MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens CN-32 chromosome

Total Repeats: 70470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009438	CCA	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291134
502	NC_009438	TTG	2	6	29877	29882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291134
503	NC_009438	T	6	6	29918	29923	0 %	100 %	0 %	0 %	146291134
504	NC_009438	TTGTG	2	10	29970	29979	0 %	60 %	40 %	0 %	146291134
505	NC_009438	AGC	2	6	30005	30010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291134
506	NC_009438	ATG	2	6	30033	30038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291134
507	NC_009438	CAAATC	2	12	30050	30061	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	146291134
508	NC_009438	CTT	2	6	30067	30072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291135
509	NC_009438	TTTG	2	8	30103	30110	0 %	75 %	25 %	0 %	146291135
510	NC_009438	GATA	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	146291135
511	NC_009438	ACAA	2	8	30144	30151	75 %	0 %	0 %	25 %	146291135
512	NC_009438	GGT	2	6	30163	30168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291135
513	NC_009438	CAA	2	6	30211	30216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291135
514	NC_009438	ACT	2	6	30329	30334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291135
515	NC_009438	GTT	2	6	30403	30408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291135
516	NC_009438	GCA	2	6	30429	30434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291135
517	NC_009438	TCA	2	6	30540	30545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291135
518	NC_009438	ACA	2	6	30695	30700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291136
519	NC_009438	GTTT	2	8	30756	30763	0 %	75 %	25 %	0 %	146291136
520	NC_009438	A	6	6	30814	30819	100 %	0 %	0 %	0 %	146291136
521	NC_009438	TTAT	2	8	30917	30924	25 %	75 %	0 %	0 %	146291136
522	NC_009438	A	6	6	31008	31013	100 %	0 %	0 %	0 %	146291136
523	NC_009438	ATT	2	6	31030	31035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291136
524	NC_009438	AGC	2	6	31127	31132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291136
525	NC_009438	ATT	2	6	31171	31176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291136
526	NC_009438	T	6	6	31249	31254	0 %	100 %	0 %	0 %	146291136
527	NC_009438	AGT	2	6	31351	31356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291136
528	NC_009438	GA	3	6	31361	31366	50 %	0 %	50 %	0 %	146291136
529	NC_009438	GGA	2	6	31395	31400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146291136
530	NC_009438	GAA	2	6	31579	31584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291136
531	NC_009438	ATG	2	6	31598	31603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291136
532	NC_009438	CAT	2	6	31644	31649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291136
533	NC_009438	TGA	2	6	31776	31781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291136
534	NC_009438	ATT	2	6	31799	31804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291136
535	NC_009438	GAC	2	6	31918	31923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291137
536	NC_009438	GA	3	6	31945	31950	50 %	0 %	50 %	0 %	146291137
537	NC_009438	ATC	2	6	31970	31975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291137
538	NC_009438	TGAT	2	8	31991	31998	25 %	50 %	25 %	0 %	146291137
539	NC_009438	GCA	2	6	32028	32033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291137
540	NC_009438	CTC	2	6	32037	32042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146291137
541	NC_009438	GTT	2	6	32085	32090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291137
542	NC_009438	CCT	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146291137
543	NC_009438	TGC	2	6	32283	32288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291137
544	NC_009438	ATA	2	6	32309	32314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291137
545	NC_009438	CAG	2	6	32392	32397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291137
546	NC_009438	CGAAA	2	10	32456	32465	60 %	0 %	20 %	20 %	146291137
547	NC_009438	ATT	2	6	32470	32475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291137
548	NC_009438	TTA	2	6	32623	32628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291137
549	NC_009438	GAA	2	6	32704	32709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291137
550	NC_009438	CCA	2	6	32721	32726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291137
551	NC_009438	AGA	2	6	32732	32737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291137
552	NC_009438	ACA	2	6	32794	32799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291137
553	NC_009438	GGT	2	6	32896	32901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291137
554	NC_009438	ACT	2	6	32981	32986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291138
555	NC_009438	TGA	2	6	32990	32995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291138
556	NC_009438	ACTC	2	8	33014	33021	25 %	25 %	0 %	50 %	146291138
557	NC_009438	TCA	2	6	33032	33037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291138
558	NC_009438	AAG	2	6	33088	33093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291138
559	NC_009438	TTCGT	2	10	33128	33137	0 %	60 %	20 %	20 %	146291138
560	NC_009438	TTG	2	6	33189	33194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291138
561	NC_009438	TGAT	2	8	33241	33248	25 %	50 %	25 %	0 %	146291138
562	NC_009438	AACC	2	8	33268	33275	50 %	0 %	0 %	50 %	146291138
563	NC_009438	AGA	2	6	33284	33289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291138
