MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009380	CGG	2	6	132573	132578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592688
3002	NC_009380	CTG	2	6	132588	132593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592688
3003	NC_009380	GGCCT	2	10	132604	132613	0 %	20 %	40 %	40 %	145592688
3004	NC_009380	CGG	2	6	132620	132625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592688
3005	NC_009380	GTCA	2	8	132661	132668	25 %	25 %	25 %	25 %	145592688
3006	NC_009380	GGA	2	6	132669	132674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592688
3007	NC_009380	GAA	2	6	132691	132696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592688
3008	NC_009380	TGG	2	6	132761	132766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592688
3009	NC_009380	TTC	2	6	132802	132807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592688
3010	NC_009380	GCA	3	9	132816	132824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592688
3011	NC_009380	CGGG	2	8	132866	132873	0 %	0 %	75 %	25 %	145592688
3012	NC_009380	CTC	2	6	132969	132974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592688
3013	NC_009380	GA	3	6	133004	133009	50 %	0 %	50 %	0 %	145592688
3014	NC_009380	GTCGT	2	10	133121	133130	0 %	40 %	40 %	20 %	145592689
3015	NC_009380	CGC	2	6	133145	133150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592689
3016	NC_009380	TGC	2	6	133176	133181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592689
3017	NC_009380	GGT	2	6	133195	133200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592689
3018	NC_009380	GTTC	2	8	133228	133235	0 %	50 %	25 %	25 %	145592689
3019	NC_009380	GGC	3	9	133264	133272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592689
3020	NC_009380	TCG	2	6	133286	133291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592689
3021	NC_009380	CGATG	2	10	133300	133309	20 %	20 %	40 %	20 %	145592689
3022	NC_009380	GTG	2	6	133343	133348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592689
3023	NC_009380	GGT	2	6	133432	133437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592689
3024	NC_009380	GCT	2	6	133461	133466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592689
3025	NC_009380	CGA	2	6	133516	133521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592689
3026	NC_009380	CTC	2	6	133541	133546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592689
3027	NC_009380	TGG	2	6	133574	133579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592689
3028	NC_009380	TCGG	2	8	133601	133608	0 %	25 %	50 %	25 %	145592689
3029	NC_009380	CAG	2	6	133656	133661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592689
3030	NC_009380	CCCT	2	8	133685	133692	0 %	25 %	0 %	75 %	145592689
3031	NC_009380	ACC	2	6	133755	133760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592690
3032	NC_009380	GCG	2	6	133763	133768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592690
3033	NC_009380	CGGC	2	8	133789	133796	0 %	0 %	50 %	50 %	145592690
3034	NC_009380	CG	3	6	133811	133816	0 %	0 %	50 %	50 %	145592690
3035	NC_009380	CGC	2	6	133823	133828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3036	NC_009380	CGC	2	6	133862	133867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3037	NC_009380	CCG	2	6	133882	133887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3038	NC_009380	CCG	2	6	133930	133935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3039	NC_009380	CGA	2	6	133946	133951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592690
3040	NC_009380	CAC	2	6	133979	133984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592690
3041	NC_009380	GTC	2	6	134048	134053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592690
3042	NC_009380	GAT	2	6	134058	134063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592690
3043	NC_009380	CGC	2	6	134114	134119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3044	NC_009380	CCG	2	6	134211	134216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592690
3045	NC_009380	GTCG	2	8	134246	134253	0 %	25 %	50 %	25 %	145592690
3046	NC_009380	GTC	2	6	134385	134390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592690
3047	NC_009380	GGC	2	6	134462	134467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592690
3048	NC_009380	CGG	2	6	134484	134489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592690
3049	NC_009380	TGG	2	6	134491	134496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592690
3050	NC_009380	CG	3	6	134532	134537	0 %	0 %	50 %	50 %	145592690
3051	NC_009380	ACG	2	6	134701	134706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592691
3052	NC_009380	TCA	2	6	134719	134724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592691
3053	NC_009380	GTG	2	6	134751	134756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592691
3054	NC_009380	GC	3	6	134768	134773	0 %	0 %	50 %	50 %	145592691
3055	NC_009380	GCG	2	6	134795	134800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592691
