MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009442	ACA	2	6	262697	262702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317930
4502	NC_009442	AGA	2	6	262712	262717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317930
4503	NC_009442	ATCT	2	8	263024	263031	25 %	50 %	0 %	25 %	146317931
4504	NC_009442	ATTT	2	8	263101	263108	25 %	75 %	0 %	0 %	146317931
4505	NC_009442	T	6	6	263243	263248	0 %	100 %	0 %	0 %	146317932
4506	NC_009442	GTTT	2	8	263275	263282	0 %	75 %	25 %	0 %	146317932
4507	NC_009442	T	6	6	263280	263285	0 %	100 %	0 %	0 %	146317932
4508	NC_009442	TAT	2	6	263358	263363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317933
4509	NC_009442	AGC	2	6	263372	263377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317933
4510	NC_009442	GTA	2	6	263399	263404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317933
4511	NC_009442	AGT	2	6	263444	263449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317933
4512	NC_009442	TCA	2	6	263451	263456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317933
4513	NC_009442	GCT	2	6	263472	263477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317933
4514	NC_009442	ACG	2	6	263492	263497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317933
4515	NC_009442	TTC	2	6	263505	263510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317933
4516	NC_009442	TTTC	2	8	263542	263549	0 %	75 %	0 %	25 %	146317933
4517	NC_009442	TAT	2	6	263814	263819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317934
4518	NC_009442	TAC	2	6	263852	263857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317934
4519	NC_009442	GCA	2	6	263900	263905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4520	NC_009442	ACG	2	6	263986	263991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4521	NC_009442	GTT	2	6	264073	264078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317934
4522	NC_009442	GCAG	2	8	264171	264178	25 %	0 %	50 %	25 %	146317934
4523	NC_009442	GTC	2	6	264179	264184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4524	NC_009442	CCA	2	6	264195	264200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317934
4525	NC_009442	CTT	2	6	264270	264275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317934
4526	NC_009442	AG	3	6	264330	264335	50 %	0 %	50 %	0 %	146317934
4527	NC_009442	TGC	2	6	264339	264344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4528	NC_009442	TTGA	2	8	264358	264365	25 %	50 %	25 %	0 %	146317934
4529	NC_009442	CGC	2	6	264374	264379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317934
4530	NC_009442	AGA	2	6	264417	264422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317934
4531	NC_009442	GT	3	6	264434	264439	0 %	50 %	50 %	0 %	146317934
4532	NC_009442	AGA	2	6	264456	264461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317934
4533	NC_009442	GAA	2	6	264508	264513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317934
4534	NC_009442	TTAC	2	8	264563	264570	25 %	50 %	0 %	25 %	146317934
4535	NC_009442	ACT	2	6	264602	264607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317934
4536	NC_009442	GTGG	2	8	264640	264647	0 %	25 %	75 %	0 %	146317934
4537	NC_009442	TGACC	2	10	264651	264660	20 %	20 %	20 %	40 %	146317934
4538	NC_009442	ACG	2	6	264680	264685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4539	NC_009442	TGG	2	6	264702	264707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317934
4540	NC_009442	AGG	2	6	264830	264835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317934
4541	NC_009442	GCAA	2	8	264872	264879	50 %	0 %	25 %	25 %	146317934
4542	NC_009442	CAG	2	6	264935	264940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317934
4543	NC_009442	GGT	2	6	264973	264978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317934
4544	NC_009442	AAG	2	6	265023	265028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317934
4545	NC_009442	AGA	2	6	265080	265085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317934
4546	NC_009442	AGT	2	6	265097	265102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317934
4547	NC_009442	AAC	2	6	265290	265295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317935
4548	NC_009442	CTA	2	6	265430	265435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317935
4549	NC_009442	CCA	2	6	265441	265446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317935
4550	NC_009442	ACA	2	6	265498	265503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317935
4551	NC_009442	CCA	2	6	265519	265524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317935
4552	NC_009442	AT	3	6	265537	265542	50 %	50 %	0 %	0 %	146317935
4553	NC_009442	TCT	2	6	265552	265557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317935
4554	NC_009442	CTT	2	6	265592	265597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317935
4555	NC_009442	ATT	2	6	265617	265622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317935
4556	NC_009442	T	6	6	265656	265661	0 %	100 %	0 %	0 %	146317935
4557	NC_009442	CCA	2	6	265690	265695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317935
4558	NC_009442	ATAG	2	8	265701	265708	50 %	25 %	25 %	0 %	146317935
4559	NC_009442	CTT	2	6	265736	265741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317935
4560	NC_009442	CTTG	2	8	265783	265790	0 %	50 %	25 %	25 %	146317935
4561	NC_009442	ACC	2	6	265857	265862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317935
4562	NC_009442	T	6	6	265882	265887	0 %	100 %	0 %	0 %	146317935
