MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009442	TGG	2	6	205276	205281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317872
3502	NC_009442	TTTGG	2	10	205329	205338	0 %	60 %	40 %	0 %	146317872
3503	NC_009442	TTA	2	6	205345	205350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317872
3504	NC_009442	AT	3	6	205382	205387	50 %	50 %	0 %	0 %	146317872
3505	NC_009442	TTC	2	6	205408	205413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317872
3506	NC_009442	ATT	2	6	205639	205644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317872
3507	NC_009442	AGC	2	6	205668	205673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317872
3508	NC_009442	TAT	2	6	205740	205745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317872
3509	NC_009442	AAC	2	6	205779	205784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317872
3510	NC_009442	AGC	2	6	205791	205796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317872
3511	NC_009442	ATTG	2	8	205887	205894	25 %	50 %	25 %	0 %	146317872
3512	NC_009442	AGTT	2	8	205919	205926	25 %	50 %	25 %	0 %	146317872
3513	NC_009442	A	8	8	205967	205974	100 %	0 %	0 %	0 %	146317872
3514	NC_009442	GTT	2	6	206028	206033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317873
3515	NC_009442	AAAT	2	8	206044	206051	75 %	25 %	0 %	0 %	146317873
3516	NC_009442	GTT	2	6	206082	206087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317873
3517	NC_009442	TCTAC	2	10	206109	206118	20 %	40 %	0 %	40 %	146317873
3518	NC_009442	TGA	2	6	206168	206173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317873
3519	NC_009442	TTG	2	6	206182	206187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317873
3520	NC_009442	GTT	2	6	206208	206213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317873
3521	NC_009442	CAA	2	6	206217	206222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317873
3522	NC_009442	ATT	2	6	206228	206233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317873
3523	NC_009442	TAC	2	6	206248	206253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317873
3524	NC_009442	AATGT	2	10	206256	206265	40 %	40 %	20 %	0 %	146317873
3525	NC_009442	ACTA	2	8	206471	206478	50 %	25 %	0 %	25 %	146317873
3526	NC_009442	TTGA	2	8	206499	206506	25 %	50 %	25 %	0 %	146317873
3527	NC_009442	A	6	6	206524	206529	100 %	0 %	0 %	0 %	146317873
3528	NC_009442	T	6	6	206534	206539	0 %	100 %	0 %	0 %	146317873
3529	NC_009442	A	7	7	206671	206677	100 %	0 %	0 %	0 %	146317873
3530	NC_009442	AT	3	6	206698	206703	50 %	50 %	0 %	0 %	146317873
3531	NC_009442	A	6	6	206734	206739	100 %	0 %	0 %	0 %	146317873
3532	NC_009442	AT	3	6	206782	206787	50 %	50 %	0 %	0 %	146317874
3533	NC_009442	GCA	2	6	206817	206822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317874
3534	NC_009442	TCTT	2	8	206839	206846	0 %	75 %	0 %	25 %	146317874
3535	NC_009442	CCT	2	6	206865	206870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317874
3536	NC_009442	AT	3	6	206911	206916	50 %	50 %	0 %	0 %	146317874
3537	NC_009442	AGG	2	6	206976	206981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317874
3538	NC_009442	ATTG	2	8	206995	207002	25 %	50 %	25 %	0 %	146317874
3539	NC_009442	GTT	2	6	207110	207115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317874
3540	NC_009442	ATTG	2	8	207145	207152	25 %	50 %	25 %	0 %	146317874
3541	NC_009442	TCGG	2	8	207154	207161	0 %	25 %	50 %	25 %	146317874
3542	NC_009442	GAAA	2	8	207195	207202	75 %	0 %	25 %	0 %	146317874
3543	NC_009442	CAG	2	6	207225	207230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317874
3544	NC_009442	GCTT	2	8	207244	207251	0 %	50 %	25 %	25 %	146317874
3545	NC_009442	ATT	2	6	207287	207292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317874
3546	NC_009442	TGT	2	6	207324	207329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317874
3547	NC_009442	A	7	7	207483	207489	100 %	0 %	0 %	0 %	146317874
3548	NC_009442	A	6	6	207495	207500	100 %	0 %	0 %	0 %	146317874
3549	NC_009442	GAAG	2	8	207556	207563	50 %	0 %	50 %	0 %	146317874
3550	NC_009442	ACA	2	6	207700	207705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317874
3551	NC_009442	A	7	7	207705	207711	100 %	0 %	0 %	0 %	146317874
3552	NC_009442	AAT	2	6	207801	207806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317874
3553	NC_009442	TAG	2	6	207943	207948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317875
3554	NC_009442	A	6	6	207964	207969	100 %	0 %	0 %	0 %	146317875
3555	NC_009442	AAT	2	6	207971	207976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317875
3556	NC_009442	TAA	2	6	208017	208022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317875
3557	NC_009442	A	8	8	208034	208041	100 %	0 %	0 %	0 %	146317875
3558	NC_009442	GATT	2	8	208120	208127	25 %	50 %	25 %	0 %	146317875
3559	NC_009442	TTA	2	6	208257	208262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317875
3560	NC_009442	GAA	2	6	208268	208273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317875
3561	NC_009442	TGG	2	6	208354	208359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317875
3562	NC_009442	AGA	2	6	208504	208509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317875
3563	NC_009442	ATT	2	6	208518	208523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317875
3564	NC_009442	A	7	7	208559	208565	100 %	0 %	0 %	0 %	146317875
3565	NC_009442	CAT	2	6	208592	208597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317875
3566	NC_009442	TCTA	3	12	208676	208687	25 %	50 %	0 %	25 %	146317875
3567	NC_009442	ATTGCC	2	12	209215	209226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146317876
3568	NC_009442	TGC	2	6	209380	209385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317876
