MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 1333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	146319849
2	NC_009442	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	146319849
3	NC_009442	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	146317665
4	NC_009442	AAACA	2	10	5722	5731	80 %	0 %	0 %	20 %	146317669
5	NC_009442	TGTCT	2	10	6113	6122	0 %	60 %	20 %	20 %	146317669
6	NC_009442	GAGAT	2	10	6831	6840	40 %	20 %	40 %	0 %	146317670
7	NC_009442	TGAAA	2	10	9968	9977	60 %	20 %	20 %	0 %	146317671
8	NC_009442	CTATT	2	10	11205	11214	20 %	60 %	0 %	20 %	146317674
9	NC_009442	CTTTG	2	10	13434	13443	0 %	60 %	20 %	20 %	146317676
10	NC_009442	AACAG	2	10	13878	13887	60 %	0 %	20 %	20 %	146317677
11	NC_009442	CTTGT	2	10	15034	15043	0 %	60 %	20 %	20 %	146317677
12	NC_009442	AATGC	2	10	25407	25416	40 %	20 %	20 %	20 %	146317680
13	NC_009442	CTACG	2	10	30757	30766	20 %	20 %	20 %	40 %	146317686
14	NC_009442	GAACG	2	10	33043	33052	40 %	0 %	40 %	20 %	146317687
15	NC_009442	AAACC	2	10	33179	33188	60 %	0 %	0 %	40 %	146317687
16	NC_009442	ATTCT	2	10	34526	34535	20 %	60 %	0 %	20 %	146317687
17	NC_009442	GCCAT	2	10	35001	35010	20 %	20 %	20 %	40 %	146317687
18	NC_009442	AAATG	2	10	36087	36096	60 %	20 %	20 %	0 %	146317688
19	NC_009442	AGCAG	2	10	38719	38728	40 %	0 %	40 %	20 %	146317692
20	NC_009442	CTATT	2	10	38944	38953	20 %	60 %	0 %	20 %	146317692
21	NC_009442	CTATT	2	10	41506	41515	20 %	60 %	0 %	20 %	146317694
22	NC_009442	AGCGG	2	10	45792	45801	20 %	0 %	60 %	20 %	146317699
23	NC_009442	TTAGT	2	10	47408	47417	20 %	60 %	20 %	0 %	146317701
24	NC_009442	GAAGT	2	10	48055	48064	40 %	20 %	40 %	0 %	146317703
25	NC_009442	TTATC	2	10	48186	48195	20 %	60 %	0 %	20 %	146317703
26	NC_009442	TAATC	2	10	48294	48303	40 %	40 %	0 %	20 %	146317703
27	NC_009442	TCAAT	2	10	48553	48562	40 %	40 %	0 %	20 %	146317704
28	NC_009442	TTATT	2	10	48806	48815	20 %	80 %	0 %	0 %	146317704
29	NC_009442	GAGAA	2	10	52307	52316	60 %	0 %	40 %	0 %	146317709
30	NC_009442	GCAGA	2	10	53788	53797	40 %	0 %	40 %	20 %	146317711
31	NC_009442	GGGCT	2	10	54259	54268	0 %	20 %	60 %	20 %	146317711
32	NC_009442	TGAAT	2	10	55882	55891	40 %	40 %	20 %	0 %	146317713
33	NC_009442	AGCAG	2	10	60022	60031	40 %	0 %	40 %	20 %	146317716
34	NC_009442	GCCCT	2	10	62844	62853	0 %	20 %	20 %	60 %	146317719
35	NC_009442	TTGCT	2	10	65943	65952	0 %	60 %	20 %	20 %	146317721
36	NC_009442	AGTCA	2	10	67829	67838	40 %	20 %	20 %	20 %	146317723
37	NC_009442	GTATC	2	10	69230	69239	20 %	40 %	20 %	20 %	146317725
38	NC_009442	TGGAT	2	10	71224	71233	20 %	40 %	40 %	0 %	146317729
