MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009092	GCCA	2	8	81603	81610	25 %	0 %	25 %	50 %	127511003
1502	NC_009092	CGG	2	6	81646	81651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511003
1503	NC_009092	GAG	2	6	81675	81680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511003
1504	NC_009092	GA	3	6	81699	81704	50 %	0 %	50 %	0 %	127511003
1505	NC_009092	CGG	2	6	81736	81741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511003
1506	NC_009092	CCG	2	6	81775	81780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511003
1507	NC_009092	CAT	2	6	81818	81823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511003
1508	NC_009092	CTC	2	6	81908	81913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511003
1509	NC_009092	CAT	2	6	81914	81919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511003
1510	NC_009092	TGG	2	6	81961	81966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511003
1511	NC_009092	CTA	2	6	82062	82067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511003
1512	NC_009092	CCT	2	6	82100	82105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511003
1513	NC_009092	GTG	2	6	82131	82136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511003
1514	NC_009092	CAAG	2	8	82232	82239	50 %	0 %	25 %	25 %	127511003
1515	NC_009092	GAG	3	9	82296	82304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511003
1516	NC_009092	CTG	2	6	82314	82319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511003
1517	NC_009092	CGG	2	6	82340	82345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511003
1518	NC_009092	GGC	2	6	82553	82558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511004
1519	NC_009092	CGG	2	6	82684	82689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511004
1520	NC_009092	CG	3	6	82724	82729	0 %	0 %	50 %	50 %	127511004
1521	NC_009092	TCG	2	6	82791	82796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1522	NC_009092	GCC	2	6	82802	82807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511004
1523	NC_009092	CTT	2	6	82832	82837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511004
1524	NC_009092	CCA	2	6	82855	82860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511004
1525	NC_009092	CCG	2	6	82921	82926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511004
1526	NC_009092	CAC	2	6	82929	82934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511004
1527	NC_009092	GTT	2	6	82937	82942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511004
1528	NC_009092	GAG	2	6	83025	83030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511004
1529	NC_009092	CCAG	2	8	83038	83045	25 %	0 %	25 %	50 %	127511004
1530	NC_009092	TGC	2	6	83073	83078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1531	NC_009092	CAG	2	6	83189	83194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1532	NC_009092	GCT	2	6	83243	83248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1533	NC_009092	CAG	3	9	83255	83263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1534	NC_009092	GT	3	6	83325	83330	0 %	50 %	50 %	0 %	127511004
1535	NC_009092	GCG	2	6	83419	83424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511004
1536	NC_009092	CTG	2	6	83463	83468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1537	NC_009092	CAG	3	9	83474	83482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511004
1538	NC_009092	GTC	2	6	83781	83786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1539	NC_009092	GAA	2	6	83844	83849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511005
1540	NC_009092	GGCT	2	8	83882	83889	0 %	25 %	50 %	25 %	127511005
1541	NC_009092	TCG	2	6	83890	83895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1542	NC_009092	GCA	2	6	83930	83935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1543	NC_009092	CAGA	2	8	83968	83975	50 %	0 %	25 %	25 %	127511005
1544	NC_009092	CGG	2	6	83984	83989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511005
1545	NC_009092	GTC	2	6	84049	84054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1546	NC_009092	CGG	2	6	84194	84199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511005
1547	NC_009092	CAG	2	6	84321	84326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1548	NC_009092	GCC	2	6	84369	84374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511005
1549	NC_009092	GGCA	2	8	84417	84424	25 %	0 %	50 %	25 %	127511005
1550	NC_009092	CAG	2	6	84492	84497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1551	NC_009092	GCTGTC	2	12	84498	84509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1552	NC_009092	CCAT	2	8	84547	84554	25 %	25 %	0 %	50 %	127511005
1553	NC_009092	GCC	2	6	84561	84566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511005
1554	NC_009092	CAG	2	6	84576	84581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1555	NC_009092	CTC	2	6	84594	84599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511005
1556	NC_009092	GCC	2	6	84613	84618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511005
1557	NC_009092	GCC	2	6	84654	84659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511005
1558	NC_009092	CGA	2	6	84665	84670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511005
1559	NC_009092	GCC	3	9	84729	84737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511005
1560	NC_009092	CGG	2	6	84761	84766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511005
1561	NC_009092	TG	3	6	84814	84819	0 %	50 %	50 %	0 %	127511005
1562	NC_009092	GCT	2	6	85135	85140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511006
1563	NC_009092	GGGCA	2	10	85194	85203	20 %	0 %	60 %	20 %	127511006
1564	NC_009092	TATC	2	8	85211	85218	25 %	50 %	0 %	25 %	127511006
1565	NC_009092	TGA	2	6	85261	85266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511006
1566	NC_009092	AGG	2	6	85306	85311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511006
1567	NC_009092	TGA	3	9	85324	85332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511006
1568	NC_009092	CAC	2	6	85383	85388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511006
1569	NC_009092	GGCGA	2	10	85446	85455	20 %	0 %	60 %	20 %	127511006
1570	NC_009092	GCA	2	6	85462	85467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511006
1571	NC_009092	CTG	2	6	85476	85481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511006
1572	NC_009092	CGC	2	6	85495	85500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511006
1573	NC_009092	CTG	2	6	85551	85556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511006
