MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009092	CAGA	2	8	108604	108611	50 %	0 %	25 %	25 %	127511031
2003	NC_009092	CTG	2	6	108640	108645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511031
2004	NC_009092	TTG	2	6	108679	108684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511031
2005	NC_009092	GGCT	2	8	108879	108886	0 %	25 %	50 %	25 %	127511031
2006	NC_009092	TGT	2	6	108981	108986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511032
2007	NC_009092	GGC	2	6	109042	109047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511032
2008	NC_009092	CAG	2	6	109064	109069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511032
2009	NC_009092	TGG	2	6	109137	109142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511032
2010	NC_009092	TGG	2	6	109164	109169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511032
2011	NC_009092	GCT	2	6	109201	109206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511032
2012	NC_009092	GCC	2	6	109431	109436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511032
2013	NC_009092	CGC	2	6	109460	109465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511032
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2015	NC_009092	GAG	2	6	109676	109681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511032
2016	NC_009092	GAG	2	6	109709	109714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511032
2017	NC_009092	TC	3	6	109751	109756	0 %	50 %	0 %	50 %	127511032
2018	NC_009092	GAG	2	6	109766	109771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511032
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2021	NC_009092	TGG	2	6	109944	109949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511032
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2034	NC_009092	TGG	2	6	110722	110727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511033
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2056	NC_009092	ATCA	2	8	111841	111848	50 %	25 %	0 %	25 %	127511036
2057	NC_009092	GAA	2	6	111867	111872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511036
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2062	NC_009092	GTGG	2	8	112311	112318	0 %	25 %	75 %	0 %	127511037
2063	NC_009092	CTG	2	6	112320	112325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511037
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2088	NC_009092	TGA	2	6	113272	113277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511037
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2102	NC_009092	CTC	2	6	113947	113952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511039
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2112	NC_009092	GC	3	6	114255	114260	0 %	0 %	50 %	50 %	127511039
2113	NC_009092	CGA	2	6	114270	114275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2117	NC_009092	CACC	2	8	114456	114463	25 %	0 %	0 %	75 %	127511039
2118	NC_009092	GCGA	2	8	114602	114609	25 %	0 %	50 %	25 %	127511039
2119	NC_009092	GGC	2	6	114643	114648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511039
2120	NC_009092	GCA	2	6	114725	114730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2121	NC_009092	GCG	2	6	114776	114781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511039
2122	NC_009092	CTG	2	6	114784	114789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2123	NC_009092	TGC	2	6	114819	114824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2124	NC_009092	GTC	2	6	114865	114870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2125	NC_009092	CGT	2	6	114936	114941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2126	NC_009092	CAG	3	9	114985	114993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2127	NC_009092	TCT	2	6	114996	115001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511039
2128	NC_009092	TGAT	2	8	115007	115014	25 %	50 %	25 %	0 %	127511039
2129	NC_009092	GTC	2	6	115030	115035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2130	NC_009092	AGA	2	6	115080	115085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511039
2131	NC_009092	GC	3	6	115146	115151	0 %	0 %	50 %	50 %	127511039
2132	NC_009092	GGTG	2	8	115181	115188	0 %	25 %	75 %	0 %	127511039
2133	NC_009092	TGCCAG	2	12	115237	115248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2134	NC_009092	AGG	2	6	115269	115274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511039
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2136	NC_009092	GCA	2	6	115308	115313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2140	NC_009092	GCT	2	6	115449	115454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2143	NC_009092	TCTG	2	8	115722	115729	0 %	50 %	25 %	25 %	127511039
2144	NC_009092	TCACCT	2	12	115752	115763	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	127511039
2145	NC_009092	GTT	2	6	115774	115779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511039
2146	NC_009092	TCG	2	6	115928	115933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2153	NC_009092	GTA	2	6	116140	116145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511039
2154	NC_009092	GCT	2	6	116215	116220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2229	NC_009092	TTA	2	6	120223	120228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511043
2230	NC_009092	AAC	2	6	120243	120248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511043
2231	NC_009092	TGAC	2	8	120271	120278	25 %	25 %	25 %	25 %	127511043
2232	NC_009092	GGC	2	6	120279	120284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511043
2233	NC_009092	GAC	2	6	120432	120437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511043
2234	NC_009092	TCA	2	6	120455	120460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511043
2235	NC_009092	CGG	2	6	120566	120571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511043
2236	NC_009092	ACC	2	6	120577	120582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511043
2237	NC_009092	AGC	2	6	120616	120621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511043
2238	NC_009092	CACCGA	2	12	120699	120710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	127511044
2239	NC_009092	GCG	2	6	120728	120733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511044
2240	NC_009092	TAT	2	6	120783	120788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511044
