MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009443	GAA	2	6	320821	320826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5502	NC_009443	ATCACT	2	12	320910	320921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320174
5503	NC_009443	AAG	2	6	320956	320961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5504	NC_009443	AGA	2	6	320980	320985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5505	NC_009443	TAC	2	6	321005	321010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320174
5506	NC_009443	AGA	2	6	321088	321093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5507	NC_009443	GAA	2	6	321104	321109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5508	NC_009443	TGA	2	6	321112	321117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320174
5509	NC_009443	ATT	2	6	321122	321127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320174
5510	NC_009443	GAA	2	6	321131	321136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5511	NC_009443	AGA	2	6	321160	321165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5512	NC_009443	AGA	2	6	321181	321186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5513	NC_009443	ATG	2	6	321270	321275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320174
5514	NC_009443	AGCA	2	8	321277	321284	50 %	0 %	25 %	25 %	146320174
5515	NC_009443	GTT	2	6	321287	321292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320174
5516	NC_009443	AGA	2	6	321343	321348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5517	NC_009443	A	6	6	321513	321518	100 %	0 %	0 %	0 %	146320175
5518	NC_009443	GAA	2	6	321557	321562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320175
5519	NC_009443	TGGA	2	8	321681	321688	25 %	25 %	50 %	0 %	146320175
5520	NC_009443	CGA	2	6	321751	321756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320175
5521	NC_009443	GAA	2	6	321773	321778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320175
5522	NC_009443	GAT	2	6	321779	321784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320175
5523	NC_009443	AAG	2	6	321803	321808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320175
5524	NC_009443	TGA	3	9	321835	321843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320175
5525	NC_009443	ATG	2	6	321861	321866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320175
5526	NC_009443	ATC	2	6	321901	321906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320175
5527	NC_009443	GAT	2	6	321914	321919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320175
5528	NC_009443	GTT	2	6	322288	322293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577512
5529	NC_009443	AGC	2	6	322317	322322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5530	NC_009443	GAA	2	6	322341	322346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577512
5531	NC_009443	ACA	2	6	322525	322530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229577512
5532	NC_009443	TCC	2	6	322550	322555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577512
5533	NC_009443	CA	3	6	322604	322609	50 %	0 %	0 %	50 %	229577512
5534	NC_009443	TAC	2	6	322650	322655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577512
5535	NC_009443	TCA	3	9	322667	322675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577512
5536	NC_009443	GTGG	2	8	322681	322688	0 %	25 %	75 %	0 %	229577512
5537	NC_009443	ACA	2	6	322780	322785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229577512
5538	NC_009443	AGC	2	6	322803	322808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5539	NC_009443	CAACA	2	10	322829	322838	60 %	0 %	0 %	40 %	229577512
5540	NC_009443	AGC	2	6	322898	322903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5541	NC_009443	CTG	2	6	322904	322909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5542	NC_009443	CAG	2	6	323069	323074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5543	NC_009443	A	6	6	323122	323127	100 %	0 %	0 %	0 %	229577512
5544	NC_009443	ATG	2	6	323216	323221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577512
5545	NC_009443	CAG	2	6	323261	323266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5546	NC_009443	TGG	2	6	323313	323318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577512
5547	NC_009443	CACGT	2	10	323432	323441	20 %	20 %	20 %	40 %	229577512
5548	NC_009443	ATT	2	6	323497	323502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577512
5549	NC_009443	CAT	2	6	323505	323510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577512
5550	NC_009443	AGG	2	6	323538	323543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577512
5551	NC_009443	CAAG	2	8	323567	323574	50 %	0 %	25 %	25 %	229577512
5552	NC_009443	GCT	2	6	323599	323604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5553	NC_009443	AAG	2	6	323615	323620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577512
5554	NC_009443	CATCGT	2	12	323635	323646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229577512
5555	NC_009443	TAA	2	6	323655	323660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577512
5556	NC_009443	GTTTT	2	10	323690	323699	0 %	80 %	20 %	0 %	229577512
5557	NC_009443	TTG	2	6	323735	323740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577512
