MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 1081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	139472890
2	NC_009332	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	139472891
3	NC_009332	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	139472892
4	NC_009332	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	139472894
5	NC_009332	TCAAT	2	10	11646	11655	40 %	40 %	0 %	20 %	139472899
6	NC_009332	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	139472899
7	NC_009332	TACAC	2	10	15914	15923	40 %	20 %	0 %	40 %	139472902
8	NC_009332	TAAAT	2	10	15924	15933	60 %	40 %	0 %	0 %	139472902
9	NC_009332	AGTGA	2	10	33008	33017	40 %	20 %	40 %	0 %	139472904
10	NC_009332	ATTTT	2	10	33707	33716	20 %	80 %	0 %	0 %	139472905
11	NC_009332	TTGAT	2	10	33896	33905	20 %	60 %	20 %	0 %	139472905
12	NC_009332	AGCAG	2	10	43302	43311	40 %	0 %	40 %	20 %	139472911
13	NC_009332	GGTCA	2	10	43666	43675	20 %	20 %	40 %	20 %	139472911
14	NC_009332	GCAGG	2	10	48143	48152	20 %	0 %	60 %	20 %	139472913
15	NC_009332	CTGCC	2	10	49107	49116	0 %	20 %	20 %	60 %	139472915
16	NC_009332	CTCAG	2	10	49500	49509	20 %	20 %	20 %	40 %	139472915
17	NC_009332	TGTAT	2	10	53678	53687	20 %	60 %	20 %	0 %	139472918
18	NC_009332	TATTT	2	10	53757	53766	20 %	80 %	0 %	0 %	139472918
19	NC_009332	TCGGA	2	10	54106	54115	20 %	20 %	40 %	20 %	139472919
20	NC_009332	GCTTT	2	10	56851	56860	0 %	60 %	20 %	20 %	139472922
21	NC_009332	TTTTC	2	10	57049	57058	0 %	80 %	0 %	20 %	139472922
22	NC_009332	AAACC	2	10	57114	57123	60 %	0 %	0 %	40 %	139472922
23	NC_009332	ATGGT	2	10	58887	58896	20 %	40 %	40 %	0 %	139472923
24	NC_009332	ATTCA	2	10	59571	59580	40 %	40 %	0 %	20 %	139472923
25	NC_009332	TTTTA	2	10	63342	63351	20 %	80 %	0 %	0 %	139472925
26	NC_009332	AAAGC	2	10	63535	63544	60 %	0 %	20 %	20 %	139472925
27	NC_009332	TTTGG	2	10	68608	68617	0 %	60 %	40 %	0 %	139472932
28	NC_009332	TTCAC	2	10	68964	68973	20 %	40 %	0 %	40 %	139472933
29	NC_009332	GAAAT	2	10	70045	70054	60 %	20 %	20 %	0 %	139472935
30	NC_009332	TCCAA	2	10	75745	75754	40 %	20 %	0 %	40 %	139472947
31	NC_009332	AACAA	2	10	81223	81232	80 %	0 %	0 %	20 %	139472955
32	NC_009332	CTTGG	2	10	91045	91054	0 %	40 %	40 %	20 %	139472958
33	NC_009332	TCTTA	2	10	91463	91472	20 %	60 %	0 %	20 %	139472958
34	NC_009332	CACTC	2	10	93007	93016	20 %	20 %	0 %	60 %	139472959
35	NC_009332	GATTG	2	10	95268	95277	20 %	40 %	40 %	0 %	139472960
36	NC_009332	TTGAT	2	10	105427	105436	20 %	60 %	20 %	0 %	139472965
37	NC_009332	AAATC	2	10	105595	105604	60 %	20 %	0 %	20 %	139472965
38	NC_009332	TGAAG	2	10	110911	110920	40 %	20 %	40 %	0 %	139472974
39	NC_009332	TTTAG	2	10	112770	112779	20 %	60 %	20 %	0 %	139472977
40	NC_009332	GTGTT	2	10	117173	117182	0 %	60 %	40 %	0 %	139472983
41	NC_009332	TTGAA	2	10	117462	117471	40 %	40 %	20 %	0 %	139472984
42	NC_009332	CTACA	2	10	122288	122297	40 %	20 %	0 %	40 %	139472987
43	NC_009332	AAAGA	2	10	122322	122331	80 %	0 %	20 %	0 %	139472987
44	NC_009332	AGGAG	2	10	126007	126016	40 %	0 %	60 %	0 %	139472991
