MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_008750	TGT	2	6	330816	330821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597135
5003	NC_008750	TGC	2	6	330898	330903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597135
5004	NC_008750	ATT	2	6	331187	331192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597136
5005	NC_008750	CTA	2	6	331210	331215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597136
5006	NC_008750	GCT	2	6	331284	331289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597136
5007	NC_008750	T	6	6	331320	331325	0 %	100 %	0 %	0 %	120597136
5008	NC_008750	TAA	2	6	331442	331447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597136
5009	NC_008750	TG	3	6	331498	331503	0 %	50 %	50 %	0 %	120597136
5010	NC_008750	GTG	2	6	331531	331536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597136
5011	NC_008750	TGA	2	6	331612	331617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597136
5012	NC_008750	GT	3	6	331719	331724	0 %	50 %	50 %	0 %	120597136
5013	NC_008750	AAG	2	6	331756	331761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597136
5014	NC_008750	T	6	6	331985	331990	0 %	100 %	0 %	0 %	120597137
5015	NC_008750	GTT	2	6	332125	332130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597137
5016	NC_008750	GCA	3	9	332139	332147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597137
5017	NC_008750	ATC	2	6	332189	332194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597137
5018	NC_008750	GACC	2	8	332200	332207	25 %	0 %	25 %	50 %	120597137
5019	NC_008750	GCA	2	6	332278	332283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597137
5020	NC_008750	ATC	2	6	332381	332386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597137
5021	NC_008750	AGT	2	6	332417	332422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597137
5022	NC_008750	TCA	2	6	332520	332525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597137
5023	NC_008750	ATC	2	6	332531	332536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597137
5024	NC_008750	CAC	2	6	332575	332580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597137
5025	NC_008750	CT	3	6	332670	332675	0 %	50 %	0 %	50 %	120597137
5026	NC_008750	TTGGT	2	10	332718	332727	0 %	60 %	40 %	0 %	120597137
5027	NC_008750	TTTG	2	8	332776	332783	0 %	75 %	25 %	0 %	120597137
5028	NC_008750	GAT	2	6	332824	332829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597137
5029	NC_008750	AATCTC	2	12	332867	332878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597137
5030	NC_008750	TGT	2	6	332902	332907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597137
5031	NC_008750	TGTA	2	8	332958	332965	25 %	50 %	25 %	0 %	120597137
5032	NC_008750	TGC	2	6	332998	333003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597137
5033	NC_008750	CAC	2	6	333013	333018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597137
5034	NC_008750	TGC	2	6	333035	333040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597137
5035	NC_008750	TAAA	2	8	333136	333143	75 %	25 %	0 %	0 %	120597137
5036	NC_008750	ATT	2	6	333179	333184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597137
5037	NC_008750	ATA	2	6	333288	333293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597137
5038	NC_008750	TTC	2	6	333320	333325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597137
5039	NC_008750	AAC	2	6	333354	333359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597137
5040	NC_008750	GTG	2	6	333384	333389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597137
5041	NC_008750	AAT	2	6	333408	333413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597137
5042	NC_008750	TATGAA	2	12	333579	333590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120597138
5043	NC_008750	GGAG	2	8	333612	333619	25 %	0 %	75 %	0 %	120597138
5044	NC_008750	A	7	7	333646	333652	100 %	0 %	0 %	0 %	120597138
5045	NC_008750	AAC	2	6	333701	333706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597138
5046	NC_008750	AT	3	6	333708	333713	50 %	50 %	0 %	0 %	120597138
5047	NC_008750	A	6	6	333743	333748	100 %	0 %	0 %	0 %	120597138
5048	NC_008750	GTC	2	6	333799	333804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597138
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5050	NC_008750	GT	3	6	334579	334584	0 %	50 %	50 %	0 %	120597139
5051	NC_008750	T	6	6	334595	334600	0 %	100 %	0 %	0 %	120597139
5052	NC_008750	AAG	3	9	334611	334619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597139
5053	NC_008750	AGCA	2	8	335816	335823	50 %	0 %	25 %	25 %	120597140
5054	NC_008750	GAC	2	6	335848	335853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597140
5055	NC_008750	T	7	7	335888	335894	0 %	100 %	0 %	0 %	120597140
5056	NC_008750	CGA	2	6	335895	335900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597140
5057	NC_008750	TGA	2	6	335931	335936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597140
5058	NC_008750	CAT	2	6	335937	335942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597140