39	NC_009442	AAATT	2	10	72326	72335	60 %	40 %	0 %	0 %	146317730
40	NC_009442	TGGCG	2	10	73333	73342	0 %	20 %	60 %	20 %	146317732
41	NC_009442	AAAAC	2	10	73893	73902	80 %	0 %	0 %	20 %	146317733
42	NC_009442	TACAC	2	10	74307	74316	40 %	20 %	0 %	40 %	146317734
43	NC_009442	GAAAA	2	10	75186	75195	80 %	0 %	20 %	0 %	162139882
44	NC_009442	GTCTT	2	10	75474	75483	0 %	60 %	20 %	20 %	146317736
45	NC_009442	TTTGG	2	10	75605	75614	0 %	60 %	40 %	0 %	146317736
46	NC_009442	AGAAT	2	10	83725	83734	60 %	20 %	20 %	0 %	146317750
47	NC_009442	GAAAA	2	10	86050	86059	80 %	0 %	20 %	0 %	146317755
48	NC_009442	TGACT	2	10	86445	86454	20 %	40 %	20 %	20 %	146317755
49	NC_009442	TGTGA	2	10	94386	94395	20 %	40 %	40 %	0 %	146317758
50	NC_009442	TGCTT	2	10	95948	95957	0 %	60 %	20 %	20 %	146317760
51	NC_009442	TTGTT	2	10	97153	97162	0 %	80 %	20 %	0 %	146317762
52	NC_009442	TTTCA	2	10	99412	99421	20 %	60 %	0 %	20 %	146317765
53	NC_009442	CTTCG	2	10	99655	99664	0 %	40 %	20 %	40 %	146317765
54	NC_009442	AAAAT	2	10	99789	99798	80 %	20 %	0 %	0 %	146317765
55	NC_009442	TTTTC	2	10	100576	100585	0 %	80 %	0 %	20 %	146317766
56	NC_009442	TTTGG	2	10	102872	102881	0 %	60 %	40 %	0 %	146317769
57	NC_009442	ATTGC	2	10	103337	103346	20 %	40 %	20 %	20 %	146317769
58	NC_009442	GCTTT	2	10	103568	103577	0 %	60 %	20 %	20 %	146317770
59	NC_009442	AGAAA	2	10	104026	104035	80 %	0 %	20 %	0 %	146317770
60	NC_009442	GACTT	2	10	105605	105614	20 %	40 %	20 %	20 %	146317771
61	NC_009442	CTGGG	2	10	109828	109837	0 %	20 %	60 %	20 %	146317778
62	NC_009442	AAGAA	2	10	114480	114489	80 %	0 %	20 %	0 %	146317780
63	NC_009442	CCGTT	2	10	115523	115532	0 %	40 %	20 %	40 %	146317780
64	NC_009442	GGCCT	2	10	119063	119072	0 %	20 %	40 %	40 %	146317783
65	NC_009442	GTCAA	2	10	119160	119169	40 %	20 %	20 %	20 %	146317783
66	NC_009442	GCTTG	2	10	121011	121020	0 %	40 %	40 %	20 %	146317785
67	NC_009442	TGGTT	2	10	121139	121148	0 %	60 %	40 %	0 %	146317785
68	NC_009442	GGTCA	2	10	121438	121447	20 %	20 %	40 %	20 %	146317785
69	NC_009442	AAGGA	2	10	122528	122537	60 %	0 %	40 %	0 %	146317788
70	NC_009442	GGCAA	2	10	123087	123096	40 %	0 %	40 %	20 %	146317790
71	NC_009442	TTGGT	2	10	125477	125486	0 %	60 %	40 %	0 %	146317793
72	NC_009442	GAAAA	2	10	125939	125948	80 %	0 %	20 %	0 %	146317794
73	NC_009442	CCTTG	2	10	125992	126001	0 %	40 %	20 %	40 %	146317794
74	NC_009442	CTGGA	2	10	126880	126889	20 %	20 %	40 %	20 %	146317795
75	NC_009442	AGCAG	2	10	127236	127245	40 %	0 %	40 %	20 %	146317795
76	NC_009442	GCTCA	2	10	127344	127353	20 %	20 %	20 %	40 %	146317795
