MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009380	GGT	2	6	21147	21152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592583
502	NC_009380	TCG	3	9	21175	21183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
503	NC_009380	CGG	2	6	21254	21259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
504	NC_009380	TG	3	6	21288	21293	0 %	50 %	50 %	0 %	145592583
505	NC_009380	CCG	2	6	21320	21325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
506	NC_009380	GCG	2	6	21328	21333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
507	NC_009380	CGA	2	6	21368	21373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
508	NC_009380	TCG	3	9	21391	21399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
509	NC_009380	CTC	2	6	21408	21413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592583
510	NC_009380	GAC	3	9	21414	21422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
511	NC_009380	GGCC	2	8	21449	21456	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
512	NC_009380	CTG	2	6	21477	21482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
513	NC_009380	CGT	2	6	21500	21505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
514	NC_009380	CAC	2	6	21513	21518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592583
515	NC_009380	CCG	2	6	21531	21536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
516	NC_009380	CGC	2	6	21596	21601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
517	NC_009380	CGG	2	6	21653	21658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
518	NC_009380	GCC	2	6	21706	21711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
519	NC_009380	CGG	2	6	21712	21717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
520	NC_009380	GTC	2	6	21753	21758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
521	NC_009380	TCG	2	6	21808	21813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
522	NC_009380	CGG	2	6	21824	21829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
523	NC_009380	GCC	2	6	21866	21871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
524	NC_009380	GCC	2	6	21971	21976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
525	NC_009380	GCG	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
526	NC_009380	CGACG	2	10	22029	22038	20 %	0 %	40 %	40 %	145592583
527	NC_009380	CGG	2	6	22049	22054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
528	NC_009380	CGG	2	6	22112	22117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
529	NC_009380	CGAGCG	2	12	22121	22132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145592583
530	NC_009380	CCG	2	6	22153	22158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
531	NC_009380	CGC	3	9	22172	22180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
532	NC_009380	CGAG	2	8	22195	22202	25 %	0 %	50 %	25 %	145592583
533	NC_009380	CGA	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
534	NC_009380	CGG	2	6	22265	22270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
535	NC_009380	GGT	2	6	22275	22280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592583
536	NC_009380	GTCG	2	8	22314	22321	0 %	25 %	50 %	25 %	145592583
537	NC_009380	GGTC	2	8	22334	22341	0 %	25 %	50 %	25 %	145592583
538	NC_009380	GAT	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592583
539	NC_009380	GCT	3	9	22484	22492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
540	NC_009380	GCC	2	6	22497	22502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
541	NC_009380	CCG	2	6	22503	22508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
542	NC_009380	GCC	2	6	22596	22601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
543	NC_009380	ACC	2	6	22603	22608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592583
544	NC_009380	GCG	2	6	22621	22626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
545	NC_009380	ACG	2	6	22643	22648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
546	NC_009380	CGG	2	6	22664	22669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
547	NC_009380	CGG	2	6	22762	22767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
548	NC_009380	TCG	2	6	22810	22815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
549	NC_009380	CCG	2	6	22850	22855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
550	NC_009380	CGG	2	6	22862	22867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
551	NC_009380	GGT	2	6	22889	22894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592583
552	NC_009380	GCC	2	6	22927	22932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
553	NC_009380	CAGC	2	8	22991	22998	25 %	0 %	25 %	50 %	145592583
554	NC_009380	GTC	2	6	23041	23046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
555	NC_009380	CGG	2	6	23050	23055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
556	NC_009380	GCC	2	6	23065	23070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
557	NC_009380	ACC	2	6	23074	23079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592583
558	NC_009380	CGA	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
559	NC_009380	C	6	6	23120	23125	0 %	0 %	0 %	100 %	145592583
560	NC_009380	CTC	2	6	23136	23141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592583
561	NC_009380	GGT	2	6	23145	23150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592583
562	NC_009380	CCG	2	6	23184	23189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
563	NC_009380	AGC	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
564	NC_009380	CCG	2	6	23260	23265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
565	NC_009380	GTC	3	9	23301	23309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
566	NC_009380	GC	3	6	23332	23337	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
