MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_008750	GTT	2	6	165107	165112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596969
2503	NC_008750	TCAA	2	8	165224	165231	50 %	25 %	0 %	25 %	120596969
2504	NC_008750	TAA	2	6	165260	165265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596969
2505	NC_008750	CAGT	2	8	165303	165310	25 %	25 %	25 %	25 %	120596969
2506	NC_008750	CAT	2	6	165357	165362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596969
2507	NC_008750	A	6	6	165481	165486	100 %	0 %	0 %	0 %	120596969
2508	NC_008750	GTTAA	2	10	165505	165514	40 %	40 %	20 %	0 %	120596969
2509	NC_008750	GAT	2	6	165541	165546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596969
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2513	NC_008750	TGG	2	6	165760	165765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596970
2514	NC_008750	TGC	2	6	165799	165804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596970
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2517	NC_008750	GGT	2	6	165984	165989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596970
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2524	NC_008750	TGGT	2	8	166462	166469	0 %	50 %	50 %	0 %	120596970
2525	NC_008750	TCG	2	6	166542	166547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596970
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2543	NC_008750	GATT	2	8	167720	167727	25 %	50 %	25 %	0 %	120596971
2544	NC_008750	GCA	2	6	167857	167862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596971
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2546	NC_008750	GTTT	2	8	167962	167969	0 %	75 %	25 %	0 %	120596971
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2551	NC_008750	GGC	2	6	168557	168562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596972
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2555	NC_008750	ATCTTG	2	12	168828	168839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120596972
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2557	NC_008750	TAA	2	6	169036	169041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596972
2558	NC_008750	T	7	7	169102	169108	0 %	100 %	0 %	0 %	120596972
2559	NC_008750	AGTG	2	8	169120	169127	25 %	25 %	50 %	0 %	120596972
2560	NC_008750	TGCT	2	8	169129	169136	0 %	50 %	25 %	25 %	120596972
2561	NC_008750	CGA	2	6	169161	169166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596972
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2564	NC_008750	GCAG	2	8	169225	169232	25 %	0 %	50 %	25 %	120596972
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2612	NC_008750	AGA	2	6	173002	173007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596975
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2620	NC_008750	A	6	6	173710	173715	100 %	0 %	0 %	0 %	120596976
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2743	NC_008750	GTC	2	6	180351	180356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596982
2744	NC_008750	GCC	2	6	180503	180508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596982
2745	NC_008750	GAA	2	6	180545	180550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596982
2746	NC_008750	GCTG	2	8	180559	180566	0 %	25 %	50 %	25 %	120596982
2747	NC_008750	GCA	2	6	180613	180618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596982
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2749	NC_008750	GAT	2	6	180644	180649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596982
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2751	NC_008750	AAAGAG	2	12	180719	180730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596982
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2753	NC_008750	TACATG	2	12	180833	180844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120596982
2754	NC_008750	TGA	2	6	180865	180870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596982
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2762	NC_008750	AAG	2	6	181375	181380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596983
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2766	NC_008750	TCG	2	6	181691	181696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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2770	NC_008750	CTG	2	6	181822	181827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
2771	NC_008750	GAAA	2	8	181845	181852	75 %	0 %	25 %	0 %	120596983
2772	NC_008750	GAA	2	6	181867	181872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596983
2773	NC_008750	TCAA	2	8	181879	181886	50 %	25 %	0 %	25 %	120596983
2774	NC_008750	TCG	2	6	181896	181901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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2853	NC_008750	CTG	2	6	186510	186515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596985
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2858	NC_008750	CAAGAG	2	12	186824	186835	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	120596986
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2981	NC_008750	TGA	2	6	194235	194240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596995
2982	NC_008750	TGC	2	6	194375	194380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596995
2983	NC_008750	AGC	3	9	194399	194407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596995
2984	NC_008750	TGC	2	6	194449	194454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596996
2985	NC_008750	GGCCGT	2	12	194556	194567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120596996
2986	NC_008750	CGT	2	6	194595	194600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596996
2987	NC_008750	GTAAAG	2	12	194695	194706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120596996
2988	NC_008750	GCT	2	6	194805	194810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596996
2989	NC_008750	AGCG	2	8	194863	194870	25 %	0 %	50 %	25 %	120596997
2990	NC_008750	GA	3	6	194875	194880	50 %	0 %	50 %	0 %	120596997
2991	NC_008750	A	6	6	194880	194885	100 %	0 %	0 %	0 %	120596997
2992	NC_008750	GAA	2	6	194891	194896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596997
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