MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008750	TAC	2	6	526073	526078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597315
8002	NC_008750	TCT	2	6	526086	526091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597315
8003	NC_008750	CAA	2	6	526463	526468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597316
8004	NC_008750	AGCA	2	8	526522	526529	50 %	0 %	25 %	25 %	120597316
8005	NC_008750	GCT	2	6	526552	526557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597316
8006	NC_008750	ATA	2	6	526563	526568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597316
8007	NC_008750	GAA	2	6	526570	526575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597316
8008	NC_008750	CCA	2	6	526581	526586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597316
8009	NC_008750	GCG	2	6	526610	526615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597316
8010	NC_008750	GTT	2	6	526756	526761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597316
8011	NC_008750	ACT	2	6	527088	527093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597316
8012	NC_008750	AGC	2	6	527153	527158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597316
8013	NC_008750	ACC	2	6	527318	527323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597316
8014	NC_008750	AGTG	2	8	527326	527333	25 %	25 %	50 %	0 %	120597316
8015	NC_008750	GT	3	6	527346	527351	0 %	50 %	50 %	0 %	120597316
8016	NC_008750	GCT	2	6	527414	527419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597316
8017	NC_008750	TAAA	2	8	527631	527638	75 %	25 %	0 %	0 %	120597316
8018	NC_008750	GC	3	6	527666	527671	0 %	0 %	50 %	50 %	120597316
8019	NC_008750	ATTT	2	8	527702	527709	25 %	75 %	0 %	0 %	120597316
8020	NC_008750	GTT	2	6	527764	527769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597316
8021	NC_008750	TGC	3	9	527849	527857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597317
8022	NC_008750	TGC	2	6	527915	527920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597317
8023	NC_008750	GGT	2	6	528021	528026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597317
8024	NC_008750	CAA	2	6	528268	528273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597318
8025	NC_008750	TAC	2	6	528341	528346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597318
8026	NC_008750	TGA	2	6	528366	528371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597318
8027	NC_008750	AAC	2	6	528401	528406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597318
8028	NC_008750	GCC	2	6	528418	528423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597318
8029	NC_008750	AGTG	2	8	528438	528445	25 %	25 %	50 %	0 %	120597318
8030	NC_008750	GAT	2	6	528454	528459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597318
8031	NC_008750	TCT	2	6	528466	528471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597319
8032	NC_008750	GAC	2	6	528505	528510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597319
8033	NC_008750	GTT	2	6	528556	528561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597319
8034	NC_008750	CTG	2	6	528582	528587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597319
8035	NC_008750	CGTT	2	8	528605	528612	0 %	50 %	25 %	25 %	120597319
8036	NC_008750	CAC	2	6	528619	528624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597319
8037	NC_008750	TAA	2	6	528673	528678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597319
8038	NC_008750	GAT	2	6	528776	528781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597319
8039	NC_008750	GTT	2	6	528821	528826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597319
8040	NC_008750	GC	3	6	528930	528935	0 %	0 %	50 %	50 %	120597319
8041	NC_008750	AGT	2	6	529022	529027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597319
8042	NC_008750	GAC	2	6	529048	529053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597319
8043	NC_008750	GT	3	6	529113	529118	0 %	50 %	50 %	0 %	120597319
8044	NC_008750	GCA	2	6	529246	529251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597319
8045	NC_008750	A	6	6	529313	529318	100 %	0 %	0 %	0 %	120597319
8046	NC_008750	ATGC	2	8	529400	529407	25 %	25 %	25 %	25 %	120597319
8047	NC_008750	TGG	2	6	529480	529485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597319
8048	NC_008750	CAA	2	6	529520	529525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597319
8049	NC_008750	CAG	3	9	529526	529534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597319
8050	NC_008750	ATT	2	6	529543	529548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597319
8051	NC_008750	TGA	2	6	529596	529601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597319
8052	NC_008750	AG	3	6	529604	529609	50 %	0 %	50 %	0 %	120597319
8053	NC_008750	TAA	2	6	529674	529679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597320
8054	NC_008750	T	6	6	529694	529699	0 %	100 %	0 %	0 %	120597320
8055	NC_008750	CTG	2	6	529716	529721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597320
8056	NC_008750	CCTGTG	2	12	529796	529807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597320
8057	NC_008750	TGC	2	6	529872	529877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597320
8058	NC_008750	ATG	2	6	529955	529960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597320
8059	NC_008750	TGA	2	6	530083	530088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597320
8060	NC_008750	GAC	2	6	530131	530136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597321
8061	NC_008750	CAA	2	6	530156	530161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597321
8062	NC_008750	GAA	2	6	530180	530185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597321
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8064	NC_008750	GAT	2	6	530302	530307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597321
8065	NC_008750	CTTG	2	8	530311	530318	0 %	50 %	25 %	25 %	120597321
8066	NC_008750	ATTT	2	8	530356	530363	25 %	75 %	0 %	0 %	120597321
8067	NC_008750	AAG	2	6	530407	530412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597321
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8071	NC_008750	TTG	3	9	530603	530611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597321
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8077	NC_008750	CTG	2	6	530959	530964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597322
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8088	NC_008750	TGC	3	9	531473	531481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597322
8089	NC_008750	T	6	6	531521	531526	0 %	100 %	0 %	0 %	120597322
8090	NC_008750	ATG	2	6	531630	531635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597322
8091	NC_008750	TGGA	2	8	531702	531709	25 %	25 %	50 %	0 %	120597322
8092	NC_008750	ATT	2	6	531746	531751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597323
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8098	NC_008750	TAT	2	6	532009	532014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597323
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8101	NC_008750	A	6	6	532294	532299	100 %	0 %	0 %	0 %	120597323
8102	NC_008750	TTTA	2	8	532357	532364	25 %	75 %	0 %	0 %	120597323
8103	NC_008750	GTG	3	9	532419	532427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597323
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8105	NC_008750	CGG	2	6	532500	532505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597323
8106	NC_008750	TCG	2	6	532510	532515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597323
8107	NC_008750	CCT	2	6	532536	532541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120597323
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8109	NC_008750	GC	3	6	532572	532577	0 %	0 %	50 %	50 %	120597323
8110	NC_008750	ATT	2	6	532740	532745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597324
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8113	NC_008750	TTATC	2	10	533173	533182	20 %	60 %	0 %	20 %	120597325
8114	NC_008750	TATCAA	2	12	533215	533226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120597325
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8118	NC_008750	CTT	2	6	533395	533400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597325
8119	NC_008750	T	6	6	533572	533577	0 %	100 %	0 %	0 %	120597326
8120	NC_008750	T	6	6	533581	533586	0 %	100 %	0 %	0 %	120597326
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8122	NC_008750	GT	3	6	533645	533650	0 %	50 %	50 %	0 %	120597326
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8487	NC_008750	TCT	2	6	558136	558141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597349
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