MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008750	AGT	2	6	195279	195284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596998
3002	NC_008750	GCG	2	6	195516	195521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596999
3003	NC_008750	TCG	2	6	195562	195567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596999
3004	NC_008750	AAG	2	6	195606	195611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596999
3005	NC_008750	GAA	2	6	195631	195636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596999
3006	NC_008750	GGT	2	6	195655	195660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596999
3007	NC_008750	CGT	2	6	195683	195688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596999
3008	NC_008750	AAC	3	9	195737	195745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596999
3009	NC_008750	CGT	2	6	195871	195876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597000
3010	NC_008750	TCCT	2	8	195938	195945	0 %	50 %	0 %	50 %	120597000
3011	NC_008750	A	6	6	195982	195987	100 %	0 %	0 %	0 %	120597000
3012	NC_008750	TTG	2	6	196028	196033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597000
3013	NC_008750	AGAA	2	8	196034	196041	75 %	0 %	25 %	0 %	120597000
3014	NC_008750	A	6	6	196126	196131	100 %	0 %	0 %	0 %	120597000
3015	NC_008750	TTC	2	6	196138	196143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597000
3016	NC_008750	TGT	2	6	196215	196220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597001
3017	NC_008750	A	6	6	196321	196326	100 %	0 %	0 %	0 %	120597001
3018	NC_008750	GCGT	2	8	196574	196581	0 %	25 %	50 %	25 %	120597001
3019	NC_008750	TGA	2	6	196668	196673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597001
3020	NC_008750	TAT	2	6	196819	196824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597002
3021	NC_008750	CTT	2	6	196836	196841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597002
3022	NC_008750	TGA	2	6	196843	196848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597002
3023	NC_008750	GTG	2	6	197001	197006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597002
3024	NC_008750	GCT	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597003
3025	NC_008750	AGA	2	6	197185	197190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597003
3026	NC_008750	AAGCC	2	10	197223	197232	40 %	0 %	20 %	40 %	120597003
3027	NC_008750	GTC	2	6	197298	197303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597003
3028	NC_008750	TGA	2	6	197391	197396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597003
3029	NC_008750	GCC	2	6	197405	197410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597003
3030	NC_008750	CAA	2	6	197576	197581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597004
3031	NC_008750	TGT	2	6	197591	197596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3032	NC_008750	TTC	2	6	197620	197625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597004
3033	NC_008750	GTT	2	6	197637	197642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3034	NC_008750	TAC	2	6	197663	197668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597004
3035	NC_008750	ACA	2	6	197683	197688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597004
3036	NC_008750	GTT	2	6	197691	197696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3037	NC_008750	AGTT	2	8	197728	197735	25 %	50 %	25 %	0 %	120597004
3038	NC_008750	TCG	2	6	197758	197763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3039	NC_008750	TC	3	6	197791	197796	0 %	50 %	0 %	50 %	120597004
3040	NC_008750	GCT	2	6	197898	197903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3041	NC_008750	CCA	2	6	197922	197927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597004
3042	NC_008750	GAC	2	6	197958	197963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3043	NC_008750	GAA	2	6	197964	197969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597004
3044	NC_008750	AAG	3	9	197988	197996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597004
3045	NC_008750	AAG	2	6	198055	198060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597005
3046	NC_008750	GGT	2	6	198144	198149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597005
3047	NC_008750	GCT	2	6	198154	198159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3048	NC_008750	TTG	2	6	198236	198241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597005
3049	NC_008750	GC	3	6	198246	198251	0 %	0 %	50 %	50 %	120597005
3050	NC_008750	GCT	2	6	198316	198321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3051	NC_008750	TGC	2	6	198330	198335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3052	NC_008750	ATTG	2	8	198417	198424	25 %	50 %	25 %	0 %	120597006
3053	NC_008750	AGT	2	6	198444	198449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597006
3054	NC_008750	AGT	2	6	198486	198491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597006
3055	NC_008750	GGCTAT	2	12	198514	198525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120597006
3056	NC_008750	GC	3	6	198532	198537	0 %	0 %	50 %	50 %	120597006
3057	NC_008750	CAG	2	6	198545	198550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3058	NC_008750	CGT	2	6	198577	198582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3059	NC_008750	GTC	2	6	198635	198640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3060	NC_008750	TAT	2	6	198687	198692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597006
3061	NC_008750	CTA	2	6	198764	198769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597006
3062	NC_008750	CG	3	6	198787	198792	0 %	0 %	50 %	50 %	120597006
3063	NC_008750	AGA	2	6	198999	199004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597007
3064	NC_008750	CAA	2	6	199029	199034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597007
3065	NC_008750	CTA	2	6	199038	199043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597007
3066	NC_008750	GGA	2	6	199056	199061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120597007
