MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009092	TGC	2	6	307844	307849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511222
5502	NC_009092	GCG	2	6	307886	307891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511222
5503	NC_009092	AGA	2	6	308022	308027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511222
5504	NC_009092	AGA	2	6	308556	308561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511223
5505	NC_009092	TCA	2	6	308580	308585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511223
5506	NC_009092	CAT	2	6	308638	308643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511223
5507	NC_009092	GTC	2	6	308691	308696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5508	NC_009092	GCC	2	6	308708	308713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511223
5509	NC_009092	CGC	2	6	308716	308721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511223
5510	NC_009092	GAG	2	6	308954	308959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511223
5511	NC_009092	CGC	2	6	308992	308997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511223
5512	NC_009092	TGG	2	6	309021	309026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511223
5513	NC_009092	CTG	2	6	309053	309058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5514	NC_009092	GCG	2	6	309171	309176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511223
5515	NC_009092	GGCG	2	8	309187	309194	0 %	0 %	75 %	25 %	127511223
5516	NC_009092	AGC	2	6	309201	309206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5517	NC_009092	TCA	2	6	309216	309221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511223
5518	NC_009092	GCA	2	6	309264	309269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5519	NC_009092	CGG	2	6	309313	309318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511223
5520	NC_009092	GGC	2	6	309322	309327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511223
5521	NC_009092	CTG	3	9	309353	309361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5522	NC_009092	CGA	2	6	309379	309384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5523	NC_009092	GGT	2	6	309427	309432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511223
5524	NC_009092	GATATC	2	12	309440	309451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	127511223
5525	NC_009092	CTGG	2	8	309547	309554	0 %	25 %	50 %	25 %	127511223
5526	NC_009092	GGC	2	6	309643	309648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511223
5527	NC_009092	GTG	2	6	309668	309673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511223
5528	NC_009092	CGG	2	6	309783	309788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511223
5529	NC_009092	TG	3	6	309821	309826	0 %	50 %	50 %	0 %	127511223
5530	NC_009092	ATG	2	6	309854	309859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511223
5531	NC_009092	ACC	2	6	309875	309880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511223
5532	NC_009092	CTG	2	6	309911	309916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5533	NC_009092	CAA	2	6	309953	309958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511223
5534	NC_009092	T	6	6	309962	309967	0 %	100 %	0 %	0 %	127511223
5535	NC_009092	GAA	2	6	309968	309973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511223
5536	NC_009092	GACC	2	8	309985	309992	25 %	0 %	25 %	50 %	127511223
5537	NC_009092	CGA	2	6	310084	310089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5538	NC_009092	CGA	2	6	310132	310137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511223
5539	NC_009092	GCC	2	6	310162	310167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511223
5540	NC_009092	ATG	2	6	310187	310192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511223
5541	NC_009092	ACC	2	6	310336	310341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511224
5542	NC_009092	TGG	3	9	310352	310360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511224
5543	NC_009092	AGCG	2	8	310363	310370	25 %	0 %	50 %	25 %	127511224
5544	NC_009092	CG	3	6	310369	310374	0 %	0 %	50 %	50 %	127511224
5545	NC_009092	CGC	2	6	310446	310451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511224
5546	NC_009092	CAG	2	6	310522	310527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511225
5547	NC_009092	GA	3	6	310546	310551	50 %	0 %	50 %	0 %	127511225
5548	NC_009092	G	6	6	310561	310566	0 %	0 %	100 %	0 %	127511225
5549	NC_009092	CGG	2	6	310654	310659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511225
5550	NC_009092	TAA	2	6	310775	310780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511225
5551	NC_009092	CGC	2	6	310787	310792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511225
5552	NC_009092	TGG	2	6	310870	310875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511225
5553	NC_009092	G	6	6	310888	310893	0 %	0 %	100 %	0 %	127511225
5554	NC_009092	GCA	2	6	310909	310914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511225
5555	NC_009092	GCG	2	6	310921	310926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511225
5556	NC_009092	CCT	2	6	310942	310947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511225
5557	NC_009092	ATACC	2	10	310966	310975	40 %	20 %	0 %	40 %	127511225
5558	NC_009092	GGCG	2	8	310988	310995	0 %	0 %	75 %	25 %	127511225
5559	NC_009092	TC	3	6	311003	311008	0 %	50 %	0 %	50 %	127511225
5560	NC_009092	GGTGCC	2	12	311091	311102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	127511225
5561	NC_009092	GCC	2	6	311151	311156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511225
5562	NC_009092	CTG	2	6	311160	311165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511225
5563	NC_009092	CAT	2	6	311183	311188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511225
5564	NC_009092	GA	3	6	311198	311203	50 %	0 %	50 %	0 %	127511225
5565	NC_009092	GGT	2	6	311216	311221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511225
5566	NC_009092	CG	3	6	311236	311241	0 %	0 %	50 %	50 %	127511225
5567	NC_009092	CCG	3	9	311281	311289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511225
5568	NC_009092	CTT	2	6	311372	311377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511225
5569	NC_009092	GCT	2	6	311423	311428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511225
5570	NC_009092	GC	4	8	311596	311603	0 %	0 %	50 %	50 %	127511226
5571	NC_009092	GGCG	2	8	311609	311616	0 %	0 %	75 %	25 %	127511226
5572	NC_009092	TGG	2	6	311720	311725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5573	NC_009092	GGCG	2	8	311742	311749	0 %	0 %	75 %	25 %	127511226
5574	NC_009092	GAT	2	6	311782	311787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511226
5575	NC_009092	CGG	2	6	311805	311810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5576	NC_009092	CT	3	6	311820	311825	0 %	50 %	0 %	50 %	127511226
5577	NC_009092	GT	3	6	311893	311898	0 %	50 %	50 %	0 %	127511226
5578	NC_009092	GGC	2	6	311937	311942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5579	NC_009092	GTG	2	6	311962	311967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5580	NC_009092	CGG	2	6	311976	311981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5581	NC_009092	TGG	2	6	312035	312040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5582	NC_009092	TGG	2	6	312047	312052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5583	NC_009092	GAT	2	6	312061	312066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511226
