MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009140	T	6	6	61032	61037	0 %	100 %	0 %	0 %	134047123
1002	NC_009140	ATC	2	6	61094	61099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047123
1003	NC_009140	CAA	2	6	61153	61158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047123
1004	NC_009140	ACC	3	9	61161	61169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047123
1005	NC_009140	CAC	2	6	61177	61182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047123
1006	NC_009140	CCATGC	2	12	61216	61227	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134047123
1007	NC_009140	CTT	2	6	61283	61288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047123
1008	NC_009140	AG	3	6	61337	61342	50 %	0 %	50 %	0 %	134047123
1009	NC_009140	CGC	2	6	61415	61420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047123
1010	NC_009140	TAA	2	6	61468	61473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047123
1011	NC_009140	AG	3	6	61714	61719	50 %	0 %	50 %	0 %	134047225
1012	NC_009140	TC	3	6	61868	61873	0 %	50 %	0 %	50 %	134047225
1013	NC_009140	GTA	2	6	62007	62012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047225
1014	NC_009140	GTGG	2	8	62072	62079	0 %	25 %	75 %	0 %	134047225
1015	NC_009140	TGT	2	6	62243	62248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1016	NC_009140	TCG	2	6	62390	62395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1017	NC_009140	TTC	2	6	62413	62418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047225
1018	NC_009140	CATA	2	8	62443	62450	50 %	25 %	0 %	25 %	134047225
1019	NC_009140	GGT	2	6	62517	62522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047225
1020	NC_009140	CAG	2	6	62576	62581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1021	NC_009140	GAA	2	6	62616	62621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1022	NC_009140	AGGC	2	8	62652	62659	25 %	0 %	50 %	25 %	134047225
1023	NC_009140	CTT	2	6	62682	62687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047225
1024	NC_009140	CCG	2	6	62753	62758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047225
1025	NC_009140	TCA	2	6	62785	62790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1026	NC_009140	TTC	2	6	62838	62843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047225
1027	NC_009140	CAA	2	6	62909	62914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047225
1028	NC_009140	ACAA	2	8	62983	62990	75 %	0 %	0 %	25 %	134047225
1029	NC_009140	ACA	2	6	63034	63039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047225
1030	NC_009140	CAC	2	6	63081	63086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1031	NC_009140	TCT	2	6	63148	63153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047225
1032	NC_009140	CGT	2	6	63179	63184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1033	NC_009140	CA	3	6	63199	63204	50 %	0 %	0 %	50 %	134047225
1034	NC_009140	GTC	2	6	63234	63239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1035	NC_009140	CAG	2	6	63257	63262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1036	NC_009140	CAC	2	6	63314	63319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1037	NC_009140	AAG	2	6	63334	63339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1038	NC_009140	CAG	2	6	63401	63406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1039	NC_009140	ACGG	2	8	63411	63418	25 %	0 %	50 %	25 %	134047225
1040	NC_009140	TTG	2	6	63721	63726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1041	NC_009140	GGT	2	6	63747	63752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047225
1042	NC_009140	CTC	2	6	63753	63758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047225
1043	NC_009140	CGCT	2	8	63765	63772	0 %	25 %	25 %	50 %	134047225
1044	NC_009140	GCG	2	6	63786	63791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047225
1045	NC_009140	TGG	2	6	63803	63808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047225
1046	NC_009140	TGT	2	6	63941	63946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1047	NC_009140	TGG	2	6	63987	63992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047225
1048	NC_009140	TCG	2	6	64018	64023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1049	NC_009140	AG	3	6	64107	64112	50 %	0 %	50 %	0 %	134047225
1050	NC_009140	CTG	2	6	64158	64163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1051	NC_009140	ACAG	2	8	64172	64179	50 %	0 %	25 %	25 %	134047225
1052	NC_009140	T	6	6	64218	64223	0 %	100 %	0 %	0 %	134047225
1053	NC_009140	TCA	2	6	64321	64326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1054	NC_009140	AGT	2	6	64356	64361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047225
1055	NC_009140	CAC	2	6	64409	64414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1056	NC_009140	GTT	2	6	64442	64447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1057	NC_009140	CCAGC	2	10	64472	64481	20 %	0 %	20 %	60 %	134047225
1058	NC_009140	GTT	2	6	64494	64499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1059	NC_009140	AC	3	6	64551	64556	50 %	0 %	0 %	50 %	134047225
1060	NC_009140	GTG	2	6	64600	64605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047225
1061	NC_009140	CAG	2	6	64682	64687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1062	NC_009140	AG	3	6	64686	64691	50 %	0 %	50 %	0 %	134047225
1063	NC_009140	AAG	2	6	64761	64766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1064	NC_009140	CAG	2	6	64793	64798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1065	NC_009140	ACC	2	6	64821	64826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1066	NC_009140	CTGGC	2	10	64866	64875	0 %	20 %	40 %	40 %	134047225
1067	NC_009140	ACC	2	6	64894	64899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1068	NC_009140	CGT	2	6	64937	64942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1069	NC_009140	GAT	2	6	64992	64997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047225
