MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 4735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009380	CCGCG	2	10	969	978	0 %	0 %	40 %	60 %	145592567
2	NC_009380	ACCAC	2	10	2276	2285	40 %	0 %	0 %	60 %	145592567
3	NC_009380	ACCGG	2	10	2447	2456	20 %	0 %	40 %	40 %	145592568
4	NC_009380	GCCGG	2	10	4781	4790	0 %	0 %	60 %	40 %	145592570
5	NC_009380	TCGCC	2	10	6218	6227	0 %	20 %	20 %	60 %	145592571
6	NC_009380	GCGCT	2	10	10424	10433	0 %	20 %	40 %	40 %	145592575
7	NC_009380	CGGCG	2	10	10705	10714	0 %	0 %	60 %	40 %	145592575
8	NC_009380	GCTGA	2	10	10976	10985	20 %	20 %	40 %	20 %	145592575
9	NC_009380	GGGCC	2	10	12707	12716	0 %	0 %	60 %	40 %	145592576
10	NC_009380	GAGTC	2	10	14123	14132	20 %	20 %	40 %	20 %	145592577
11	NC_009380	CCACC	2	10	15274	15283	20 %	0 %	0 %	80 %	145592579
12	NC_009380	CTGCG	2	10	16055	16064	0 %	20 %	40 %	40 %	145592580
13	NC_009380	CGCAC	2	10	18787	18796	20 %	0 %	20 %	60 %	145592581
14	NC_009380	GCGCC	2	10	20148	20157	0 %	0 %	40 %	60 %	145592582
15	NC_009380	CGGGG	2	10	20297	20306	0 %	0 %	80 %	20 %	145592583
16	NC_009380	CCGGC	2	10	20566	20575	0 %	0 %	40 %	60 %	145592583
17	NC_009380	CGACG	2	10	22029	22038	20 %	0 %	40 %	40 %	145592583
18	NC_009380	CGGCC	2	10	23948	23957	0 %	0 %	40 %	60 %	145592583
19	NC_009380	CTCGG	2	10	24400	24409	0 %	20 %	40 %	40 %	145592583
20	NC_009380	GGCCG	2	10	27620	27629	0 %	0 %	60 %	40 %	145592589
21	NC_009380	ACGGC	2	10	27941	27950	20 %	0 %	40 %	40 %	145592589
22	NC_009380	CGCCC	2	10	28239	28248	0 %	0 %	20 %	80 %	145592589
23	NC_009380	CCGGG	2	10	30214	30223	0 %	0 %	60 %	40 %	145592591
24	NC_009380	ACCGA	2	10	30240	30249	40 %	0 %	20 %	40 %	145592591
25	NC_009380	CTGCC	2	10	31643	31652	0 %	20 %	20 %	60 %	145592592
26	NC_009380	ATTCA	2	10	34307	34316	40 %	40 %	0 %	20 %	145592594
27	NC_009380	CGCGG	2	10	34372	34381	0 %	0 %	60 %	40 %	145592594
28	NC_009380	CGGGC	2	10	34837	34846	0 %	0 %	60 %	40 %	145592595
29	NC_009380	CTGGC	2	10	36690	36699	0 %	20 %	40 %	40 %	145592595
30	NC_009380	GCGGA	2	10	38244	38253	20 %	0 %	60 %	20 %	145592596
31	NC_009380	TCAGC	2	10	39407	39416	20 %	20 %	20 %	40 %	145592597
32	NC_009380	CTCGG	2	10	39473	39482	0 %	20 %	40 %	40 %	145592597
33	NC_009380	CCCCG	2	10	40442	40451	0 %	0 %	20 %	80 %	145592598
34	NC_009380	CTCGG	2	10	40733	40742	0 %	20 %	40 %	40 %	145592598
35	NC_009380	CGCCA	2	10	41713	41722	20 %	0 %	20 %	60 %	145592599
36	NC_009380	CCGGC	2	10	44217	44226	0 %	0 %	40 %	60 %	145592603
37	NC_009380	GCACG	2	10	45787	45796	20 %	0 %	40 %	40 %	145592605
38	NC_009380	CAGCC	2	10	47155	47164	20 %	0 %	20 %	60 %	145592606
39	NC_009380	GGCCG	2	10	50218	50227	0 %	0 %	60 %	40 %	145592609