45	NC_009332	TAATT	2	10	126834	126843	40 %	60 %	0 %	0 %	139472991
46	NC_009332	TCAGG	2	10	127297	127306	20 %	20 %	40 %	20 %	139472991
47	NC_009332	TTTTA	2	10	129068	129077	20 %	80 %	0 %	0 %	139472993
48	NC_009332	GCTTT	3	15	129644	129658	0 %	60 %	20 %	20 %	139472993
49	NC_009332	GTCAT	2	10	129963	129972	20 %	40 %	20 %	20 %	139472993
50	NC_009332	TAGTG	2	10	130907	130916	20 %	40 %	40 %	0 %	139472994
51	NC_009332	GTTAA	2	10	131310	131319	40 %	40 %	20 %	0 %	139472994
52	NC_009332	AATAA	2	10	131339	131348	80 %	20 %	0 %	0 %	139472994
53	NC_009332	TTGAT	2	10	132426	132435	20 %	60 %	20 %	0 %	139472995
54	NC_009332	TTGAC	2	10	133648	133657	20 %	40 %	20 %	20 %	139472997
55	NC_009332	TACCT	2	10	133829	133838	20 %	40 %	0 %	40 %	139472997
56	NC_009332	AATCA	2	10	134608	134617	60 %	20 %	0 %	20 %	139472998
57	NC_009332	TCATG	2	10	135215	135224	20 %	40 %	20 %	20 %	139472999
58	NC_009332	AACAA	2	10	136361	136370	80 %	0 %	0 %	20 %	139473000
59	NC_009332	CAAAA	2	10	137576	137585	80 %	0 %	0 %	20 %	139473002
60	NC_009332	TTTTA	2	10	138649	138658	20 %	80 %	0 %	0 %	139473002
61	NC_009332	AAAGC	2	10	139837	139846	60 %	0 %	20 %	20 %	139473004
62	NC_009332	AGTTC	2	10	140087	140096	20 %	40 %	20 %	20 %	139473004
63	NC_009332	GCTGA	2	10	140107	140116	20 %	20 %	40 %	20 %	139473004
64	NC_009332	ATCGC	2	10	143481	143490	20 %	20 %	20 %	40 %	139473007
65	NC_009332	TTGGG	2	10	144884	144893	0 %	40 %	60 %	0 %	139473008
66	NC_009332	GTACG	2	10	149275	149284	20 %	20 %	40 %	20 %	139473012
67	NC_009332	GAAAA	2	10	150194	150203	80 %	0 %	20 %	0 %	139473013
68	NC_009332	GGATT	2	10	150311	150320	20 %	40 %	40 %	0 %	139473013
69	NC_009332	TTTTG	2	10	150831	150840	0 %	80 %	20 %	0 %	139473013
70	NC_009332	TCATG	2	10	152338	152347	20 %	40 %	20 %	20 %	139473015
71	NC_009332	GTCGC	2	10	154038	154047	0 %	20 %	40 %	40 %	139473017
72	NC_009332	CTTGT	2	10	158679	158688	0 %	60 %	20 %	20 %	139473021
73	NC_009332	GCAAC	2	10	159613	159622	40 %	0 %	20 %	40 %	139473022
74	NC_009332	AAGGT	2	10	161295	161304	40 %	20 %	40 %	0 %	139473022
75	NC_009332	ATTTG	2	10	167579	167588	20 %	60 %	20 %	0 %	139473030
76	NC_009332	CAAGA	2	10	169501	169510	60 %	0 %	20 %	20 %	139473031
77	NC_009332	TTTGG	2	10	170669	170678	0 %	60 %	40 %	0 %	139473032
78	NC_009332	TGGAT	2	10	171618	171627	20 %	40 %	40 %	0 %	139473033
79	NC_009332	TTGCC	2	10	171993	172002	0 %	40 %	20 %	40 %	139473033
80	NC_009332	CCTAA	2	10	172691	172700	40 %	20 %	0 %	40 %	139473033
81	NC_009332	GGAAA	2	10	177720	177729	60 %	0 %	40 %	0 %	139473037
82	NC_009332	TAATC	2	10	180546	180555	40 %	40 %	0 %	20 %	139473041
83	NC_009332	AGATA	2	10	188395	188404	60 %	20 %	20 %	0 %	139473049
84	NC_009332	ATATA	2	10	189184	189193	60 %	40 %	0 %	0 %	139473049
85	NC_009332	GTTTT	2	10	191141	191150	0 %	80 %	20 %	0 %	139473053
86	NC_009332	TTTTG	2	10	193071	193080	0 %	80 %	20 %	0 %	139473054
87	NC_009332	TTTTA	2	10	195557	195566	20 %	80 %	0 %	0 %	139473057
88	NC_009332	CTAAT	2	10	195795	195804	40 %	40 %	0 %	20 %	139473057
89	NC_009332	GAATG	2	10	196318	196327	40 %	20 %	40 %	0 %	139473057