3067	NC_008750	TGG	2	6	199194	199199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597008
3068	NC_008750	GGT	2	6	199222	199227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597008
3069	NC_008750	TCGCG	2	10	199270	199279	0 %	20 %	40 %	40 %	120597008
3070	NC_008750	TTA	2	6	199367	199372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597008
3071	NC_008750	GCA	2	6	199465	199470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597008
3072	NC_008750	GCT	2	6	199477	199482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597008
3073	NC_008750	AAT	2	6	199499	199504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597008
3074	NC_008750	CCT	2	6	199573	199578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120597009
3075	NC_008750	GTG	2	6	199713	199718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597009
3076	NC_008750	TAT	2	6	199750	199755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3077	NC_008750	A	6	6	199823	199828	100 %	0 %	0 %	0 %	120597009
3078	NC_008750	GTCG	2	8	199900	199907	0 %	25 %	50 %	25 %	120597009
3079	NC_008750	TTG	2	6	199974	199979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3080	NC_008750	TTG	2	6	200085	200090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3081	NC_008750	TTG	3	9	200159	200167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3082	NC_008750	CGT	2	6	200225	200230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597009
3083	NC_008750	GTT	2	6	200234	200239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3084	NC_008750	CAG	2	6	200255	200260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597009
3085	NC_008750	C	6	6	200326	200331	0 %	0 %	0 %	100 %	120597009
3086	NC_008750	CAT	2	6	200347	200352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
3087	NC_008750	ATT	2	6	200455	200460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3088	NC_008750	GCA	3	9	200465	200473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597009
3089	NC_008750	ATT	2	6	200474	200479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3090	NC_008750	TTC	2	6	200480	200485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597009
3091	NC_008750	TCT	2	6	200490	200495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597009
3092	NC_008750	GAA	2	6	200539	200544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597009
3093	NC_008750	GTG	2	6	200547	200552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597009
3094	NC_008750	ACT	2	6	200716	200721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
3095	NC_008750	ATG	2	6	200771	200776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597009
3096	NC_008750	TCA	2	6	200779	200784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
3097	NC_008750	TGA	2	6	200796	200801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597009
3098	NC_008750	GAA	2	6	200893	200898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597010
3099	NC_008750	TAA	2	6	200984	200989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597010
3100	NC_008750	CATTG	2	10	201150	201159	20 %	40 %	20 %	20 %	120597011
3101	NC_008750	GAA	2	6	201274	201279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597011
3102	NC_008750	TAG	2	6	201293	201298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597011
3103	NC_008750	CGT	2	6	201310	201315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597011
3104	NC_008750	GTT	2	6	201353	201358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597011
3105	NC_008750	TCG	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597011
3106	NC_008750	GCCT	2	8	201383	201390	0 %	25 %	25 %	50 %	120597011
3107	NC_008750	CGTA	2	8	201510	201517	25 %	25 %	25 %	25 %	120597012
3108	NC_008750	ATGGC	2	10	201530	201539	20 %	20 %	40 %	20 %	120597012
3109	NC_008750	CTT	2	6	201551	201556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597012
3110	NC_008750	CAA	2	6	201558	201563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597012
3111	NC_008750	GGT	2	6	201619	201624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597012
3112	NC_008750	TGC	2	6	201660	201665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3113	NC_008750	GCT	2	6	201673	201678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3114	NC_008750	TGC	3	9	201690	201698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3115	NC_008750	A	6	6	201714	201719	100 %	0 %	0 %	0 %	120597012
3116	NC_008750	GTCCAG	2	12	201740	201751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3117	NC_008750	GTC	2	6	201839	201844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3118	NC_008750	CGT	2	6	201856	201861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3119	NC_008750	CAAGCT	2	12	201920	201931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120597013
3120	NC_008750	GCC	2	6	201934	201939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597013
3121	NC_008750	ACA	2	6	202016	202021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597013
3122	NC_008750	GTCT	2	8	202039	202046	0 %	50 %	25 %	25 %	120597013
3123	NC_008750	TCG	2	6	202082	202087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597013
3124	NC_008750	GT	3	6	202096	202101	0 %	50 %	50 %	0 %	120597013
3125	NC_008750	TGC	2	6	202133	202138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597013
3126	NC_008750	GTT	2	6	202200	202205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597013
3127	NC_008750	GTT	2	6	202284	202289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597013
3128	NC_008750	ATG	2	6	202318	202323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597013
3129	NC_008750	TCG	2	6	202498	202503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597013
3130	NC_008750	GTC	2	6	202688	202693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597014
3131	NC_008750	CAG	2	6	202748	202753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597014