5584	NC_009092	GCT	2	6	312204	312209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5585	NC_009092	CGC	2	6	312226	312231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511226
5586	NC_009092	CTT	2	6	312237	312242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511226
5587	NC_009092	CTA	2	6	312279	312284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511226
5588	NC_009092	GAT	2	6	312289	312294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511226
5589	NC_009092	GGC	2	6	312370	312375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5590	NC_009092	AGG	2	6	312413	312418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511226
5591	NC_009092	CTG	2	6	312574	312579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5592	NC_009092	CAG	2	6	312667	312672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5593	NC_009092	GCC	2	6	312679	312684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511226
5594	NC_009092	CAC	2	6	312702	312707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511226
5595	NC_009092	TCAG	2	8	312791	312798	25 %	25 %	25 %	25 %	127511226
5596	NC_009092	GGC	2	6	312802	312807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5597	NC_009092	CCG	2	6	312857	312862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511226
5598	NC_009092	GAC	2	6	312919	312924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5599	NC_009092	GGC	2	6	312943	312948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5600	NC_009092	GGT	2	6	312951	312956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5601	NC_009092	CCA	2	6	313028	313033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511226
5602	NC_009092	GACG	2	8	313081	313088	25 %	0 %	50 %	25 %	127511226
5603	NC_009092	CT	3	6	313111	313116	0 %	50 %	0 %	50 %	127511226
5604	NC_009092	GGC	3	9	313137	313145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511226
5605	NC_009092	TGG	2	6	313163	313168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511226
5606	NC_009092	CGA	2	6	313227	313232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5607	NC_009092	TCG	2	6	313245	313250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511226
5608	NC_009092	CCA	2	6	313343	313348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511226
5609	NC_009092	GGA	2	6	313386	313391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511226
5610	NC_009092	TAT	2	6	313439	313444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511227
5611	NC_009092	AGA	2	6	313449	313454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511227
5612	NC_009092	GTC	2	6	313462	313467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511227
5613	NC_009092	ATG	2	6	313473	313478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511227
5614	NC_009092	CGC	2	6	313491	313496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511227
5615	NC_009092	CAA	2	6	313507	313512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511227
5616	NC_009092	GC	3	6	313520	313525	0 %	0 %	50 %	50 %	127511227
5617	NC_009092	GCG	2	6	313587	313592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511227
5618	NC_009092	AGG	2	6	313620	313625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511227
5619	NC_009092	GTG	2	6	313640	313645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511227
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5742	NC_009092	CCGG	2	8	320399	320406	0 %	0 %	50 %	50 %	127511232
5743	NC_009092	CCA	2	6	320462	320467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511232
5744	NC_009092	TGG	2	6	320556	320561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511232
5745	NC_009092	CT	3	6	320574	320579	0 %	50 %	0 %	50 %	127511232
5746	NC_009092	GCT	2	6	320635	320640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511232
5747	NC_009092	GGT	2	6	320652	320657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511232
5748	NC_009092	GATC	2	8	320716	320723	25 %	25 %	25 %	25 %	127511232
5749	NC_009092	GCG	2	6	320802	320807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511232
5750	NC_009092	TGG	2	6	320923	320928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511232
5751	NC_009092	GCC	2	6	320942	320947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511232
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5753	NC_009092	GCG	2	6	321010	321015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511232
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5755	NC_009092	CTCG	2	8	321233	321240	0 %	25 %	25 %	50 %	127511233
5756	NC_009092	CG	3	6	321250	321255	0 %	0 %	50 %	50 %	127511233
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5772	NC_009092	GC	3	6	322146	322151	0 %	0 %	50 %	50 %	127511234
5773	NC_009092	CAG	2	6	322214	322219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511234
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5849	NC_009092	GCT	2	6	326794	326799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511238
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5863	NC_009092	TGA	2	6	327477	327482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511239
5864	NC_009092	TGA	2	6	327510	327515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511239
5865	NC_009092	CGA	2	6	327622	327627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511239
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5981	NC_009092	GCT	2	6	333326	333331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511241
5982	NC_009092	TTG	2	6	333361	333366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511241
5983	NC_009092	TGT	2	6	333425	333430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511241
5984	NC_009092	TGC	2	6	333530	333535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511241
5985	NC_009092	GGC	2	6	333579	333584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511241
5986	NC_009092	TCT	2	6	333632	333637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511241
5987	NC_009092	ACA	2	6	333641	333646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511241
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5989	NC_009092	CAT	2	6	333717	333722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511241
5990	NC_009092	TTG	2	6	333733	333738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511241
5991	NC_009092	GGC	2	6	333761	333766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511241
5992	NC_009092	CAT	2	6	333768	333773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511241
5993	NC_009092	AT	3	6	333772	333777	50 %	50 %	0 %	0 %	127511241
5994	NC_009092	TTC	2	6	333814	333819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511241
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5997	NC_009092	ATG	2	6	334030	334035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511241
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6000	NC_009092	CGT	2	6	334232	334237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511241

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