MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 84118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008554	CGA	2	6	236366	236371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747651
4002	NC_008554	CGG	2	6	236441	236446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747651
4003	NC_008554	TCA	2	6	236494	236499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747651
4004	NC_008554	CAT	2	6	236549	236554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747651
4005	NC_008554	TCAT	2	8	236557	236564	25 %	50 %	0 %	25 %	116747651
4006	NC_008554	GC	3	6	236633	236638	0 %	0 %	50 %	50 %	116747651
4007	NC_008554	CGGT	2	8	236710	236717	0 %	25 %	50 %	25 %	116747651
4008	NC_008554	ATC	2	6	236781	236786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747651
4009	NC_008554	TCGA	2	8	236797	236804	25 %	25 %	25 %	25 %	116747651
4010	NC_008554	GCC	2	6	236852	236857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747651
4011	NC_008554	GC	3	6	236887	236892	0 %	0 %	50 %	50 %	116747651
4012	NC_008554	GCT	2	6	236901	236906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747651
4013	NC_008554	TAC	2	6	236907	236912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747651
4014	NC_008554	TGG	2	6	237010	237015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747651
4015	NC_008554	ATC	2	6	237190	237195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747652
4016	NC_008554	TCTGG	2	10	237225	237234	0 %	40 %	40 %	20 %	116747652
4017	NC_008554	GGTC	2	8	237285	237292	0 %	25 %	50 %	25 %	116747652
4018	NC_008554	CTG	2	6	237301	237306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747652
4019	NC_008554	CGGT	2	8	237358	237365	0 %	25 %	50 %	25 %	116747652
4020	NC_008554	TGG	2	6	237416	237421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747652
4021	NC_008554	TCC	2	6	237479	237484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747652
4022	NC_008554	CGG	2	6	237528	237533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747652
4023	NC_008554	CAA	3	9	237543	237551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747652
4024	NC_008554	CGGT	2	8	237574	237581	0 %	25 %	50 %	25 %	116747652
4025	NC_008554	TGT	2	6	237611	237616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747652
4026	NC_008554	CG	3	6	237757	237762	0 %	0 %	50 %	50 %	116747652
4027	NC_008554	CTT	2	6	237840	237845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747652
4028	NC_008554	CCG	2	6	237878	237883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747652
4029	NC_008554	CCA	2	6	237887	237892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747652
4030	NC_008554	TTC	2	6	237898	237903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747652
4031	NC_008554	GTG	2	6	237949	237954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747652
4032	NC_008554	TGAT	2	8	238112	238119	25 %	50 %	25 %	0 %	116747652
4033	NC_008554	GGC	2	6	238172	238177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747653
4034	NC_008554	TGG	2	6	238185	238190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747653
4035	NC_008554	CCG	2	6	238210	238215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747653
4036	NC_008554	GGT	2	6	238228	238233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747653
4037	NC_008554	GGT	2	6	238255	238260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747653
4038	NC_008554	CGCC	2	8	238269	238276	0 %	0 %	25 %	75 %	116747653
4039	NC_008554	GCCCA	2	10	238394	238403	20 %	0 %	20 %	60 %	116747653
4040	NC_008554	GC	3	6	238571	238576	0 %	0 %	50 %	50 %	116747653
4041	NC_008554	GCG	2	6	238639	238644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747654
4042	NC_008554	TCG	3	9	238664	238672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747654
4043	NC_008554	TCC	2	6	238718	238723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747654
4044	NC_008554	CGG	2	6	238761	238766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747654
4045	NC_008554	CTT	2	6	238788	238793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747654
4046	NC_008554	CAT	2	6	238854	238859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747654
4047	NC_008554	CCCG	2	8	238865	238872	0 %	0 %	25 %	75 %	116747654
4048	NC_008554	AG	3	6	238894	238899	50 %	0 %	50 %	0 %	116747654
4049	NC_008554	CGA	2	6	238925	238930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747654
4050	NC_008554	TGG	2	6	238943	238948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747654
4051	NC_008554	TGG	2	6	238952	238957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747654
4052	NC_008554	GCCG	2	8	238983	238990	0 %	0 %	50 %	50 %	116747654
4053	NC_008554	TGC	2	6	239033	239038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747654
4054	NC_008554	CTG	2	6	239080	239085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747654
4055	NC_008554	CAT	2	6	239091	239096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747654
4056	NC_008554	ATC	2	6	239104	239109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747654
4057	NC_008554	CAG	2	6	239121	239126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747654
4058	NC_008554	GTTCT	2	10	239175	239184	0 %	60 %	20 %	20 %	116747655
