MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009092	GCT	2	6	192825	192830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3502	NC_009092	ATC	2	6	193170	193175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511119
3503	NC_009092	CCA	2	6	193197	193202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511119
3504	NC_009092	GT	3	6	193213	193218	0 %	50 %	50 %	0 %	127511119
3505	NC_009092	GCCT	2	8	193247	193254	0 %	25 %	25 %	50 %	127511119
3506	NC_009092	CG	3	6	193370	193375	0 %	0 %	50 %	50 %	127511119
3507	NC_009092	TAT	2	6	193387	193392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511119
3508	NC_009092	CAG	2	6	193403	193408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511119
3509	NC_009092	CTT	2	6	193409	193414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511119
3510	NC_009092	ACA	2	6	193548	193553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511119
3511	NC_009092	TGG	2	6	193561	193566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511119
3512	NC_009092	GCTC	2	8	193576	193583	0 %	25 %	25 %	50 %	127511119
3513	NC_009092	GTC	2	6	193601	193606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511119
3514	NC_009092	ATG	3	9	193614	193622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511119
3515	NC_009092	CGT	2	6	193654	193659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511119
3516	NC_009092	TGG	2	6	193723	193728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511119
3517	NC_009092	TGAA	2	8	193797	193804	50 %	25 %	25 %	0 %	127511119
3518	NC_009092	GGC	2	6	193814	193819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511119
3519	NC_009092	AGG	2	6	193848	193853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511119
3520	NC_009092	ATGG	2	8	193869	193876	25 %	25 %	50 %	0 %	127511119
3521	NC_009092	GGC	2	6	194078	194083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511120
3522	NC_009092	ACC	2	6	194131	194136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511120
3523	NC_009092	CGA	2	6	194157	194162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511120
3524	NC_009092	CGG	2	6	194226	194231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511120
3525	NC_009092	CT	3	6	194261	194266	0 %	50 %	0 %	50 %	127511120
3526	NC_009092	TCTT	2	8	194345	194352	0 %	75 %	0 %	25 %	127511120
3527	NC_009092	GGC	2	6	194428	194433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511120
3528	NC_009092	CCA	2	6	194438	194443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511120
3529	NC_009092	TTC	2	6	194520	194525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511121
3530	NC_009092	TCT	2	6	194534	194539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511121
3531	NC_009092	CAC	2	6	194580	194585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511121
3532	NC_009092	CA	3	6	194629	194634	50 %	0 %	0 %	50 %	127511121
3533	NC_009092	A	7	7	194658	194664	100 %	0 %	0 %	0 %	127511121
3534	NC_009092	ATT	2	6	194686	194691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511121
3535	NC_009092	ATC	2	6	194787	194792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511122
3536	NC_009092	CAG	2	6	194816	194821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511122
3537	NC_009092	CCA	2	6	194894	194899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511122
3538	NC_009092	TGA	2	6	194914	194919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511122
3539	NC_009092	CGG	2	6	194956	194961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511122
3540	NC_009092	GCG	2	6	194967	194972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511122
3541	NC_009092	AG	3	6	195000	195005	50 %	0 %	50 %	0 %	127511122
3542	NC_009092	CACC	2	8	195062	195069	25 %	0 %	0 %	75 %	127511122
3543	NC_009092	GCA	2	6	195096	195101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511122
3544	NC_009092	TGA	2	6	195106	195111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511122
3545	NC_009092	GCC	2	6	195156	195161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511122
3546	NC_009092	CGACAT	2	12	195227	195238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	127511122
3547	NC_009092	GAT	2	6	195263	195268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511122
3548	NC_009092	CTG	2	6	195284	195289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511122
3549	NC_009092	ACA	2	6	195307	195312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511122
3550	NC_009092	AG	3	6	195380	195385	50 %	0 %	50 %	0 %	127511122
3551	NC_009092	TTAG	2	8	195435	195442	25 %	50 %	25 %	0 %	127511123
3552	NC_009092	ACTC	2	8	195444	195451	25 %	25 %	0 %	50 %	127511123
3553	NC_009092	CAG	2	6	195615	195620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511123
3554	NC_009092	CGC	2	6	195623	195628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511123
3555	NC_009092	GCA	3	9	195740	195748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511123
3556	NC_009092	AGC	2	6	195847	195852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511123
3557	NC_009092	CGA	2	6	195872	195877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511123
3558	NC_009092	ACA	2	6	195905	195910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511123
3559	NC_009092	CAG	2	6	195918	195923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511123
3560	NC_009092	GGC	2	6	195924	195929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511123
3561	NC_009092	GAT	2	6	195936	195941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511123
3562	NC_009092	ACC	2	6	196003	196008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511123
3563	NC_009092	A	6	6	196014	196019	100 %	0 %	0 %	0 %	127511123
3564	NC_009092	ATTC	2	8	196116	196123	25 %	50 %	0 %	25 %	127511123
3565	NC_009092	TAAA	2	8	196134	196141	75 %	25 %	0 %	0 %	127511124
3566	NC_009092	TGG	2	6	196197	196202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511124
3567	NC_009092	ATG	2	6	196209	196214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511124
3568	NC_009092	CCG	2	6	196221	196226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511124
3569	NC_009092	TGT	2	6	196236	196241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511124
3570	NC_009092	TTC	2	6	196259	196264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511124
3571	NC_009092	ACG	2	6	196349	196354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511124
3572	NC_009092	CCG	2	6	196363	196368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511124
3573	NC_009092	GGCC	2	8	196375	196382	0 %	0 %	50 %	50 %	127511124
3574	NC_009092	TGGT	2	8	196425	196432	0 %	50 %	50 %	0 %	127511124
