MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 71774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008700	GCT	2	6	181802	181807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773297
3002	NC_008700	TGC	2	6	181808	181813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773297
3003	NC_008700	GCC	2	6	181891	181896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773297
3004	NC_008700	TCTG	2	8	181898	181905	0 %	50 %	25 %	25 %	119773297
3005	NC_008700	GTG	2	6	181939	181944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773297
3006	NC_008700	CT	3	6	182302	182307	0 %	50 %	0 %	50 %	119773298
3007	NC_008700	CGC	2	6	182400	182405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773298
3008	NC_008700	CAGG	2	8	182430	182437	25 %	0 %	50 %	25 %	119773298
3009	NC_008700	GCA	2	6	182552	182557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3010	NC_008700	GAT	2	6	182581	182586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773298
3011	NC_008700	TGA	2	6	182613	182618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773298
3012	NC_008700	GCT	2	6	182631	182636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3013	NC_008700	CGA	2	6	182784	182789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3014	NC_008700	CTT	2	6	182793	182798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773298
3015	NC_008700	GGC	2	6	182803	182808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
3016	NC_008700	TGG	2	6	182862	182867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3017	NC_008700	TGC	2	6	182930	182935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3018	NC_008700	AGC	2	6	182971	182976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3019	NC_008700	TCT	2	6	183020	183025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773298
3020	NC_008700	GCTG	2	8	183051	183058	0 %	25 %	50 %	25 %	119773298
3021	NC_008700	ACG	2	6	183134	183139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3022	NC_008700	TGAT	2	8	183212	183219	25 %	50 %	25 %	0 %	119773298
3023	NC_008700	CGG	2	6	183255	183260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
3024	NC_008700	ACG	2	6	183275	183280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3025	NC_008700	CAA	2	6	183468	183473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773298
3026	NC_008700	GCT	2	6	183475	183480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3027	NC_008700	TGGGC	2	10	183533	183542	0 %	20 %	60 %	20 %	119773298
3028	NC_008700	TGG	2	6	183681	183686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3029	NC_008700	GGC	2	6	183765	183770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
3030	NC_008700	GC	3	6	183769	183774	0 %	0 %	50 %	50 %	119773298
3031	NC_008700	TGG	2	6	183784	183789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3032	NC_008700	CGA	2	6	183792	183797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3033	NC_008700	GCA	2	6	183806	183811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3034	NC_008700	ACC	2	6	183862	183867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773298
3035	NC_008700	GAT	2	6	183928	183933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773298
3036	NC_008700	GATT	2	8	184065	184072	25 %	50 %	25 %	0 %	119773298
3037	NC_008700	GGT	2	6	184086	184091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3038	NC_008700	GC	3	6	184158	184163	0 %	0 %	50 %	50 %	119773298
3039	NC_008700	CGC	2	6	184291	184296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773298
3040	NC_008700	CAG	2	6	184300	184305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3041	NC_008700	GAA	2	6	184411	184416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773298
3042	NC_008700	TGC	2	6	184463	184468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3043	NC_008700	A	6	6	184477	184482	100 %	0 %	0 %	0 %	119773298
3044	NC_008700	GCA	2	6	184504	184509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3045	NC_008700	GGCCAA	2	12	184512	184523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3046	NC_008700	TGA	2	6	184620	184625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773298
3047	NC_008700	GGC	2	6	184638	184643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
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3049	NC_008700	CCG	2	6	184688	184693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773298
3050	NC_008700	GTC	2	6	184712	184717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3051	NC_008700	GAA	2	6	184723	184728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773298
3052	NC_008700	A	6	6	184802	184807	100 %	0 %	0 %	0 %	119773298
3053	NC_008700	GCGA	2	8	184838	184845	25 %	0 %	50 %	25 %	119773298
3054	NC_008700	C	6	6	184871	184876	0 %	0 %	0 %	100 %	119773298
3055	NC_008700	AAC	2	6	184936	184941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773298
3056	NC_008700	TGC	2	6	185030	185035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3057	NC_008700	GTG	2	6	185105	185110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3058	NC_008700	GCT	2	6	185121	185126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3059	NC_008700	CGC	2	6	185225	185230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773298
3060	NC_008700	GCAG	2	8	185248	185255	25 %	0 %	50 %	25 %	119773298
3061	NC_008700	CGG	2	6	185280	185285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
3062	NC_008700	GGC	2	6	185334	185339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773298
3063	NC_008700	GGTCG	2	10	185344	185353	0 %	20 %	60 %	20 %	119773298
3064	NC_008700	GCT	2	6	185379	185384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773298
3065	NC_008700	TGG	2	6	185597	185602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773298
3066	NC_008700	TGA	2	6	185713	185718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773299
3067	NC_008700	TGTC	2	8	185743	185750	0 %	50 %	25 %	25 %	119773299
3068	NC_008700	CTG	2	6	185826	185831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773299
