MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009443	GTG	2	6	292177	292182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320143
5002	NC_009443	ACA	2	6	292209	292214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320143
5003	NC_009443	CCAG	2	8	292259	292266	25 %	0 %	25 %	50 %	146320143
5004	NC_009443	ACA	2	6	292312	292317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320143
5005	NC_009443	GACA	2	8	292340	292347	50 %	0 %	25 %	25 %	146320143
5006	NC_009443	GCA	2	6	292353	292358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320143
5007	NC_009443	TCGACA	2	12	292390	292401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146320143
5008	NC_009443	GAA	2	6	292491	292496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320143
5009	NC_009443	ATG	2	6	292506	292511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320143
5010	NC_009443	GAA	2	6	292554	292559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320143
5011	NC_009443	CCAAGC	2	12	292652	292663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320143
5012	NC_009443	TGA	2	6	292670	292675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320143
5013	NC_009443	AGC	2	6	292682	292687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320143
5014	NC_009443	AAC	2	6	292698	292703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320143
5015	NC_009443	GAC	2	6	292707	292712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320143
5016	NC_009443	AAGCCC	2	12	292744	292755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320143
5017	NC_009443	GCA	3	9	292782	292790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320143
5018	NC_009443	CAA	2	6	292791	292796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320143
5019	NC_009443	AAG	2	6	292810	292815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320143
5020	NC_009443	GAT	3	9	292839	292847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320143
5021	NC_009443	AGT	2	6	292873	292878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320143
5022	NC_009443	TG	3	6	293221	293226	0 %	50 %	50 %	0 %	146320144
5023	NC_009443	AAG	2	6	293372	293377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320145
5024	NC_009443	GGA	2	6	293434	293439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320145
5025	NC_009443	AGG	2	6	293448	293453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320145
5026	NC_009443	AGG	2	6	293457	293462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320145
5027	NC_009443	CTG	2	6	293517	293522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320145
5028	NC_009443	CGG	2	6	293539	293544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320145
5029	NC_009443	TGG	2	6	293560	293565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320145
5030	NC_009443	TGG	2	6	293617	293622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320145
5031	NC_009443	GGT	2	6	293624	293629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320145
5032	NC_009443	GAT	2	6	293663	293668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320145
5033	NC_009443	GAA	2	6	293696	293701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320145
5034	NC_009443	CGT	2	6	293864	293869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320145
5035	NC_009443	TGTC	2	8	293884	293891	0 %	50 %	25 %	25 %	146320145
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5039	NC_009443	AGC	2	6	294346	294351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320145
5040	NC_009443	A	6	6	294398	294403	100 %	0 %	0 %	0 %	146320145
5041	NC_009443	T	6	6	294407	294412	0 %	100 %	0 %	0 %	146320145
5042	NC_009443	GAT	2	6	294894	294899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320146
5043	NC_009443	CAGG	2	8	294946	294953	25 %	0 %	50 %	25 %	146320146
5044	NC_009443	TAT	2	6	294963	294968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320146
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5047	NC_009443	GT	3	6	295253	295258	0 %	50 %	50 %	0 %	146320146
5048	NC_009443	GTG	2	6	295285	295290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320146
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5050	NC_009443	GGTC	2	8	295383	295390	0 %	25 %	50 %	25 %	146320146
5051	NC_009443	GGA	2	6	295404	295409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320146
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5053	NC_009443	TCG	2	6	295474	295479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320146
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5055	NC_009443	TCAA	2	8	295595	295602	50 %	25 %	0 %	25 %	146320147
5056	NC_009443	AGCA	2	8	295684	295691	50 %	0 %	25 %	25 %	146320147
5057	NC_009443	GAA	2	6	295696	295701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320147
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5059	NC_009443	AGA	2	6	295722	295727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320147
5060	NC_009443	TTG	2	6	295762	295767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320147
5061	NC_009443	TCT	2	6	295801	295806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320147
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5065	NC_009443	TGG	2	6	295989	295994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320147
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5069	NC_009443	TGG	3	9	296058	296066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320147
5070	NC_009443	CCT	2	6	296084	296089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320147
5071	NC_009443	TGGC	2	8	296154	296161	0 %	25 %	50 %	25 %	146320147
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5077	NC_009443	TGA	2	6	296456	296461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320147
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5085	NC_009443	A	6	6	297137	297142	100 %	0 %	0 %	0 %	146320148
5086	NC_009443	CT	3	6	297156	297161	0 %	50 %	0 %	50 %	146320148
5087	NC_009443	GCA	2	6	297182	297187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320148
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5091	NC_009443	CTT	2	6	297300	297305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320148
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5099	NC_009443	TGG	3	9	297601	297609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320148