3575	NC_009092	ATC	2	6	196439	196444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511124
3576	NC_009092	CGG	2	6	196483	196488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511124
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3578	NC_009092	TCG	2	6	196545	196550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511124
3579	NC_009092	CAG	2	6	196625	196630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511124
3580	NC_009092	AGCTC	2	10	196693	196702	20 %	20 %	20 %	40 %	127511124
3581	NC_009092	CAAGT	2	10	196731	196740	40 %	20 %	20 %	20 %	127511124
3582	NC_009092	GTT	2	6	196758	196763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511124
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3585	NC_009092	AAG	2	6	197180	197185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511125
3586	NC_009092	TA	3	6	197195	197200	50 %	50 %	0 %	0 %	127511125
3587	NC_009092	ATG	2	6	197255	197260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511125
3588	NC_009092	ACT	2	6	197301	197306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511125
3589	NC_009092	CCA	2	6	197338	197343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511125
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3591	NC_009092	CGA	2	6	197367	197372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511125
3592	NC_009092	ATCA	2	8	197616	197623	50 %	25 %	0 %	25 %	127511126
3593	NC_009092	AG	3	6	197706	197711	50 %	0 %	50 %	0 %	127511126
3594	NC_009092	CGC	2	6	197756	197761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511126
3595	NC_009092	CGC	2	6	197823	197828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511126
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3597	NC_009092	TGGCCT	2	12	197948	197959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511126
3598	NC_009092	TGA	2	6	197962	197967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511126
3599	NC_009092	CGT	2	6	197972	197977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511126
3600	NC_009092	TGA	2	6	198032	198037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511126
3601	NC_009092	ATCG	2	8	198090	198097	25 %	25 %	25 %	25 %	127511126
3602	NC_009092	CTT	2	6	198099	198104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511126
3603	NC_009092	GAA	2	6	198117	198122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511126
3604	NC_009092	TTGG	2	8	198216	198223	0 %	50 %	50 %	0 %	127511126
3605	NC_009092	GTA	2	6	198228	198233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511126
3606	NC_009092	AGC	2	6	198256	198261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511126
3607	NC_009092	CAT	3	9	198311	198319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511126
3608	NC_009092	CAG	2	6	198357	198362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511126
3609	NC_009092	CGGCT	2	10	198375	198384	0 %	20 %	40 %	40 %	127511126
3610	NC_009092	CAT	2	6	198399	198404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511126
3611	NC_009092	GGC	2	6	198429	198434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511126
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3613	NC_009092	GACC	2	8	198575	198582	25 %	0 %	25 %	50 %	127511126
3614	NC_009092	TTCT	2	8	198633	198640	0 %	75 %	0 %	25 %	127511126
3615	NC_009092	CAG	2	6	198666	198671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511126
3616	NC_009092	TGG	2	6	198728	198733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511126
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3621	NC_009092	CT	3	6	199414	199419	0 %	50 %	0 %	50 %	127511127
3622	NC_009092	CGA	2	6	199451	199456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511127
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3653	NC_009092	TGCC	2	8	200542	200549	0 %	25 %	25 %	50 %	127511127
3654	NC_009092	TGG	2	6	200587	200592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511127
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3733	NC_009092	TGAC	2	8	211052	211059	25 %	25 %	25 %	25 %	127511133
3734	NC_009092	TCAGCA	2	12	211074	211085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	127511133
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3737	NC_009092	GGA	2	6	211223	211228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511134
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3739	NC_009092	GAT	2	6	211370	211375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511134
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3741	NC_009092	GAA	2	6	211470	211475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511134
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3743	NC_009092	CTG	2	6	211530	211535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511134
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3745	NC_009092	GGC	2	6	211652	211657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511134
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3863	NC_009092	CTG	2	6	218586	218591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511139
3864	NC_009092	ACT	2	6	218619	218624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511139
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3969	NC_009092	CGC	2	6	224262	224267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511142
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3974	NC_009092	TGG	2	6	224385	224390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511142
3975	NC_009092	CTATC	2	10	224408	224417	20 %	40 %	0 %	40 %	127511142
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3977	NC_009092	TG	3	6	224594	224599	0 %	50 %	50 %	0 %	127511142
3978	NC_009092	CAT	2	6	224661	224666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511142
3979	NC_009092	TTGC	2	8	224685	224692	0 %	50 %	25 %	25 %	127511142
3980	NC_009092	TAA	2	6	224733	224738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511142
3981	NC_009092	GAG	2	6	224766	224771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511142
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3983	NC_009092	AAAAAC	2	12	224824	224835	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	127511143
3984	NC_009092	GCT	2	6	224856	224861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511143
3985	NC_009092	TTTA	2	8	224887	224894	25 %	75 %	0 %	0 %	127511143
3986	NC_009092	ATG	2	6	224913	224918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511143
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3989	NC_009092	AAGA	2	8	225012	225019	75 %	0 %	25 %	0 %	127511143
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