3069	NC_008700	CAA	2	6	185861	185866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773299
3070	NC_008700	TGC	2	6	185906	185911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773299
3071	NC_008700	CATT	2	8	185992	185999	25 %	50 %	0 %	25 %	119773299
3072	NC_008700	GGC	2	6	186004	186009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773299
3073	NC_008700	TGC	2	6	186033	186038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773299
3074	NC_008700	CGG	2	6	186104	186109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773299
3075	NC_008700	GCT	2	6	186198	186203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773299
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3077	NC_008700	TCA	2	6	186364	186369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773299
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3079	NC_008700	GCC	2	6	186385	186390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773299
3080	NC_008700	GGC	2	6	186393	186398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773299
3081	NC_008700	CT	3	6	186490	186495	0 %	50 %	0 %	50 %	119773299
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3083	NC_008700	TCA	2	6	186596	186601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773299
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3086	NC_008700	GCG	2	6	186831	186836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773300
3087	NC_008700	CCG	2	6	186917	186922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773300
3088	NC_008700	CGG	2	6	186946	186951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773300
3089	NC_008700	GCT	2	6	186972	186977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3090	NC_008700	GAG	2	6	187026	187031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773300
3091	NC_008700	GCC	2	6	187061	187066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773300
3092	NC_008700	CTG	2	6	187083	187088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3093	NC_008700	GTC	2	6	187145	187150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3094	NC_008700	CA	3	6	187151	187156	50 %	0 %	0 %	50 %	119773300
3095	NC_008700	G	6	6	187174	187179	0 %	0 %	100 %	0 %	119773300
3096	NC_008700	AGG	2	6	187204	187209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773300
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3098	NC_008700	CGA	2	6	187412	187417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3099	NC_008700	TG	3	6	187440	187445	0 %	50 %	50 %	0 %	119773300
3100	NC_008700	CCCA	2	8	187486	187493	25 %	0 %	0 %	75 %	119773300
3101	NC_008700	CT	3	6	187502	187507	0 %	50 %	0 %	50 %	119773300
3102	NC_008700	AAC	2	6	187898	187903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773301
3103	NC_008700	GCC	2	6	187918	187923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773301
3104	NC_008700	GCAA	2	8	187952	187959	50 %	0 %	25 %	25 %	119773301
3105	NC_008700	CAG	2	6	188038	188043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773301
3106	NC_008700	GCA	2	6	188052	188057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773301
3107	NC_008700	GCA	2	6	188178	188183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773301
3108	NC_008700	ATC	2	6	188282	188287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773301
3109	NC_008700	CGG	2	6	188296	188301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773301
3110	NC_008700	CAA	2	6	188310	188315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773301
3111	NC_008700	CTG	2	6	188320	188325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773301
3112	NC_008700	CGA	2	6	188334	188339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773301
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3116	NC_008700	CAG	2	6	188778	188783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773302
3117	NC_008700	GAA	2	6	188805	188810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773302
3118	NC_008700	ACT	2	6	188911	188916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773302
3119	NC_008700	AGA	2	6	188954	188959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773302
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3121	NC_008700	TC	4	8	189045	189052	0 %	50 %	0 %	50 %	119773302
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3242	NC_008700	TCA	2	6	196587	196592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773307
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3481	NC_008700	TTG	2	6	209921	209926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773322
3482	NC_008700	CTT	2	6	209931	209936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773322
3483	NC_008700	CAC	2	6	209955	209960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773322
3484	NC_008700	CA	3	6	210120	210125	50 %	0 %	0 %	50 %	119773322
3485	NC_008700	GGCT	2	8	210172	210179	0 %	25 %	50 %	25 %	119773322
3486	NC_008700	TTG	2	6	210184	210189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773322
3487	NC_008700	TGC	2	6	210409	210414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773322
3488	NC_008700	ATGG	2	8	210541	210548	25 %	25 %	50 %	0 %	119773323
3489	NC_008700	GTT	2	6	210576	210581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773323
3490	NC_008700	TGC	2	6	210631	210636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773323
3491	NC_008700	CAG	2	6	210637	210642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773323
3492	NC_008700	GTC	2	6	210655	210660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773323
3493	NC_008700	GCG	2	6	210841	210846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773323
3494	NC_008700	CCTG	2	8	210888	210895	0 %	25 %	25 %	50 %	119773323
3495	NC_008700	GTTCCC	2	12	210948	210959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119773323
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3499	NC_008700	CCAT	2	8	211121	211128	25 %	25 %	0 %	50 %	119773323
3500	NC_008700	GTA	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773323

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