4563	NC_009442	AG	3	6	265898	265903	50 %	0 %	50 %	0 %	146317935
4564	NC_009442	CA	3	6	265928	265933	50 %	0 %	0 %	50 %	146317935
4565	NC_009442	GAA	2	6	265947	265952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317935
4566	NC_009442	CGACAA	2	12	266159	266170	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146317935
4567	NC_009442	TGGT	2	8	266742	266749	0 %	50 %	50 %	0 %	146317936
4568	NC_009442	A	8	8	266775	266782	100 %	0 %	0 %	0 %	146317936
4569	NC_009442	T	9	9	266789	266797	0 %	100 %	0 %	0 %	146317936
4570	NC_009442	GAA	2	6	266855	266860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
4571	NC_009442	GTG	2	6	266868	266873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
4572	NC_009442	CTA	2	6	266889	266894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4573	NC_009442	GAT	2	6	266966	266971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
4574	NC_009442	CGGT	2	8	267000	267007	0 %	25 %	50 %	25 %	146317936
4575	NC_009442	GTT	2	6	267008	267013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317936
4576	NC_009442	CAA	3	9	267027	267035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
4577	NC_009442	ATTG	2	8	267064	267071	25 %	50 %	25 %	0 %	146317936
4578	NC_009442	TCT	2	6	267125	267130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
4579	NC_009442	AGC	2	6	267157	267162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4580	NC_009442	TGA	2	6	267234	267239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
4581	NC_009442	ATG	2	6	267243	267248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317936
4582	NC_009442	CAA	2	6	267255	267260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
4583	NC_009442	TGG	2	6	267271	267276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
4584	NC_009442	GTGC	2	8	267287	267294	0 %	25 %	50 %	25 %	146317936
4585	NC_009442	GCA	2	6	267380	267385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
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4588	NC_009442	TAA	2	6	267514	267519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317936
4589	NC_009442	GAAA	2	8	267520	267527	75 %	0 %	25 %	0 %	146317936
4590	NC_009442	CTT	2	6	267533	267538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
4591	NC_009442	GAA	2	6	267539	267544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
4592	NC_009442	AGC	2	6	267781	267786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4593	NC_009442	GGT	2	6	267917	267922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
4594	NC_009442	CAT	2	6	267951	267956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4595	NC_009442	ATA	2	6	268053	268058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317936
4596	NC_009442	ATC	2	6	268193	268198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4597	NC_009442	TCG	2	6	268213	268218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4598	NC_009442	TAA	2	6	268219	268224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317936
4599	NC_009442	GTT	2	6	268226	268231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317936
4600	NC_009442	TCT	2	6	268239	268244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
4601	NC_009442	ATC	2	6	268322	268327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4602	NC_009442	GGT	3	9	268334	268342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
4603	NC_009442	TGC	2	6	268354	268359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4604	NC_009442	AAC	2	6	268383	268388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
4605	NC_009442	AAC	2	6	268550	268555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317936
4606	NC_009442	ACT	2	6	268575	268580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4607	NC_009442	CAG	2	6	268644	268649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4608	NC_009442	GAA	2	6	268774	268779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
4609	NC_009442	TGG	2	6	268885	268890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317936
4610	NC_009442	ACT	2	6	268995	269000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4611	NC_009442	TCT	2	6	269035	269040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
4612	NC_009442	AGA	2	6	269062	269067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317936
4613	NC_009442	GCA	2	6	269075	269080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4614	NC_009442	CGA	2	6	269149	269154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317936
4615	NC_009442	CTT	2	6	269189	269194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317936
4616	NC_009442	ATC	2	6	269258	269263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4617	NC_009442	CTA	2	6	269272	269277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317936
4618	NC_009442	ATCA	2	8	269738	269745	50 %	25 %	0 %	25 %	229577509
4619	NC_009442	CGAC	2	8	269801	269808	25 %	0 %	25 %	50 %	229577509
4620	NC_009442	GGT	2	6	269809	269814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577509
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4622	NC_009442	GAT	2	6	269917	269922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577509
4623	NC_009442	ACT	2	6	269942	269947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577509
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4989	NC_009442	TAC	2	6	290537	290542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317954
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