MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009332	ATT	2	6	215427	215432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473075
3502	NC_009332	CAA	2	6	215447	215452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473075
3503	NC_009332	TATT	2	8	215525	215532	25 %	75 %	0 %	0 %	139473075
3504	NC_009332	ATT	2	6	215560	215565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473075
3505	NC_009332	GCT	2	6	215583	215588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473075
3506	NC_009332	CA	3	6	215592	215597	50 %	0 %	0 %	50 %	139473075
3507	NC_009332	ATC	2	6	215604	215609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473075
3508	NC_009332	TAA	2	6	215672	215677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473075
3509	NC_009332	TGG	2	6	215741	215746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473075
3510	NC_009332	GAC	2	6	215748	215753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473075
3511	NC_009332	AGG	2	6	215789	215794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473075
3512	NC_009332	TGC	3	9	215807	215815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473075
3513	NC_009332	TGG	2	6	215822	215827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473075
3514	NC_009332	ATT	2	6	215849	215854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473075
3515	NC_009332	AAGGCC	2	12	215895	215906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473075
3516	NC_009332	TTA	2	6	215971	215976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473075
3517	NC_009332	AAG	2	6	215977	215982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473075
3518	NC_009332	GCT	3	9	216072	216080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473075
3519	NC_009332	ATT	2	6	216139	216144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473076
3520	NC_009332	TGG	2	6	216158	216163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473076
3521	NC_009332	CTGG	2	8	216306	216313	0 %	25 %	50 %	25 %	139473076
3522	NC_009332	TCT	2	6	216324	216329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473076
3523	NC_009332	TGA	2	6	216347	216352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473076
3524	NC_009332	A	6	6	216408	216413	100 %	0 %	0 %	0 %	139473076
3525	NC_009332	GTA	2	6	216583	216588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473076
3526	NC_009332	GTC	2	6	216715	216720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473076
3527	NC_009332	AGC	2	6	216761	216766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473076
3528	NC_009332	GTT	2	6	216819	216824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473076
3529	NC_009332	TGG	2	6	216835	216840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473076
3530	NC_009332	TGG	2	6	216845	216850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473076
3531	NC_009332	ATT	2	6	216871	216876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473076
3532	NC_009332	AAT	2	6	216963	216968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473076
3533	NC_009332	TAC	2	6	216987	216992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473076
3534	NC_009332	AAT	2	6	217050	217055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473076
3535	NC_009332	AAT	2	6	217205	217210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473077
3536	NC_009332	T	6	6	217225	217230	0 %	100 %	0 %	0 %	139473077
3537	NC_009332	ATAA	2	8	217265	217272	75 %	25 %	0 %	0 %	139473077
3538	NC_009332	CAT	2	6	217277	217282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473077
3539	NC_009332	AAG	2	6	217286	217291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473077
3540	NC_009332	AC	3	6	217306	217311	50 %	0 %	0 %	50 %	139473077
3541	NC_009332	TGG	2	6	217329	217334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473077
3542	NC_009332	TGA	2	6	217337	217342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473077
3543	NC_009332	AAT	2	6	217349	217354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473077
3544	NC_009332	GTC	2	6	217364	217369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473077
3545	NC_009332	TGT	2	6	217388	217393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473077
3546	NC_009332	TGA	2	6	217428	217433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473077
3547	NC_009332	TGA	2	6	217441	217446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473077
3548	NC_009332	GTTT	2	8	217451	217458	0 %	75 %	25 %	0 %	139473077
3549	NC_009332	CTA	2	6	217591	217596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473077
3550	NC_009332	AGA	2	6	217601	217606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473077
3551	NC_009332	TAA	2	6	217699	217704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473077
3552	NC_009332	T	6	6	217830	217835	0 %	100 %	0 %	0 %	139473077
3553	NC_009332	GGC	2	6	217850	217855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473077
3554	NC_009332	GA	3	6	217858	217863	50 %	0 %	50 %	0 %	139473077
3555	NC_009332	TAA	2	6	217921	217926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473077
3556	NC_009332	A	7	7	217925	217931	100 %	0 %	0 %	0 %	139473077
3557	NC_009332	ATG	2	6	217969	217974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473077
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3559	NC_009332	TAA	2	6	218286	218291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473078
