MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009140	ATG	2	6	30191	30196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047221
502	NC_009140	TCA	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
503	NC_009140	CGC	2	6	30257	30262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047221
504	NC_009140	ATC	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
505	NC_009140	GC	3	6	30302	30307	0 %	0 %	50 %	50 %	134047221
506	NC_009140	GA	3	6	30448	30453	50 %	0 %	50 %	0 %	134047221
507	NC_009140	CTCCC	2	10	30517	30526	0 %	20 %	0 %	80 %	134047221
508	NC_009140	TCA	2	6	30561	30566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
509	NC_009140	TCT	2	6	30573	30578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047221
510	NC_009140	GGC	2	6	30702	30707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047221
511	NC_009140	AAGGC	2	10	30749	30758	40 %	0 %	40 %	20 %	134047125
512	NC_009140	GC	3	6	30809	30814	0 %	0 %	50 %	50 %	134047125
513	NC_009140	CTG	2	6	30885	30890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047125
514	NC_009140	GCC	2	6	30897	30902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047125
515	NC_009140	CCA	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047125
516	NC_009140	AAC	2	6	30979	30984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047125
517	NC_009140	GCG	2	6	31053	31058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047125
518	NC_009140	AAG	2	6	31079	31084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047125
519	NC_009140	TGC	2	6	31196	31201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047125
520	NC_009140	CAGA	2	8	31236	31243	50 %	0 %	25 %	25 %	134047125
521	NC_009140	GCC	2	6	31247	31252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047125
522	NC_009140	TCC	2	6	31298	31303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047125
523	NC_009140	TGA	2	6	31311	31316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047125
524	NC_009140	CGG	2	6	31385	31390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047125
525	NC_009140	CAC	2	6	31425	31430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047125
526	NC_009140	A	8	8	31495	31502	100 %	0 %	0 %	0 %	134047125
527	NC_009140	TTTC	2	8	31596	31603	0 %	75 %	0 %	25 %	134047177
528	NC_009140	GCC	2	6	31607	31612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047177
529	NC_009140	GT	3	6	31648	31653	0 %	50 %	50 %	0 %	134047177
530	NC_009140	GCG	3	9	31676	31684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047177
531	NC_009140	GC	4	8	31740	31747	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
532	NC_009140	ACAG	2	8	31766	31773	50 %	0 %	25 %	25 %	134047177
533	NC_009140	AGC	2	6	31843	31848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047177
534	NC_009140	A	6	6	31855	31860	100 %	0 %	0 %	0 %	134047177
535	NC_009140	GC	3	6	31924	31929	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
536	NC_009140	CGC	2	6	31939	31944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047177
537	NC_009140	ATG	2	6	31955	31960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047177
538	NC_009140	CTGC	2	8	31986	31993	0 %	25 %	25 %	50 %	134047177
539	NC_009140	ACG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047177
540	NC_009140	GAT	2	6	32030	32035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047177
541	NC_009140	CAC	2	6	32097	32102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047177
542	NC_009140	CGAG	2	8	32142	32149	25 %	0 %	50 %	25 %	134047177
543	NC_009140	CG	3	6	32195	32200	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
544	NC_009140	GCG	2	6	32225	32230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047177
545	NC_009140	ATG	2	6	32375	32380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047177
546	NC_009140	CGT	2	6	32817	32822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047229
547	NC_009140	GAA	2	6	32845	32850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047229
548	NC_009140	AGA	2	6	32907	32912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047229
549	NC_009140	CGATG	2	10	32958	32967	20 %	20 %	40 %	20 %	134047229
550	NC_009140	AGC	2	6	32991	32996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047229
551	NC_009140	CAG	2	6	33249	33254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047169
552	NC_009140	AGA	2	6	33274	33279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047169
553	NC_009140	AAAG	2	8	33281	33288	75 %	0 %	25 %	0 %	134047169
554	NC_009140	ATGG	2	8	33303	33310	25 %	25 %	50 %	0 %	134047169
555	NC_009140	TCAT	2	8	33460	33467	25 %	50 %	0 %	25 %	134047169
556	NC_009140	ACTACG	2	12	33562	33573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134047169
557	NC_009140	TGAT	2	8	33577	33584	25 %	50 %	25 %	0 %	134047169
558	NC_009140	TGG	2	6	33610	33615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047169
559	NC_009140	CT	3	6	33657	33662	0 %	50 %	0 %	50 %	134047169
560	NC_009140	ATT	2	6	33702	33707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047169
561	NC_009140	TGT	2	6	33826	33831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047169
562	NC_009140	CGA	2	6	33871	33876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047169
563	NC_009140	AAG	2	6	33925	33930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047169
564	NC_009140	GAA	2	6	33945	33950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047169
565	NC_009140	GCC	2	6	34017	34022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047105
566	NC_009140	GAC	2	6	34062	34067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047105
567	NC_009140	GGC	2	6	34118	34123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047105