40	NC_009380	CGGAC	2	10	51098	51107	20 %	0 %	40 %	40 %	145592610
41	NC_009380	CGACG	2	10	51128	51137	20 %	0 %	40 %	40 %	145592610
42	NC_009380	CCGAG	2	10	51733	51742	20 %	0 %	40 %	40 %	145592610
43	NC_009380	CGGCA	2	10	54704	54713	20 %	0 %	40 %	40 %	145592612
44	NC_009380	CGGGT	2	10	55763	55772	0 %	20 %	60 %	20 %	145592613
45	NC_009380	CCGGC	2	10	57445	57454	0 %	0 %	40 %	60 %	145592614
46	NC_009380	CCCGG	2	10	58696	58705	0 %	0 %	40 %	60 %	145592615
47	NC_009380	CCCGG	2	10	62702	62711	0 %	0 %	40 %	60 %	145592620
48	NC_009380	CGCTC	2	10	65078	65087	0 %	20 %	20 %	60 %	145592621
49	NC_009380	TGGCC	2	10	65123	65132	0 %	20 %	40 %	40 %	145592621
50	NC_009380	AGGTC	2	10	66356	66365	20 %	20 %	40 %	20 %	145592622
51	NC_009380	CGGGC	2	10	66691	66700	0 %	0 %	60 %	40 %	145592623
52	NC_009380	GCGCG	2	10	67834	67843	0 %	0 %	60 %	40 %	145592624
53	NC_009380	CGCGA	2	10	67899	67908	20 %	0 %	40 %	40 %	145592624
54	NC_009380	CGGCG	2	10	69021	69030	0 %	0 %	60 %	40 %	145592625
55	NC_009380	GGGCC	2	10	69654	69663	0 %	0 %	60 %	40 %	145592626
56	NC_009380	TTCGG	2	10	70463	70472	0 %	40 %	40 %	20 %	145592626
57	NC_009380	ACGAA	2	10	70806	70815	60 %	0 %	20 %	20 %	145592627
58	NC_009380	GGTCG	2	10	73258	73267	0 %	20 %	60 %	20 %	145592629
59	NC_009380	CCACG	2	10	74312	74321	20 %	0 %	20 %	60 %	145592629
60	NC_009380	TGGGG	2	10	74789	74798	0 %	20 %	80 %	0 %	145592629
61	NC_009380	GCAGC	2	10	75402	75411	20 %	0 %	40 %	40 %	145592630
62	NC_009380	GGTCG	2	10	77404	77413	0 %	20 %	60 %	20 %	145592633
63	NC_009380	GCCAC	2	10	77748	77757	20 %	0 %	20 %	60 %	145592633
64	NC_009380	AACCG	2	10	77885	77894	40 %	0 %	20 %	40 %	145592633
65	NC_009380	GCCGC	2	10	77997	78006	0 %	0 %	40 %	60 %	145592633
66	NC_009380	CGGCG	2	10	78774	78783	0 %	0 %	60 %	40 %	145592635
67	NC_009380	CGGGT	2	10	79241	79250	0 %	20 %	60 %	20 %	145592635
68	NC_009380	GCGCG	2	10	82746	82755	0 %	0 %	60 %	40 %	145592640
69	NC_009380	CGCGA	2	10	82811	82820	20 %	0 %	40 %	40 %	145592640
70	NC_009380	GAGCT	2	10	83822	83831	20 %	20 %	40 %	20 %	145592642
71	NC_009380	ACGTC	2	10	85146	85155	20 %	20 %	20 %	40 %	145592643
72	NC_009380	TGTCG	2	10	88508	88517	0 %	40 %	40 %	20 %	145592647
73	NC_009380	TCCGC	2	10	88728	88737	0 %	20 %	20 %	60 %	145592647
74	NC_009380	TCGGC	2	10	91326	91335	0 %	20 %	40 %	40 %	145592649
75	NC_009380	TCGGC	2	10	93563	93572	0 %	20 %	40 %	40 %	145592651
76	NC_009380	GTCGC	2	10	93579	93588	0 %	20 %	40 %	40 %	145592651
77	NC_009380	GGGCC	2	10	94773	94782	0 %	0 %	60 %	40 %	145592652
78	NC_009380	TGGTG	2	10	100105	100114	0 %	40 %	60 %	0 %	145592658
79	NC_009380	CCGGC	2	10	100860	100869	0 %	0 %	40 %	60 %	145592658
80	NC_009380	CGGGA	2	10	101268	101277	20 %	0 %	60 %	20 %	145592659
