MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008750	ATA	2	6	29263	29268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596856
502	NC_008750	CTT	2	6	29378	29383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596856
503	NC_008750	CTT	3	9	29423	29431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596856
504	NC_008750	AGC	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596856
505	NC_008750	CGCC	2	8	29666	29673	0 %	0 %	25 %	75 %	120596856
506	NC_008750	GCG	2	6	29750	29755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596856
507	NC_008750	ACC	3	9	29794	29802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596856
508	NC_008750	ATA	2	6	29803	29808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596856
509	NC_008750	TTG	2	6	29832	29837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596856
510	NC_008750	TTG	2	6	29881	29886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596856
511	NC_008750	T	6	6	29922	29927	0 %	100 %	0 %	0 %	120596856
512	NC_008750	TTGTG	2	10	29974	29983	0 %	60 %	40 %	0 %	120596856
513	NC_008750	AGC	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596856
514	NC_008750	ATG	2	6	30037	30042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596856
515	NC_008750	CAAATC	2	12	30054	30065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120596856
516	NC_008750	CTT	2	6	30071	30076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596857
517	NC_008750	TTTG	2	8	30107	30114	0 %	75 %	25 %	0 %	120596857
518	NC_008750	GCG	2	6	30131	30136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596857
519	NC_008750	ACAA	2	8	30148	30155	75 %	0 %	0 %	25 %	120596857
520	NC_008750	GGT	2	6	30167	30172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596857
521	NC_008750	CAA	2	6	30215	30220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596857
522	NC_008750	ACT	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596857
523	NC_008750	GTT	2	6	30407	30412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596857
524	NC_008750	GCA	2	6	30433	30438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596857
525	NC_008750	TCA	2	6	30544	30549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596857
526	NC_008750	ACA	2	6	30699	30704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596858
527	NC_008750	GTTT	2	8	30760	30767	0 %	75 %	25 %	0 %	120596858
528	NC_008750	A	6	6	30818	30823	100 %	0 %	0 %	0 %	120596858
529	NC_008750	TTAT	2	8	30921	30928	25 %	75 %	0 %	0 %	120596858
530	NC_008750	A	6	6	31012	31017	100 %	0 %	0 %	0 %	120596858
531	NC_008750	AGC	2	6	31131	31136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596858
532	NC_008750	ATT	2	6	31175	31180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596858
533	NC_008750	T	6	6	31253	31258	0 %	100 %	0 %	0 %	120596858
534	NC_008750	AGT	2	6	31355	31360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596858
535	NC_008750	GA	3	6	31365	31370	50 %	0 %	50 %	0 %	120596858
536	NC_008750	GGA	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120596858
537	NC_008750	GAA	2	6	31583	31588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596858
538	NC_008750	ATG	2	6	31602	31607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596858
539	NC_008750	CAT	2	6	31648	31653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596858
540	NC_008750	TGA	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596858
541	NC_008750	ATT	2	6	31803	31808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596858
542	NC_008750	GAC	2	6	31922	31927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
543	NC_008750	GA	3	6	31949	31954	50 %	0 %	50 %	0 %	120596859
544	NC_008750	ATC	2	6	31974	31979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596859
545	NC_008750	TGAT	2	8	31995	32002	25 %	50 %	25 %	0 %	120596859
546	NC_008750	GCA	2	6	32032	32037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
547	NC_008750	CTC	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596859
548	NC_008750	GTT	2	6	32089	32094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596859
549	NC_008750	CCT	2	6	32156	32161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596859
550	NC_008750	TGC	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596859
551	NC_008750	ATA	2	6	32313	32318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596859
552	NC_008750	CAG	2	6	32396	32401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
553	NC_008750	CGAAA	2	10	32460	32469	60 %	0 %	20 %	20 %	120596859
554	NC_008750	ATT	2	6	32474	32479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596859
555	NC_008750	TTA	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596859
556	NC_008750	GAA	2	6	32708	32713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596859
557	NC_008750	CCA	2	6	32725	32730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596859
558	NC_008750	AGA	2	6	32736	32741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596859
559	NC_008750	ACA	2	6	32798	32803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596859
560	NC_008750	GGT	2	6	32900	32905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596859