77	NC_009442	AATCA	2	10	127858	127867	60 %	20 %	0 %	20 %	146317796
78	NC_009442	AGGTG	2	10	128546	128555	20 %	20 %	60 %	0 %	146317796
79	NC_009442	ACTTT	2	10	132252	132261	20 %	60 %	0 %	20 %	146317802
80	NC_009442	TAGCG	2	10	135350	135359	20 %	20 %	40 %	20 %	146317807
81	NC_009442	ATCAA	2	10	136511	136520	60 %	20 %	0 %	20 %	146317809
82	NC_009442	CGTAT	2	10	137783	137792	20 %	40 %	20 %	20 %	146317810
83	NC_009442	ATCCA	2	10	137874	137883	40 %	20 %	0 %	40 %	146317810
84	NC_009442	CAAGA	2	10	138650	138659	60 %	0 %	20 %	20 %	146317810
85	NC_009442	AAGCT	2	10	139080	139089	40 %	20 %	20 %	20 %	146317810
86	NC_009442	AAGAA	2	10	141340	141349	80 %	0 %	20 %	0 %	146317812
87	NC_009442	GCAGT	2	10	141630	141639	20 %	20 %	40 %	20 %	146317812
88	NC_009442	ATCCA	2	10	141741	141750	40 %	20 %	0 %	40 %	146317812
89	NC_009442	TACGA	2	10	142242	142251	40 %	20 %	20 %	20 %	146317812
90	NC_009442	GTTTA	2	10	146238	146247	20 %	60 %	20 %	0 %	146317816
91	NC_009442	GCATG	2	10	147758	147767	20 %	20 %	40 %	20 %	146317818
92	NC_009442	AAAAT	2	10	148171	148180	80 %	20 %	0 %	0 %	146317818
93	NC_009442	GGGTC	2	10	152795	152804	0 %	20 %	60 %	20 %	146317824
94	NC_009442	TTTCA	2	10	153765	153774	20 %	60 %	0 %	20 %	146317825
95	NC_009442	AAAAG	2	10	154358	154367	80 %	0 %	20 %	0 %	146317826
96	NC_009442	TGGTC	2	10	156953	156962	0 %	40 %	40 %	20 %	146317829
97	NC_009442	GTCTT	2	10	157908	157917	0 %	60 %	20 %	20 %	146317830
98	NC_009442	TTGGA	2	10	160424	160433	20 %	40 %	40 %	0 %	146317832
99	NC_009442	TCATC	2	10	161297	161306	20 %	40 %	0 %	40 %	146317834
100	NC_009442	CTTGG	2	10	161466	161475	0 %	40 %	40 %	20 %	146317834
101	NC_009442	TTTTC	2	10	162485	162494	0 %	80 %	0 %	20 %	146317835
102	NC_009442	CACCT	2	10	163048	163057	20 %	20 %	0 %	60 %	146317835
103	NC_009442	AGACT	2	10	167834	167843	40 %	20 %	20 %	20 %	146317838
104	NC_009442	ATACA	2	10	173002	173011	60 %	20 %	0 %	20 %	146317845
105	NC_009442	GGTTT	2	10	175160	175169	0 %	60 %	40 %	0 %	146317846
106	NC_009442	TTATC	2	10	176037	176046	20 %	60 %	0 %	20 %	146317847
107	NC_009442	TCTGG	2	10	179472	179481	0 %	40 %	40 %	20 %	146317849
108	NC_009442	TTCAA	2	10	180012	180021	40 %	40 %	0 %	20 %	146317849
109	NC_009442	TGATT	2	10	184643	184652	20 %	60 %	20 %	0 %	146317853
110	NC_009442	GAAGC	2	10	186760	186769	40 %	0 %	40 %	20 %	146317854
111	NC_009442	GGAAA	2	10	192130	192139	60 %	0 %	40 %	0 %	146317857
112	NC_009442	CTGGT	2	10	192627	192636	0 %	40 %	40 %	20 %	146317858
113	NC_009442	CCAGA	2	10	192680	192689	40 %	0 %	20 %	40 %	146317858