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3133	NC_008750	AAG	2	6	202768	202773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597014
3134	NC_008750	GCA	2	6	202878	202883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597014
3135	NC_008750	ATG	2	6	202894	202899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597014
3136	NC_008750	CGTGGT	2	12	202983	202994	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	120597014
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3140	NC_008750	CGT	2	6	203193	203198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597014
3141	NC_008750	TTG	2	6	203233	203238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597014
3142	NC_008750	CGTGA	2	10	203244	203253	20 %	20 %	40 %	20 %	120597014
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3144	NC_008750	CGA	2	6	203312	203317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597014
3145	NC_008750	GCT	2	6	203405	203410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597014
3146	NC_008750	CCAG	2	8	203508	203515	25 %	0 %	25 %	50 %	120597014
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3149	NC_008750	CAG	2	6	203613	203618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597015
3150	NC_008750	ATC	2	6	203671	203676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597015
3151	NC_008750	TCG	2	6	203760	203765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597015
3152	NC_008750	TGG	2	6	203847	203852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597015
3153	NC_008750	GCT	2	6	203935	203940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597015
3154	NC_008750	TGTTGA	2	12	203946	203957	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120597015
3155	NC_008750	GCT	2	6	203959	203964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597015
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3163	NC_008750	TCA	2	6	204836	204841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597016
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3224	NC_008750	TCT	2	6	208380	208385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597022
3225	NC_008750	GA	3	6	208411	208416	50 %	0 %	50 %	0 %	120597022
3226	NC_008750	ACTG	2	8	208430	208437	25 %	25 %	25 %	25 %	120597022
3227	NC_008750	T	7	7	208439	208445	0 %	100 %	0 %	0 %	120597022
3228	NC_008750	TCA	3	9	208470	208478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597022
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3230	NC_008750	T	6	6	208598	208603	0 %	100 %	0 %	0 %	120597022
3231	NC_008750	GAAA	2	8	208615	208622	75 %	0 %	25 %	0 %	120597022
3232	NC_008750	ATTC	2	8	208625	208632	25 %	50 %	0 %	25 %	120597022
3233	NC_008750	TCA	2	6	208680	208685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597022
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3238	NC_008750	ATT	2	6	209037	209042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597022
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3240	NC_008750	CCTG	2	8	209094	209101	0 %	25 %	25 %	50 %	120597022
3241	NC_008750	T	6	6	209135	209140	0 %	100 %	0 %	0 %	120597022
3242	NC_008750	TTC	2	6	209171	209176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597022
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3244	NC_008750	CTT	2	6	209248	209253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597022
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3263	NC_008750	GCTT	2	8	210603	210610	0 %	50 %	25 %	25 %	120597023
3264	NC_008750	CATT	2	8	210650	210657	25 %	50 %	0 %	25 %	120597023
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3322	NC_008750	A	6	6	220544	220549	100 %	0 %	0 %	0 %	120597028
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3360	NC_008750	GC	3	6	223339	223344	0 %	0 %	50 %	50 %	120597030
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3362	NC_008750	ATCAAA	2	12	223377	223388	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	120597030
3363	NC_008750	CTGT	2	8	223417	223424	0 %	50 %	25 %	25 %	120597030
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3480	NC_008750	GATT	2	8	231602	231609	25 %	50 %	25 %	0 %	120597038
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3482	NC_008750	TCT	2	6	231781	231786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597038
3483	NC_008750	ATC	2	6	231810	231815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597038
3484	NC_008750	CTGA	2	8	231828	231835	25 %	25 %	25 %	25 %	120597038
3485	NC_008750	AAT	2	6	231968	231973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597038
3486	NC_008750	CGGT	2	8	232009	232016	0 %	25 %	50 %	25 %	120597038
3487	NC_008750	CAG	2	6	232173	232178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597038
3488	NC_008750	CGG	2	6	232244	232249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597039
3489	NC_008750	TTTGA	2	10	232318	232327	20 %	60 %	20 %	0 %	120597039
3490	NC_008750	TCT	2	6	232328	232333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597039
3491	NC_008750	GCA	2	6	232398	232403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597039
3492	NC_008750	TTGT	2	8	232459	232466	0 %	75 %	25 %	0 %	120597039
3493	NC_008750	TGC	2	6	232490	232495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597039
3494	NC_008750	GGC	2	6	232521	232526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597039
3495	NC_008750	AGT	2	6	232550	232555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597039
3496	NC_008750	ATC	2	6	232585	232590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597039
3497	NC_008750	TCT	2	6	232748	232753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597039
3498	NC_008750	TTG	2	6	232811	232816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597039
3499	NC_008750	GC	3	6	232831	232836	0 %	0 %	50 %	50 %	120597039
3500	NC_008750	ATC	2	6	232849	232854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597039

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