1070	NC_009140	CCAT	2	8	65053	65060	25 %	25 %	0 %	50 %	134047225
1071	NC_009140	CTTC	2	8	65168	65175	0 %	50 %	0 %	50 %	134047225
1072	NC_009140	AAG	2	6	65177	65182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1073	NC_009140	CTC	2	6	65223	65228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047225
1074	NC_009140	C	6	6	65262	65267	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
1075	NC_009140	TAA	2	6	65321	65326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047225
1076	NC_009140	CAT	2	6	65330	65335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1077	NC_009140	GCT	2	6	65350	65355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1078	NC_009140	TGGT	2	8	65378	65385	0 %	50 %	50 %	0 %	134047225
1079	NC_009140	CTG	2	6	65447	65452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1080	NC_009140	CAA	2	6	65456	65461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047225
1081	NC_009140	GTT	2	6	65520	65525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1082	NC_009140	CCA	2	6	65536	65541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1083	NC_009140	TTG	2	6	65554	65559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1084	NC_009140	CTGG	2	8	65621	65628	0 %	25 %	50 %	25 %	134047225
1085	NC_009140	CTG	2	6	65667	65672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1086	NC_009140	TGT	2	6	65781	65786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1087	NC_009140	TAC	2	6	65906	65911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1088	NC_009140	GAA	2	6	65924	65929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1089	NC_009140	GA	3	6	66026	66031	50 %	0 %	50 %	0 %	134047225
1090	NC_009140	C	7	7	66058	66064	0 %	0 %	0 %	100 %	134047225
1091	NC_009140	AAT	2	6	66089	66094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047225
1092	NC_009140	TCT	2	6	66148	66153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047225
1093	NC_009140	TC	3	6	66167	66172	0 %	50 %	0 %	50 %	134047225
1094	NC_009140	CAA	2	6	66287	66292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047225
1095	NC_009140	GTT	2	6	66315	66320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047225
1096	NC_009140	GCTTT	2	10	66569	66578	0 %	60 %	20 %	20 %	134047225
1097	NC_009140	TCA	2	6	66598	66603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1098	NC_009140	GGC	2	6	66721	66726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047225
1099	NC_009140	CTGTA	2	10	66759	66768	20 %	40 %	20 %	20 %	134047225
1100	NC_009140	CCA	2	6	66811	66816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047225
1101	NC_009140	TAG	2	6	66847	66852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047225
1102	NC_009140	CCAC	2	8	66859	66866	25 %	0 %	0 %	75 %	134047225
1103	NC_009140	AAG	2	6	66888	66893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047225
1104	NC_009140	CCGA	2	8	66926	66933	25 %	0 %	25 %	50 %	134047225
1105	NC_009140	GTTGG	2	10	66994	67003	0 %	40 %	60 %	0 %	134047225
1106	NC_009140	CAG	2	6	67065	67070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1107	NC_009140	AGC	2	6	67080	67085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047225
1108	NC_009140	ATC	2	6	67144	67149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047225
1109	NC_009140	TTC	2	6	67778	67783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047260
1110	NC_009140	CA	3	6	67802	67807	50 %	0 %	0 %	50 %	134047260
1111	NC_009140	GAC	2	6	67820	67825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047260
1112	NC_009140	CTT	2	6	67835	67840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047260
1113	NC_009140	TTA	2	6	67891	67896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047260
1114	NC_009140	GCG	2	6	67984	67989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047260
1115	NC_009140	CT	3	6	68011	68016	0 %	50 %	0 %	50 %	134047260
1116	NC_009140	GGC	2	6	68082	68087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047260
1117	NC_009140	TGC	2	6	68102	68107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047260
1118	NC_009140	ATT	2	6	68164	68169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047260
1119	NC_009140	CACT	2	8	68184	68191	25 %	25 %	0 %	50 %	134047260
1120	NC_009140	TTTCA	2	10	68268	68277	20 %	60 %	0 %	20 %	134047101
1121	NC_009140	TAG	2	6	68285	68290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047101
1122	NC_009140	A	6	6	68398	68403	100 %	0 %	0 %	0 %	134047101
1123	NC_009140	TAA	2	6	68498	68503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047101
1124	NC_009140	GCC	2	6	68511	68516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047101
1125	NC_009140	GTC	2	6	68517	68522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047101
1126	NC_009140	GC	3	6	68580	68585	0 %	0 %	50 %	50 %	134047101
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1238	NC_009140	CCAAC	2	10	75326	75335	40 %	0 %	0 %	60 %	134047272
1239	NC_009140	TCGG	2	8	75396	75403	0 %	25 %	50 %	25 %	134047272
1240	NC_009140	CTT	2	6	75436	75441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047272
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1242	NC_009140	CTA	2	6	75477	75482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047272
1243	NC_009140	TGG	2	6	75513	75518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047272
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1247	NC_009140	CAAAG	2	10	75750	75759	60 %	0 %	20 %	20 %	134047272
1248	NC_009140	ACAA	2	8	76006	76013	75 %	0 %	0 %	25 %	134047272
1249	NC_009140	TTG	2	6	76037	76042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047272
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