MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009092	AGC	2	6	250903	250908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511169
4502	NC_009092	GCC	2	6	250921	250926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511169
4503	NC_009092	GCTC	2	8	251024	251031	0 %	25 %	25 %	50 %	127511169
4504	NC_009092	ATC	2	6	251052	251057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511169
4505	NC_009092	CGT	2	6	251078	251083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511169
4506	NC_009092	CTG	2	6	251214	251219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511169
4507	NC_009092	GA	3	6	251276	251281	50 %	0 %	50 %	0 %	127511169
4508	NC_009092	TGGC	2	8	251359	251366	0 %	25 %	50 %	25 %	127511169
4509	NC_009092	TTGA	2	8	251513	251520	25 %	50 %	25 %	0 %	127511170
4510	NC_009092	A	6	6	251534	251539	100 %	0 %	0 %	0 %	127511170
4511	NC_009092	CGA	2	6	251576	251581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4512	NC_009092	GGT	2	6	251582	251587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511170
4513	NC_009092	CCG	2	6	251605	251610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511170
4514	NC_009092	CGG	2	6	251638	251643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511170
4515	NC_009092	GCT	2	6	251687	251692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4516	NC_009092	CAC	2	6	251720	251725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511170
4517	NC_009092	CTG	2	6	251769	251774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4518	NC_009092	GGC	2	6	251789	251794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511170
4519	NC_009092	CAG	2	6	251802	251807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4520	NC_009092	GCT	2	6	251861	251866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4521	NC_009092	CAT	2	6	251873	251878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511170
4522	NC_009092	GCT	2	6	251906	251911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4523	NC_009092	GCA	2	6	251951	251956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4524	NC_009092	TGG	2	6	252040	252045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511170
4525	NC_009092	GCC	2	6	252072	252077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511170
4526	NC_009092	CGG	2	6	252082	252087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511170
4527	NC_009092	TGC	2	6	252139	252144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511170
4528	NC_009092	GGC	2	6	252170	252175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511170
4529	NC_009092	GCGTT	2	10	252369	252378	0 %	40 %	40 %	20 %	127511170
4530	NC_009092	TAG	2	6	252379	252384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511170
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4532	NC_009092	CGC	2	6	252528	252533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511171
4533	NC_009092	CGG	3	9	252612	252620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511171
4534	NC_009092	GTG	2	6	252698	252703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511171
4535	NC_009092	CTC	2	6	252787	252792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511171
4536	NC_009092	CCG	2	6	252798	252803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511171
4537	NC_009092	GC	3	6	252817	252822	0 %	0 %	50 %	50 %	127511171
4538	NC_009092	TCG	2	6	252839	252844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4539	NC_009092	CCA	2	6	252846	252851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511171
4540	NC_009092	GGC	2	6	252895	252900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511171
4541	NC_009092	GGTT	2	8	252915	252922	0 %	50 %	50 %	0 %	127511171
4542	NC_009092	CGAT	2	8	252977	252984	25 %	25 %	25 %	25 %	127511171
4543	NC_009092	CGG	2	6	252999	253004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511171
4544	NC_009092	AGG	2	6	253101	253106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511171
4545	NC_009092	CGT	2	6	253131	253136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4546	NC_009092	GCA	2	6	253272	253277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4547	NC_009092	CAT	2	6	253285	253290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511171
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4549	NC_009092	AGG	2	6	253439	253444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511171
4550	NC_009092	CAAG	2	8	253455	253462	50 %	0 %	25 %	25 %	127511171
4551	NC_009092	ATG	2	6	253484	253489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511171
4552	NC_009092	TCG	2	6	253652	253657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4553	NC_009092	GAT	2	6	253663	253668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511171
4554	NC_009092	CTG	2	6	253672	253677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4555	NC_009092	TGA	2	6	253764	253769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511171
4556	NC_009092	ACA	2	6	253802	253807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511171
4557	NC_009092	CAC	2	6	253840	253845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511171
4558	NC_009092	TTC	2	6	253859	253864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511171
4559	NC_009092	CGT	2	6	253893	253898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4560	NC_009092	CTG	2	6	253942	253947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511171
4561	NC_009092	GA	3	6	254072	254077	50 %	0 %	50 %	0 %	127511171
4562	NC_009092	CG	3	6	254090	254095	0 %	0 %	50 %	50 %	127511171
4563	NC_009092	TGG	2	6	254241	254246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511171