5059	NC_008750	GCG	2	6	335948	335953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597140
5060	NC_008750	GACCT	2	10	335992	336001	20 %	20 %	20 %	40 %	120597140
5061	NC_008750	GAC	2	6	336121	336126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597140
5062	NC_008750	GCT	2	6	336139	336144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597140
5063	NC_008750	TGG	2	6	336183	336188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597140
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5065	NC_008750	CGA	2	6	336234	336239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597140
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5067	NC_008750	TAT	2	6	336367	336372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597140
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5070	NC_008750	GCG	2	6	336663	336668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597140
5071	NC_008750	CTAT	2	8	336758	336765	25 %	50 %	0 %	25 %	120597140
5072	NC_008750	GTG	2	6	336965	336970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597140
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5074	NC_008750	ACT	2	6	337065	337070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597141
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5076	NC_008750	CGAC	2	8	337430	337437	25 %	0 %	25 %	50 %	120597141
5077	NC_008750	GGC	2	6	337493	337498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597141
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5086	NC_008750	TTGC	2	8	338130	338137	0 %	50 %	25 %	25 %	120597143
5087	NC_008750	GGT	2	6	338145	338150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597143
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5093	NC_008750	GTT	2	6	338609	338614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597144
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5095	NC_008750	AGC	3	9	338676	338684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597144
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5099	NC_008750	T	6	6	338802	338807	0 %	100 %	0 %	0 %	120597144
5100	NC_008750	AT	3	6	338823	338828	50 %	50 %	0 %	0 %	120597144
5101	NC_008750	TTA	2	6	339165	339170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597145
5102	NC_008750	CAGA	2	8	339384	339391	50 %	0 %	25 %	25 %	120597145
5103	NC_008750	TTC	2	6	339421	339426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597145
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5106	NC_008750	CAC	2	6	339696	339701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597145
5107	NC_008750	CGC	2	6	339851	339856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597145
5108	NC_008750	TGC	2	6	339864	339869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597145
5109	NC_008750	GCA	2	6	339874	339879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597145
5110	NC_008750	GAGC	2	8	339904	339911	25 %	0 %	50 %	25 %	120597145
5111	NC_008750	ACC	2	6	339954	339959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597145
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5118	NC_008750	GTG	2	6	340349	340354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597145
5119	NC_008750	ATA	2	6	340420	340425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597145
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5364	NC_008750	GGT	2	6	353695	353700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597156
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5475	NC_008750	AAAGA	2	10	360907	360916	80 %	0 %	20 %	0 %	120597164
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5484	NC_008750	ATCG	2	8	361607	361614	25 %	25 %	25 %	25 %	120597165
5485	NC_008750	ATG	2	6	361622	361627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597165
5486	NC_008750	GCG	2	6	361766	361771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597165
5487	NC_008750	ATG	2	6	361835	361840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597165
5488	NC_008750	TTC	2	6	361859	361864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597165
5489	NC_008750	CTG	2	6	361866	361871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597165
5490	NC_008750	TAA	2	6	361910	361915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597165
5491	NC_008750	CTG	2	6	361933	361938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597165
5492	NC_008750	GTGG	2	8	362226	362233	0 %	25 %	75 %	0 %	120597166
5493	NC_008750	GTTTGA	2	12	362237	362248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120597166
5494	NC_008750	ACT	2	6	362400	362405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597166
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5496	NC_008750	AGT	3	9	362494	362502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597166
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5499	NC_008750	ACG	2	6	362742	362747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597166
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