90	NC_009332	CCTTC	2	10	200744	200753	0 %	40 %	0 %	60 %	139473061
91	NC_009332	GCTAA	2	10	200787	200796	40 %	20 %	20 %	20 %	139473061
92	NC_009332	TGGAT	2	10	202878	202887	20 %	40 %	40 %	0 %	139473063
93	NC_009332	CTTTT	2	10	203048	203057	0 %	80 %	0 %	20 %	139473063
94	NC_009332	GAGAA	2	10	204419	204428	60 %	0 %	40 %	0 %	139473064
95	NC_009332	AAATG	2	10	207077	207086	60 %	20 %	20 %	0 %	139473065
96	NC_009332	CAAAT	2	10	208222	208231	60 %	20 %	0 %	20 %	139473067
97	NC_009332	CTCAT	2	10	212668	212677	20 %	40 %	0 %	40 %	139473072
98	NC_009332	TTTTC	2	10	212888	212897	0 %	80 %	0 %	20 %	139473072
99	NC_009332	TTATT	2	10	213128	213137	20 %	80 %	0 %	0 %	139473072
100	NC_009332	TTGTC	2	10	214628	214637	0 %	60 %	20 %	20 %	139473074
101	NC_009332	GCAGC	2	10	218884	218893	20 %	0 %	40 %	40 %	139473078
102	NC_009332	ATTCC	2	10	220189	220198	20 %	40 %	0 %	40 %	139473080
103	NC_009332	AATCA	2	10	224731	224740	60 %	20 %	0 %	20 %	139473085
104	NC_009332	AGCTA	2	10	228403	228412	40 %	20 %	20 %	20 %	139473087
105	NC_009332	GAAAC	2	10	228851	228860	60 %	0 %	20 %	20 %	139473087
106	NC_009332	CCAAT	2	10	231224	231233	40 %	20 %	0 %	40 %	139473090
107	NC_009332	CAAGA	2	10	231998	232007	60 %	0 %	20 %	20 %	139473090
108	NC_009332	TTTGG	2	10	234979	234988	0 %	60 %	40 %	0 %	139473093
109	NC_009332	TTTTA	2	10	239483	239492	20 %	80 %	0 %	0 %	139473096
110	NC_009332	TGGTT	2	10	241421	241430	0 %	60 %	40 %	0 %	139473098
111	NC_009332	TTTGC	2	10	242686	242695	0 %	60 %	20 %	20 %	139473099
112	NC_009332	ATTAC	2	10	242816	242825	40 %	40 %	0 %	20 %	139473099
113	NC_009332	TGATT	2	10	243829	243838	20 %	60 %	20 %	0 %	139473100
114	NC_009332	CCAAT	2	10	244086	244095	40 %	20 %	0 %	40 %	139473100
115	NC_009332	GTGAT	2	10	245683	245692	20 %	40 %	40 %	0 %	139473102
116	NC_009332	GGTTC	2	10	249779	249788	0 %	40 %	40 %	20 %	139473105
117	NC_009332	ATAGT	2	10	249899	249908	40 %	40 %	20 %	0 %	139473105
118	NC_009332	AAAAG	2	10	264385	264394	80 %	0 %	20 %	0 %	139473112
119	NC_009332	TAAAT	2	10	265184	265193	60 %	40 %	0 %	0 %	139473113
120	NC_009332	TTGGT	2	10	266857	266866	0 %	60 %	40 %	0 %	139473115
121	NC_009332	TCTAG	2	10	267189	267198	20 %	40 %	20 %	20 %	139473116
122	NC_009332	GTAAT	2	10	268504	268513	40 %	40 %	20 %	0 %	139473117
123	NC_009332	ATAAA	2	10	268909	268918	80 %	20 %	0 %	0 %	139473118
124	NC_009332	CAAAA	2	10	269570	269579	80 %	0 %	0 %	20 %	139473118
125	NC_009332	TGAAA	2	10	271731	271740	60 %	20 %	20 %	0 %	139473120
126	NC_009332	TGTGA	2	10	271861	271870	20 %	40 %	40 %	0 %	139473120
127	NC_009332	GTTTT	2	10	272609	272618	0 %	80 %	20 %	0 %	139473120
128	NC_009332	AAGAG	2	10	273050	273059	60 %	0 %	40 %	0 %	139473121
129	NC_009332	ATCAA	2	10	274868	274877	60 %	20 %	0 %	20 %	139473122
130	NC_009332	AAACG	2	10	275555	275564	60 %	0 %	20 %	20 %	139473123
131	NC_009332	AAACC	2	10	275572	275581	60 %	0 %	0 %	40 %	139473123
132	NC_009332	GTCTT	2	10	276755	276764	0 %	60 %	20 %	20 %	139473125
133	NC_009332	AAACC	2	10	278897	278906	60 %	0 %	0 %	40 %	139473126
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