4564	NC_009092	TCG	2	6	254474	254479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511172
4565	NC_009092	TTCCA	2	10	254540	254549	20 %	40 %	0 %	40 %	127511172
4566	NC_009092	GTG	2	6	254552	254557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511172
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4569	NC_009092	CCA	2	6	254772	254777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511172
4570	NC_009092	GCC	2	6	254953	254958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511172
4571	NC_009092	CGA	2	6	254988	254993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511172
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4574	NC_009092	GA	3	6	255246	255251	50 %	0 %	50 %	0 %	127511172
4575	NC_009092	TC	3	6	255257	255262	0 %	50 %	0 %	50 %	127511172
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4588	NC_009092	GCCAG	2	10	255881	255890	20 %	0 %	40 %	40 %	127511173
4589	NC_009092	ACC	2	6	255893	255898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511173
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4591	NC_009092	GCC	2	6	255997	256002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511173
4592	NC_009092	GCT	2	6	256114	256119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511173
4593	NC_009092	CCA	2	6	256128	256133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511173
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4600	NC_009092	CAG	2	6	256450	256455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511173
4601	NC_009092	CTG	2	6	256528	256533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511173
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4604	NC_009092	TTG	2	6	256898	256903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511174
4605	NC_009092	CGG	2	6	256906	256911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511174
4606	NC_009092	GCAG	2	8	256921	256928	25 %	0 %	50 %	25 %	127511174
4607	NC_009092	CGGC	2	8	256960	256967	0 %	0 %	50 %	50 %	127511174
4608	NC_009092	TCG	2	6	256980	256985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511174
4609	NC_009092	GACCA	2	10	256988	256997	40 %	0 %	20 %	40 %	127511174
4610	NC_009092	TTG	2	6	257000	257005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511174
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4615	NC_009092	TAGGT	2	10	257329	257338	20 %	40 %	40 %	0 %	127511175
4616	NC_009092	TTGC	2	8	257372	257379	0 %	50 %	25 %	25 %	127511175
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4618	NC_009092	CAG	2	6	257470	257475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511175
4619	NC_009092	CA	4	8	257479	257486	50 %	0 %	0 %	50 %	127511175
4620	NC_009092	CGT	2	6	257508	257513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511175
4621	NC_009092	CA	3	6	257553	257558	50 %	0 %	0 %	50 %	127511175
4622	NC_009092	CAC	2	6	257590	257595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511175
4623	NC_009092	TGCA	2	8	257663	257670	25 %	25 %	25 %	25 %	127511175
4624	NC_009092	CTTCA	2	10	257710	257719	20 %	40 %	0 %	40 %	127511175
4625	NC_009092	GGCA	2	8	257772	257779	25 %	0 %	50 %	25 %	127511175
4626	NC_009092	CGCGA	2	10	257876	257885	20 %	0 %	40 %	40 %	127511176
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4632	NC_009092	GTTG	2	8	258058	258065	0 %	50 %	50 %	0 %	127511176
4633	NC_009092	GTT	2	6	258083	258088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511176
4634	NC_009092	CAG	2	6	258206	258211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511176
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4648	NC_009092	AGC	2	6	259182	259187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511176
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4651	NC_009092	TGA	2	6	259384	259389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511176
4652	NC_009092	TGG	2	6	259408	259413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511176
4653	NC_009092	TGT	2	6	259456	259461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511176
4654	NC_009092	GGTA	2	8	259480	259487	25 %	25 %	50 %	0 %	127511176
4655	NC_009092	GGC	2	6	259514	259519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511176
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4665	NC_009092	CGG	2	6	259768	259773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511176
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4986	NC_009092	AGG	2	6	278819	278824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511193
4987	NC_009092	GCC	2	6	278863	278868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511193
4988	NC_009092	GCGG	2	8	278869	278876	0 %	0 %	75 %	25 %	127511193
4989	NC_009092	ATG	2	6	278923	278928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511193
4990	NC_009092	GCA	3	9	278936	278944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511193
4991	NC_009092	TC	4	8	278969	278976	0 %	50 %	0 %	50 %	127511193
4992	NC_009092	TTG	2	6	279019	279024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511193
4993	NC_009092	CTTGG	2	10	279120	279129	0 %	40 %	40 %	20 %	127511193
4994	NC_009092	GGC	2	6	279159	279164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511193
4995	NC_009092	GCA	2	6	279182	279187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511193
4996	NC_009092	AT	3	6	279543	279548	50 %	50 %	0 %	0 %	127511194
4997	NC_009092	ATT	2	6	279553	279558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511194
4998	NC_009092	CAA	2	6	279619	279624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511194
4999	NC_009092	GGT	2	6	279648	279653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511194
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