MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 chromosome

Total Repeats: 204097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009142	CGG	2	6	20021	20026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096632
502	NC_009142	CAT	2	6	20028	20033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134096632
503	NC_009142	CTG	3	9	20113	20121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096632
504	NC_009142	TCG	2	6	20129	20134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096632
505	NC_009142	TGC	3	9	20165	20173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096632
506	NC_009142	TGG	2	6	20185	20190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096632
507	NC_009142	GAA	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134096632
508	NC_009142	TCGC	2	8	20318	20325	0 %	25 %	25 %	50 %	134096633
509	NC_009142	GGA	2	6	20326	20331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096633
510	NC_009142	ACG	2	6	20400	20405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
511	NC_009142	AGCG	2	8	20408	20415	25 %	0 %	50 %	25 %	134096633
512	NC_009142	ACCT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	0 %	50 %	134096633
513	NC_009142	GGA	2	6	20476	20481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096633
514	NC_009142	GC	3	6	20491	20496	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
515	NC_009142	CTG	2	6	20522	20527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
516	NC_009142	TGG	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096633
517	NC_009142	CGG	2	6	20553	20558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
518	NC_009142	AGC	2	6	20619	20624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
519	NC_009142	GC	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
520	NC_009142	CAC	2	6	20687	20692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096633
521	NC_009142	CGG	2	6	20737	20742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
522	NC_009142	GTG	2	6	20795	20800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096633
523	NC_009142	GC	3	6	20810	20815	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
524	NC_009142	CGA	2	6	20818	20823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
525	NC_009142	GCG	2	6	20826	20831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
526	NC_009142	CGGG	2	8	20835	20842	0 %	0 %	75 %	25 %	134096633
527	NC_009142	GC	3	6	20923	20928	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
528	NC_009142	CGG	2	6	20938	20943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
529	NC_009142	GAG	2	6	20990	20995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096633
530	NC_009142	GCA	2	6	21051	21056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
531	NC_009142	AGC	2	6	21108	21113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
532	NC_009142	GTC	2	6	21134	21139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
533	NC_009142	CGG	2	6	21155	21160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
534	NC_009142	CTG	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
535	NC_009142	GGT	2	6	21265	21270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096633
536	NC_009142	GTCG	2	8	21316	21323	0 %	25 %	50 %	25 %	134096633
537	NC_009142	GT	3	6	21366	21371	0 %	50 %	50 %	0 %	134096633
538	NC_009142	AGA	2	6	21375	21380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134096633
539	NC_009142	TGG	2	6	21396	21401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096633
540	NC_009142	GAA	2	6	21491	21496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134096633
541	NC_009142	GC	3	6	21499	21504	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
542	NC_009142	GCT	2	6	21526	21531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
543	NC_009142	ACG	2	6	21534	21539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
544	NC_009142	GTT	2	6	21580	21585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134096633
545	NC_009142	GAC	2	6	21599	21604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
546	NC_009142	GC	3	6	21640	21645	0 %	0 %	50 %	50 %	134096633
547	NC_009142	GCA	2	6	21658	21663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
548	NC_009142	CGG	2	6	21677	21682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
549	NC_009142	CCG	2	6	21696	21701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096633
550	NC_009142	CAC	2	6	21748	21753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096633
551	NC_009142	AGC	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
552	NC_009142	CGA	2	6	21793	21798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
553	NC_009142	CCG	2	6	21870	21875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096633
554	NC_009142	TGC	2	6	21909	21914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
555	NC_009142	GGC	2	6	21936	21941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096633
556	NC_009142	CGT	2	6	21988	21993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
557	NC_009142	GCA	2	6	22009	22014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096633
558	NC_009142	TCG	2	6	22064	22069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096633
559	NC_009142	GCGAAC	2	12	22297	22308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
560	NC_009142	CG	3	6	22311	22316	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
561	NC_009142	GGA	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