114	NC_009442	AGCAG	2	10	194736	194745	40 %	0 %	40 %	20 %	146317862
115	NC_009442	TTTTG	2	10	196272	196281	0 %	80 %	20 %	0 %	146317866
116	NC_009442	GAACA	2	10	196307	196316	60 %	0 %	20 %	20 %	146317866
117	NC_009442	AAAAT	2	10	197125	197134	80 %	20 %	0 %	0 %	146317868
118	NC_009442	TTTTA	2	10	197496	197505	20 %	80 %	0 %	0 %	146317868
119	NC_009442	TGAAA	2	10	198661	198670	60 %	20 %	20 %	0 %	146317869
120	NC_009442	AAGGA	2	10	199313	199322	60 %	0 %	40 %	0 %	146317869
121	NC_009442	AGTAA	2	10	199784	199793	60 %	20 %	20 %	0 %	146317869
122	NC_009442	CAAGT	2	10	201542	201551	40 %	20 %	20 %	20 %	146317870
123	NC_009442	ATGGA	2	10	202212	202221	40 %	20 %	40 %	0 %	146317870
124	NC_009442	TTTGG	2	10	205329	205338	0 %	60 %	40 %	0 %	146317872
125	NC_009442	TCTAC	2	10	206109	206118	20 %	40 %	0 %	40 %	146317873
126	NC_009442	AATGT	2	10	206256	206265	40 %	40 %	20 %	0 %	146317873
127	NC_009442	AGCAG	2	10	210396	210405	40 %	0 %	40 %	20 %	146317878
128	NC_009442	GACCA	2	10	213226	213235	40 %	0 %	20 %	40 %	146317880
129	NC_009442	GTTTT	2	10	214335	214344	0 %	80 %	20 %	0 %	146317881
130	NC_009442	CCATA	2	10	214437	214446	40 %	20 %	0 %	40 %	146317882
131	NC_009442	ATGAC	2	10	215825	215834	40 %	20 %	20 %	20 %	146317884
132	NC_009442	AGCTC	2	10	217507	217516	20 %	20 %	20 %	40 %	146317885
133	NC_009442	TCCAA	2	10	220044	220053	40 %	20 %	0 %	40 %	146317887
134	NC_009442	AAAGA	2	10	222949	222958	80 %	0 %	20 %	0 %	146317889
135	NC_009442	AGGGC	2	10	226477	226486	20 %	0 %	60 %	20 %	146317892
136	NC_009442	AGCAG	2	10	226510	226519	40 %	0 %	40 %	20 %	146317892
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142	NC_009442	TTGGA	2	10	236901	236910	20 %	40 %	40 %	0 %	146317905
143	NC_009442	CTACT	2	10	238002	238011	20 %	40 %	0 %	40 %	146317906
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252	NC_009442	CAGGT	2	10	411177	411186	20 %	20 %	40 %	20 %	146318083
253	NC_009442	GGTTT	2	10	412338	412347	0 %	60 %	40 %	0 %	146318084
254	NC_009442	AGCCT	2	10	412855	412864	20 %	20 %	20 %	40 %	146318086
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257	NC_009442	TGGAT	2	10	416614	416623	20 %	40 %	40 %	0 %	146318090
258	NC_009442	AGCAG	2	10	417621	417630	40 %	0 %	40 %	20 %	146318091
259	NC_009442	TGTAT	2	10	420357	420366	20 %	60 %	20 %	0 %	146318094
260	NC_009442	TTAAT	2	10	427866	427875	40 %	60 %	0 %	0 %	146318097
261	NC_009442	CTTGA	2	10	428107	428116	20 %	40 %	20 %	20 %	146318097
262	NC_009442	ATAGT	2	10	428192	428201	40 %	40 %	20 %	0 %	146318097
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