MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009092	GTTC	2	8	27652	27659	0 %	50 %	25 %	25 %	127510959
502	NC_009092	GT	3	6	27664	27669	0 %	50 %	50 %	0 %	127510959
503	NC_009092	CCA	2	6	27700	27705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510959
504	NC_009092	GC	3	6	27714	27719	0 %	0 %	50 %	50 %	127510959
505	NC_009092	ATC	2	6	27816	27821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510959
506	NC_009092	GCG	2	6	28249	28254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510960
507	NC_009092	GGC	2	6	28416	28421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510960
508	NC_009092	CTT	2	6	28434	28439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510960
509	NC_009092	GTG	2	6	28450	28455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510960
510	NC_009092	AAC	2	6	28486	28491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510960
511	NC_009092	CT	3	6	28516	28521	0 %	50 %	0 %	50 %	127510960
512	NC_009092	CCT	2	6	28571	28576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127510960
513	NC_009092	GAT	2	6	28596	28601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510960
514	NC_009092	CTG	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510960
515	NC_009092	GTTT	2	8	28848	28855	0 %	75 %	25 %	0 %	127510961
516	NC_009092	GTC	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510961
517	NC_009092	GCT	2	6	29026	29031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510961
518	NC_009092	CTT	2	6	29038	29043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510961
519	NC_009092	CGC	2	6	29071	29076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510961
520	NC_009092	GTG	2	6	29135	29140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510961
521	NC_009092	AGC	2	6	29169	29174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510961
522	NC_009092	GCG	2	6	29184	29189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510961
523	NC_009092	GCG	2	6	29217	29222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510961
524	NC_009092	AAC	2	6	29231	29236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510961
525	NC_009092	AGG	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127510961
526	NC_009092	CCG	2	6	29303	29308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510961
527	NC_009092	AAGA	2	8	29342	29349	75 %	0 %	25 %	0 %	127510961
528	NC_009092	CCTG	2	8	29356	29363	0 %	25 %	25 %	50 %	127510961
529	NC_009092	CGC	2	6	29575	29580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510962
530	NC_009092	AGC	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510962
531	NC_009092	TCT	2	6	29670	29675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510962
532	NC_009092	CAG	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510962
533	NC_009092	AG	3	6	29704	29709	50 %	0 %	50 %	0 %	127510962
534	NC_009092	AGT	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510962
535	NC_009092	ATG	3	9	29823	29831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510962
536	NC_009092	CTG	2	6	29894	29899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510962
537	NC_009092	AGA	2	6	30016	30021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510962
538	NC_009092	GCC	2	6	30114	30119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510963
539	NC_009092	CAG	2	6	30137	30142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510963
540	NC_009092	GAT	2	6	30217	30222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
541	NC_009092	GCA	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510963
542	NC_009092	TGA	2	6	30346	30351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
543	NC_009092	CGCC	2	8	30421	30428	0 %	0 %	25 %	75 %	127510963
544	NC_009092	ATG	3	9	30440	30448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
545	NC_009092	GC	3	6	30472	30477	0 %	0 %	50 %	50 %	127510963
546	NC_009092	CCA	2	6	30505	30510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510963
547	NC_009092	GGC	2	6	30560	30565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510963
548	NC_009092	ATCT	2	8	30584	30591	25 %	50 %	0 %	25 %	127510963
549	NC_009092	CTGT	2	8	30611	30618	0 %	50 %	25 %	25 %	127510963
550	NC_009092	GA	3	6	30633	30638	50 %	0 %	50 %	0 %	127510963
551	NC_009092	TGA	2	6	30670	30675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
552	NC_009092	TC	3	6	30685	30690	0 %	50 %	0 %	50 %	127510963
553	NC_009092	TGC	2	6	30724	30729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510963
554	NC_009092	CTG	2	6	30745	30750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510963
555	NC_009092	AGC	2	6	30786	30791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510963
556	NC_009092	CCT	2	6	30820	30825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127510963
557	NC_009092	GGT	2	6	30845	30850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510963
558	NC_009092	CGG	2	6	30934	30939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510963
