MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008750	CTA	2	6	100434	100439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596914
1502	NC_008750	GAA	2	6	100495	100500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596914
1503	NC_008750	TTA	2	6	100536	100541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596914
1504	NC_008750	C	6	6	100681	100686	0 %	0 %	0 %	100 %	120596914
1505	NC_008750	CAA	2	6	100704	100709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596914
1506	NC_008750	TTGT	2	8	100732	100739	0 %	75 %	25 %	0 %	120596914
1507	NC_008750	GTT	2	6	100754	100759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596914
1508	NC_008750	TAC	2	6	100794	100799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596914
1509	NC_008750	CTG	2	6	100815	100820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596914
1510	NC_008750	ATG	2	6	100879	100884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596914
1511	NC_008750	TGAG	2	8	101206	101213	25 %	25 %	50 %	0 %	120596915
1512	NC_008750	TGTT	2	8	101269	101276	0 %	75 %	25 %	0 %	120596915
1513	NC_008750	TTGCTA	2	12	101308	101319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120596915
1514	NC_008750	A	8	8	101424	101431	100 %	0 %	0 %	0 %	120596915
1515	NC_008750	GTC	2	6	101465	101470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596915
1516	NC_008750	GA	3	6	101479	101484	50 %	0 %	50 %	0 %	120596915
1517	NC_008750	AAC	2	6	101485	101490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596915
1518	NC_008750	GC	3	6	101590	101595	0 %	0 %	50 %	50 %	120596915
1519	NC_008750	TTA	2	6	101622	101627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596915
1520	NC_008750	TCTGC	2	10	101652	101661	0 %	40 %	20 %	40 %	120596915
1521	NC_008750	TGC	2	6	101752	101757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596915
1522	NC_008750	ATA	2	6	101809	101814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596915
1523	NC_008750	AGA	2	6	101846	101851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596915
1524	NC_008750	ATGA	2	8	101895	101902	50 %	25 %	25 %	0 %	120596915
1525	NC_008750	TCG	2	6	102028	102033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596915
1526	NC_008750	AAG	2	6	102070	102075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596915
1527	NC_008750	GCC	2	6	102087	102092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596915
1528	NC_008750	CATTT	2	10	102121	102130	20 %	60 %	0 %	20 %	120596915
1529	NC_008750	TGG	2	6	102310	102315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596915
1530	NC_008750	TAT	2	6	102496	102501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596916
1531	NC_008750	TTA	2	6	102509	102514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596916
1532	NC_008750	ATT	2	6	102524	102529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596916
1533	NC_008750	AAGCT	2	10	102600	102609	40 %	20 %	20 %	20 %	120596916
1534	NC_008750	TGA	2	6	102646	102651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596916
1535	NC_008750	AGT	2	6	102695	102700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596916
1536	NC_008750	TGC	2	6	102738	102743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596916
1537	NC_008750	GCA	2	6	102806	102811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596916
1538	NC_008750	TGT	2	6	102819	102824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596916
1539	NC_008750	AAGTT	2	10	102848	102857	40 %	40 %	20 %	0 %	120596916
1540	NC_008750	TGG	2	6	102957	102962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596916
1541	NC_008750	GGC	2	6	102998	103003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596916
1542	NC_008750	CTT	2	6	103051	103056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596916
1543	NC_008750	CAG	2	6	103508	103513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596917
1544	NC_008750	CTTA	2	8	103534	103541	25 %	50 %	0 %	25 %	120596918
1545	NC_008750	TA	3	6	103554	103559	50 %	50 %	0 %	0 %	120596918
1546	NC_008750	TGC	2	6	103581	103586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596918
1547	NC_008750	CAA	2	6	103605	103610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596918
1548	NC_008750	AAAC	2	8	103665	103672	75 %	0 %	0 %	25 %	120596918
1549	NC_008750	ATAA	2	8	103699	103706	75 %	25 %	0 %	0 %	120596918
1550	NC_008750	GCGA	2	8	103857	103864	25 %	0 %	50 %	25 %	120596918
1551	NC_008750	TCG	2	6	103871	103876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596918
1552	NC_008750	TCA	2	6	103894	103899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596918
1553	NC_008750	CAA	2	6	103919	103924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596918
1554	NC_008750	CA	3	6	103957	103962	50 %	0 %	0 %	50 %	120596918
1555	NC_008750	AC	3	6	104039	104044	50 %	0 %	0 %	50 %	120596918
1556	NC_008750	GC	3	6	104073	104078	0 %	0 %	50 %	50 %	120596918
1557	NC_008750	A	6	6	104205	104210	100 %	0 %	0 %	0 %	120596918
1558	NC_008750	CGC	2	6	104256	104261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596918
1559	NC_008750	GAT	2	6	104289	104294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596918
1560	NC_008750	T	6	6	104310	104315	0 %	100 %	0 %	0 %	120596918
1561	NC_008750	GCG	2	6	104323	104328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596918
1562	NC_008750	GGCT	2	8	104357	104364	0 %	25 %	50 %	25 %	120596918
1563	NC_008750	AAT	2	6	104439	104444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596918
1564	NC_008750	CCA	2	6	104926	104931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596919
1565	NC_008750	TCC	2	6	104958	104963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596919
1566	NC_008750	CCA	2	6	105069	105074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596919
1567	NC_008750	A	6	6	105125	105130	100 %	0 %	0 %	0 %	120596919
1568	NC_008750	GTA	2	6	105146	105151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596919
1569	NC_008750	GAC	2	6	105152	105157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596919
1570	NC_008750	TCT	2	6	105232	105237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596919
1571	NC_008750	CTT	2	6	105274	105279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596919