3056	NC_009380	GCC	2	6	134820	134825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592691
3057	NC_009380	TGG	2	6	134830	134835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592691
3058	NC_009380	TGC	2	6	134842	134847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592691
3059	NC_009380	ACG	2	6	134872	134877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592691
3060	NC_009380	GGTG	2	8	134879	134886	0 %	25 %	75 %	0 %	145592691
3061	NC_009380	CCA	2	6	134932	134937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592691
3062	NC_009380	CCGT	2	8	134948	134955	0 %	25 %	25 %	50 %	145592691
3063	NC_009380	CCA	2	6	135061	135066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592691
3064	NC_009380	CTG	2	6	135085	135090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592691
3065	NC_009380	TTG	2	6	135139	135144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592691
3066	NC_009380	GCC	2	6	135171	135176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592691
3067	NC_009380	CGC	2	6	135337	135342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592692
3068	NC_009380	GCGT	2	8	135462	135469	0 %	25 %	50 %	25 %	145592692
3069	NC_009380	GT	3	6	135468	135473	0 %	50 %	50 %	0 %	145592692
3070	NC_009380	CAT	2	6	135516	135521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592692
3071	NC_009380	CTG	2	6	135546	135551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592692
3072	NC_009380	TAC	2	6	135579	135584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592692
3073	NC_009380	CGC	3	9	135628	135636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592692
3074	NC_009380	GC	3	6	135641	135646	0 %	0 %	50 %	50 %	145592692
3075	NC_009380	AAG	2	6	135651	135656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592692
3076	NC_009380	GC	3	6	135657	135662	0 %	0 %	50 %	50 %	145592692
3077	NC_009380	ACCGT	2	10	135665	135674	20 %	20 %	20 %	40 %	145592692
3078	NC_009380	CCT	2	6	135869	135874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592693
3079	NC_009380	CGG	3	9	135875	135883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592693
3080	NC_009380	CCG	2	6	135890	135895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592693
3081	NC_009380	GGT	2	6	135897	135902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592693
3082	NC_009380	CGC	2	6	135912	135917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592693
3083	NC_009380	GCA	2	6	135929	135934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592693
3084	NC_009380	ACC	2	6	135952	135957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592693
3085	NC_009380	GATCAG	2	12	135975	135986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145592693
3086	NC_009380	GAA	2	6	136191	136196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592693
3087	NC_009380	CAG	2	6	136209	136214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592693
3088	NC_009380	TGA	2	6	136319	136324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592693
3089	NC_009380	CAGA	2	8	136326	136333	50 %	0 %	25 %	25 %	145592693
3090	NC_009380	CCAG	2	8	136334	136341	25 %	0 %	25 %	50 %	145592693
3091	NC_009380	CGG	2	6	136367	136372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592693
3092	NC_009380	CGG	2	6	136382	136387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592693
3093	NC_009380	CAG	2	6	136392	136397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592693
3094	NC_009380	GAA	2	6	136413	136418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592693
3095	NC_009380	GTG	2	6	136528	136533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592693
3096	NC_009380	CGA	2	6	136801	136806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3097	NC_009380	CGG	3	9	136818	136826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592694
3098	NC_009380	GCCG	2	8	136838	136845	0 %	0 %	50 %	50 %	145592694
3099	NC_009380	AGC	2	6	136857	136862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3100	NC_009380	GCC	2	6	136865	136870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3101	NC_009380	GCC	3	9	136931	136939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3102	NC_009380	CCG	2	6	136941	136946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3103	NC_009380	TCG	2	6	136977	136982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3104	NC_009380	ATC	2	6	136997	137002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592694
3105	NC_009380	GCC	2	6	137009	137014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3106	NC_009380	TCG	2	6	137070	137075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3107	NC_009380	CTG	2	6	137099	137104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3108	NC_009380	AGG	2	6	137122	137127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592694
3109	NC_009380	AGC	2	6	137134	137139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3110	NC_009380	CCG	2	6	137218	137223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3111	NC_009380	AGGT	2	8	137250	137257	25 %	25 %	50 %	0 %	145592694
