MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 71774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008700	TCAA	2	8	312916	312923	50 %	25 %	0 %	25 %	119773413
5002	NC_008700	TGG	2	6	313025	313030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773413
5003	NC_008700	GCC	2	6	313044	313049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773413
5004	NC_008700	C	7	7	313080	313086	0 %	0 %	0 %	100 %	119773413
5005	NC_008700	AGT	2	6	313115	313120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773413
5006	NC_008700	GGCA	2	8	313194	313201	25 %	0 %	50 %	25 %	119773413
5007	NC_008700	GCCAGG	2	12	313211	313222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119773413
5008	NC_008700	TGT	2	6	313223	313228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773413
5009	NC_008700	CAG	2	6	313239	313244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5010	NC_008700	TCA	2	6	313339	313344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773413
5011	NC_008700	TGG	2	6	313373	313378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773413
5012	NC_008700	GTC	2	6	313407	313412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5013	NC_008700	TCG	2	6	313531	313536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5014	NC_008700	TCA	2	6	313651	313656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773413
5015	NC_008700	CCG	2	6	313805	313810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773413
5016	NC_008700	C	6	6	313816	313821	0 %	0 %	0 %	100 %	119773413
5017	NC_008700	GCC	3	9	313828	313836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773413
5018	NC_008700	GTT	2	6	313851	313856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773413
5019	NC_008700	TCG	2	6	313918	313923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5020	NC_008700	GTC	2	6	313932	313937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5021	NC_008700	GCC	2	6	313945	313950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773413
5022	NC_008700	GTG	2	6	313975	313980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773413
5023	NC_008700	TCT	2	6	314011	314016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773413
5024	NC_008700	CTG	2	6	314020	314025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5025	NC_008700	TGG	2	6	314051	314056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773413
5026	NC_008700	GCT	2	6	314180	314185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773413
5027	NC_008700	CGCCTG	2	12	314216	314227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119773413
5028	NC_008700	CAT	2	6	314246	314251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773413
5029	NC_008700	CA	4	8	314277	314284	50 %	0 %	0 %	50 %	119773413
5030	NC_008700	TGG	2	6	314333	314338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773413
5031	NC_008700	GAG	2	6	314348	314353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773413
5032	NC_008700	TTG	2	6	314377	314382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773413
5033	NC_008700	GCC	2	6	314388	314393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773413
5034	NC_008700	GGC	2	6	314421	314426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773413
5035	NC_008700	AGT	2	6	314431	314436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773413
5036	NC_008700	TTG	2	6	314437	314442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773413
5037	NC_008700	CGG	2	6	314707	314712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773414
5038	NC_008700	TTG	2	6	314718	314723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773414
5039	NC_008700	TCA	2	6	314736	314741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773414
5040	NC_008700	GCC	2	6	314826	314831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773414
5041	NC_008700	GTC	2	6	314867	314872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773414
5042	NC_008700	ATC	2	6	314888	314893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773414
5043	NC_008700	TCA	2	6	314941	314946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773414
5044	NC_008700	TGCC	2	8	314956	314963	0 %	25 %	25 %	50 %	119773414
5045	NC_008700	ACC	2	6	315020	315025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773414
5046	NC_008700	AGC	2	6	315063	315068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773414
5047	NC_008700	AAAC	2	8	315112	315119	75 %	0 %	0 %	25 %	119773414
5048	NC_008700	CGG	2	6	315187	315192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773414
5049	NC_008700	GTG	2	6	315235	315240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773414
5050	NC_008700	CA	5	10	315275	315284	50 %	0 %	0 %	50 %	119773414
5051	NC_008700	TGG	2	6	315286	315291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773414
5052	NC_008700	ATA	2	6	315312	315317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773414
5053	NC_008700	CAGG	2	8	315331	315338	25 %	0 %	50 %	25 %	119773414
5054	NC_008700	CGGG	2	8	315404	315411	0 %	0 %	75 %	25 %	119773415
5055	NC_008700	AC	4	8	315470	315477	50 %	0 %	0 %	50 %	119773415
5056	NC_008700	CGCT	2	8	315491	315498	0 %	25 %	25 %	50 %	119773415
5057	NC_008700	ACC	2	6	315509	315514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773415