561	NC_008750	ACT	2	6	32985	32990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596860
562	NC_008750	TGA	2	6	32994	32999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596860
563	NC_008750	ACTC	2	8	33018	33025	25 %	25 %	0 %	50 %	120596860
564	NC_008750	TCA	2	6	33036	33041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596860
565	NC_008750	AAG	2	6	33092	33097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596860
566	NC_008750	TTCGT	2	10	33132	33141	0 %	60 %	20 %	20 %	120596860
567	NC_008750	TTG	2	6	33193	33198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596860
568	NC_008750	TGAT	2	8	33245	33252	25 %	50 %	25 %	0 %	120596860
569	NC_008750	AACC	2	8	33272	33279	50 %	0 %	0 %	50 %	120596860
570	NC_008750	AGA	2	6	33288	33293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596860
571	NC_008750	TGA	2	6	33536	33541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596861
572	NC_008750	ATT	2	6	33545	33550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596861
573	NC_008750	CGG	2	6	33635	33640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596861
574	NC_008750	TAA	2	6	33653	33658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596861
575	NC_008750	GCA	2	6	33692	33697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596861
576	NC_008750	TAA	2	6	33845	33850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596861
577	NC_008750	TCC	2	6	33968	33973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596861
578	NC_008750	A	6	6	34057	34062	100 %	0 %	0 %	0 %	120596861
579	NC_008750	GGT	2	6	34281	34286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596862
580	NC_008750	CAG	2	6	34419	34424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596862
581	NC_008750	TGA	2	6	34439	34444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596862
582	NC_008750	CTG	2	6	34456	34461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596862
583	NC_008750	AGC	2	6	34462	34467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596862
584	NC_008750	GTG	2	6	34546	34551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596862
585	NC_008750	TAA	2	6	34616	34621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596862
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587	NC_008750	GGT	3	9	34957	34965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596863
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589	NC_008750	TAA	2	6	35124	35129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596863
590	NC_008750	GTG	2	6	35199	35204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596863
591	NC_008750	TTA	2	6	35232	35237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596863
592	NC_008750	GC	3	6	35288	35293	0 %	0 %	50 %	50 %	120596863
593	NC_008750	TTC	2	6	35344	35349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596863
594	NC_008750	GTGG	2	8	35377	35384	0 %	25 %	75 %	0 %	120596863
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596	NC_008750	CTT	2	6	35457	35462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596863
597	NC_008750	CGT	2	6	35488	35493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596863
598	NC_008750	GTGAGC	2	12	35510	35521	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120596863
599	NC_008750	CGT	2	6	35539	35544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596863
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601	NC_008750	GGC	2	6	35605	35610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596863
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605	NC_008750	TTC	2	6	35849	35854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596864
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609	NC_008750	TCT	2	6	36073	36078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596864
610	NC_008750	CGC	2	6	36115	36120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596864
611	NC_008750	GGATC	2	10	36145	36154	20 %	20 %	40 %	20 %	120596864
612	NC_008750	ATC	2	6	36158	36163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596864
613	NC_008750	GT	3	6	36174	36179	0 %	50 %	50 %	0 %	120596864
614	NC_008750	GACA	2	8	36352	36359	50 %	0 %	25 %	25 %	120596865
615	NC_008750	TTCA	2	8	36404	36411	25 %	50 %	0 %	25 %	120596865
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617	NC_008750	CCCA	2	8	36428	36435	25 %	0 %	0 %	75 %	120596865
618	NC_008750	TTA	2	6	36440	36445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596865
619	NC_008750	GCGG	2	8	36509	36516	0 %	0 %	75 %	25 %	120596865
620	NC_008750	TG	3	6	36564	36569	0 %	50 %	50 %	0 %	120596865
621	NC_008750	TGG	2	6	36669	36674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596865
622	NC_008750	TGG	2	6	36733	36738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596865
623	NC_008750	GCG	2	6	36740	36745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596865
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626	NC_008750	CCG	2	6	36879	36884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596865
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628	NC_008750	ATT	2	6	36920	36925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596865
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