MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009092	TGT	2	6	334249	334254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511241
6002	NC_009092	CCAG	2	8	334265	334272	25 %	0 %	25 %	50 %	127511241
6003	NC_009092	GCC	2	6	334296	334301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511241
6004	NC_009092	TGA	2	6	334463	334468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511241
6005	NC_009092	GAC	2	6	334663	334668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511242
6006	NC_009092	TCTG	2	8	334720	334727	0 %	50 %	25 %	25 %	127511242
6007	NC_009092	TAG	2	6	334770	334775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511242
6008	NC_009092	GCA	2	6	334855	334860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511242
6009	NC_009092	CCA	2	6	334899	334904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511242
6010	NC_009092	AGT	2	6	334936	334941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511242
6011	NC_009092	GTC	2	6	334964	334969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511242
6012	NC_009092	TCT	2	6	335011	335016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511242
6013	NC_009092	GGC	2	6	335060	335065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511242
6014	NC_009092	GC	3	6	335079	335084	0 %	0 %	50 %	50 %	127511242
6015	NC_009092	TGCC	2	8	335217	335224	0 %	25 %	25 %	50 %	127511242
6016	NC_009092	TCT	2	6	335239	335244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511242
6017	NC_009092	T	6	6	335252	335257	0 %	100 %	0 %	0 %	127511243
6018	NC_009092	TCA	2	6	335269	335274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511243
6019	NC_009092	CGG	2	6	335338	335343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511243
6020	NC_009092	GT	4	8	335348	335355	0 %	50 %	50 %	0 %	127511243
6021	NC_009092	ACA	2	6	335444	335449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511243
6022	NC_009092	TAC	2	6	335513	335518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511243
6023	NC_009092	GTA	2	6	335607	335612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511243
6024	NC_009092	TGG	2	6	335690	335695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511243
6025	NC_009092	CGA	2	6	335729	335734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511243
6026	NC_009092	ATCTTT	2	12	335742	335753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	127511243
6027	NC_009092	CG	3	6	335804	335809	0 %	0 %	50 %	50 %	127511243
6028	NC_009092	GCC	2	6	335817	335822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511243
6029	NC_009092	AAT	2	6	335841	335846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511243
6030	NC_009092	ATT	2	6	335860	335865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511243
6031	NC_009092	AGT	2	6	335931	335936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511244
6032	NC_009092	GAT	2	6	335969	335974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511244
6033	NC_009092	TCG	2	6	335976	335981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6034	NC_009092	GGC	2	6	336101	336106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511244
6035	NC_009092	CGA	2	6	336181	336186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6036	NC_009092	TCGCC	2	10	336217	336226	0 %	20 %	20 %	60 %	127511244
6037	NC_009092	CTTC	2	8	336241	336248	0 %	50 %	0 %	50 %	127511244
6038	NC_009092	ACC	2	6	336266	336271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511244
6039	NC_009092	ACC	2	6	336323	336328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511244
6040	NC_009092	ACC	2	6	336389	336394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511244
6041	NC_009092	TAG	2	6	336417	336422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511244
6042	NC_009092	GCC	2	6	336453	336458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511244
6043	NC_009092	GCA	2	6	336535	336540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6044	NC_009092	CGA	2	6	336586	336591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6045	NC_009092	GAA	2	6	336617	336622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511244
6046	NC_009092	CGTTGG	2	12	336643	336654	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	127511244
6047	NC_009092	GAC	2	6	336664	336669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6048	NC_009092	GCT	2	6	336718	336723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511244
6049	NC_009092	TTTG	2	8	336928	336935	0 %	75 %	25 %	0 %	127511244
6050	NC_009092	CAC	2	6	336952	336957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511244
6051	NC_009092	CCA	2	6	337047	337052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511244
6052	NC_009092	ATGCG	2	10	337126	337135	20 %	20 %	40 %	20 %	127511244
6053	NC_009092	TGA	2	6	337382	337387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511245
6054	NC_009092	ATG	2	6	337414	337419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511245
6055	NC_009092	CGT	2	6	337433	337438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6056	NC_009092	AGTTC	2	10	337456	337465	20 %	40 %	20 %	20 %	127511245
6057	NC_009092	TGT	2	6	337506	337511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511245
6058	NC_009092	CGG	2	6	337586	337591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511245
6059	NC_009092	CAG	2	6	337644	337649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6060	NC_009092	ATG	2	6	337675	337680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511245
6061	NC_009092	ACA	2	6	337696	337701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511245
6062	NC_009092	CG	4	8	337778	337785	0 %	0 %	50 %	50 %	127511245
6063	NC_009092	CGG	2	6	337850	337855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511245
6064	NC_009092	GA	3	6	337932	337937	50 %	0 %	50 %	0 %	127511245
6065	NC_009092	CGC	2	6	337946	337951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511245
6066	NC_009092	ACGTT	2	10	337963	337972	20 %	40 %	20 %	20 %	127511245
6067	NC_009092	GCGG	2	8	338018	338025	0 %	0 %	75 %	25 %	127511245