567	NC_009380	CGGC	2	8	23345	23352	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
568	NC_009380	AGG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
569	NC_009380	GCA	2	6	23390	23395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
570	NC_009380	CGA	2	6	23399	23404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
571	NC_009380	CGT	2	6	23411	23416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
572	NC_009380	GAG	2	6	23427	23432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
573	NC_009380	GCC	2	6	23436	23441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
574	NC_009380	TG	3	6	23462	23467	0 %	50 %	50 %	0 %	145592583
575	NC_009380	GAG	2	6	23493	23498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
576	NC_009380	CAGC	2	8	23518	23525	25 %	0 %	25 %	50 %	145592583
577	NC_009380	CCG	3	9	23537	23545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
578	NC_009380	GGC	2	6	23577	23582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
579	NC_009380	G	6	6	23609	23614	0 %	0 %	100 %	0 %	145592583
580	NC_009380	GAG	2	6	23625	23630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
581	NC_009380	GCG	2	6	23700	23705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
582	NC_009380	CGA	2	6	23714	23719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592583
583	NC_009380	CGC	2	6	23720	23725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
584	NC_009380	GGC	2	6	23751	23756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
585	NC_009380	GCG	2	6	23809	23814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
586	NC_009380	CGG	3	9	23843	23851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
587	NC_009380	CTG	2	6	23852	23857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592583
588	NC_009380	TCGG	2	8	23926	23933	0 %	25 %	50 %	25 %	145592583
589	NC_009380	CGGCC	2	10	23948	23957	0 %	0 %	40 %	60 %	145592583
590	NC_009380	CAC	2	6	24027	24032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592583
591	NC_009380	GCC	2	6	24066	24071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
592	NC_009380	AGG	2	6	24109	24114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
593	NC_009380	GC	3	6	24130	24135	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
594	NC_009380	GAG	2	6	24186	24191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592583
595	NC_009380	GGC	2	6	24237	24242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
596	NC_009380	G	6	6	24290	24295	0 %	0 %	100 %	0 %	145592583
597	NC_009380	TCCT	2	8	24303	24310	0 %	50 %	0 %	50 %	145592583
598	NC_009380	CGG	2	6	24312	24317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
599	NC_009380	GCG	2	6	24320	24325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
600	NC_009380	CTCGG	2	10	24400	24409	0 %	20 %	40 %	40 %	145592583
601	NC_009380	ACC	3	9	24424	24432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592583
602	NC_009380	CCG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
603	NC_009380	GACA	2	8	24527	24534	50 %	0 %	25 %	25 %	145592583
604	NC_009380	CGG	3	9	24577	24585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
605	NC_009380	CG	3	6	24601	24606	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
606	NC_009380	GCG	2	6	24616	24621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592583
607	NC_009380	GCC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592583
608	NC_009380	GC	3	6	24668	24673	0 %	0 %	50 %	50 %	145592583
609	NC_009380	ATC	2	6	24703	24708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592583
610	NC_009380	CGG	2	6	24893	24898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592584
611	NC_009380	CCG	2	6	24902	24907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592584
612	NC_009380	CACC	2	8	24977	24984	25 %	0 %	0 %	75 %	145592584
613	NC_009380	CGC	2	6	25021	25026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592584
614	NC_009380	TAC	2	6	25041	25046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592584
615	NC_009380	TGG	2	6	25099	25104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592584
616	NC_009380	TCTG	2	8	25136	25143	0 %	50 %	25 %	25 %	145592584
617	NC_009380	CAC	2	6	25329	25334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592585
618	NC_009380	GGA	2	6	25404	25409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592585
619	NC_009380	GAG	2	6	25444	25449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592585
620	NC_009380	GCC	2	6	25453	25458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592585
621	NC_009380	CTG	2	6	25474	25479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592585
622	NC_009380	CGG	2	6	25607	25612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592586
623	NC_009380	TCAG	2	8	25616	25623	25 %	25 %	25 %	25 %	145592586
624	NC_009380	GGC	2	6	25624	25629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592586
625	NC_009380	GCG	2	6	25718	25723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592586
626	NC_009380	GAG	2	6	25765	25770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592586
627	NC_009380	CGT	2	6	25848	25853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592586
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753	NC_009380	CGA	2	6	31985	31990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592593
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755	NC_009380	CCG	2	6	32044	32049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592593
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784	NC_009380	CCG	2	6	33362	33367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592593
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