568	NC_009140	GCA	2	6	34142	34147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047105
569	NC_009140	ATC	2	6	34155	34160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047105
570	NC_009140	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047105
571	NC_009140	GAA	2	6	34176	34181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047105
572	NC_009140	GCG	2	6	34208	34213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047105
573	NC_009140	TGG	2	6	34255	34260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047105
574	NC_009140	AAC	2	6	34278	34283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047105
575	NC_009140	CTG	2	6	34294	34299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047105
576	NC_009140	TGACT	2	10	34328	34337	20 %	40 %	20 %	20 %	134047105
577	NC_009140	GAA	2	6	34374	34379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047105
578	NC_009140	TG	3	6	34467	34472	0 %	50 %	50 %	0 %	134047105
579	NC_009140	TGAA	2	8	34543	34550	50 %	25 %	25 %	0 %	134047105
580	NC_009140	GCT	2	6	34616	34621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047105
581	NC_009140	ATG	2	6	34624	34629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047105
582	NC_009140	ACTG	2	8	34664	34671	25 %	25 %	25 %	25 %	134047105
583	NC_009140	ATG	2	6	34684	34689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047105
584	NC_009140	CGA	2	6	34709	34714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047105
585	NC_009140	GAC	2	6	34764	34769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047105
586	NC_009140	AGG	2	6	34783	34788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047105
587	NC_009140	GAT	2	6	34824	34829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047105
588	NC_009140	TGA	2	6	34847	34852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047105
589	NC_009140	AGC	2	6	34879	34884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047105
590	NC_009140	GAA	2	6	34911	34916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047105
591	NC_009140	TCC	2	6	34931	34936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047105
592	NC_009140	GAA	2	6	34958	34963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047105
593	NC_009140	TCA	2	6	35029	35034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047105
594	NC_009140	GACC	2	8	35036	35043	25 %	0 %	25 %	50 %	134047105
595	NC_009140	TAA	2	6	35154	35159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047105
596	NC_009140	GAAAA	2	10	35225	35234	80 %	0 %	20 %	0 %	134047247
597	NC_009140	CAA	2	6	35296	35301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047247
598	NC_009140	TGA	2	6	35345	35350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047247
599	NC_009140	GAAT	2	8	35356	35363	50 %	25 %	25 %	0 %	134047247
600	NC_009140	CTA	2	6	35408	35413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047247
601	NC_009140	T	7	7	35525	35531	0 %	100 %	0 %	0 %	134047269
602	NC_009140	TGC	2	6	35533	35538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047269
603	NC_009140	GCG	2	6	35546	35551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047269
604	NC_009140	GTA	2	6	35572	35577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047269
605	NC_009140	CGA	2	6	35616	35621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047269
606	NC_009140	AAT	2	6	35658	35663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047269
607	NC_009140	GCA	2	6	35680	35685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047269
608	NC_009140	TC	3	6	35729	35734	0 %	50 %	0 %	50 %	134047269
609	NC_009140	TCCA	2	8	35768	35775	25 %	25 %	0 %	50 %	134047269
610	NC_009140	CAG	2	6	35801	35806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047269
611	NC_009140	CAA	2	6	35838	35843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047269
612	NC_009140	GGA	2	6	35870	35875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047269
613	NC_009140	CTT	2	6	35896	35901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047269
614	NC_009140	TGG	2	6	35943	35948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047269
615	NC_009140	GGC	2	6	35962	35967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047269
616	NC_009140	GA	3	6	35979	35984	50 %	0 %	50 %	0 %	134047269
617	NC_009140	TTC	2	6	36007	36012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047269
618	NC_009140	TCC	2	6	36020	36025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047269
619	NC_009140	CAA	2	6	36078	36083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047269
620	NC_009140	GA	3	6	36121	36126	50 %	0 %	50 %	0 %	134047269
621	NC_009140	AGCA	2	8	36734	36741	50 %	0 %	25 %	25 %	134047210
622	NC_009140	ATC	2	6	36743	36748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047210
623	NC_009140	GAA	2	6	36756	36761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047210
624	NC_009140	AGG	2	6	36788	36793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047210
625	NC_009140	CAT	2	6	36828	36833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047210
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627	NC_009140	GGT	2	6	36898	36903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047210
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753	NC_009140	TGGTT	2	10	44588	44597	0 %	60 %	40 %	0 %	134047127
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882	NC_009140	AGA	2	6	52031	52036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047224
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884	NC_009140	GAT	2	6	52211	52216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047224
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