4059	NC_008554	CTC	2	6	239193	239198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747655
4060	NC_008554	ATC	2	6	239322	239327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747655
4061	NC_008554	GCC	3	9	239349	239357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747655
4062	NC_008554	CAT	2	6	239378	239383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747655
4063	NC_008554	TTG	2	6	239480	239485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747656
4064	NC_008554	GCG	2	6	239606	239611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4065	NC_008554	GCCG	2	8	239639	239646	0 %	0 %	50 %	50 %	116747656
4066	NC_008554	CGTTC	2	10	239692	239701	0 %	40 %	20 %	40 %	116747656
4067	NC_008554	CTG	2	6	239708	239713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4068	NC_008554	CCT	2	6	239725	239730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747656
4069	NC_008554	CTA	2	6	239815	239820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747656
4070	NC_008554	ATG	2	6	239849	239854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747656
4071	NC_008554	GTT	2	6	239884	239889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747656
4072	NC_008554	TCT	2	6	239892	239897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747656
4073	NC_008554	CCT	2	6	239923	239928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747656
4074	NC_008554	TAC	2	6	239939	239944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747656
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4076	NC_008554	TGA	2	6	239985	239990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747656
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4078	NC_008554	CTC	2	6	240170	240175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747656
4079	NC_008554	GC	3	6	240216	240221	0 %	0 %	50 %	50 %	116747656
4080	NC_008554	CGA	2	6	240234	240239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4081	NC_008554	TGG	2	6	240240	240245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747656
4082	NC_008554	ATGGCC	2	12	240305	240316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4083	NC_008554	TGC	2	6	240339	240344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4084	NC_008554	CCATGG	2	12	240354	240365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4085	NC_008554	CCA	2	6	240399	240404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747656
4086	NC_008554	TCATGG	2	12	240420	240431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116747656
4087	NC_008554	CGG	2	6	240442	240447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4088	NC_008554	TCACC	2	10	240466	240475	20 %	20 %	0 %	60 %	116747656
4089	NC_008554	CTG	2	6	240497	240502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747656
4090	NC_008554	TTCA	2	8	240521	240528	25 %	50 %	0 %	25 %	116747656
4091	NC_008554	T	6	6	240649	240654	0 %	100 %	0 %	0 %	116747656
4092	NC_008554	AGG	2	6	240660	240665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747656
4093	NC_008554	CGC	2	6	240682	240687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747656
4094	NC_008554	GCG	2	6	240710	240715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4095	NC_008554	GCT	2	6	240718	240723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747656
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4099	NC_008554	CGG	2	6	240850	240855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4100	NC_008554	TGA	2	6	240885	240890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747656
4101	NC_008554	CTT	2	6	240919	240924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747656
4102	NC_008554	GCCG	2	8	240959	240966	0 %	0 %	50 %	50 %	116747656
4103	NC_008554	GCC	3	9	240974	240982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747656
4104	NC_008554	GGC	2	6	240988	240993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4105	NC_008554	GGC	2	6	241009	241014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
4106	NC_008554	GGGC	2	8	241075	241082	0 %	0 %	75 %	25 %	116747656
4107	NC_008554	GAA	2	6	241111	241116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747656
4108	NC_008554	AGGT	2	8	241125	241132	25 %	25 %	50 %	0 %	116747656
4109	NC_008554	TTTG	2	8	241162	241169	0 %	75 %	25 %	0 %	116747656
4110	NC_008554	CGG	2	6	241309	241314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747656
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4116	NC_008554	CAAG	2	8	241583	241590	50 %	0 %	25 %	25 %	116747657
4117	NC_008554	GGC	2	6	241662	241667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747657
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4121	NC_008554	TGG	2	6	241846	241851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747657
4122	NC_008554	TCT	3	9	242125	242133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747657
4123	NC_008554	CGC	2	6	242153	242158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747657
4124	NC_008554	GGC	2	6	242198	242203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747657
4125	NC_008554	CGG	2	6	242209	242214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747657
4126	NC_008554	TGA	2	6	242239	242244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747657