1572	NC_008750	TAA	2	6	105665	105670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596920
1573	NC_008750	GAT	2	6	105746	105751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596920
1574	NC_008750	TGC	2	6	105776	105781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596920
1575	NC_008750	TGA	2	6	105833	105838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596920
1576	NC_008750	GAA	2	6	105846	105851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596920
1577	NC_008750	GCC	2	6	105874	105879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596920
1578	NC_008750	GGT	2	6	105882	105887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596920
1579	NC_008750	CAT	2	6	106023	106028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596920
1580	NC_008750	GGA	2	6	106097	106102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120596920
1581	NC_008750	GATA	2	8	106145	106152	50 %	25 %	25 %	0 %	120596920
1582	NC_008750	AGG	2	6	106162	106167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120596920
1583	NC_008750	TGAT	2	8	106168	106175	25 %	50 %	25 %	0 %	120596920
1584	NC_008750	GCC	2	6	106220	106225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596920
1585	NC_008750	CGC	2	6	106286	106291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596920
1586	NC_008750	TG	3	6	106305	106310	0 %	50 %	50 %	0 %	120596920
1587	NC_008750	TGA	2	6	106367	106372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596920
1588	NC_008750	GCG	2	6	106559	106564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596920
1589	NC_008750	ATT	2	6	106597	106602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596920
1590	NC_008750	GAT	2	6	106718	106723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596920
1591	NC_008750	CTG	2	6	106793	106798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596920
1592	NC_008750	CGG	2	6	106822	106827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596920
1593	NC_008750	GGT	2	6	106938	106943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596920
1594	NC_008750	ATG	2	6	107032	107037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596920
1595	NC_008750	GT	3	6	107064	107069	0 %	50 %	50 %	0 %	120596920
1596	NC_008750	GTG	2	6	107110	107115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596920
1597	NC_008750	TGA	2	6	107490	107495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596921
1598	NC_008750	TGG	2	6	107521	107526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596921
1599	NC_008750	GGCGCT	2	12	107581	107592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120596921
1600	NC_008750	CAC	2	6	107601	107606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596921
1601	NC_008750	ATC	2	6	107654	107659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596921
1602	NC_008750	ACC	2	6	107660	107665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596921
1603	NC_008750	GCC	2	6	107711	107716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596921
1604	NC_008750	GGC	2	6	107731	107736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596921
1605	NC_008750	GCTG	2	8	107737	107744	0 %	25 %	50 %	25 %	120596921
1606	NC_008750	GCC	2	6	107806	107811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596921
1607	NC_008750	CTGG	2	8	107908	107915	0 %	25 %	50 %	25 %	120596921
1608	NC_008750	CTG	2	6	108109	108114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596921
1609	NC_008750	CCCAA	2	10	108219	108228	40 %	0 %	0 %	60 %	120596921
1610	NC_008750	ACG	2	6	108243	108248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596921
1611	NC_008750	GC	3	6	108310	108315	0 %	0 %	50 %	50 %	120596921
1612	NC_008750	CT	3	6	108325	108330	0 %	50 %	0 %	50 %	120596921
1613	NC_008750	CGG	2	6	108334	108339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596921
1614	NC_008750	CTG	2	6	108340	108345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596921
1615	NC_008750	AG	3	6	108409	108414	50 %	0 %	50 %	0 %	120596922
1616	NC_008750	TGG	2	6	108459	108464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596922
1617	NC_008750	GGGC	2	8	108465	108472	0 %	0 %	75 %	25 %	120596922
1618	NC_008750	CGC	2	6	108565	108570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596922
1619	NC_008750	GGC	2	6	108611	108616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596922
1620	NC_008750	TGG	2	6	108651	108656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596922
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1622	NC_008750	CCA	2	6	108690	108695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596922
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1985	NC_008750	AAT	2	6	132149	132154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596940
1986	NC_008750	TCA	2	6	132173	132178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596940
1987	NC_008750	TCA	2	6	132262	132267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596940
1988	NC_008750	CTT	2	6	132326	132331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596940
1989	NC_008750	GGC	2	6	132365	132370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596940
1990	NC_008750	ATC	2	6	132429	132434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596940
1991	NC_008750	AAT	2	6	132453	132458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596940
1992	NC_008750	ATC	3	9	132693	132701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596940
1993	NC_008750	GAC	2	6	132702	132707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596940
1994	NC_008750	GGTT	2	8	133138	133145	0 %	50 %	50 %	0 %	120596941
1995	NC_008750	AGA	2	6	133317	133322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596941
1996	NC_008750	CGC	2	6	133343	133348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596941
1997	NC_008750	ACG	2	6	133394	133399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596941
1998	NC_008750	TCG	2	6	133424	133429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596941
1999	NC_008750	GC	4	8	133483	133490	0 %	0 %	50 %	50 %	120596941
2000	NC_008750	GCAA	2	8	133499	133506	50 %	0 %	25 %	25 %	120596941

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