3569	NC_009442	ACCA	2	8	209423	209430	50 %	0 %	0 %	50 %	146317876
3570	NC_009442	TGA	2	6	209559	209564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317876
3571	NC_009442	AAG	2	6	209604	209609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317876
3572	NC_009442	ATA	2	6	209687	209692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317876
3573	NC_009442	TGA	2	6	209713	209718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317876
3574	NC_009442	A	7	7	209750	209756	100 %	0 %	0 %	0 %	146317876
3575	NC_009442	TCAA	2	8	209786	209793	50 %	25 %	0 %	25 %	146317876
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3581	NC_009442	CTT	2	6	209976	209981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317877
3582	NC_009442	TGCC	2	8	210036	210043	0 %	25 %	25 %	50 %	146317878
3583	NC_009442	GT	3	6	210045	210050	0 %	50 %	50 %	0 %	146317878
3584	NC_009442	GACA	2	8	210210	210217	50 %	0 %	25 %	25 %	146317878
3585	NC_009442	CTA	2	6	210230	210235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317878
3586	NC_009442	GCA	2	6	210262	210267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317878
3587	NC_009442	CAG	2	6	210317	210322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317878
3588	NC_009442	GCCA	2	8	210346	210353	25 %	0 %	25 %	50 %	146317878
3589	NC_009442	AGCAG	2	10	210396	210405	40 %	0 %	40 %	20 %	146317878
3590	NC_009442	ATCT	2	8	210409	210416	25 %	50 %	0 %	25 %	146317878
3591	NC_009442	AGCC	2	8	210516	210523	25 %	0 %	25 %	50 %	146317878
3592	NC_009442	CATTGC	2	12	210543	210554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146317878
3593	NC_009442	A	6	6	210641	210646	100 %	0 %	0 %	0 %	146317878
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3595	NC_009442	CCAA	2	8	210716	210723	50 %	0 %	0 %	50 %	146317878
3596	NC_009442	AGC	2	6	210936	210941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317878
3597	NC_009442	A	6	6	211008	211013	100 %	0 %	0 %	0 %	146317879
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3599	NC_009442	TAG	2	6	211059	211064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317879
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3601	NC_009442	CTGG	2	8	211112	211119	0 %	25 %	50 %	25 %	146317879
3602	NC_009442	AAG	2	6	211128	211133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317879
3603	NC_009442	GTT	2	6	211139	211144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317879
3604	NC_009442	GTT	2	6	211146	211151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317879
3605	NC_009442	ACT	2	6	211159	211164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317879
3606	NC_009442	TCTG	2	8	211179	211186	0 %	50 %	25 %	25 %	146317879
3607	NC_009442	T	6	6	211236	211241	0 %	100 %	0 %	0 %	146317879
3608	NC_009442	AGG	2	6	211360	211365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317879
3609	NC_009442	GGA	2	6	211445	211450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317879
3610	NC_009442	TGGA	2	8	211483	211490	25 %	25 %	50 %	0 %	146317879
3611	NC_009442	AGGA	2	8	211600	211607	50 %	0 %	50 %	0 %	146317880
3612	NC_009442	ATGA	2	8	211666	211673	50 %	25 %	25 %	0 %	146317880
3613	NC_009442	CTGG	2	8	211957	211964	0 %	25 %	50 %	25 %	146317880
3614	NC_009442	ATC	2	6	211984	211989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317880
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3616	NC_009442	GAG	2	6	212120	212125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317880
3617	NC_009442	CCAA	2	8	212148	212155	50 %	0 %	0 %	50 %	146317880
3618	NC_009442	GAT	2	6	212182	212187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317880
3619	NC_009442	ATC	2	6	212206	212211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317880
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3621	NC_009442	TGG	2	6	212259	212264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317880
3622	NC_009442	ATTC	2	8	212283	212290	25 %	50 %	0 %	25 %	146317880
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3624	NC_009442	TTC	2	6	212338	212343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317880
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3848	NC_009442	TGA	2	6	226276	226281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317892
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3853	NC_009442	AGCAG	2	10	226510	226519	40 %	0 %	40 %	20 %	146317892
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3865	NC_009442	GATG	2	8	227214	227221	25 %	25 %	50 %	0 %	146317893
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3990	NC_009442	CTA	2	6	233914	233919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317903
3991	NC_009442	TTC	2	6	233969	233974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317903
3992	NC_009442	CAG	2	6	233975	233980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317903
3993	NC_009442	CTA	2	6	234021	234026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317903
3994	NC_009442	CTTG	2	8	234057	234064	0 %	50 %	25 %	25 %	146317903
3995	NC_009442	T	7	7	234077	234083	0 %	100 %	0 %	0 %	146317903
3996	NC_009442	GCT	2	6	234085	234090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317903
3997	NC_009442	TTATGG	2	12	234170	234181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146317903
3998	NC_009442	TGG	2	6	234200	234205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317903
3999	NC_009442	TAT	2	6	234232	234237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317903
4000	NC_009442	CAG	2	6	234271	234276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317903

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