MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal03

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009037	AAG	2	6	160	165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
2	NC_009037	TTAT	2	8	213	220	25 %	75 %	0 %	0 %	126090320
3	NC_009037	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
4	NC_009037	GCC	2	6	289	294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
5	NC_009037	GTG	2	6	401	406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
6	NC_009037	AGC	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
7	NC_009037	GGCA	2	8	468	475	25 %	0 %	50 %	25 %	126090320
8	NC_009037	AAG	2	6	497	502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
9	NC_009037	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
10	NC_009037	TTC	2	6	604	609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
11	NC_009037	TCA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
12	NC_009037	TAT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090320
13	NC_009037	CGC	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
14	NC_009037	CTGC	2	8	748	755	0 %	25 %	25 %	50 %	126090320
15	NC_009037	CAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
16	NC_009037	TCAAGA	2	12	827	838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126090320
17	NC_009037	GTC	2	6	938	943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
18	NC_009037	GC	3	6	952	957	0 %	0 %	50 %	50 %	126090320
19	NC_009037	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	126090320
20	NC_009037	AT	3	6	1011	1016	50 %	50 %	0 %	0 %	126090320
21	NC_009037	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
22	NC_009037	AGA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
23	NC_009037	ATG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
24	NC_009037	CCA	2	6	1264	1269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090320
25	NC_009037	TGC	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
26	NC_009037	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
27	NC_009037	CGT	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
28	NC_009037	TGA	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
29	NC_009037	AGA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
30	NC_009037	TCG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
31	NC_009037	GAA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
32	NC_009037	CAT	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
33	NC_009037	CGA	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
34	NC_009037	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
35	NC_009037	CCG	2	6	1491	1496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090320
36	NC_009037	GC	3	6	1557	1562	0 %	0 %	50 %	50 %	126090320
37	NC_009037	CGTG	2	8	1563	1570	0 %	25 %	50 %	25 %	126090320
38	NC_009037	TTC	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
39	NC_009037	TTC	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090320
40	NC_009037	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090320
41	NC_009037	CGT	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
42	NC_009037	GGT	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
43	NC_009037	GAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
44	NC_009037	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
45	NC_009037	GTC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
46	NC_009037	GC	3	6	2076	2081	0 %	0 %	50 %	50 %	126090320
47	NC_009037	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090320
48	NC_009037	TGC	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
49	NC_009037	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
50	NC_009037	TAG	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
51	NC_009037	ACGC	2	8	2256	2263	25 %	0 %	25 %	50 %	126090320
52	NC_009037	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
53	NC_009037	GTG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
54	NC_009037	GTT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
55	NC_009037	CAAC	2	8	2436	2443	50 %	0 %	0 %	50 %	126090320
56	NC_009037	TTG	2	6	2448	2453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
57	NC_009037	TCGT	2	8	2471	2478	0 %	50 %	25 %	25 %	126090320
58	NC_009037	AAG	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
59	NC_009037	ACT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
60	NC_009037	GAA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
61	NC_009037	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090320
62	NC_009037	GCG	2	6	2777	2782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090320
63	NC_009037	TGGT	2	8	2789	2796	0 %	50 %	50 %	0 %	126090320
64	NC_009037	AGA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
65	NC_009037	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090320
66	NC_009037	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
67	NC_009037	TGC	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
68	NC_009037	AAAC	2	8	3160	3167	75 %	0 %	0 %	25 %	126090320
69	NC_009037	AAG	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
70	NC_009037	CGT	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
71	NC_009037	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
72	NC_009037	GTC	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
73	NC_009037	GCT	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
74	NC_009037	GAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
75	NC_009037	GCTG	2	8	3552	3559	0 %	25 %	50 %	25 %	126090320
76	NC_009037	ATTC	2	8	3626	3633	25 %	50 %	0 %	25 %	126090320
77	NC_009037	TGA	3	9	3636	3644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
78	NC_009037	AAAGAG	2	12	3712	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090320
79	NC_009037	GTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090320
80	NC_009037	TACATG	2	12	3826	3837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126090320
81	NC_009037	TGA	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090320
82	NC_009037	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090320
83	NC_009037	GGT	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090320
84	NC_009037	TCG	2	6	4064	4069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090320
85	NC_009037	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090321
86	NC_009037	AGCAA	2	10	4283	4292	60 %	0 %	20 %	20 %	126090321
87	NC_009037	GAA	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
88	NC_009037	CTGAT	2	10	4334	4343	20 %	40 %	20 %	20 %	126090321
89	NC_009037	AAG	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
90	NC_009037	TCTGT	2	10	4419	4428	0 %	60 %	20 %	20 %	126090321
91	NC_009037	GTG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
92	NC_009037	CGT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
93	NC_009037	AGA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
94	NC_009037	AGA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
95	NC_009037	TGA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
96	NC_009037	GAAA	2	8	4839	4846	75 %	0 %	25 %	0 %	126090321
97	NC_009037	GAA	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
98	NC_009037	TCAA	2	8	4873	4880	50 %	25 %	0 %	25 %	126090321
99	NC_009037	TCG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
100	NC_009037	CAA	2	6	4947	4952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
101	NC_009037	GAT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
102	NC_009037	ACC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090321
103	NC_009037	GGC	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090321
104	NC_009037	CGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126090321
105	NC_009037	AAC	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
106	NC_009037	GTC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
107	NC_009037	AAG	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
108	NC_009037	CTA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
109	NC_009037	AGC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
110	NC_009037	AAG	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
111	NC_009037	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
112	NC_009037	CAA	2	6	5715	5720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
113	NC_009037	TAC	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
114	NC_009037	GTG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
115	NC_009037	GCT	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
116	NC_009037	ATT	2	6	5920	5925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090321
117	NC_009037	AAC	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
118	NC_009037	TTG	2	6	5960	5965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090321
119	NC_009037	CTG	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
120	NC_009037	CAG	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
121	NC_009037	ACA	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090321
122	NC_009037	ATG	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
123	NC_009037	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
124	NC_009037	ATC	2	6	6514	6519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090321
125	NC_009037	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
126	NC_009037	GGT	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
127	NC_009037	CAC	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126090321
128	NC_009037	CGA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
129	NC_009037	AGA	2	6	6870	6875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
130	NC_009037	CGA	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
131	NC_009037	GT	4	8	6932	6939	0 %	50 %	50 %	0 %	126090321
132	NC_009037	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090321
133	NC_009037	GGT	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
134	NC_009037	TTC	2	6	7188	7193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090321
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140	NC_009037	CTT	2	6	7551	7556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090321
141	NC_009037	GGT	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
142	NC_009037	CGT	2	6	7771	7776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090321
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152	NC_009037	GGT	2	6	8266	8271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090321
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154	NC_009037	GAA	2	6	8376	8381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090321
155	NC_009037	GTA	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090321
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163	NC_009037	GTG	2	6	8899	8904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090322
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253	NC_009037	CAT	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090328
254	NC_009037	A	6	6	14474	14479	100 %	0 %	0 %	0 %	126090328
255	NC_009037	TTCA	2	8	14529	14536	25 %	50 %	0 %	25 %	126090328
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262	NC_009037	AGC	2	6	15031	15036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126090329
263	NC_009037	GAT	2	6	15059	15064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090329
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.