81	NC_009380	CAACC	2	10	102879	102888	40 %	0 %	0 %	60 %	145592662
82	NC_009380	GAGCT	2	10	103559	103568	20 %	20 %	40 %	20 %	145592663
83	NC_009380	CGGTG	2	10	104939	104948	0 %	20 %	60 %	20 %	145592664
84	NC_009380	CGGTG	2	10	105756	105765	0 %	20 %	60 %	20 %	145592665
85	NC_009380	CGGTG	2	10	106233	106242	0 %	20 %	60 %	20 %	145592666
86	NC_009380	GCTCG	2	10	106363	106372	0 %	20 %	40 %	40 %	145592666
87	NC_009380	CCAGG	2	10	106804	106813	20 %	0 %	40 %	40 %	145592666
88	NC_009380	CCGTC	2	10	107046	107055	0 %	20 %	20 %	60 %	145592666
89	NC_009380	CCTCG	2	10	109738	109747	0 %	20 %	20 %	60 %	145592670
90	NC_009380	GGTCT	2	10	110800	110809	0 %	40 %	40 %	20 %	145592670
91	NC_009380	GAACG	2	10	110866	110875	40 %	0 %	40 %	20 %	145592670
92	NC_009380	TGGAT	2	10	111287	111296	20 %	40 %	40 %	0 %	145592671
93	NC_009380	TACCC	2	10	111582	111591	20 %	20 %	0 %	60 %	145592671
94	NC_009380	CGCGG	2	10	113397	113406	0 %	0 %	60 %	40 %	145592672
95	NC_009380	CCGGC	2	10	113434	113443	0 %	0 %	40 %	60 %	145592672
96	NC_009380	CGGGG	2	10	114225	114234	0 %	0 %	80 %	20 %	145592672
97	NC_009380	GCCCA	2	10	114360	114369	20 %	0 %	20 %	60 %	145592672
98	NC_009380	AGCGC	2	10	114924	114933	20 %	0 %	40 %	40 %	145592672
99	NC_009380	CGAGC	2	10	115294	115303	20 %	0 %	40 %	40 %	145592673
100	NC_009380	CGAGC	2	10	116032	116041	20 %	0 %	40 %	40 %	145592673
101	NC_009380	GCCCG	2	10	120299	120308	0 %	0 %	40 %	60 %	145592677
102	NC_009380	CGGCG	2	10	120963	120972	0 %	0 %	60 %	40 %	145592678
103	NC_009380	TCCGC	2	10	120995	121004	0 %	20 %	20 %	60 %	145592678
104	NC_009380	CGGAC	2	10	122201	122210	20 %	0 %	40 %	40 %	145592679
105	NC_009380	TGACG	2	10	122820	122829	20 %	20 %	40 %	20 %	145592679
106	NC_009380	GACCC	2	10	124556	124565	20 %	0 %	20 %	60 %	145592680
107	NC_009380	GTTCG	2	10	125146	125155	0 %	40 %	40 %	20 %	145592681
108	NC_009380	GGGAC	2	10	125200	125209	20 %	0 %	60 %	20 %	145592681
109	NC_009380	GCGGG	2	10	125569	125578	0 %	0 %	80 %	20 %	145592681
110	NC_009380	CGCGG	2	10	128426	128435	0 %	0 %	60 %	40 %	145592685
111	NC_009380	GTCGT	2	10	128679	128688	0 %	40 %	40 %	20 %	145592685
112	NC_009380	TCACC	2	10	128817	128826	20 %	20 %	0 %	60 %	145592686
113	NC_009380	GCTGC	2	10	129576	129585	0 %	20 %	40 %	40 %	145592687
114	NC_009380	GCCGA	2	10	129609	129618	20 %	0 %	40 %	40 %	145592687
115	NC_009380	GGCCT	2	10	132604	132613	0 %	20 %	40 %	40 %	145592688
116	NC_009380	GTCGT	2	10	133121	133130	0 %	40 %	40 %	20 %	145592689
117	NC_009380	CGATG	2	10	133300	133309	20 %	20 %	40 %	20 %	145592689
118	NC_009380	ACCGT	2	10	135665	135674	20 %	20 %	20 %	40 %	145592692
119	NC_009380	TGCTC	2	10	137853	137862	0 %	40 %	20 %	40 %	145592694
