25 %	0 %	50 %	25 %	146319912
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