562	NC_009142	GCT	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
563	NC_009142	GCT	2	6	22439	22444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
564	NC_009142	GCA	2	6	22493	22498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
565	NC_009142	GCT	2	6	22511	22516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
566	NC_009142	CGA	2	6	22517	22522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
567	NC_009142	GCC	2	6	22535	22540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
568	NC_009142	GC	3	6	22559	22564	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
569	NC_009142	GTG	2	6	22602	22607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096634
570	NC_009142	CGG	3	9	22609	22617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
571	NC_009142	GCT	2	6	22625	22630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
572	NC_009142	CG	4	8	22640	22647	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
573	NC_009142	GCT	2	6	22655	22660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
574	NC_009142	CGT	3	9	22661	22669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
575	NC_009142	CGA	2	6	22670	22675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
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577	NC_009142	CCGC	2	8	22720	22727	0 %	0 %	25 %	75 %	134096634
578	NC_009142	ACCGA	2	10	22737	22746	40 %	0 %	20 %	40 %	134096634
579	NC_009142	GCT	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
580	NC_009142	AGC	2	6	22777	22782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
581	NC_009142	TGC	2	6	22813	22818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
582	NC_009142	CGA	2	6	22832	22837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
583	NC_009142	GCC	2	6	22839	22844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
584	NC_009142	GAC	2	6	22845	22850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
585	NC_009142	CGA	2	6	22856	22861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
586	NC_009142	GCTGG	2	10	22862	22871	0 %	20 %	60 %	20 %	134096634
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589	NC_009142	GCT	3	9	22976	22984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
590	NC_009142	GAGC	2	8	23000	23007	25 %	0 %	50 %	25 %	134096634
591	NC_009142	CTGC	2	8	23043	23050	0 %	25 %	25 %	50 %	134096634
592	NC_009142	GCT	3	9	23063	23071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
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595	NC_009142	GTG	2	6	23106	23111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096634
596	NC_009142	CGG	2	6	23230	23235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
597	NC_009142	CGC	2	6	23276	23281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
598	NC_009142	GAG	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
599	NC_009142	GACC	2	8	23297	23304	25 %	0 %	25 %	50 %	134096634
600	NC_009142	GGC	2	6	23342	23347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
601	NC_009142	GAG	2	6	23361	23366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
602	NC_009142	AGCGC	2	10	23383	23392	20 %	0 %	40 %	40 %	134096634
603	NC_009142	CCG	2	6	23398	23403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
604	NC_009142	GCG	2	6	23405	23410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
605	NC_009142	CGG	2	6	23411	23416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
606	NC_009142	GGT	2	6	23426	23431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096634
607	NC_009142	GC	3	6	23444	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
608	NC_009142	GAC	2	6	23549	23554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
609	NC_009142	CTG	2	6	23607	23612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
610	NC_009142	CGG	2	6	23641	23646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
611	NC_009142	GC	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
612	NC_009142	AGG	2	6	23677	23682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
613	NC_009142	GGA	2	6	23699	23704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
614	NC_009142	CGG	2	6	23735	23740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
615	NC_009142	CGGGC	2	10	23767	23776	0 %	0 %	60 %	40 %	134096634
616	NC_009142	CG	3	6	23777	23782	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
617	NC_009142	TGA	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134096634
618	NC_009142	GCT	2	6	23819	23824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
619	NC_009142	CGC	2	6	23840	23845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
620	NC_009142	CAC	2	6	23873	23878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096634
621	NC_009142	CG	3	6	23881	23886	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
622	NC_009142	GCT	2	6	23888	23893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
623	NC_009142	CGA	3	9	23921	23929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
624	NC_009142	GCCAG	2	10	23980	23989	20 %	0 %	40 %	40 %	134096634
625	NC_009142	ACC	2	6	24082	24087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096634
626	NC_009142	GAG	2	6	24120	24125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
627	NC_009142	GCT	2	6	24182	24187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
628	NC_009142	ACGCCG	2	12	24235	24246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134096634