3560	NC_009332	CAT	2	6	218292	218297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473078
3561	NC_009332	ACTA	2	8	218316	218323	50 %	25 %	0 %	25 %	139473078
3562	NC_009332	GAA	2	6	218377	218382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473078
3563	NC_009332	TTGGCT	2	12	218383	218394	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	139473078
3564	NC_009332	CTA	2	6	218492	218497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473078
3565	NC_009332	GAG	2	6	218542	218547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473078
3566	NC_009332	TC	3	6	218555	218560	0 %	50 %	0 %	50 %	139473078
3567	NC_009332	TGGA	2	8	218614	218621	25 %	25 %	50 %	0 %	139473078
3568	NC_009332	TCA	2	6	218735	218740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473078
3569	NC_009332	AGC	2	6	218742	218747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473078
3570	NC_009332	CAT	2	6	218769	218774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473078
3571	NC_009332	ATG	2	6	218827	218832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473078
3572	NC_009332	GCAGC	2	10	218884	218893	20 %	0 %	40 %	40 %	139473078
3573	NC_009332	TGG	2	6	218915	218920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473078
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3580	NC_009332	AATC	2	8	219214	219221	50 %	25 %	0 %	25 %	139473079
3581	NC_009332	GTG	2	6	219237	219242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473079
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3583	NC_009332	ATG	3	9	219441	219449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473079
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3585	NC_009332	ATT	2	6	219592	219597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473079
3586	NC_009332	GAA	2	6	219620	219625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473079
3587	NC_009332	AT	3	6	219759	219764	50 %	50 %	0 %	0 %	139473080
3588	NC_009332	TGC	2	6	219963	219968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473080
3589	NC_009332	TGA	2	6	219990	219995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473080
3590	NC_009332	TCAA	2	8	220052	220059	50 %	25 %	0 %	25 %	139473080
3591	NC_009332	GGT	2	6	220125	220130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473080
3592	NC_009332	TAC	2	6	220144	220149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473080
3593	NC_009332	TTGA	2	8	220174	220181	25 %	50 %	25 %	0 %	139473080
3594	NC_009332	ATTCC	2	10	220189	220198	20 %	40 %	0 %	40 %	139473080
3595	NC_009332	ATG	2	6	220213	220218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473080
3596	NC_009332	TTGA	2	8	220399	220406	25 %	50 %	25 %	0 %	139473080
3597	NC_009332	TCG	2	6	220458	220463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473080
3598	NC_009332	GTG	2	6	220568	220573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473080
3599	NC_009332	AAG	2	6	220619	220624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473080
3600	NC_009332	CTGG	2	8	221083	221090	0 %	25 %	50 %	25 %	139473081
3601	NC_009332	TTA	2	6	221094	221099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473081
3602	NC_009332	CAG	2	6	221195	221200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473081
3603	NC_009332	CCT	2	6	221260	221265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139473081
3604	NC_009332	TTA	2	6	221291	221296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473081
3605	NC_009332	TCT	2	6	221328	221333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473081
3606	NC_009332	CTTG	2	8	221349	221356	0 %	50 %	25 %	25 %	139473081
3607	NC_009332	TTA	2	6	221401	221406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473081
3608	NC_009332	GAG	2	6	221416	221421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473081
3609	NC_009332	TTG	2	6	221485	221490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473081
3610	NC_009332	GTC	2	6	221618	221623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473081
3611	NC_009332	ACC	2	6	221626	221631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473081
3612	NC_009332	TCA	2	6	221689	221694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473081
3613	NC_009332	TACCCA	2	12	221784	221795	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	139473081
3614	NC_009332	CGT	2	6	221893	221898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473081
3615	NC_009332	A	6	6	221908	221913	100 %	0 %	0 %	0 %	139473081
3616	NC_009332	AAAG	2	8	221921	221928	75 %	0 %	25 %	0 %	139473081
3617	NC_009332	AGC	2	6	221973	221978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473082
3618	NC_009332	AGCT	2	8	222002	222009	25 %	25 %	25 %	25 %	139473082
3619	NC_009332	GAA	2	6	222016	222021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473082
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3621	NC_009332	TGT	2	6	222093	222098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473082
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3988	NC_009332	GTT	2	6	243338	243343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473100
3989	NC_009332	TGA	2	6	243418	243423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473100
3990	NC_009332	AGTGAC	2	12	243533	243544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	139473100
3991	NC_009332	AAAG	2	8	243581	243588	75 %	0 %	25 %	0 %	139473100
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