MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 33579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009033	TTA	2	6	22692	22697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464937
502	NC_009033	TTC	2	6	22712	22717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464937
503	NC_009033	TTC	2	6	22730	22735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464937
504	NC_009033	TCC	2	6	22764	22769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464937
505	NC_009033	GA	3	6	22784	22789	50 %	0 %	50 %	0 %	126464937
506	NC_009033	GA	3	6	22806	22811	50 %	0 %	50 %	0 %	126464937
507	NC_009033	GATC	2	8	22815	22822	25 %	25 %	25 %	25 %	126464937
508	NC_009033	ACTT	2	8	22828	22835	25 %	50 %	0 %	25 %	126464938
509	NC_009033	TAT	2	6	22850	22855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464938
510	NC_009033	AAG	2	6	22915	22920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464938
511	NC_009033	ATA	2	6	22921	22926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464938
512	NC_009033	CAC	2	6	22994	22999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464938
513	NC_009033	CAA	2	6	23042	23047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464938
514	NC_009033	GAGG	2	8	23196	23203	25 %	0 %	75 %	0 %	126464938
515	NC_009033	AGA	2	6	23206	23211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464938
516	NC_009033	TTC	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464939
517	NC_009033	TGT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464939
518	NC_009033	CTA	2	6	23258	23263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464939
519	NC_009033	AT	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	126464939
520	NC_009033	TAG	2	6	23325	23330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464939
521	NC_009033	CTT	2	6	23437	23442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464939
522	NC_009033	ATGTA	2	10	23469	23478	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
523	NC_009033	GTT	3	9	23597	23605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464939
524	NC_009033	TAA	3	9	23617	23625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464939
525	NC_009033	TAT	2	6	23630	23635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464939
526	NC_009033	A	6	6	23714	23719	100 %	0 %	0 %	0 %	126464939
527	NC_009033	GATTA	2	10	23726	23735	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
528	NC_009033	AAG	2	6	23852	23857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464940
529	NC_009033	AT	3	6	23867	23872	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
530	NC_009033	ATC	2	6	23881	23886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
531	NC_009033	AAT	2	6	23947	23952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
532	NC_009033	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464940
533	NC_009033	TCC	2	6	23974	23979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464940
534	NC_009033	TCAAT	2	10	24004	24013	40 %	40 %	0 %	20 %	126464940
535	NC_009033	ATT	2	6	24025	24030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
536	NC_009033	TAA	2	6	24076	24081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
537	NC_009033	CGA	2	6	24088	24093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
538	NC_009033	ATTG	2	8	24115	24122	25 %	50 %	25 %	0 %	126464940
539	NC_009033	TA	3	6	24150	24155	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
540	NC_009033	TAG	2	6	24216	24221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
541	NC_009033	AGC	2	6	24253	24258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
542	NC_009033	TAT	2	6	24271	24276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
543	NC_009033	ACA	2	6	24290	24295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464940
544	NC_009033	AT	3	6	24320	24325	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
545	NC_009033	ACT	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
546	NC_009033	CAG	2	6	24531	24536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
547	NC_009033	GTT	2	6	24551	24556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464940
548	NC_009033	TA	3	6	24588	24593	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
549	NC_009033	CT	3	6	24594	24599	0 %	50 %	0 %	50 %	126464940
550	NC_009033	AT	3	6	24623	24628	50 %	50 %	0 %	0 %	126464940
551	NC_009033	AGG	2	6	24673	24678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464940
552	NC_009033	ATG	3	9	24695	24703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
553	NC_009033	AG	3	6	24708	24713	50 %	0 %	50 %	0 %	126464940
554	NC_009033	AGC	2	6	24802	24807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464940
555	NC_009033	ATA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
556	NC_009033	GCT	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464940
557	NC_009033	ATGAA	2	10	24924	24933	60 %	20 %	20 %	0 %	126464940
558	NC_009033	TTC	2	6	25019	25024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464940
559	NC_009033	ATT	2	6	25067	25072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
560	NC_009033	ATA	2	6	25091	25096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464940
561	NC_009033	TAG	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464940
562	NC_009033	AG	3	6	25160	25165	50 %	0 %	50 %	0 %	126464940
563	NC_009033	TAC	2	6	25197	25202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464940
564	NC_009033	TAT	2	6	25203	25208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464940
565	NC_009033	TTG	3	9	25223	25231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464940
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573	NC_009033	TTAT	2	8	25603	25610	25 %	75 %	0 %	0 %	126464941
574	NC_009033	GCAT	2	8	25617	25624	25 %	25 %	25 %	25 %	126464941
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578	NC_009033	AT	3	6	25706	25711	50 %	50 %	0 %	0 %	126464941
579	NC_009033	GTT	2	6	25712	25717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464941
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581	NC_009033	TAA	2	6	25743	25748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464942
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583	NC_009033	TATT	2	8	25785	25792	25 %	75 %	0 %	0 %	126464942
584	NC_009033	T	6	6	25791	25796	0 %	100 %	0 %	0 %	126464942
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593	NC_009033	TGA	2	6	26112	26117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464942
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595	NC_009033	ATT	2	6	26206	26211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464942
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597	NC_009033	TTA	2	6	26459	26464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464942
598	NC_009033	GGA	2	6	26516	26521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464942
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603	NC_009033	AAT	2	6	26680	26685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464942
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607	NC_009033	ATA	2	6	26942	26947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464943
608	NC_009033	GA	3	6	26957	26962	50 %	0 %	50 %	0 %	126464943
609	NC_009033	TTA	2	6	26967	26972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464943
610	NC_009033	ACT	2	6	27009	27014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464943
611	NC_009033	TCTACG	2	12	27018	27029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126464943
612	NC_009033	TACA	2	8	27033	27040	50 %	25 %	0 %	25 %	126464943
613	NC_009033	TATT	2	8	27189	27196	25 %	75 %	0 %	0 %	126464943
614	NC_009033	TCA	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464943
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619	NC_009033	ATCCT	2	10	27473	27482	20 %	40 %	0 %	40 %	126464943
620	NC_009033	TCAT	2	8	27524	27531	25 %	50 %	0 %	25 %	126464943
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623	NC_009033	TAT	2	6	27697	27702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464943
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627	NC_009033	TTC	2	6	27929	27934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464943
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