MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 71774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008700	GCC	2	6	243953	243958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773348
4002	NC_008700	AAG	2	6	243959	243964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4003	NC_008700	GT	3	6	244124	244129	0 %	50 %	50 %	0 %	119773348
4004	NC_008700	TGA	2	6	244215	244220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4005	NC_008700	CAA	2	6	244228	244233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773348
4006	NC_008700	GCCA	2	8	244243	244250	25 %	0 %	25 %	50 %	119773348
4007	NC_008700	ATC	2	6	244262	244267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4008	NC_008700	TAC	2	6	244298	244303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4009	NC_008700	GCTGAA	2	12	244358	244369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119773348
4010	NC_008700	TGC	2	6	244387	244392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4011	NC_008700	CAT	2	6	244432	244437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4012	NC_008700	AGC	2	6	244461	244466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4013	NC_008700	GTCT	2	8	244524	244531	0 %	50 %	25 %	25 %	119773348
4014	NC_008700	AAG	2	6	244559	244564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4015	NC_008700	GCT	2	6	244576	244581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4016	NC_008700	CCA	2	6	244662	244667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773348
4017	NC_008700	AGA	2	6	244708	244713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4018	NC_008700	CT	3	6	244720	244725	0 %	50 %	0 %	50 %	119773348
4019	NC_008700	GCCGAA	2	12	244736	244747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4020	NC_008700	GTCTG	2	10	244774	244783	0 %	40 %	40 %	20 %	119773348
4021	NC_008700	CCG	2	6	244788	244793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773348
4022	NC_008700	ACA	2	6	244803	244808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773348
4023	NC_008700	GAT	2	6	244855	244860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4024	NC_008700	GAA	3	9	244901	244909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4025	NC_008700	ATG	2	6	244937	244942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4026	NC_008700	GC	3	6	244953	244958	0 %	0 %	50 %	50 %	119773348
4027	NC_008700	CAT	2	6	245026	245031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4028	NC_008700	TCG	2	6	245158	245163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4029	NC_008700	TGG	2	6	245166	245171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4030	NC_008700	ATC	2	6	245192	245197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4031	NC_008700	GGT	2	6	245249	245254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4032	NC_008700	CGA	2	6	245326	245331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4033	NC_008700	CTG	2	6	245354	245359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4034	NC_008700	ACAGC	2	10	245386	245395	40 %	0 %	20 %	40 %	119773348
4035	NC_008700	GT	4	8	245445	245452	0 %	50 %	50 %	0 %	119773348
4036	NC_008700	CAT	2	6	245488	245493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4037	NC_008700	GGT	2	6	245579	245584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4038	NC_008700	GAA	2	6	245623	245628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4039	NC_008700	TTC	2	6	245701	245706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773348
4040	NC_008700	CAT	2	6	245716	245721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4041	NC_008700	AAG	2	6	245784	245789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4042	NC_008700	ATC	2	6	245846	245851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4043	NC_008700	CGA	2	6	245917	245922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4044	NC_008700	GTCT	2	8	245931	245938	0 %	50 %	25 %	25 %	119773348
4045	NC_008700	TCG	2	6	245943	245948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4046	NC_008700	CAG	2	6	245994	245999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4047	NC_008700	TGG	2	6	246006	246011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4048	NC_008700	CCTG	2	8	246067	246074	0 %	25 %	25 %	50 %	119773348
4049	NC_008700	GAC	2	6	246095	246100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4050	NC_008700	GGT	2	6	246173	246178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4051	NC_008700	CGT	2	6	246209	246214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4052	NC_008700	ACG	2	6	246306	246311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4053	NC_008700	GTG	2	6	246384	246389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773348
4054	NC_008700	TGC	2	6	246546	246551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4055	NC_008700	CAT	2	6	246559	246564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4056	NC_008700	AGC	2	6	246657	246662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4057	NC_008700	CTG	2	6	246683	246688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4058	NC_008700	GTC	2	6	246828	246833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4059	NC_008700	GAA	2	6	246896	246901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4060	NC_008700	CTG	2	6	246953	246958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4061	NC_008700	GTG	2	6	247249	247254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773349
4062	NC_008700	GT	3	6	247264	247269	0 %	50 %	50 %	0 %	119773349
4063	NC_008700	ACC	2	6	247272	247277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773349
4064	NC_008700	CGG	2	6	247358	247363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773349
4065	NC_008700	CGC	2	6	247485	247490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773349
4066	NC_008700	GTA	2	6	247627	247632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773350
4067	NC_008700	CCTG	2	8	247647	247654	0 %	25 %	25 %	50 %	119773350
