MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009140	GCA	2	6	90002	90007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047133
1502	NC_009140	GGC	2	6	90016	90021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047133
1503	NC_009140	GCA	2	6	90026	90031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047133
1504	NC_009140	ATG	2	6	90053	90058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047133
1505	NC_009140	ACA	2	6	90068	90073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047133
1506	NC_009140	AT	3	6	90095	90100	50 %	50 %	0 %	0 %	134047133
1507	NC_009140	TGA	2	6	90123	90128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047133
1508	NC_009140	GAT	2	6	90133	90138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047133
1509	NC_009140	GAA	2	6	90152	90157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047133
1510	NC_009140	A	6	6	90246	90251	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
1511	NC_009140	TGC	2	6	90263	90268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047133
1512	NC_009140	CT	3	6	90281	90286	0 %	50 %	0 %	50 %	134047133
1513	NC_009140	TAT	2	6	90289	90294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047133
1514	NC_009140	ATTG	2	8	90386	90393	25 %	50 %	25 %	0 %	134047133
1515	NC_009140	AATT	2	8	90400	90407	50 %	50 %	0 %	0 %	134047133
1516	NC_009140	CAG	2	6	90431	90436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047133
1517	NC_009140	GAA	2	6	90520	90525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047133
1518	NC_009140	GC	3	6	90615	90620	0 %	0 %	50 %	50 %	134047133
1519	NC_009140	TGG	3	9	90625	90633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047133
1520	NC_009140	A	7	7	90636	90642	100 %	0 %	0 %	0 %	134047133
1521	NC_009140	GATT	2	8	90670	90677	25 %	50 %	25 %	0 %	134047164
1522	NC_009140	AAG	2	6	90718	90723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047164
1523	NC_009140	AGGTAG	2	12	90776	90787	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134047164
1524	NC_009140	GAG	2	6	90834	90839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047164
1525	NC_009140	TGC	2	6	90847	90852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047164
1526	NC_009140	CATT	2	8	91034	91041	25 %	50 %	0 %	25 %	134047164
1527	NC_009140	TCAG	2	8	91106	91113	25 %	25 %	25 %	25 %	134047164
1528	NC_009140	GAAA	2	8	91142	91149	75 %	0 %	25 %	0 %	134047164
1529	NC_009140	TGT	2	6	91419	91424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047164
1530	NC_009140	CTG	2	6	91466	91471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047164
1531	NC_009140	GCT	2	6	91493	91498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047164
1532	NC_009140	GGT	2	6	91513	91518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047164
1533	NC_009140	TGT	2	6	91536	91541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047164
1534	NC_009140	TGC	2	6	91662	91667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047093
1535	NC_009140	CTT	2	6	91742	91747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047093
1536	NC_009140	GAT	2	6	91791	91796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047093
1537	NC_009140	TGA	2	6	91811	91816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047093
1538	NC_009140	TGC	2	6	91822	91827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047093
1539	NC_009140	GCT	2	6	91850	91855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047093
1540	NC_009140	AG	3	6	91880	91885	50 %	0 %	50 %	0 %	134047093
1541	NC_009140	GAG	2	6	91946	91951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047093
1542	NC_009140	ATTC	2	8	91970	91977	25 %	50 %	0 %	25 %	134047093
1543	NC_009140	CAT	2	6	91995	92000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047093
1544	NC_009140	TTG	2	6	92026	92031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047093
1545	NC_009140	GAT	2	6	92124	92129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047093
1546	NC_009140	CTTG	2	8	92225	92232	0 %	50 %	25 %	25 %	134047093
1547	NC_009140	AGT	2	6	92246	92251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047093
1548	NC_009140	TGC	2	6	92255	92260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047093
1549	NC_009140	GTT	2	6	92265	92270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047093
1550	NC_009140	CAT	2	6	92600	92605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047273
1551	NC_009140	TCA	2	6	92764	92769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047273
1552	NC_009140	TGC	2	6	92777	92782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047273
1553	NC_009140	AAG	2	6	92833	92838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047273
1554	NC_009140	TAA	2	6	92913	92918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047273
1555	NC_009140	ACG	2	6	93241	93246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047084
1556	NC_009140	CAT	2	6	93257	93262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047084
1557	NC_009140	ACG	2	6	93376	93381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047084
1558	NC_009140	GTC	2	6	93871	93876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047151
1559	NC_009140	ACC	2	6	93971	93976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047151
1560	NC_009140	CTC	2	6	94032	94037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047151
1561	NC_009140	GCTG	2	8	94070	94077	0 %	25 %	50 %	25 %	134047151
1562	NC_009140	ATC	2	6	94134	94139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047151