6068	NC_009092	AGCTCG	2	12	338029	338040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6069	NC_009092	CTG	2	6	338103	338108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6070	NC_009092	GC	3	6	338124	338129	0 %	0 %	50 %	50 %	127511245
6071	NC_009092	TCG	2	6	338176	338181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6072	NC_009092	GCT	2	6	338240	338245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6073	NC_009092	CGG	2	6	338273	338278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511245
6074	NC_009092	GC	3	6	338311	338316	0 %	0 %	50 %	50 %	127511245
6075	NC_009092	CCT	2	6	338348	338353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511245
6076	NC_009092	CTG	2	6	338358	338363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511245
6077	NC_009092	ATG	2	6	338455	338460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511245
6078	NC_009092	CACCTG	2	12	338481	338492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	127511245
6079	NC_009092	GGC	2	6	338577	338582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511245
6080	NC_009092	GAT	2	6	338592	338597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511245
6081	NC_009092	TGG	2	6	338609	338614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511245
6082	NC_009092	TCA	2	6	338624	338629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511245
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6084	NC_009092	CCA	2	6	338754	338759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511246
6085	NC_009092	CAG	3	9	338824	338832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511246
6086	NC_009092	CATC	2	8	338910	338917	25 %	25 %	0 %	50 %	127511246
6087	NC_009092	C	7	7	338992	338998	0 %	0 %	0 %	100 %	127511246
6088	NC_009092	AG	3	6	339055	339060	50 %	0 %	50 %	0 %	127511246
6089	NC_009092	TGT	2	6	339114	339119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511246
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6091	NC_009092	ATG	2	6	339299	339304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511246
6092	NC_009092	GCA	2	6	339345	339350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511246
6093	NC_009092	TGATC	2	10	339465	339474	20 %	40 %	20 %	20 %	127511246
6094	NC_009092	TCA	2	6	339513	339518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511246
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6099	NC_009092	TGC	2	6	339734	339739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511246
6100	NC_009092	CT	3	6	339842	339847	0 %	50 %	0 %	50 %	127511246
6101	NC_009092	GCC	2	6	339904	339909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511246
6102	NC_009092	ATG	2	6	339920	339925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511246
6103	NC_009092	CGA	2	6	339939	339944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511246
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6105	NC_009092	GGT	2	6	339991	339996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511246
6106	NC_009092	GCC	2	6	340057	340062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511246
6107	NC_009092	CTT	2	6	340138	340143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511246
6108	NC_009092	CAC	2	6	340255	340260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511246
6109	NC_009092	G	6	6	340287	340292	0 %	0 %	100 %	0 %	127511246
6110	NC_009092	AGTG	2	8	340380	340387	25 %	25 %	50 %	0 %	127511246
6111	NC_009092	TGC	2	6	340433	340438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511246
6112	NC_009092	ACAT	2	8	340460	340467	50 %	25 %	0 %	25 %	127511246
6113	NC_009092	CAC	2	6	340500	340505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511246
6114	NC_009092	TC	3	6	340551	340556	0 %	50 %	0 %	50 %	127511246
6115	NC_009092	GAG	2	6	340582	340587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511246
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6118	NC_009092	TTA	2	6	340992	340997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511247
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6120	NC_009092	GCC	2	6	341059	341064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511247
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6479	NC_009092	CGA	2	6	363555	363560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511251
6480	NC_009092	AGC	2	6	363566	363571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511251
6481	NC_009092	CACGT	2	10	363589	363598	20 %	20 %	20 %	40 %	127511251
6482	NC_009092	AGC	2	6	363709	363714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511252
6483	NC_009092	GCT	2	6	363737	363742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511252
6484	NC_009092	CTA	2	6	363803	363808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511252
6485	NC_009092	TCG	2	6	363967	363972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511252
6486	NC_009092	CCG	2	6	364025	364030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511252
6487	NC_009092	GCC	2	6	364081	364086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511252
6488	NC_009092	GC	3	6	364173	364178	0 %	0 %	50 %	50 %	127511252
6489	NC_009092	CGA	2	6	364217	364222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511252
6490	NC_009092	TGCCT	2	10	364368	364377	0 %	40 %	20 %	40 %	127511252
6491	NC_009092	ACC	2	6	364419	364424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511252
6492	NC_009092	GCA	2	6	364475	364480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511252
6493	NC_009092	CGA	2	6	364484	364489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511252
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6495	NC_009092	CGG	2	6	364830	364835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511253
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6499	NC_009092	TGGT	2	8	365141	365148	0 %	50 %	50 %	0 %	127511253
6500	NC_009092	CGA	2	6	365167	365172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511253

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