MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009036	GCAA	2	8	1077	1084	50 %	0 %	25 %	25 %	126090237
2	NC_009036	ATGA	2	8	1594	1601	50 %	25 %	25 %	0 %	126090237
3	NC_009036	AATG	2	8	2334	2341	50 %	25 %	25 %	0 %	126090237
4	NC_009036	AGTT	2	8	2342	2349	25 %	50 %	25 %	0 %	126090237
5	NC_009036	TTTC	2	8	3524	3531	0 %	75 %	0 %	25 %	126090238
6	NC_009036	ATTG	2	8	3643	3650	25 %	50 %	25 %	0 %	126090238
7	NC_009036	ATTC	2	8	4813	4820	25 %	50 %	0 %	25 %	126090240
8	NC_009036	ATCC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	126090240
9	NC_009036	GTCT	2	8	5443	5450	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
10	NC_009036	GCTT	2	8	5490	5497	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
11	NC_009036	CTGT	2	8	5563	5570	0 %	50 %	25 %	25 %	126090240
12	NC_009036	TCTT	2	8	6550	6557	0 %	75 %	0 %	25 %	126090241
13	NC_009036	GCTT	2	8	6581	6588	0 %	50 %	25 %	25 %	126090241
14	NC_009036	TCAA	2	8	8399	8406	50 %	25 %	0 %	25 %	126090245
15	NC_009036	ATTT	2	8	8655	8662	25 %	75 %	0 %	0 %	126090245
16	NC_009036	TTCC	2	8	9740	9747	0 %	50 %	0 %	50 %	126090246
17	NC_009036	CCAA	2	8	10286	10293	50 %	0 %	0 %	50 %	126090247
18	NC_009036	TACT	2	8	10491	10498	25 %	50 %	0 %	25 %	126090247
19	NC_009036	TTAT	2	8	10668	10675	25 %	75 %	0 %	0 %	126090247
20	NC_009036	TTAT	2	8	11102	11109	25 %	75 %	0 %	0 %	126090247
21	NC_009036	AAAG	2	8	11144	11151	75 %	0 %	25 %	0 %	126090247
22	NC_009036	GCTT	2	8	11521	11528	0 %	50 %	25 %	25 %	126090248
23	NC_009036	CCCA	2	8	11705	11712	25 %	0 %	0 %	75 %	126090248
24	NC_009036	GCTT	2	8	11770	11777	0 %	50 %	25 %	25 %	126090248
25	NC_009036	CCAA	2	8	11892	11899	50 %	0 %	0 %	50 %	126090248
26	NC_009036	GGCC	2	8	12212	12219	0 %	0 %	50 %	50 %	126090249
27	NC_009036	AGTT	2	8	12295	12302	25 %	50 %	25 %	0 %	126090249
28	NC_009036	AACT	2	8	13238	13245	50 %	25 %	0 %	25 %	126090249
29	NC_009036	AACT	2	8	14282	14289	50 %	25 %	0 %	25 %	126090249
30	NC_009036	GCTT	2	8	15858	15865	0 %	50 %	25 %	25 %	126090249
31	NC_009036	TGCC	2	8	15868	15875	0 %	25 %	25 %	50 %	126090249
32	NC_009036	ACTC	2	8	15890	15897	25 %	25 %	0 %	50 %	126090249
33	NC_009036	AGCA	2	8	16276	16283	50 %	0 %	25 %	25 %	126090250
34	NC_009036	GTTG	2	8	16478	16485	0 %	50 %	50 %	0 %	126090250
35	NC_009036	TCAA	2	8	16769	16776	50 %	25 %	0 %	25 %	126090250
36	NC_009036	ATTG	2	8	17469	17476	25 %	50 %	25 %	0 %	126090251
37	NC_009036	GTCA	2	8	17485	17492	25 %	25 %	25 %	25 %	126090251
38	NC_009036	GCTG	2	8	17724	17731	0 %	25 %	50 %	25 %	126090251
39	NC_009036	GGAC	2	8	17993	18000	25 %	0 %	50 %	25 %	126090251
40	NC_009036	GTTC	2	8	18879	18886	0 %	50 %	25 %	25 %	126090252
41	NC_009036	GGCA	2	8	19115	19122	25 %	0 %	50 %	25 %	126090252
42	NC_009036	TCAA	2	8	21403	21410	50 %	25 %	0 %	25 %	126090256
43	NC_009036	ATTT	2	8	21659	21666	25 %	75 %	0 %	0 %	126090256
44	NC_009036	ATTG	2	8	23101	23108	25 %	50 %	25 %	0 %	126090258
45	NC_009036	GCTT	2	8	23875	23882	0 %	50 %	25 %	25 %	126090259
46	NC_009036	GCTT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	25 %	25 %	126090259