3112	NC_009380	GTT	2	6	137300	137305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592694
3113	NC_009380	CGG	2	6	137332	137337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592694
3114	NC_009380	GTT	2	6	137420	137425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592694
3115	NC_009380	CGGC	2	8	137563	137570	0 %	0 %	50 %	50 %	145592694
3116	NC_009380	G	6	6	137638	137643	0 %	0 %	100 %	0 %	145592694
3117	NC_009380	AGA	2	6	137686	137691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592694
3118	NC_009380	GGT	2	6	137695	137700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592694
3119	NC_009380	CGT	2	6	137704	137709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3120	NC_009380	AGTTGC	2	12	137710	137721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145592694
3121	NC_009380	TGCTC	2	10	137853	137862	0 %	40 %	20 %	40 %	145592694
3122	NC_009380	CGA	2	6	137866	137871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592694
3123	NC_009380	CGTCG	2	10	137897	137906	0 %	20 %	40 %	40 %	145592694
3124	NC_009380	CGG	4	12	137971	137982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592694
3125	NC_009380	GTG	2	6	138072	138077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592694
3126	NC_009380	GAG	2	6	138099	138104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592694
3127	NC_009380	GAT	2	6	138182	138187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592694
3128	NC_009380	CGG	2	6	138205	138210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592694
3129	NC_009380	CGG	2	6	138214	138219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592694
3130	NC_009380	GCC	2	6	138267	138272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592694
3131	NC_009380	AGTGGC	2	12	138281	138292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145592694
3132	NC_009380	GC	3	6	138298	138303	0 %	0 %	50 %	50 %	145592694
3133	NC_009380	GGGTG	2	10	138334	138343	0 %	20 %	80 %	0 %	145592694
3134	NC_009380	GTC	2	6	138546	138551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592695
3135	NC_009380	TCG	2	6	138553	138558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592695
3136	NC_009380	CGA	2	6	138563	138568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592695
3137	NC_009380	CCG	2	6	138581	138586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592695
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3139	NC_009380	CCG	2	6	138671	138676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592695
3140	NC_009380	AAGG	2	8	139161	139168	50 %	0 %	50 %	0 %	145592696
3141	NC_009380	CAT	2	6	139256	139261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592696
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3143	NC_009380	CGC	2	6	139337	139342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592696
3144	NC_009380	AAG	2	6	139362	139367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592696
3145	NC_009380	AC	3	6	139388	139393	50 %	0 %	0 %	50 %	145592696
3146	NC_009380	TGA	2	6	139438	139443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592696
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3148	NC_009380	CGG	2	6	139510	139515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592696
3149	NC_009380	GAG	2	6	139545	139550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592696
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3151	NC_009380	GGT	2	6	139608	139613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592696
3152	NC_009380	GAG	2	6	139614	139619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592696
3153	NC_009380	ACC	2	6	139656	139661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592696
3154	NC_009380	GAC	2	6	139665	139670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592696
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3180	NC_009380	GGC	2	6	140642	140647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592697
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3189	NC_009380	GGC	2	6	141071	141076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592698
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3196	NC_009380	GCA	2	6	141370	141375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592698
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3200	NC_009380	CCAGG	2	10	141449	141458	20 %	0 %	40 %	40 %	145592698
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3223	NC_009380	CGGGC	2	10	142256	142265	0 %	0 %	60 %	40 %	145592698
3224	NC_009380	GGC	2	6	142272	142277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592698
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3226	NC_009380	TCGGCC	2	12	142317	142328	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145592698
3227	NC_009380	GCT	2	6	142366	142371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592698
