MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 84118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008554	GAGAT	2	10	179322	179331	40 %	20 %	40 %	0 %	116747596
3002	NC_008554	CGT	2	6	179396	179401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747596
3003	NC_008554	GCC	2	6	179939	179944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747597
3004	NC_008554	CGA	2	6	179959	179964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747597
3005	NC_008554	ATTAA	2	10	179972	179981	60 %	40 %	0 %	0 %	116747597
3006	NC_008554	GAC	2	6	179984	179989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747597
3007	NC_008554	GGA	2	6	180154	180159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747597
3008	NC_008554	GGT	3	9	180211	180219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747597
3009	NC_008554	GAAA	2	8	180241	180248	75 %	0 %	25 %	0 %	116747597
3010	NC_008554	CAGG	2	8	180257	180264	25 %	0 %	50 %	25 %	116747597
3011	NC_008554	CCT	2	6	180268	180273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747597
3012	NC_008554	GCA	2	6	180286	180291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747597
3013	NC_008554	ATC	2	6	180300	180305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747597
3014	NC_008554	ATCG	2	8	180323	180330	25 %	25 %	25 %	25 %	116747597
3015	NC_008554	GAA	2	6	180370	180375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747597
3016	NC_008554	A	6	6	180374	180379	100 %	0 %	0 %	0 %	116747597
3017	NC_008554	CTT	2	6	180452	180457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747598
3018	NC_008554	GCGG	2	8	180521	180528	0 %	0 %	75 %	25 %	116747598
3019	NC_008554	A	7	7	180531	180537	100 %	0 %	0 %	0 %	116747598
3020	NC_008554	CCCA	2	8	180546	180553	25 %	0 %	0 %	75 %	116747598
3021	NC_008554	CGAT	2	8	180620	180627	25 %	25 %	25 %	25 %	116747598
3022	NC_008554	GTG	2	6	180658	180663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747598
3023	NC_008554	GC	3	6	180716	180721	0 %	0 %	50 %	50 %	116747598
3024	NC_008554	TGC	2	6	180740	180745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747598
3025	NC_008554	GCC	2	6	180760	180765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747598
3026	NC_008554	CATC	2	8	180768	180775	25 %	25 %	0 %	50 %	116747598
3027	NC_008554	CTC	2	6	180820	180825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747598
3028	NC_008554	GGAT	2	8	180833	180840	25 %	25 %	50 %	0 %	116747598
3029	NC_008554	CTG	2	6	180934	180939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747598
3030	NC_008554	CGC	2	6	180975	180980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747598
3031	NC_008554	AGG	2	6	181028	181033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747598
3032	NC_008554	T	6	6	181110	181115	0 %	100 %	0 %	0 %	116747598
3033	NC_008554	TG	3	6	181118	181123	0 %	50 %	50 %	0 %	116747598
3034	NC_008554	GCT	2	6	181155	181160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747598
3035	NC_008554	G	8	8	181182	181189	0 %	0 %	100 %	0 %	116747598
3036	NC_008554	CGG	2	6	181209	181214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747598
3037	NC_008554	GTG	2	6	181229	181234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747598
3038	NC_008554	CTG	2	6	181246	181251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747598
3039	NC_008554	TTCG	2	8	181300	181307	0 %	50 %	25 %	25 %	116747598
3040	NC_008554	GTC	2	6	181310	181315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747598
3041	NC_008554	GCC	2	6	181320	181325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747598
3042	NC_008554	TCC	2	6	181468	181473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747599
3043	NC_008554	GTTCT	2	10	181476	181485	0 %	60 %	20 %	20 %	116747599
3044	NC_008554	CTA	2	6	181496	181501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747599
3045	NC_008554	CGC	2	6	181553	181558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747599
3046	NC_008554	G	6	6	181563	181568	0 %	0 %	100 %	0 %	116747599
3047	NC_008554	TGG	2	6	181597	181602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747599
3048	NC_008554	ACG	2	6	181618	181623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747599
3049	NC_008554	GAA	2	6	181634	181639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747599
3050	NC_008554	GCT	2	6	181664	181669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747599
3051	NC_008554	CGT	2	6	181682	181687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747599
3052	NC_008554	AGG	2	6	181711	181716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747599
3053	NC_008554	CTG	2	6	181797	181802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747599
3054	NC_008554	GGGA	2	8	181946	181953	25 %	0 %	75 %	0 %	116747599
3055	NC_008554	CG	3	6	181958	181963	0 %	0 %	50 %	50 %	116747599
3056	NC_008554	A	6	6	181978	181983	100 %	0 %	0 %	0 %	116747599
3057	NC_008554	ATC	2	6	181995	182000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747599
3058	NC_008554	AGG	2	6	182140	182145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747599
3059	NC_008554	CGGC	2	8	182260	182267	0 %	0 %	50 %	50 %	116747600
3060	NC_008554	TTC	2	6	182322	182327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747600
3061	NC_008554	CCCG	2	8	182373	182380	0 %	0 %	25 %	75 %	116747600
3062	NC_008554	A	6	6	182382	182387	100 %	0 %	0 %	0 %	116747600
3063	NC_008554	CCG	2	6	182394	182399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747600
3064	NC_008554	TTC	2	6	182406	182411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747600
3065	NC_008554	GCC	2	6	182462	182467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747600
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3068	NC_008554	GAA	2	6	182588	182593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747600
3069	NC_008554	ACC	2	6	182615	182620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747600
3070	NC_008554	GAG	2	6	182669	182674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747600
3071	NC_008554	AAC	2	6	182696	182701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747600
3072	NC_008554	TCGA	2	8	182744	182751	25 %	25 %	25 %	25 %	116747600
3073	NC_008554	TCC	2	6	182757	182762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747600
3074	NC_008554	CGG	2	6	182814	182819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747600
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3078	NC_008554	CGG	2	6	182968	182973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747600
3079	NC_008554	GTC	2	6	183017	183022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747600
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3081	NC_008554	CAT	2	6	183088	183093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747600
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3084	NC_008554	GGA	2	6	183136	183141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747600