1563	NC_009140	TGA	2	6	94219	94224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047151
1564	NC_009140	GTG	2	6	94471	94476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047151
1565	NC_009140	GAA	2	6	94605	94610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047175
1566	NC_009140	CGT	2	6	94627	94632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047175
1567	NC_009140	CTC	2	6	94710	94715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047175
1568	NC_009140	AAAG	2	8	94852	94859	75 %	0 %	25 %	0 %	134047175
1569	NC_009140	G	6	6	94945	94950	0 %	0 %	100 %	0 %	134047175
1570	NC_009140	CAGC	2	8	94970	94977	25 %	0 %	25 %	50 %	134047175
1571	NC_009140	TC	3	6	94984	94989	0 %	50 %	0 %	50 %	134047175
1572	NC_009140	TTG	2	6	95051	95056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047175
1573	NC_009140	ATCC	2	8	95200	95207	25 %	25 %	0 %	50 %	134047175
1574	NC_009140	CTG	2	6	95260	95265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047175
1575	NC_009140	TGG	2	6	95324	95329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047175
1576	NC_009140	TGA	2	6	95337	95342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047175
1577	NC_009140	GGTTT	2	10	95399	95408	0 %	60 %	40 %	0 %	134047175
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1580	NC_009140	ATG	2	6	95572	95577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047264
1581	NC_009140	CAA	2	6	95589	95594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047264
1582	NC_009140	CAA	2	6	95678	95683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047264
1583	NC_009140	AG	3	6	95719	95724	50 %	0 %	50 %	0 %	134047264
1584	NC_009140	CAA	2	6	95848	95853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047264
1585	NC_009140	ACC	2	6	95866	95871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047264
1586	NC_009140	TGG	2	6	95901	95906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047264
1587	NC_009140	GCA	2	6	95994	95999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047264
1588	NC_009140	GGT	2	6	96013	96018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047264
1589	NC_009140	GAT	2	6	96055	96060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047264
1590	NC_009140	CAC	2	6	96082	96087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047264
1591	NC_009140	TGGC	2	8	96089	96096	0 %	25 %	50 %	25 %	134047264
1592	NC_009140	AGC	2	6	96291	96296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047188
1593	NC_009140	CCGA	2	8	96311	96318	25 %	0 %	25 %	50 %	134047188
1594	NC_009140	GAT	2	6	96325	96330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047188
1595	NC_009140	GTA	2	6	96422	96427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047188
1596	NC_009140	CAT	2	6	96448	96453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047188
1597	NC_009140	ATG	2	6	96471	96476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047188
1598	NC_009140	TGA	2	6	96604	96609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047188
1599	NC_009140	GCG	2	6	96938	96943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047188
1600	NC_009140	CCG	2	6	97071	97076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047188
1601	NC_009140	TGG	2	6	97078	97083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047188
1602	NC_009140	GAA	2	6	97109	97114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047188
1603	NC_009140	GCC	2	6	97117	97122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047188
1604	NC_009140	AGA	2	6	97153	97158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047188
1605	NC_009140	TAC	2	6	97178	97183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047188
1606	NC_009140	GGC	2	6	97295	97300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047100
1607	NC_009140	CGC	2	6	97323	97328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047100
1608	NC_009140	TGC	2	6	97452	97457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047100
1609	NC_009140	GAG	2	6	97471	97476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047100
1610	NC_009140	ATG	2	6	97481	97486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047100
1611	NC_009140	TGC	2	6	97490	97495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047100
1612	NC_009140	GA	3	6	97554	97559	50 %	0 %	50 %	0 %	134047100
1613	NC_009140	TTA	2	6	97650	97655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047100
1614	NC_009140	CAAG	2	8	97692	97699	50 %	0 %	25 %	25 %	134047100
1615	NC_009140	TCT	2	6	97709	97714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047100
1616	NC_009140	GTA	2	6	97807	97812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047100
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1618	NC_009140	AG	4	8	97839	97846	50 %	0 %	50 %	0 %	134047100
1619	NC_009140	TGC	3	9	97887	97895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047100
1620	NC_009140	ATG	2	6	97913	97918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047100
1621	NC_009140	ACT	2	6	98021	98026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047100
1622	NC_009140	AG	3	6	98131	98136	50 %	0 %	50 %	0 %	134047100
1623	NC_009140	TCA	2	6	98140	98145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047100
1624	NC_009140	TTG	2	6	98192	98197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047100
1625	NC_009140	TGCT	2	8	98207	98214	0 %	50 %	25 %	25 %	134047100
1626	NC_009140	TGA	2	6	98220	98225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047100