559	NC_009092	TAT	2	6	31235	31240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127510964
560	NC_009092	GC	3	6	31274	31279	0 %	0 %	50 %	50 %	127510964
561	NC_009092	GGC	2	6	31293	31298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510964
562	NC_009092	GCT	2	6	31370	31375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510964
563	NC_009092	CTGAG	2	10	31378	31387	20 %	20 %	40 %	20 %	127510964
564	NC_009092	AAG	2	6	31389	31394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510964
565	NC_009092	TCG	2	6	31423	31428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510964
566	NC_009092	ACA	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510964
567	NC_009092	GGC	2	6	31451	31456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510964
568	NC_009092	CTT	2	6	31457	31462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510964
569	NC_009092	CAG	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510964
570	NC_009092	GAA	2	6	31547	31552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510964
571	NC_009092	AT	3	6	31563	31568	50 %	50 %	0 %	0 %	127510964
572	NC_009092	GCTC	2	8	31598	31605	0 %	25 %	25 %	50 %	127510964
573	NC_009092	ATA	2	6	31645	31650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127510964
574	NC_009092	CTG	2	6	31746	31751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510964
575	NC_009092	GGCA	2	8	31852	31859	25 %	0 %	50 %	25 %	127510964
576	NC_009092	CT	3	6	31871	31876	0 %	50 %	0 %	50 %	127510964
577	NC_009092	TCA	2	6	32110	32115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510965
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579	NC_009092	TGGA	2	8	32313	32320	25 %	25 %	50 %	0 %	127510965
580	NC_009092	GCCA	2	8	32339	32346	25 %	0 %	25 %	50 %	127510965
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582	NC_009092	AC	3	6	32588	32593	50 %	0 %	0 %	50 %	127510965
583	NC_009092	CCAT	2	8	32653	32660	25 %	25 %	0 %	50 %	127510965
584	NC_009092	CAC	2	6	32672	32677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510965
585	NC_009092	GCC	2	6	32721	32726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510965
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587	NC_009092	TCA	2	6	32819	32824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510965
588	NC_009092	TCATC	2	10	32828	32837	20 %	40 %	0 %	40 %	127510965
589	NC_009092	GTTA	2	8	33282	33289	25 %	50 %	25 %	0 %	127510966
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592	NC_009092	GGT	2	6	33372	33377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510966
593	NC_009092	AGC	2	6	33389	33394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510966
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596	NC_009092	TCG	2	6	33491	33496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510966
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598	NC_009092	TC	3	6	33523	33528	0 %	50 %	0 %	50 %	127510966
599	NC_009092	TCG	2	6	33541	33546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510966
600	NC_009092	GGC	2	6	33555	33560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510966
601	NC_009092	GCCAAG	2	12	33613	33624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510966
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606	NC_009092	CGA	2	6	33860	33865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510966
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608	NC_009092	GGC	2	6	33957	33962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510966
609	NC_009092	ATGT	2	8	34117	34124	25 %	50 %	25 %	0 %	127510966
610	NC_009092	GC	3	6	34125	34130	0 %	0 %	50 %	50 %	127510966
611	NC_009092	AGT	2	6	34251	34256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510966
612	NC_009092	GAC	2	6	34257	34262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510966
613	NC_009092	GATC	2	8	34272	34279	25 %	25 %	25 %	25 %	127510966
614	NC_009092	AGA	2	6	34340	34345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510966
615	NC_009092	TGG	2	6	34364	34369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510966
616	NC_009092	T	6	6	34434	34439	0 %	100 %	0 %	0 %	127510967
617	NC_009092	ATCG	2	8	34441	34448	25 %	25 %	25 %	25 %	127510967
618	NC_009092	ATT	2	6	34474	34479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127510967
619	NC_009092	CT	3	6	34498	34503	0 %	50 %	0 %	50 %	127510967
620	NC_009092	GCC	2	6	34542	34547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510967
621	NC_009092	GTG	2	6	34552	34557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510967
622	NC_009092	AGC	2	6	34622	34627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510967
623	NC_009092	CAA	2	6	34812	34817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510967
624	NC_009092	GAA	2	6	34875	34880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510967
625	NC_009092	CAT	2	6	35031	35036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510967
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