MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009092	GCCC	2	8	54672	54679	0 %	0 %	25 %	75 %	127510979
1003	NC_009092	TGC	2	6	54715	54720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510979
1004	NC_009092	GGC	2	6	54767	54772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510979
1005	NC_009092	TCG	2	6	54778	54783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510979
1006	NC_009092	CGA	2	6	54878	54883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510979
1007	NC_009092	CCA	2	6	54898	54903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510979
1008	NC_009092	CT	4	8	54947	54954	0 %	50 %	0 %	50 %	127510980
1009	NC_009092	GGT	2	6	55006	55011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510980
1010	NC_009092	GGT	2	6	55153	55158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510980
1011	NC_009092	TAA	2	6	55282	55287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127510980
1012	NC_009092	GCC	2	6	55337	55342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510980
1013	NC_009092	GAT	2	6	55375	55380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510980
1014	NC_009092	GAT	2	6	55385	55390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510980
1015	NC_009092	CAT	2	6	55426	55431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510980
1016	NC_009092	TCG	2	6	55482	55487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510980
1017	NC_009092	ACC	2	6	55745	55750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510980
1018	NC_009092	GTG	2	6	55769	55774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510980
1019	NC_009092	CCG	2	6	55782	55787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510980
1020	NC_009092	CAGCGA	2	12	55888	55899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510980
1021	NC_009092	GGT	2	6	55903	55908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510980
1022	NC_009092	CAG	2	6	55940	55945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510980
1023	NC_009092	CAT	2	6	56225	56230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510981
1024	NC_009092	GAA	2	6	56259	56264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510981
1025	NC_009092	GATG	2	8	56357	56364	25 %	25 %	50 %	0 %	127510981
1026	NC_009092	TG	3	6	56469	56474	0 %	50 %	50 %	0 %	127510981
1027	NC_009092	CAT	2	6	56477	56482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510981
1028	NC_009092	GC	3	6	56488	56493	0 %	0 %	50 %	50 %	127510981
1029	NC_009092	CCG	2	6	56499	56504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510981
1030	NC_009092	CGT	2	6	56595	56600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510981
1031	NC_009092	TGA	2	6	56614	56619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510981
1032	NC_009092	GCC	2	6	56658	56663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510981
1033	NC_009092	CCA	2	6	56680	56685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510981
1034	NC_009092	GCCA	2	8	56691	56698	25 %	0 %	25 %	50 %	127510981
1035	NC_009092	CTT	2	6	56729	56734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510981
1036	NC_009092	GAC	2	6	56868	56873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510981
1037	NC_009092	GCG	2	6	56938	56943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510981
1038	NC_009092	CGA	2	6	56981	56986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510981
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1040	NC_009092	TCC	2	6	57093	57098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127510981
1041	NC_009092	GCT	2	6	57128	57133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510981
1042	NC_009092	GCCT	2	8	57148	57155	0 %	25 %	25 %	50 %	127510981
1043	NC_009092	GCGTG	2	10	57230	57239	0 %	20 %	60 %	20 %	127510981
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1051	NC_009092	TGG	2	6	57797	57802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510982
1052	NC_009092	ACA	2	6	57833	57838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510982
1053	NC_009092	GTG	2	6	57841	57846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510982
1054	NC_009092	AGC	2	6	57851	57856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510982
1055	NC_009092	GTG	2	6	58030	58035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510982
1056	NC_009092	TGA	2	6	58115	58120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510982
1057	NC_009092	AGC	2	6	58163	58168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510982
1058	NC_009092	CCA	2	6	58329	58334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510983
1059	NC_009092	GCA	2	6	58393	58398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510983
1060	NC_009092	CGC	2	6	58408	58413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510983
1061	NC_009092	CT	3	6	58415	58420	0 %	50 %	0 %	50 %	127510983
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1065	NC_009092	CTT	2	6	58592	58597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510983
1066	NC_009092	GAT	2	6	58631	58636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510983
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1068	NC_009092	GCG	2	6	58666	58671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510983
1069	NC_009092	CAT	2	6	58715	58720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510983
1070	NC_009092	TGA	2	6	58999	59004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510983
1071	NC_009092	T	6	6	59011	59016	0 %	100 %	0 %	0 %	127510983
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1073	NC_009092	CTG	2	6	59533	59538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510984
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1102	NC_009092	CGAT	2	8	60572	60579	25 %	25 %	25 %	25 %	127510984
1103	NC_009092	CAA	2	6	60588	60593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510984
1104	NC_009092	GGTG	2	8	60594	60601	0 %	25 %	75 %	0 %	127510984
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1124	NC_009092	GA	3	6	61446	61451	50 %	0 %	50 %	0 %	127510985
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1495	NC_009092	CTG	2	6	81453	81458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511003
1496	NC_009092	CAC	2	6	81470	81475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511003
1497	NC_009092	CAG	2	6	81483	81488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511003
1498	NC_009092	GATG	2	8	81524	81531	25 %	25 %	50 %	0 %	127511003
1499	NC_009092	G	6	6	81560	81565	0 %	0 %	100 %	0 %	127511003
1500	NC_009092	GAT	2	6	81582	81587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511003

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