4068	NC_008700	TCA	2	6	247688	247693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773350
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4071	NC_008700	GAA	2	6	247767	247772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773350
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4073	NC_008700	TGG	2	6	247787	247792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773350
4074	NC_008700	GCT	2	6	247801	247806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773350
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4076	NC_008700	TGG	2	6	247851	247856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773350
4077	NC_008700	GTCC	2	8	247882	247889	0 %	25 %	25 %	50 %	119773350
4078	NC_008700	TGGT	2	8	247918	247925	0 %	50 %	50 %	0 %	119773350
4079	NC_008700	GCT	2	6	247930	247935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773350
4080	NC_008700	GTG	2	6	247943	247948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773350
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4084	NC_008700	TAA	2	6	248080	248085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773350
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4087	NC_008700	ATTACC	2	12	248344	248355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773351
4088	NC_008700	ACC	2	6	248368	248373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773351
4089	NC_008700	CAT	2	6	248418	248423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773351
4090	NC_008700	TCAG	2	8	248526	248533	25 %	25 %	25 %	25 %	119773351
4091	NC_008700	CAA	2	6	248553	248558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773351
4092	NC_008700	GAA	2	6	248689	248694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773351
4093	NC_008700	GCC	2	6	248839	248844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773351
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4101	NC_008700	GCC	2	6	249304	249309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773351
4102	NC_008700	AAG	2	6	249323	249328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773351
4103	NC_008700	TG	3	6	249347	249352	0 %	50 %	50 %	0 %	119773351
4104	NC_008700	GGT	2	6	249682	249687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773351
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4106	NC_008700	GAA	2	6	249828	249833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773351
4107	NC_008700	CGAA	2	8	249908	249915	50 %	0 %	25 %	25 %	119773351
4108	NC_008700	GC	3	6	249956	249961	0 %	0 %	50 %	50 %	119773351
4109	NC_008700	GTA	2	6	250036	250041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773351
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4111	NC_008700	CGC	2	6	250217	250222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773351
4112	NC_008700	GCTAAA	2	12	250347	250358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119773352
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4114	NC_008700	TC	3	6	250438	250443	0 %	50 %	0 %	50 %	119773352
4115	NC_008700	GGT	2	6	250464	250469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773352
4116	NC_008700	TC	3	6	250483	250488	0 %	50 %	0 %	50 %	119773352
4117	NC_008700	AGA	2	6	250505	250510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773352
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4120	NC_008700	CTG	2	6	250704	250709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4121	NC_008700	AGGT	2	8	250717	250724	25 %	25 %	50 %	0 %	119773352
4122	NC_008700	TCA	2	6	250732	250737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773352
4123	NC_008700	GCT	2	6	250778	250783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4124	NC_008700	CTG	2	6	250812	250817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4125	NC_008700	TGA	2	6	250838	250843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773352
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4127	NC_008700	AGT	2	6	251021	251026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773352
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4132	NC_008700	CTG	2	6	251175	251180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4133	NC_008700	TGA	2	6	251195	251200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773352
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4144	NC_008700	TC	3	6	252049	252054	0 %	50 %	0 %	50 %	119773353
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4149	NC_008700	AGGC	2	8	252443	252450	25 %	0 %	50 %	25 %	119773354
4150	NC_008700	GCCG	2	8	252457	252464	0 %	0 %	50 %	50 %	119773354
4151	NC_008700	GAAGGC	2	12	252496	252507	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119773354
4152	NC_008700	GCTGA	2	10	252520	252529	20 %	20 %	40 %	20 %	119773354
4153	NC_008700	GTA	2	6	252769	252774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773354
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4159	NC_008700	CACTGG	2	12	253043	253054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119773355
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4480	NC_008700	ACCGTT	2	12	270476	270487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119773388
4481	NC_008700	GCC	2	6	270545	270550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773388
4482	NC_008700	TCA	2	6	270579	270584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773388
4483	NC_008700	AAAG	2	8	270664	270671	75 %	0 %	25 %	0 %	119773388
4484	NC_008700	CAG	2	6	270688	270693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773388
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4487	NC_008700	CAT	2	6	270946	270951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773388
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4491	NC_008700	AGC	2	6	271073	271078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773388
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4500	NC_008700	GC	3	6	271874	271879	0 %	0 %	50 %	50 %	119773389

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