629	NC_009142	GCC	2	6	24279	24284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
630	NC_009142	GCG	2	6	24285	24290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
631	NC_009142	GGGAC	2	10	24329	24338	20 %	0 %	60 %	20 %	134096634
632	NC_009142	CGG	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
633	NC_009142	GTC	2	6	24359	24364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
634	NC_009142	TCG	2	6	24427	24432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
635	NC_009142	GCG	2	6	24435	24440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
636	NC_009142	TGC	2	6	24472	24477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
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639	NC_009142	GAG	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
640	NC_009142	CGCCAC	2	12	24578	24589	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	134096634
641	NC_009142	CCGCGC	2	12	24623	24634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
642	NC_009142	CTG	2	6	24639	24644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
643	NC_009142	GCA	2	6	24698	24703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096634
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645	NC_009142	GCG	2	6	24732	24737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096634
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647	NC_009142	GCT	2	6	24785	24790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096634
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650	NC_009142	GCC	2	6	24846	24851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
651	NC_009142	CAA	2	6	24863	24868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134096634
652	NC_009142	CGC	2	6	24875	24880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096634
653	NC_009142	CACG	2	8	24898	24905	25 %	0 %	25 %	50 %	134096634
654	NC_009142	CCA	2	6	24911	24916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096634
655	NC_009142	CG	3	6	24952	24957	0 %	0 %	50 %	50 %	134096634
656	NC_009142	CCCA	2	8	24990	24997	25 %	0 %	0 %	75 %	134096634
657	NC_009142	GAG	2	6	25006	25011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096634
658	NC_009142	GGC	2	6	25254	25259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096635
659	NC_009142	TTCTCC	2	12	25267	25278	0 %	50 %	0 %	50 %	134096635
660	NC_009142	CAC	3	9	25281	25289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134096635
661	NC_009142	CGA	2	6	25301	25306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096635
662	NC_009142	GTC	3	9	25323	25331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096635
663	NC_009142	GCG	2	6	25338	25343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096635
664	NC_009142	AGG	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096635
665	NC_009142	GGT	2	6	25361	25366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096635
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668	NC_009142	CGC	3	9	25442	25450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134096635
669	NC_009142	CGCC	2	8	25467	25474	0 %	0 %	25 %	75 %	134096635
670	NC_009142	GTC	2	6	25482	25487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096635
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673	NC_009142	CGGTG	2	10	25542	25551	0 %	20 %	60 %	20 %	134096635
674	NC_009142	GTA	2	6	25599	25604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134096635
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691	NC_009142	CGGG	2	8	25985	25992	0 %	0 %	75 %	25 %	134096635
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709	NC_009142	GAG	2	6	26776	26781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134096636
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722	NC_009142	CGA	2	6	27207	27212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096636
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726	NC_009142	CGGC	2	8	27351	27358	0 %	0 %	50 %	50 %	134096636
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740	NC_009142	CGA	2	6	27969	27974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096637
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742	NC_009142	G	6	6	28024	28029	0 %	0 %	100 %	0 %	134096637
743	NC_009142	GCT	2	6	28049	28054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096638
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745	NC_009142	TCGTGC	2	12	28081	28092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096638
746	NC_009142	GC	3	6	28099	28104	0 %	0 %	50 %	50 %	134096638
747	NC_009142	GCT	2	6	28114	28119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134096638
748	NC_009142	CGG	2	6	28132	28137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096638
749	NC_009142	GTG	2	6	28164	28169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134096638
750	NC_009142	GGC	2	6	28199	28204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096638
751	NC_009142	GACC	2	8	28208	28215	25 %	0 %	25 %	50 %	134096638
752	NC_009142	GGC	2	6	28268	28273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096638
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754	NC_009142	CGG	2	6	28304	28309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134096638
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1000	NC_009142	GAC	2	6	36574	36579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134096641

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