1574	NC_009092	CGC	2	6	85568	85573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511006
1575	NC_009092	GCC	2	6	85680	85685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511006
1576	NC_009092	GCT	2	6	85717	85722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511006
1577	NC_009092	AGG	2	6	85726	85731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511006
1578	NC_009092	CAT	2	6	85738	85743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511006
1579	NC_009092	GAA	2	6	85760	85765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511006
1580	NC_009092	GTGAAG	2	12	85809	85820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	127511006
1581	NC_009092	GCC	2	6	85824	85829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511006
1582	NC_009092	GGC	2	6	85958	85963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511007
1583	NC_009092	TTG	2	6	85967	85972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511007
1584	NC_009092	TCG	2	6	86063	86068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511007
1585	NC_009092	TAG	2	6	86078	86083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511007
1586	NC_009092	GTC	2	6	86089	86094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511007
1587	NC_009092	CGC	2	6	86148	86153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511007
1588	NC_009092	TGA	2	6	86192	86197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511007
1589	NC_009092	ATG	2	6	86294	86299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511007
1590	NC_009092	GTT	2	6	86356	86361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511007
1591	NC_009092	AGC	2	6	86414	86419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511007
1592	NC_009092	CATTT	2	10	86438	86447	20 %	60 %	0 %	20 %	127511007
1593	NC_009092	GTCTTC	2	12	86821	86832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	127511008
1594	NC_009092	TAT	2	6	86833	86838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511008
1595	NC_009092	TAT	2	6	86930	86935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511008
1596	NC_009092	ATG	2	6	86975	86980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511008
1597	NC_009092	AAG	2	6	86999	87004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511008
1598	NC_009092	AGG	2	6	87078	87083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511008
1599	NC_009092	GC	4	8	87089	87096	0 %	0 %	50 %	50 %	127511008
1600	NC_009092	GGAGAT	2	12	87118	87129	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	127511008
1601	NC_009092	CGG	3	9	87169	87177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511008
1602	NC_009092	CAC	2	6	87178	87183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511008
1603	NC_009092	AGA	2	6	87193	87198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511008
1604	NC_009092	GC	3	6	87206	87211	0 %	0 %	50 %	50 %	127511008
1605	NC_009092	AAG	2	6	87227	87232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511008
1606	NC_009092	AGC	2	6	87300	87305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1607	NC_009092	TGG	2	6	87315	87320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511008
1608	NC_009092	ACG	2	6	87351	87356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1609	NC_009092	CAG	2	6	87401	87406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1610	NC_009092	GGC	2	6	87424	87429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511008
1611	NC_009092	ATC	2	6	87446	87451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511008
1612	NC_009092	ATCTT	2	10	87459	87468	20 %	60 %	0 %	20 %	127511008
1613	NC_009092	CAGA	2	8	87482	87489	50 %	0 %	25 %	25 %	127511008
1614	NC_009092	CAC	2	6	87544	87549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511008
1615	NC_009092	TGA	2	6	87558	87563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511008
1616	NC_009092	CAA	2	6	87700	87705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511008
1617	NC_009092	CGA	2	6	87715	87720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1618	NC_009092	AGC	2	6	87855	87860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1619	NC_009092	AGA	2	6	87861	87866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511008
1620	NC_009092	CTG	2	6	87902	87907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511008
1621	NC_009092	GAT	2	6	88069	88074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511008
1622	NC_009092	TGA	3	9	88083	88091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511008
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1624	NC_009092	GCG	2	6	88924	88929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511009
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1871	NC_009092	CA	3	6	101118	101123	50 %	0 %	0 %	50 %	127511020
1872	NC_009092	GCCAG	2	10	101179	101188	20 %	0 %	40 %	40 %	127511020
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1876	NC_009092	TCG	2	6	101836	101841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511021
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1884	NC_009092	CGA	2	6	102266	102271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511021
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1889	NC_009092	GAA	2	6	102497	102502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511021
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1989	NC_009092	TGT	2	6	107720	107725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511030
1990	NC_009092	AGA	2	6	107807	107812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511030
1991	NC_009092	GAC	2	6	107917	107922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511030
1992	NC_009092	CGA	2	6	107994	107999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511030
1993	NC_009092	AGA	2	6	108249	108254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511031
1994	NC_009092	ACC	2	6	108262	108267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511031
1995	NC_009092	CTG	3	9	108340	108348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511031
1996	NC_009092	CCA	2	6	108350	108355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511031
1997	NC_009092	TGC	2	6	108389	108394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511031
1998	NC_009092	GGC	2	6	108420	108425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511031
1999	NC_009092	GC	3	6	108429	108434	0 %	0 %	50 %	50 %	127511031
2000	NC_009092	CGA	2	6	108516	108521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511031

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