2241	NC_009092	TCG	2	6	120824	120829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2242	NC_009092	GTC	2	6	120837	120842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2243	NC_009092	GAT	2	6	120853	120858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511044
2244	NC_009092	AGA	2	6	120903	120908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511044
2245	NC_009092	CATG	2	8	120924	120931	25 %	25 %	25 %	25 %	127511044
2246	NC_009092	TAG	2	6	120943	120948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511044
2247	NC_009092	GCT	2	6	120954	120959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2248	NC_009092	TGAG	2	8	120978	120985	25 %	25 %	50 %	0 %	127511044
2249	NC_009092	CAG	2	6	121036	121041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2250	NC_009092	CCT	2	6	121065	121070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511044
2251	NC_009092	GGCG	2	8	121147	121154	0 %	0 %	75 %	25 %	127511044
2252	NC_009092	CGA	2	6	121213	121218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2253	NC_009092	GTG	2	6	121288	121293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511044
2254	NC_009092	AGG	2	6	121308	121313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511044
2255	NC_009092	TGA	2	6	121335	121340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511044
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2257	NC_009092	CGT	2	6	121359	121364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2258	NC_009092	GTT	2	6	121393	121398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511044
2259	NC_009092	GC	3	6	121409	121414	0 %	0 %	50 %	50 %	127511044
2260	NC_009092	CTG	2	6	121421	121426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2261	NC_009092	TGC	2	6	121445	121450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2262	NC_009092	TGC	2	6	121514	121519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
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2268	NC_009092	TCATC	2	10	121839	121848	20 %	40 %	0 %	40 %	127511045
2269	NC_009092	TTG	2	6	121865	121870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511045
2270	NC_009092	CCT	2	6	121872	121877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511045
2271	NC_009092	CCG	2	6	121884	121889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511045
2272	NC_009092	GGC	2	6	122047	122052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511045
2273	NC_009092	GCGCT	2	10	122057	122066	0 %	20 %	40 %	40 %	127511045
2274	NC_009092	GCCA	2	8	122086	122093	25 %	0 %	25 %	50 %	127511045
2275	NC_009092	GGC	2	6	122128	122133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511045
2276	NC_009092	CGG	2	6	122139	122144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511045
2277	NC_009092	CAG	2	6	122155	122160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511045
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2281	NC_009092	GGC	2	6	122275	122280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511045
2282	NC_009092	CCT	2	6	122292	122297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511045
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2284	NC_009092	GAGG	2	8	122383	122390	25 %	0 %	75 %	0 %	127511045
2285	NC_009092	CTC	2	6	122398	122403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511045
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2290	NC_009092	GAA	2	6	122677	122682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511045
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2297	NC_009092	GCTG	2	8	122877	122884	0 %	25 %	50 %	25 %	127511045
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2312	NC_009092	CTG	2	6	123778	123783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511045
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2357	NC_009092	GGAT	2	8	126017	126024	25 %	25 %	50 %	0 %	127511047
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2359	NC_009092	GTT	2	6	126106	126111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511047
2360	NC_009092	CTCG	2	8	126180	126187	0 %	25 %	25 %	50 %	127511047
2361	NC_009092	GGTGAG	2	12	126273	126284	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	127511047
2362	NC_009092	GTC	2	6	126454	126459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511047
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2479	NC_009092	GCG	2	6	131598	131603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511054
2480	NC_009092	CGG	2	6	131604	131609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511054
2481	NC_009092	CGG	2	6	131649	131654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511054
2482	NC_009092	GCG	2	6	131884	131889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511055
2483	NC_009092	TGG	2	6	131907	131912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511055
2484	NC_009092	ATTG	2	8	131923	131930	25 %	50 %	25 %	0 %	127511055
2485	NC_009092	ATC	2	6	131945	131950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511055
2486	NC_009092	ACA	2	6	132027	132032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511056
2487	NC_009092	CTGC	2	8	132054	132061	0 %	25 %	25 %	50 %	127511056
2488	NC_009092	AAG	2	6	132111	132116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511056
2489	NC_009092	AAG	3	9	132174	132182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511056
2490	NC_009092	GGA	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511056
2491	NC_009092	CGA	2	6	132359	132364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511056
2492	NC_009092	CAG	2	6	132368	132373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511056
2493	NC_009092	ATG	2	6	132375	132380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511056
2494	NC_009092	GTG	2	6	132438	132443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511056
2495	NC_009092	GAA	2	6	132557	132562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511056
2496	NC_009092	GGC	2	6	132563	132568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511056
2497	NC_009092	TAGAG	2	10	132634	132643	40 %	20 %	40 %	0 %	127511056
2498	NC_009092	CCG	2	6	132729	132734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511056
2499	NC_009092	CTG	2	6	132755	132760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511056
2500	NC_009092	ATG	2	6	132810	132815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511056

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