MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008533	GTT	3	9	215568	215576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516814
3502	NC_008533	CCA	2	6	215579	215584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516814
3503	NC_008533	TTG	2	6	215642	215647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516814
3504	NC_008533	TTC	2	6	215662	215667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516814
3505	NC_008533	CTT	2	6	215677	215682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516814
3506	NC_008533	ATT	2	6	215782	215787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516814
3507	NC_008533	ATC	2	6	215797	215802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516814
3508	NC_008533	GAA	2	6	215850	215855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516814
3509	NC_008533	AAG	2	6	215884	215889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516814
3510	NC_008533	T	7	7	215955	215961	0 %	100 %	0 %	0 %	116516814
3511	NC_008533	TAA	2	6	215967	215972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516814
3512	NC_008533	TGA	2	6	216066	216071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515816
3513	NC_008533	CATAAT	2	12	216072	216083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116515816
3514	NC_008533	AGTG	2	8	216088	216095	25 %	25 %	50 %	0 %	116515816
3515	NC_008533	TAG	2	6	216159	216164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515816
3516	NC_008533	CTT	2	6	216189	216194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515816
3517	NC_008533	GA	3	6	216195	216200	50 %	0 %	50 %	0 %	116515816
3518	NC_008533	TAA	2	6	216201	216206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515816
3519	NC_008533	T	6	6	216244	216249	0 %	100 %	0 %	0 %	116515816
3520	NC_008533	AGC	2	6	216256	216261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515816
3521	NC_008533	CTT	2	6	216285	216290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515816
3522	NC_008533	ACT	2	6	216299	216304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515816
3523	NC_008533	CTG	2	6	216336	216341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515816
3524	NC_008533	AG	3	6	216352	216357	50 %	0 %	50 %	0 %	116515816
3525	NC_008533	ATC	2	6	216571	216576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516973
3526	NC_008533	ACC	2	6	216583	216588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516973
3527	NC_008533	AGA	2	6	216628	216633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516973
3528	NC_008533	CAG	2	6	216645	216650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516973
3529	NC_008533	TTC	2	6	217351	217356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516144
3530	NC_008533	AT	3	6	217518	217523	50 %	50 %	0 %	0 %	116516144
3531	NC_008533	TGG	2	6	217631	217636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517186
3532	NC_008533	TCCA	2	8	217690	217697	25 %	25 %	0 %	50 %	116517186
3533	NC_008533	TAA	2	6	217714	217719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517186
3534	NC_008533	TGA	2	6	217742	217747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517186
3535	NC_008533	AGT	2	6	217754	217759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517186
3536	NC_008533	AATG	2	8	217884	217891	50 %	25 %	25 %	0 %	116517186
3537	NC_008533	TAA	2	6	217896	217901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517186
3538	NC_008533	T	6	6	217927	217932	0 %	100 %	0 %	0 %	116517186
3539	NC_008533	CAA	2	6	218013	218018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517186
3540	NC_008533	AGT	2	6	218023	218028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517186
3541	NC_008533	GT	3	6	218039	218044	0 %	50 %	50 %	0 %	116517186
3542	NC_008533	CCT	2	6	218108	218113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116517186
3543	NC_008533	TTC	2	6	218137	218142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517186
3544	NC_008533	TAA	2	6	218172	218177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517186
3545	NC_008533	TCT	2	6	218180	218185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517186
3546	NC_008533	TTC	2	6	218194	218199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517186
3547	NC_008533	TC	3	6	218217	218222	0 %	50 %	0 %	50 %	116517186
3548	NC_008533	T	6	6	218238	218243	0 %	100 %	0 %	0 %	116517186
3549	NC_008533	A	7	7	218306	218312	100 %	0 %	0 %	0 %	116517186
3550	NC_008533	AAT	2	6	218365	218370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517186
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3552	NC_008533	TTA	2	6	218642	218647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516292
3553	NC_008533	AG	3	6	218651	218656	50 %	0 %	50 %	0 %	116516292
3554	NC_008533	AAT	2	6	218773	218778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516292
3555	NC_008533	GCAA	2	8	218823	218830	50 %	0 %	25 %	25 %	116516292
3556	NC_008533	A	6	6	218829	218834	100 %	0 %	0 %	0 %	116516292
3557	NC_008533	T	6	6	218861	218866	0 %	100 %	0 %	0 %	116516292
3558	NC_008533	TAT	2	6	218902	218907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516292
3559	NC_008533	TGG	2	6	218914	218919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516292
3560	NC_008533	TTA	2	6	218957	218962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516292
3561	NC_008533	TTG	2	6	219000	219005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516292
3562	NC_008533	AT	3	6	219073	219078	50 %	50 %	0 %	0 %	116516292
3563	NC_008533	CAG	2	6	219081	219086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516292
3564	NC_008533	AAG	2	6	219145	219150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516292
3565	NC_008533	AAGTC	2	10	219160	219169	40 %	20 %	20 %	20 %	116516292
3566	NC_008533	TAA	2	6	219177	219182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516292
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3568	NC_008533	TAT	2	6	219314	219319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517202
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3570	NC_008533	TAG	2	6	219379	219384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517202
3571	NC_008533	ATT	2	6	219503	219508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517202
3572	NC_008533	TGA	2	6	219520	219525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517202
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3574	NC_008533	GCA	2	6	219563	219568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116517202
3575	NC_008533	TGA	2	6	219589	219594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517202
3576	NC_008533	TAG	2	6	219639	219644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517202
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3579	NC_008533	TGT	2	6	219995	220000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517202
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3581	NC_008533	AAG	2	6	220023	220028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517202
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3586	NC_008533	GTGA	2	8	220242	220249	25 %	25 %	50 %	0 %	116517202
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3591	NC_008533	CT	3	6	220664	220669	0 %	50 %	0 %	50 %	116516692
3592	NC_008533	TTCA	2	8	220673	220680	25 %	50 %	0 %	25 %	116516692
3593	NC_008533	ATC	2	6	220685	220690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516692
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3597	NC_008533	GTTT	2	8	220823	220830	0 %	75 %	25 %	0 %	116515458
3598	NC_008533	GCA	2	6	220834	220839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515458
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3602	NC_008533	TAT	2	6	221131	221136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516696
3603	NC_008533	GATG	2	8	221143	221150	25 %	25 %	50 %	0 %	116516696
3604	NC_008533	GAT	2	6	221170	221175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516696
3605	NC_008533	AGT	2	6	221242	221247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516696
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3607	NC_008533	TATCTG	2	12	221451	221462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116516696
3608	NC_008533	ATC	2	6	221482	221487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516696
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3613	NC_008533	TA	3	6	221718	221723	50 %	50 %	0 %	0 %	116516696
3614	NC_008533	TGG	2	6	221855	221860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516696
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3621	NC_008533	TTA	2	6	222341	222346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516696
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3991	NC_008533	TGA	2	6	245099	245104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515399
3992	NC_008533	AGT	2	6	245174	245179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515399
3993	NC_008533	GTTGCT	2	12	245205	245216	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116515399
3994	NC_008533	AGT	2	6	245264	245269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515399
3995	NC_008533	AAGAC	2	10	245270	245279	60 %	0 %	20 %	20 %	116515399
3996	NC_008533	TGAAG	2	10	245391	245400	40 %	20 %	40 %	0 %	116515399
3997	NC_008533	AAGTC	2	10	245465	245474	40 %	20 %	20 %	20 %	116515399
3998	NC_008533	GGC	2	6	245505	245510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116515399
3999	NC_008533	TCG	2	6	245545	245550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515399
4000	NC_008533	AGC	2	6	245559	245564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515399

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