564	NC_009438	TGA	2	6	33532	33537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291139
565	NC_009438	ATT	2	6	33541	33546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291139
566	NC_009438	CGG	2	6	33631	33636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291139
567	NC_009438	TAA	2	6	33649	33654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291139
568	NC_009438	GCA	2	6	33688	33693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291139
569	NC_009438	TAA	2	6	33841	33846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291139
570	NC_009438	TCC	2	6	33964	33969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146291139
571	NC_009438	A	6	6	34053	34058	100 %	0 %	0 %	0 %	146291139
572	NC_009438	GGT	2	6	34277	34282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291140
573	NC_009438	CAG	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291140
574	NC_009438	TGA	2	6	34435	34440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291140
575	NC_009438	CTG	2	6	34452	34457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291140
576	NC_009438	AGC	2	6	34458	34463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291140
577	NC_009438	GTG	2	6	34542	34547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291140
578	NC_009438	TAA	2	6	34612	34617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291140
579	NC_009438	CGC	2	6	34922	34927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291141
580	NC_009438	GGT	3	9	34953	34961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291141
581	NC_009438	GCT	2	6	35031	35036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291141
582	NC_009438	TAA	2	6	35120	35125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291141
583	NC_009438	GTG	2	6	35195	35200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291141
584	NC_009438	TTA	2	6	35228	35233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291141
585	NC_009438	GC	3	6	35284	35289	0 %	0 %	50 %	50 %	146291141
586	NC_009438	TTC	2	6	35340	35345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291141
587	NC_009438	GTGG	2	8	35373	35380	0 %	25 %	75 %	0 %	146291141
588	NC_009438	AGCTTT	2	12	35421	35432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146291141
589	NC_009438	CTT	2	6	35453	35458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291141
590	NC_009438	CGT	2	6	35484	35489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291141
591	NC_009438	GTGAGC	2	12	35506	35517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146291141
592	NC_009438	CGT	2	6	35535	35540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291141
593	NC_009438	TTTG	2	8	35582	35589	0 %	75 %	25 %	0 %	146291141
594	NC_009438	GGC	2	6	35601	35606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291141
595	NC_009438	GCC	2	6	35633	35638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291141
596	NC_009438	GGC	2	6	35815	35820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291142
597	NC_009438	TTA	2	6	35834	35839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291142
598	NC_009438	TTC	2	6	35845	35850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291142
599	NC_009438	CCG	2	6	35966	35971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291142
600	NC_009438	AAC	2	6	35993	35998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291142
601	NC_009438	CTG	2	6	36054	36059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291142
602	NC_009438	TCT	2	6	36069	36074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291142
603	NC_009438	CGC	2	6	36111	36116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291142
604	NC_009438	GGATC	2	10	36141	36150	20 %	20 %	40 %	20 %	146291142
605	NC_009438	ATC	2	6	36154	36159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291142
606	NC_009438	GT	3	6	36170	36175	0 %	50 %	50 %	0 %	146291142
607	NC_009438	GACA	2	8	36360	36367	50 %	0 %	25 %	25 %	146291143
608	NC_009438	TTCA	2	8	36412	36419	25 %	50 %	0 %	25 %	146291143
609	NC_009438	TGC	2	6	36429	36434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291143
610	NC_009438	CCCA	2	8	36436	36443	25 %	0 %	0 %	75 %	146291143
611	NC_009438	TTA	2	6	36448	36453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291143
612	NC_009438	GCGG	2	8	36517	36524	0 %	0 %	75 %	25 %	146291143
613	NC_009438	TG	3	6	36572	36577	0 %	50 %	50 %	0 %	146291143
614	NC_009438	TGG	2	6	36677	36682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291143
615	NC_009438	TGG	2	6	36741	36746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291143
616	NC_009438	GCG	2	6	36748	36753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291143
617	NC_009438	CG	3	6	36752	36757	0 %	0 %	50 %	50 %	146291143
618	NC_009438	ATT	2	6	36771	36776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291143
619	NC_009438	CCG	2	6	36887	36892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291143
620	NC_009438	ATGA	2	8	36898	36905	50 %	25 %	25 %	0 %	146291143
621	NC_009438	ATT	2	6	36928	36933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291143
622	NC_009438	ATG	2	6	37015	37020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291143
623	NC_009438	GTG	2	6	37159	37164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291143
624	NC_009438	GAC	2	6	37251	37256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291144
625	NC_009438	AGC	2	6	37354	37359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291144
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