1627	NC_009140	GAA	2	6	98233	98238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047100
1628	NC_009140	CAT	2	6	98455	98460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047122
1629	NC_009140	GTG	2	6	98565	98570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047122
1630	NC_009140	AAG	2	6	98606	98611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047122
1631	NC_009140	TCG	2	6	98662	98667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047122
1632	NC_009140	CCT	2	6	98668	98673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047122
1633	NC_009140	TCA	2	6	98790	98795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047122
1634	NC_009140	ACA	2	6	98802	98807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047122
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1637	NC_009140	ACT	2	6	99071	99076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047122
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1639	NC_009140	CTTT	2	8	99216	99223	0 %	75 %	0 %	25 %	134047122
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1642	NC_009140	GGT	2	6	99482	99487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047122
1643	NC_009140	CTT	2	6	99520	99525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047122
1644	NC_009140	CGAGG	2	10	99542	99551	20 %	0 %	60 %	20 %	134047122
1645	NC_009140	GAC	2	6	99670	99675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047122
1646	NC_009140	GAC	2	6	99710	99715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047122
1647	NC_009140	TCT	2	6	99729	99734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047122
1648	NC_009140	A	6	6	99827	99832	100 %	0 %	0 %	0 %	134047208
1649	NC_009140	CGA	2	6	99958	99963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047208
1650	NC_009140	AGC	2	6	100006	100011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047208
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1653	NC_009140	TTTG	2	8	100227	100234	0 %	75 %	25 %	0 %	134047208
1654	NC_009140	GTT	3	9	100328	100336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047208
1655	NC_009140	ATC	2	6	100409	100414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047208
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1658	NC_009140	AGA	2	6	100441	100446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047208
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1663	NC_009140	TGG	2	6	100561	100566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047208
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1666	NC_009140	CAG	2	6	100733	100738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047208
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1684	NC_009140	TGCT	2	8	101761	101768	0 %	50 %	25 %	25 %	134047183
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1730	NC_009140	TGC	2	6	104616	104621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047179
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1733	NC_009140	CAT	2	6	104982	104987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047237
1734	NC_009140	TCAG	2	8	104988	104995	25 %	25 %	25 %	25 %	134047237
1735	NC_009140	CT	3	6	105006	105011	0 %	50 %	0 %	50 %	134047237
1736	NC_009140	ACC	2	6	105174	105179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047128
1737	NC_009140	ATC	2	6	105242	105247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047128
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1740	NC_009140	GGTT	2	8	105347	105354	0 %	50 %	50 %	0 %	134047128
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1743	NC_009140	TGA	2	6	105529	105534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047128
1744	NC_009140	AGC	2	6	105575	105580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047204
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1746	NC_009140	TGA	2	6	105758	105763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047204
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1751	NC_009140	TGA	3	9	106264	106272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047102
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1987	NC_009140	GT	3	6	122286	122291	0 %	50 %	50 %	0 %	134047160
1988	NC_009140	GCA	3	9	122357	122365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047160
1989	NC_009140	GCG	2	6	122392	122397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047160
1990	NC_009140	GCG	2	6	122417	122422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047160
1991	NC_009140	GGT	2	6	122442	122447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047160
1992	NC_009140	GAT	2	6	122448	122453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047160
1993	NC_009140	CAA	2	6	122511	122516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047160
1994	NC_009140	TCG	2	6	122620	122625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047160
1995	NC_009140	AGCGC	2	10	122669	122678	20 %	0 %	40 %	40 %	134047160
1996	NC_009140	TTC	2	6	122680	122685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047160
1997	NC_009140	GTA	2	6	122709	122714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047160
1998	NC_009140	CGT	2	6	122729	122734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047160
1999	NC_009140	TGA	2	6	122765	122770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047160
2000	NC_009140	CGG	2	6	122786	122791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047160

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