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5101	NC_009443	A	6	6	297870	297875	100 %	0 %	0 %	0 %	146320148
5102	NC_009443	GGCA	2	8	298110	298117	25 %	0 %	50 %	25 %	146320149
5103	NC_009443	AG	3	6	298139	298144	50 %	0 %	50 %	0 %	146320149
5104	NC_009443	CTATCC	2	12	298181	298192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146320149
5105	NC_009443	T	6	6	298226	298231	0 %	100 %	0 %	0 %	146320149
5106	NC_009443	GTTG	2	8	298269	298276	0 %	50 %	50 %	0 %	146320149
5107	NC_009443	TC	3	6	298292	298297	0 %	50 %	0 %	50 %	146320149
5108	NC_009443	TTC	2	6	298320	298325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320149
5109	NC_009443	TAT	2	6	298387	298392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320149
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5112	NC_009443	CCA	2	6	298553	298558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320149
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5121	NC_009443	TCT	2	6	299350	299355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320151
5122	NC_009443	CTA	2	6	299408	299413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320151
5123	NC_009443	AATC	2	8	299424	299431	50 %	25 %	0 %	25 %	146320151
5124	NC_009443	CCAG	2	8	299527	299534	25 %	0 %	25 %	50 %	146320151
5125	NC_009443	TAA	2	6	299559	299564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320151
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5131	NC_009443	GAT	2	6	299900	299905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320152
5132	NC_009443	TGA	2	6	299914	299919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320152
5133	NC_009443	AG	3	6	299936	299941	50 %	0 %	50 %	0 %	146320152
5134	NC_009443	CATAG	2	10	300023	300032	40 %	20 %	20 %	20 %	146320152
5135	NC_009443	CGT	2	6	300061	300066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320152
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5138	NC_009443	GCT	2	6	300262	300267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320152
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5141	NC_009443	CAT	2	6	300316	300321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320152
5142	NC_009443	CAG	2	6	300385	300390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320152
5143	NC_009443	CCA	2	6	300463	300468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320152
5144	NC_009443	TCT	2	6	300486	300491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320152
5145	NC_009443	AAC	2	6	300581	300586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320152
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5149	NC_009443	AGG	2	6	300870	300875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320152
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5152	NC_009443	GCCA	2	8	301076	301083	25 %	0 %	25 %	50 %	146320152
5153	NC_009443	TGA	2	6	301144	301149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320152
5154	NC_009443	AGG	2	6	301191	301196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320152
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5158	NC_009443	TTC	2	6	301322	301327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320152
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5162	NC_009443	AGC	2	6	301403	301408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320152
5163	NC_009443	GACA	2	8	301427	301434	50 %	0 %	25 %	25 %	146320152
5164	NC_009443	CCTT	2	8	301464	301471	0 %	50 %	0 %	50 %	146320152
5165	NC_009443	TGA	2	6	301588	301593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320152
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5187	NC_009443	GGCA	2	8	303119	303126	25 %	0 %	50 %	25 %	146320154
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5230	NC_009443	CAAA	2	8	305386	305393	75 %	0 %	0 %	25 %	146320159
5231	NC_009443	TCA	2	6	305410	305415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320159
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5234	NC_009443	TAT	2	6	305864	305869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320160
5235	NC_009443	ACT	2	6	305906	305911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320160
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5237	NC_009443	TGAG	2	8	305978	305985	25 %	25 %	50 %	0 %	146320160
5238	NC_009443	AGA	2	6	306036	306041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320160
5239	NC_009443	TCG	2	6	306042	306047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320160
5240	NC_009443	TCA	2	6	306181	306186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320160
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5242	NC_009443	AGA	2	6	306411	306416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320160
5243	NC_009443	CAT	2	6	306432	306437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320160
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5351	NC_009443	AGT	2	6	312902	312907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320168
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5361	NC_009443	A	7	7	313693	313699	100 %	0 %	0 %	0 %	146320169
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5484	NC_009443	CA	3	6	320174	320179	50 %	0 %	0 %	50 %	146320174
5485	NC_009443	AGA	2	6	320182	320187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
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5487	NC_009443	TCT	2	6	320238	320243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320174
5488	NC_009443	CGG	2	6	320244	320249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320174
5489	NC_009443	AGG	2	6	320311	320316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320174
5490	NC_009443	AAGA	2	8	320336	320343	75 %	0 %	25 %	0 %	146320174
5491	NC_009443	AGA	2	6	320353	320358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
5492	NC_009443	CTT	2	6	320378	320383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320174
5493	NC_009443	GAA	2	6	320399	320404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320174
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5500	NC_009443	CAG	2	6	320790	320795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320174

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