120	NC_009380	CGTCG	2	10	137897	137906	0 %	20 %	40 %	40 %	145592694
121	NC_009380	GGGTG	2	10	138334	138343	0 %	20 %	80 %	0 %	145592694
122	NC_009380	TGACC	2	10	140133	140142	20 %	20 %	20 %	40 %	145592696
123	NC_009380	GAACC	2	10	140598	140607	40 %	0 %	20 %	40 %	145592697
124	NC_009380	CCGCG	2	10	140942	140951	0 %	0 %	40 %	60 %	145592698
125	NC_009380	CCAGG	2	10	141449	141458	20 %	0 %	40 %	40 %	145592698
126	NC_009380	CGGGC	2	10	142256	142265	0 %	0 %	60 %	40 %	145592698
127	NC_009380	GCTGC	2	10	142989	142998	0 %	20 %	40 %	40 %	145592699
128	NC_009380	CCGAG	2	10	143448	143457	20 %	0 %	40 %	40 %	145592699
129	NC_009380	CGCGG	2	10	144753	144762	0 %	0 %	60 %	40 %	145592699
130	NC_009380	CGGAG	2	10	145983	145992	20 %	0 %	60 %	20 %	145592700
131	NC_009380	GGTCG	2	10	146978	146987	0 %	20 %	60 %	20 %	145592701
132	NC_009380	CACGC	2	10	150261	150270	20 %	0 %	20 %	60 %	145592705
133	NC_009380	GGTGA	2	10	150736	150745	20 %	20 %	60 %	0 %	145592705
134	NC_009380	GCCGG	2	10	152274	152283	0 %	0 %	60 %	40 %	145592707
135	NC_009380	GCGCC	2	10	152418	152427	0 %	0 %	40 %	60 %	145592707
136	NC_009380	TGGCG	2	10	154749	154758	0 %	20 %	60 %	20 %	145592709
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167	NC_009380	GCCGC	2	10	195526	195535	0 %	0 %	40 %	60 %	145592743
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206	NC_009380	GCCCG	2	10	252330	252339	0 %	0 %	40 %	60 %	145592787
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246	NC_009380	CGGTC	2	10	290887	290896	0 %	20 %	40 %	40 %	145592822
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249	NC_009380	ACGAG	2	10	295316	295325	40 %	0 %	40 %	20 %	145592825
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252	NC_009380	GCCCC	2	10	297656	297665	0 %	0 %	20 %	80 %	145592828
253	NC_009380	GGGCG	2	10	297819	297828	0 %	0 %	80 %	20 %	145592828
254	NC_009380	TCGGC	2	10	297947	297956	0 %	20 %	40 %	40 %	145592828
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257	NC_009380	CGACC	2	10	300411	300420	20 %	0 %	20 %	60 %	145592829
258	NC_009380	GATCT	2	10	301780	301789	20 %	40 %	20 %	20 %	145592830
259	NC_009380	GAACC	2	10	308212	308221	40 %	0 %	20 %	40 %	145592836
260	NC_009380	CCGAG	2	10	308865	308874	20 %	0 %	40 %	40 %	145592836
261	NC_009380	GTGCC	2	10	309940	309949	0 %	20 %	40 %	40 %	145592837
262	NC_009380	CCGGC	2	10	310414	310423	0 %	0 %	40 %	60 %	145592837
263	NC_009380	GCCCC	2	10	310502	310511	0 %	0 %	20 %	80 %	145592837
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265	NC_009380	GCTGG	2	10	313394	313403	0 %	20 %	60 %	20 %	145592838
266	NC_009380	CGATC	2	10	316107	316116	20 %	20 %	20 %	40 %	145592840
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