5058	NC_008700	GCA	2	6	315522	315527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5059	NC_008700	CTG	2	6	315587	315592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5060	NC_008700	A	6	6	315646	315651	100 %	0 %	0 %	0 %	119773415
5061	NC_008700	GGC	2	6	315667	315672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773415
5062	NC_008700	TGG	2	6	315738	315743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773415
5063	NC_008700	GCT	2	6	315748	315753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5064	NC_008700	CGG	3	9	315814	315822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773415
5065	NC_008700	TGC	2	6	315854	315859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5066	NC_008700	TGA	2	6	315867	315872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773415
5067	NC_008700	GCT	2	6	315920	315925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5068	NC_008700	AGC	2	6	315950	315955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5069	NC_008700	GAC	2	6	315981	315986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5070	NC_008700	CAG	2	6	316024	316029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5071	NC_008700	CGC	2	6	316030	316035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773415
5072	NC_008700	GA	3	6	316050	316055	50 %	0 %	50 %	0 %	119773415
5073	NC_008700	TCGC	2	8	316072	316079	0 %	25 %	25 %	50 %	119773415
5074	NC_008700	CTGCGG	2	12	316103	316114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119773415
5075	NC_008700	AGC	2	6	316118	316123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773415
5076	NC_008700	TGG	2	6	316124	316129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773415
5077	NC_008700	GCTT	2	8	316188	316195	0 %	50 %	25 %	25 %	119773415
5078	NC_008700	CCA	2	6	316221	316226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773415
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5080	NC_008700	GCC	2	6	316684	316689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773416
5081	NC_008700	GAC	2	6	316706	316711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773416
5082	NC_008700	GCTG	2	8	316748	316755	0 %	25 %	50 %	25 %	119773416
5083	NC_008700	GCC	2	6	316925	316930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773416
5084	NC_008700	GGT	2	6	316931	316936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773416
5085	NC_008700	CTA	2	6	316960	316965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773416
5086	NC_008700	GTG	2	6	317064	317069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773416
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5088	NC_008700	TAAA	2	8	318774	318781	75 %	25 %	0 %	0 %	119773417
5089	NC_008700	GCT	2	6	318805	318810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773417
5090	NC_008700	GCTT	2	8	318948	318955	0 %	50 %	25 %	25 %	119773417
5091	NC_008700	AAG	2	6	318960	318965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773417
5092	NC_008700	TGA	2	6	319030	319035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
5093	NC_008700	TGAA	2	8	319053	319060	50 %	25 %	25 %	0 %	119773417
5094	NC_008700	GAA	2	6	319292	319297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773417
5095	NC_008700	TGC	2	6	319336	319341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773417
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5097	NC_008700	AGCAA	2	10	319365	319374	60 %	0 %	20 %	20 %	119773417
5098	NC_008700	CAGA	2	8	319478	319485	50 %	0 %	25 %	25 %	119773417
5099	NC_008700	A	7	7	319520	319526	100 %	0 %	0 %	0 %	119773417
5100	NC_008700	CGAG	2	8	319531	319538	25 %	0 %	50 %	25 %	119773417
5101	NC_008700	A	6	6	319539	319544	100 %	0 %	0 %	0 %	119773417
5102	NC_008700	TGA	2	6	319579	319584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
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5104	NC_008700	AGA	2	6	319630	319635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773417
5105	NC_008700	ATGG	2	8	319641	319648	25 %	25 %	50 %	0 %	119773417
5106	NC_008700	CGAT	2	8	319740	319747	25 %	25 %	25 %	25 %	119773417
5107	NC_008700	ATC	2	6	319797	319802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773417
5108	NC_008700	ATG	2	6	319998	320003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
5109	NC_008700	T	6	6	320043	320048	0 %	100 %	0 %	0 %	119773417
5110	NC_008700	CGA	2	6	320086	320091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773417
5111	NC_008700	ATG	2	6	320139	320144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
5112	NC_008700	TGA	2	6	320155	320160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
5113	NC_008700	TGC	2	6	320166	320171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773417
5114	NC_008700	TGA	2	6	320176	320181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773417
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5116	NC_008700	CTA	2	6	320212	320217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773417
5117	NC_008700	AGC	2	6	320287	320292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773417
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5119	NC_008700	GTT	2	6	320405	320410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773417
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