47	NC_009036	GAGC	2	8	24092	24099	25 %	0 %	50 %	25 %	126090259
48	NC_009036	CCAA	2	8	24782	24789	50 %	0 %	0 %	50 %	126090260
49	NC_009036	ACAA	2	8	24801	24808	75 %	0 %	0 %	25 %	126090260
50	NC_009036	TCAA	2	8	24930	24937	50 %	25 %	0 %	25 %	126090260
51	NC_009036	AGGG	2	8	25679	25686	25 %	0 %	75 %	0 %	126090261
52	NC_009036	AATT	2	8	27794	27801	50 %	50 %	0 %	0 %	126090262
53	NC_009036	TGAA	2	8	28147	28154	50 %	25 %	25 %	0 %	126090262
54	NC_009036	AAAC	2	8	28887	28894	75 %	0 %	0 %	25 %	126090263
55	NC_009036	GGTA	2	8	30801	30808	25 %	25 %	50 %	0 %	126090264
56	NC_009036	CAAT	2	8	31582	31589	50 %	25 %	0 %	25 %	126090265
57	NC_009036	TTAT	2	8	31596	31603	25 %	75 %	0 %	0 %	126090265
58	NC_009036	GCTT	2	8	33002	33009	0 %	50 %	25 %	25 %	126090266
59	NC_009036	GAGC	2	8	33219	33226	25 %	0 %	50 %	25 %	126090266
60	NC_009036	TCTT	2	8	34115	34122	0 %	75 %	0 %	25 %	126090267
61	NC_009036	TTTG	2	8	34349	34356	0 %	75 %	25 %	0 %	126090267
62	NC_009036	TTAC	2	8	34619	34626	25 %	50 %	0 %	25 %	126090267
63	NC_009036	TTCG	2	8	35151	35158	0 %	50 %	25 %	25 %	126090268
64	NC_009036	ATAA	2	8	35915	35922	75 %	25 %	0 %	0 %	126090269
65	NC_009036	TGAT	2	8	36675	36682	25 %	50 %	25 %	0 %	126090269
66	NC_009036	AACG	2	8	36723	36730	50 %	0 %	25 %	25 %	126090269
67	NC_009036	TGAA	2	8	37182	37189	50 %	25 %	25 %	0 %	126090269
68	NC_009036	CAAG	2	8	39302	39309	50 %	0 %	25 %	25 %	126090270
69	NC_009036	CTTG	2	8	39471	39478	0 %	50 %	25 %	25 %	126090270
70	NC_009036	TTCA	2	8	40436	40443	25 %	50 %	0 %	25 %	126090271
71	NC_009036	TGAT	2	8	40455	40462	25 %	50 %	25 %	0 %	126090271
72	NC_009036	TGAA	2	8	40488	40495	50 %	25 %	25 %	0 %	126090271
73	NC_009036	CAAA	2	8	40916	40923	75 %	0 %	0 %	25 %	126090273
74	NC_009036	AAGT	2	8	41082	41089	50 %	25 %	25 %	0 %	126090273
75	NC_009036	TGAT	2	8	41613	41620	25 %	50 %	25 %	0 %	126090274
76	NC_009036	ATCA	2	8	42204	42211	50 %	25 %	0 %	25 %	126090274
77	NC_009036	TTCC	2	8	42215	42222	0 %	50 %	0 %	50 %	126090274
78	NC_009036	GGTG	2	8	42832	42839	0 %	25 %	75 %	0 %	126090274
79	NC_009036	ATTC	2	8	43161	43168	25 %	50 %	0 %	25 %	126090274
80	NC_009036	GACT	2	8	43439	43446	25 %	25 %	25 %	25 %	126090274
81	NC_009036	CGTT	2	8	43943	43950	0 %	50 %	25 %	25 %	126090275
82	NC_009036	ATCA	2	8	44273	44280	50 %	25 %	0 %	25 %	126090276
83	NC_009036	GTAA	2	8	44500	44507	50 %	25 %	25 %	0 %	126090277
84	NC_009036	TCTG	2	8	45367	45374	0 %	50 %	25 %	25 %	126090278
85	NC_009036	TTTC	2	8	45565	45572	0 %	75 %	0 %	25 %	126090278
86	NC_009036	TTAT	2	8	45587	45594	25 %	75 %	0 %	0 %	126090278
87	NC_009036	TAAA	2	8	45961	45968	75 %	25 %	0 %	0 %	126090279
88	NC_009036	TAAA	2	8	46278	46285	75 %	25 %	0 %	0 %	126090279
89	NC_009036	CAAT	2	8	46537	46544	50 %	25 %	0 %	25 %	126090280
90	NC_009036	CAAG	2	8	47571	47578	50 %	0 %	25 %	25 %	126090281
91	NC_009036	ATTA	2	8	47831	47838	50 %	50 %	0 %	0 %	126090281
92	NC_009036	ATGA	2	8	47847	47854	50 %	25 %	25 %	0 %	126090281
93	NC_009036	CCAA	2	8	48089	48096	50 %	0 %	0 %	50 %	126090281
94	NC_009036	TCGT	2	8	48120	48127	0 %	50 %	25 %	25 %	126090281
95	NC_009036	TTAA	2	8	48261	48268	50 %	50 %	0 %	0 %	126090281