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4129	NC_008554	TGA	2	6	242500	242505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747657
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4132	NC_008554	GAT	2	6	242558	242563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747657
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4134	NC_008554	GGC	2	6	242621	242626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747657
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4150	NC_008554	ATG	3	9	243309	243317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747658
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4154	NC_008554	TCCC	2	8	243542	243549	0 %	25 %	0 %	75 %	116747658
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4160	NC_008554	TGG	2	6	243775	243780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747658
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4162	NC_008554	ATG	2	6	243882	243887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747658
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4229	NC_008554	CAG	2	6	247173	247178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747660
4230	NC_008554	AG	3	6	247234	247239	50 %	0 %	50 %	0 %	116747660
4231	NC_008554	CCT	2	6	247296	247301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747660
4232	NC_008554	CG	3	6	247324	247329	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
4233	NC_008554	GGC	2	6	247468	247473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747660
4234	NC_008554	CG	4	8	247493	247500	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
4235	NC_008554	CTC	2	6	247566	247571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747660
4236	NC_008554	AATGC	2	10	247648	247657	40 %	20 %	20 %	20 %	116747660
4237	NC_008554	GCCG	2	8	247674	247681	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
4238	NC_008554	GAGC	2	8	247682	247689	25 %	0 %	50 %	25 %	116747660
4239	NC_008554	CGC	2	6	247927	247932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747661
4240	NC_008554	AGGA	2	8	248121	248128	50 %	0 %	50 %	0 %	116747661
4241	NC_008554	TTC	2	6	248131	248136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747661
4242	NC_008554	GTT	2	6	248249	248254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747661
4243	NC_008554	G	6	6	248260	248265	0 %	0 %	100 %	0 %	116747661
4244	NC_008554	GGTTGC	2	12	248285	248296	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116747661
4245	NC_008554	GTG	2	6	248298	248303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747661
4246	NC_008554	GGC	2	6	248312	248317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
4247	NC_008554	GGC	2	6	248502	248507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
4248	NC_008554	GCG	2	6	248523	248528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
4249	NC_008554	CTC	2	6	248563	248568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747661
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4252	NC_008554	GTC	2	6	248631	248636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747661
4253	NC_008554	GCG	2	6	248640	248645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
4254	NC_008554	TCA	2	6	248662	248667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747661
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4259	NC_008554	TGG	2	6	248776	248781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747661
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4263	NC_008554	AATC	2	8	249220	249227	50 %	25 %	0 %	25 %	116747662
4264	NC_008554	AAG	3	9	249269	249277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747662
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4270	NC_008554	GC	3	6	249618	249623	0 %	0 %	50 %	50 %	116747662
4271	NC_008554	CGG	2	6	249725	249730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747662
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4273	NC_008554	GAA	3	9	249853	249861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747662
4274	NC_008554	TCA	2	6	249882	249887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747662
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4322	NC_008554	ACG	2	6	251930	251935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747663
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4350	NC_008554	GGA	2	6	253302	253307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747665
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4352	NC_008554	GAG	2	6	253381	253386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747665
4353	NC_008554	GCC	2	6	253411	253416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747665
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4487	NC_008554	CGA	2	6	262078	262083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747670
4488	NC_008554	CGG	2	6	262102	262107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747670
4489	NC_008554	CCAG	2	8	262131	262138	25 %	0 %	25 %	50 %	116747670
4490	NC_008554	GCG	2	6	262139	262144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747670
4491	NC_008554	TCC	2	6	262214	262219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747670
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