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3092	NC_008554	GCC	2	6	183494	183499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747600
3093	NC_008554	CCTG	2	8	183512	183519	0 %	25 %	25 %	50 %	116747600
3094	NC_008554	CGC	2	6	183550	183555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747601
3095	NC_008554	CAG	2	6	183563	183568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747601
3096	NC_008554	TCT	2	6	183733	183738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747601
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3098	NC_008554	AGC	2	6	183798	183803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747601
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3101	NC_008554	TGA	2	6	183895	183900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747601
3102	NC_008554	CGGG	2	8	183949	183956	0 %	0 %	75 %	25 %	116747601
3103	NC_008554	GGC	3	9	183998	184006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747601
3104	NC_008554	GGC	2	6	184145	184150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747601
3105	NC_008554	CCG	2	6	184225	184230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747601
3106	NC_008554	ACGG	2	8	184275	184282	25 %	0 %	50 %	25 %	116747601
3107	NC_008554	ACC	2	6	184308	184313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747601
3108	NC_008554	GAAA	2	8	184392	184399	75 %	0 %	25 %	0 %	116747601
3109	NC_008554	AGC	2	6	184422	184427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747601
3110	NC_008554	CTT	2	6	184433	184438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747601
3111	NC_008554	GCA	2	6	184543	184548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747601
3112	NC_008554	TGA	3	9	184576	184584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747601
3113	NC_008554	CGTC	2	8	184636	184643	0 %	25 %	25 %	50 %	116747601
3114	NC_008554	ATG	2	6	184665	184670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747601
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3117	NC_008554	ATC	2	6	184773	184778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747601
3118	NC_008554	ATGCC	2	10	184794	184803	20 %	20 %	20 %	40 %	116747601
3119	NC_008554	GGA	2	6	184809	184814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747601
3120	NC_008554	CAG	2	6	184826	184831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747601
3121	NC_008554	AAGG	2	8	184880	184887	50 %	0 %	50 %	0 %	116747601
3122	NC_008554	TAA	2	6	184911	184916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116747601
3123	NC_008554	CGC	2	6	184944	184949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747601
3124	NC_008554	TGGT	2	8	184996	185003	0 %	50 %	50 %	0 %	116747601
3125	NC_008554	GGGAG	2	10	185029	185038	20 %	0 %	80 %	0 %	116747602
3126	NC_008554	CTC	2	6	185110	185115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747602
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3128	NC_008554	GTT	2	6	185179	185184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747602
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3131	NC_008554	ATC	2	6	185446	185451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747602
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3134	NC_008554	GAA	2	6	185542	185547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747602
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3136	NC_008554	CATGC	2	10	185730	185739	20 %	20 %	20 %	40 %	116747602
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3148	NC_008554	ACCC	2	8	186502	186509	25 %	0 %	0 %	75 %	116747602
3149	NC_008554	AAC	2	6	186512	186517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747602
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3151	NC_008554	CG	3	6	186530	186535	0 %	0 %	50 %	50 %	116747602
3152	NC_008554	AGT	2	6	186579	186584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747602
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3154	NC_008554	TGA	2	6	186618	186623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747602
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3156	NC_008554	GC	3	6	186658	186663	0 %	0 %	50 %	50 %	116747602
3157	NC_008554	GGC	2	6	186936	186941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747603
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3232	NC_008554	GAT	2	6	190735	190740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747606
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3235	NC_008554	CAG	2	6	190913	190918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747606
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3237	NC_008554	CTT	2	6	191017	191022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747607
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3240	NC_008554	TCG	2	6	191228	191233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747607
3241	NC_008554	GTG	2	6	191236	191241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747607
3242	NC_008554	CCTC	2	8	191253	191260	0 %	25 %	0 %	75 %	116747607
3243	NC_008554	GTG	2	6	191299	191304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747607
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3369	NC_008554	TGA	2	6	198367	198372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747615
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3484	NC_008554	CCGAA	2	10	204109	204118	40 %	0 %	20 %	40 %	116747619
3485	NC_008554	GTC	2	6	204138	204143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747619
3486	NC_008554	GC	3	6	204213	204218	0 %	0 %	50 %	50 %	116747619
3487	NC_008554	GAA	2	6	204333	204338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747619
3488	NC_008554	TGG	2	6	204343	204348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747619
3489	NC_008554	ATCT	2	8	204366	204373	25 %	50 %	0 %	25 %	116747619
3490	NC_008554	CGG	2	6	204861	204866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747620
3491	NC_008554	CG	3	6	204874	204879	0 %	0 %	50 %	50 %	116747620
3492	NC_008554	CCT	2	6	204888	204893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747620
3493	NC_008554	GGA	2	6	205096	205101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747620
3494	NC_008554	CT	3	6	205127	205132	0 %	50 %	0 %	50 %	116747620
3495	NC_008554	GAT	2	6	205171	205176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747620
3496	NC_008554	CGC	2	6	205197	205202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747620
3497	NC_008554	TCG	2	6	205262	205267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747620
3498	NC_008554	GCG	2	6	205296	205301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747620
3499	NC_008554	CGA	2	6	205333	205338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747620
3500	NC_008554	TTC	2	6	205339	205344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747620

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