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3230	NC_009380	CGT	2	6	142557	142562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3231	NC_009380	CAC	2	6	142591	142596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592699
3232	NC_009380	CGA	2	6	142619	142624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592699
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3234	NC_009380	CCG	2	6	142754	142759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592699
3235	NC_009380	CAG	2	6	142780	142785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3236	NC_009380	GTC	2	6	142789	142794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3237	NC_009380	CGG	2	6	142797	142802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592699
3238	NC_009380	GTC	2	6	142813	142818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3239	NC_009380	CGGC	2	8	142846	142853	0 %	0 %	50 %	50 %	145592699
3240	NC_009380	C	6	6	142853	142858	0 %	0 %	0 %	100 %	145592699
3241	NC_009380	TCG	2	6	142859	142864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3242	NC_009380	AGC	2	6	142874	142879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3243	NC_009380	GC	3	6	142878	142883	0 %	0 %	50 %	50 %	145592699
3244	NC_009380	GCC	2	6	142900	142905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592699
3245	NC_009380	GCA	2	6	142914	142919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592699
3246	NC_009380	CGG	2	6	142928	142933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592699
3247	NC_009380	GC	3	6	142935	142940	0 %	0 %	50 %	50 %	145592699
3248	NC_009380	CCG	3	9	142950	142958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592699
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3250	NC_009380	GCTGC	2	10	142989	142998	0 %	20 %	40 %	40 %	145592699
3251	NC_009380	GCTG	2	8	143010	143017	0 %	25 %	50 %	25 %	145592699
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3259	NC_009380	TCG	2	6	143258	143263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592699
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3270	NC_009380	GCCG	2	8	143517	143524	0 %	0 %	50 %	50 %	145592699
3271	NC_009380	CTT	2	6	143533	143538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592699
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3354	NC_009380	GCGG	2	8	146350	146357	0 %	0 %	75 %	25 %	145592701
3355	NC_009380	GGT	2	6	146365	146370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592701
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3361	NC_009380	CGG	2	6	146507	146512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592701
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3364	NC_009380	GCG	2	6	146704	146709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592701
3365	NC_009380	CGG	3	9	146722	146730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592701
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3367	NC_009380	CGA	2	6	146748	146753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592701
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3369	NC_009380	CGA	2	6	146828	146833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592701
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3372	NC_009380	GCA	2	6	146909	146914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592701
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3482	NC_009380	CCG	2	6	150647	150652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592705
3483	NC_009380	CGGC	2	8	150671	150678	0 %	0 %	50 %	50 %	145592705
3484	NC_009380	CAG	2	6	150717	150722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592705
3485	NC_009380	GGTGA	2	10	150736	150745	20 %	20 %	60 %	0 %	145592705
3486	NC_009380	GCA	2	6	150755	150760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592705
3487	NC_009380	CGA	2	6	150868	150873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592706
3488	NC_009380	CGCC	2	8	150910	150917	0 %	0 %	25 %	75 %	145592706
3489	NC_009380	TGC	2	6	150922	150927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592706
3490	NC_009380	CG	3	6	151074	151079	0 %	0 %	50 %	50 %	145592706
3491	NC_009380	GCG	2	6	151174	151179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592706
3492	NC_009380	CCG	2	6	151215	151220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592706
3493	NC_009380	AGGT	2	8	151239	151246	25 %	25 %	50 %	0 %	145592706
3494	NC_009380	CGC	2	6	151252	151257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592706
3495	NC_009380	CCT	2	6	151264	151269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592706
3496	NC_009380	CCG	2	6	151272	151277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592706
3497	NC_009380	CAC	2	6	151292	151297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592706
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3499	NC_009380	CGG	2	6	151363	151368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592706
3500	NC_009380	TCA	2	6	151447	151452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592706

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