5558	NC_009443	TTC	2	6	323758	323763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577512
5559	NC_009443	TGCC	2	8	323766	323773	0 %	25 %	25 %	50 %	229577512
5560	NC_009443	CAG	2	6	323837	323842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577512
5561	NC_009443	CAG	2	6	324476	324481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320177
5562	NC_009443	AGC	2	6	324495	324500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320177
5563	NC_009443	TGG	2	6	324522	324527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320177
5564	NC_009443	ACAA	2	8	324535	324542	75 %	0 %	0 %	25 %	146320177
5565	NC_009443	GCA	2	6	324571	324576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320177
5566	NC_009443	GGT	2	6	324634	324639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320177
5567	NC_009443	TTGA	2	8	324670	324677	25 %	50 %	25 %	0 %	146320177
5568	NC_009443	AGA	2	6	324798	324803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320177
5569	NC_009443	GCAAAA	2	12	324811	324822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	146320177
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5571	NC_009443	GAA	2	6	324889	324894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320177
5572	NC_009443	GTAG	2	8	324904	324911	25 %	25 %	50 %	0 %	146320177
5573	NC_009443	GCA	2	6	324973	324978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320177
5574	NC_009443	CTTGAC	2	12	325024	325035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320177
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5581	NC_009443	TGAT	2	8	325852	325859	25 %	50 %	25 %	0 %	146320178
5582	NC_009443	A	6	6	325869	325874	100 %	0 %	0 %	0 %	146320178
5583	NC_009443	TAA	2	6	325923	325928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320178
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5588	NC_009443	TAAGGC	2	12	332242	332253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320180
5589	NC_009443	TTA	2	6	332387	332392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320180
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5591	NC_009443	AGA	2	6	332482	332487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320180
5592	NC_009443	ATT	2	6	332524	332529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320180
5593	NC_009443	CAA	2	6	332563	332568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320180
5594	NC_009443	ATG	2	6	332601	332606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320180
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5599	NC_009443	TTGGT	2	10	333009	333018	0 %	60 %	40 %	0 %	146320180
5600	NC_009443	ATG	2	6	333098	333103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320180
5601	NC_009443	ATT	2	6	333164	333169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320180
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5603	NC_009443	TTGG	2	8	333244	333251	0 %	50 %	50 %	0 %	146320180
5604	NC_009443	TTTAT	2	10	333279	333288	20 %	80 %	0 %	0 %	146320180
5605	NC_009443	GAA	2	6	333302	333307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320180
5606	NC_009443	GAA	2	6	333406	333411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320180
5607	NC_009443	CAT	2	6	333427	333432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320180
5608	NC_009443	TTA	2	6	333522	333527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320180
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5611	NC_009443	AAT	2	6	334159	334164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320181
5612	NC_009443	AGTG	2	8	334267	334274	25 %	25 %	50 %	0 %	146320181
5613	NC_009443	CAG	2	6	334365	334370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320181
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5615	NC_009443	TGG	2	6	334446	334451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320181
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5983	NC_009443	TCC	2	6	355326	355331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320207
5984	NC_009443	CAAG	2	8	355352	355359	50 %	0 %	25 %	25 %	146320207
5985	NC_009443	GAA	2	6	355407	355412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320207
5986	NC_009443	GCA	2	6	355433	355438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320208
5987	NC_009443	A	6	6	355470	355475	100 %	0 %	0 %	0 %	146320208
5988	NC_009443	GC	3	6	355496	355501	0 %	0 %	50 %	50 %	146320208
5989	NC_009443	GGC	2	6	355528	355533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320208
5990	NC_009443	A	6	6	355568	355573	100 %	0 %	0 %	0 %	146320208
5991	NC_009443	AGC	2	6	355582	355587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320208
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5993	NC_009443	ATA	2	6	355680	355685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320208
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5998	NC_009443	GGGGC	2	10	355781	355790	0 %	0 %	80 %	20 %	146320208
5999	NC_009443	CGT	2	6	355871	355876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320208
6000	NC_009443	AAG	2	6	355943	355948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320208

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