MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 33579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_009033	CAG	2	6	1565753	1565758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126466478
33502	NC_009033	ATC	2	6	1565791	1565796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466478
33503	NC_009033	ATA	2	6	1565799	1565804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126466478
33504	NC_009033	AAG	2	6	1565896	1565901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126466479
33505	NC_009033	AAC	2	6	1565935	1565940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126466479
33506	NC_009033	CAA	2	6	1565997	1566002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126466479
33507	NC_009033	ACC	2	6	1566013	1566018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126466479
33508	NC_009033	ACC	2	6	1566076	1566081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126466479
33509	NC_009033	TGC	2	6	1566106	1566111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126466479
33510	NC_009033	TAC	2	6	1566115	1566120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466479
33511	NC_009033	TTA	2	6	1566159	1566164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126466479
33512	NC_009033	GCT	2	6	1566185	1566190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126466479
33513	NC_009033	CAG	2	6	1566285	1566290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126466479
33514	NC_009033	CT	3	6	1566292	1566297	0 %	50 %	0 %	50 %	126466479
33515	NC_009033	TGC	2	6	1566355	1566360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126466479
33516	NC_009033	TCT	2	6	1566389	1566394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126466479
33517	NC_009033	GGA	2	6	1566414	1566419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126466479
33518	NC_009033	CAT	2	6	1566523	1566528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466479
33519	NC_009033	ATA	2	6	1566832	1566837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126466480
33520	NC_009033	GAT	2	6	1566892	1566897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126466480
33521	NC_009033	AT	3	6	1566909	1566914	50 %	50 %	0 %	0 %	126466480
33522	NC_009033	T	6	6	1567003	1567008	0 %	100 %	0 %	0 %	126466480
33523	NC_009033	TA	3	6	1567117	1567122	50 %	50 %	0 %	0 %	126466480
33524	NC_009033	CTG	2	6	1567125	1567130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126466480
33525	NC_009033	CTC	2	6	1567162	1567167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126466480
33526	NC_009033	AAT	2	6	1567241	1567246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126466480
33527	NC_009033	T	6	6	1567246	1567251	0 %	100 %	0 %	0 %	126466480
33528	NC_009033	TTC	2	6	1567277	1567282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126466480
33529	NC_009033	GTA	2	6	1567286	1567291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126466480
33530	NC_009033	ATA	2	6	1567296	1567301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126466480
33531	NC_009033	CTA	2	6	1567375	1567380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466480
33532	NC_009033	TAT	2	6	1567427	1567432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126466480
33533	NC_009033	ATT	2	6	1567454	1567459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126466480
33534	NC_009033	GATA	2	8	1567752	1567759	50 %	25 %	25 %	0 %	126466481
33535	NC_009033	TCT	2	6	1567764	1567769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126466481
33536	NC_009033	TTC	2	6	1567799	1567804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126466481
33537	NC_009033	T	6	6	1567861	1567866	0 %	100 %	0 %	0 %	126466481
33538	NC_009033	CTC	2	6	1567877	1567882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126466481
33539	NC_009033	TTTA	2	8	1567898	1567905	25 %	75 %	0 %	0 %	126466481
33540	NC_009033	ATGT	2	8	1568015	1568022	25 %	50 %	25 %	0 %	126466481
33541	NC_009033	GTA	2	6	1568026	1568031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126466481
33542	NC_009033	TAT	2	6	1568080	1568085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126466481
33543	NC_009033	CAT	2	6	1568101	1568106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466481
33544	NC_009033	TTA	2	6	1568125	1568130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126466481
33545	NC_009033	GTT	2	6	1568131	1568136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126466481
33546	NC_009033	TCG	2	6	1568181	1568186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126466481
33547	NC_009033	AGT	2	6	1568224	1568229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126466481
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33551	NC_009033	AAT	2	6	1568508	1568513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126466481
33552	NC_009033	TG	3	6	1568523	1568528	0 %	50 %	50 %	0 %	126466481
33553	NC_009033	TCT	2	6	1568616	1568621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126466481
33554	NC_009033	CAT	2	6	1568776	1568781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466481
33555	NC_009033	CTC	2	6	1568789	1568794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126466481
33556	NC_009033	TTG	2	6	1568873	1568878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126466481
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33560	NC_009033	CTA	2	6	1568932	1568937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126466481
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33566	NC_009033	CT	3	6	1569109	1569114	0 %	50 %	0 %	50 %	126466481
33567	NC_009033	CT	3	6	1569125	1569130	0 %	50 %	0 %	50 %	126466481
33568	NC_009033	CATCC	2	10	1569148	1569157	20 %	20 %	0 %	60 %	126466481
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33577	NC_009033	TGT	2	6	1570386	1570391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126466483
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.