96	NC_009036	AATA	2	8	49552	49559	75 %	25 %	0 %	0 %	126090283
97	NC_009036	CCAT	2	8	50199	50206	25 %	25 %	0 %	50 %	126090284
98	NC_009036	TTAA	2	8	50668	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	126090285
99	NC_009036	ATGA	2	8	50695	50702	50 %	25 %	25 %	0 %	126090285
100	NC_009036	ATCC	2	8	50809	50816	25 %	25 %	0 %	50 %	126090285
101	NC_009036	GGGT	2	8	51139	51146	0 %	25 %	75 %	0 %	126090286
102	NC_009036	GGTC	2	8	51623	51630	0 %	25 %	50 %	25 %	126090286
103	NC_009036	CAGA	2	8	51665	51672	50 %	0 %	25 %	25 %	126090286
104	NC_009036	TAAT	2	8	52604	52611	50 %	50 %	0 %	0 %	126090287
105	NC_009036	TTTA	2	8	52738	52745	25 %	75 %	0 %	0 %	126090287
106	NC_009036	TTTC	2	8	52862	52869	0 %	75 %	0 %	25 %	126090287
107	NC_009036	CTTT	2	8	52916	52923	0 %	75 %	0 %	25 %	126090287
108	NC_009036	TGAA	2	8	53268	53275	50 %	25 %	25 %	0 %	126090287
109	NC_009036	GTAA	2	8	53721	53728	50 %	25 %	25 %	0 %	126090287
110	NC_009036	TTAT	2	8	54854	54861	25 %	75 %	0 %	0 %	126090287
111	NC_009036	CTTG	2	8	54920	54927	0 %	50 %	25 %	25 %	126090287
112	NC_009036	GTTT	2	8	56311	56318	0 %	75 %	25 %	0 %	126090289
113	NC_009036	ATTC	2	8	57050	57057	25 %	50 %	0 %	25 %	126090290
114	NC_009036	TAAT	2	8	57403	57410	50 %	50 %	0 %	0 %	126090290
115	NC_009036	ATTG	2	8	58424	58431	25 %	50 %	25 %	0 %	126090292
116	NC_009036	GAGT	2	8	59104	59111	25 %	25 %	50 %	0 %	126090292
117	NC_009036	CAGC	2	8	59252	59259	25 %	0 %	25 %	50 %	126090292
118	NC_009036	GAAA	2	8	59346	59353	75 %	0 %	25 %	0 %	126090292
119	NC_009036	ATTC	2	8	61500	61507	25 %	50 %	0 %	25 %	126090295
120	NC_009036	CATT	2	8	61712	61719	25 %	50 %	0 %	25 %	126090295
121	NC_009036	ACGA	2	8	63703	63710	50 %	0 %	25 %	25 %	126090297
122	NC_009036	CCTT	2	8	63731	63738	0 %	50 %	0 %	50 %	126090297
123	NC_009036	TTTC	2	8	63995	64002	0 %	75 %	0 %	25 %	126090298
124	NC_009036	TTCC	2	8	64098	64105	0 %	50 %	0 %	50 %	126090298
125	NC_009036	TCAT	2	8	65745	65752	25 %	50 %	0 %	25 %	126090299
126	NC_009036	ACAA	2	8	65943	65950	75 %	0 %	0 %	25 %	126090300
127	NC_009036	GTTA	2	8	66199	66206	25 %	50 %	25 %	0 %	126090300
128	NC_009036	TTAA	2	8	66410	66417	50 %	50 %	0 %	0 %	126090300
129	NC_009036	ACTG	2	8	67134	67141	25 %	25 %	25 %	25 %	126090301
130	NC_009036	TGAT	2	8	67148	67155	25 %	50 %	25 %	0 %	126090301
131	NC_009036	CTTA	2	8	67329	67336	25 %	50 %	0 %	25 %	126090301
132	NC_009036	GAGC	2	8	67374	67381	25 %	0 %	50 %	25 %	126090301
133	NC_009036	GCTA	2	8	67688	67695	25 %	25 %	25 %	25 %	126090302
134	NC_009036	GATA	2	8	67876	67883	50 %	25 %	25 %	0 %	126090302
135	NC_009036	TTAG	2	8	68644	68651	25 %	50 %	25 %	0 %	126090303
136	NC_009036	CAAC	2	8	68757	68764	50 %	0 %	0 %	50 %	126090303
137	NC_009036	CTCA	2	8	68934	68941	25 %	25 %	0 %	50 %	126090303
138	NC_009036	AACA	2	8	68966	68973	75 %	0 %	0 %	25 %	126090304
139	NC_009036	AAAG	2	8	70867	70874	75 %	0 %	25 %	0 %	126090304
140	NC_009036	AAAG	2	8	71066	71073	75 %	0 %	25 %	0 %	126090304
141	NC_009036	ACGA	2	8	72367	72374	50 %	0 %	25 %	25 %	126090305
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.