MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_008533	ATG	2	6	2003117	2003122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516436
33503	NC_008533	CCA	2	6	2003163	2003168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516436
33504	NC_008533	AAC	2	6	2003240	2003245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516436
33505	NC_008533	CCT	2	6	2003627	2003632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116517002
33506	NC_008533	TGA	2	6	2003645	2003650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517002
33507	NC_008533	GTT	2	6	2003656	2003661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517002
33508	NC_008533	TCATC	2	10	2003714	2003723	20 %	40 %	0 %	40 %	116517002
33509	NC_008533	AGGT	2	8	2003770	2003777	25 %	25 %	50 %	0 %	116517002
33510	NC_008533	TTC	2	6	2004003	2004008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517002
33511	NC_008533	CTGA	2	8	2004029	2004036	25 %	25 %	25 %	25 %	116517002
33512	NC_008533	GATTA	2	10	2004054	2004063	40 %	40 %	20 %	0 %	116517002
33513	NC_008533	GGT	2	6	2004069	2004074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517002
33514	NC_008533	ATT	2	6	2004199	2004204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517002
33515	NC_008533	TGTC	2	8	2004229	2004236	0 %	50 %	25 %	25 %	116516189
33516	NC_008533	TCT	2	6	2004240	2004245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516189
33517	NC_008533	TGA	2	6	2004403	2004408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516189
33518	NC_008533	CTT	2	6	2004421	2004426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516189
33519	NC_008533	T	6	6	2004455	2004460	0 %	100 %	0 %	0 %	116516189
33520	NC_008533	CTT	3	9	2004484	2004492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516189
33521	NC_008533	GTT	2	6	2004512	2004517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516189
33522	NC_008533	GAT	2	6	2004521	2004526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516189
33523	NC_008533	TAG	2	6	2004537	2004542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516189
33524	NC_008533	GTA	2	6	2004623	2004628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516189
33525	NC_008533	TTGAGT	2	12	2004670	2004681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116516189
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33527	NC_008533	GA	3	6	2004829	2004834	50 %	0 %	50 %	0 %	116516189
33528	NC_008533	CAA	2	6	2004856	2004861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516189
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33533	NC_008533	CTT	2	6	2005091	2005096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516189
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33538	NC_008533	AGGC	2	8	2005476	2005483	25 %	0 %	50 %	25 %	116515916
33539	NC_008533	GAT	2	6	2005593	2005598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515916
33540	NC_008533	GTT	3	9	2005606	2005614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515916
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33542	NC_008533	GTC	2	6	2005973	2005978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516871
33543	NC_008533	TCA	2	6	2006000	2006005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516871
33544	NC_008533	TC	3	6	2006016	2006021	0 %	50 %	0 %	50 %	116516871
33545	NC_008533	ATTT	2	8	2006026	2006033	25 %	75 %	0 %	0 %	116516871
33546	NC_008533	CCT	2	6	2006058	2006063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516871
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33549	NC_008533	CTT	2	6	2006157	2006162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516871
33550	NC_008533	TGCT	2	8	2006244	2006251	0 %	50 %	25 %	25 %	116516871
33551	NC_008533	CGT	2	6	2006554	2006559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516664
33552	NC_008533	AAT	2	6	2006589	2006594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516664
33553	NC_008533	ATA	2	6	2006650	2006655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516664
33554	NC_008533	ATA	2	6	2006710	2006715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516664
33555	NC_008533	ATTTG	2	10	2006758	2006767	20 %	60 %	20 %	0 %	116516664
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33557	NC_008533	TAT	2	6	2006814	2006819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516664
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33561	NC_008533	CGA	2	6	2006897	2006902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516664
33562	NC_008533	TC	3	6	2006973	2006978	0 %	50 %	0 %	50 %	116516664
33563	NC_008533	ATA	2	6	2006983	2006988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516664
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33571	NC_008533	ACTA	2	8	2007235	2007242	50 %	25 %	0 %	25 %	116516664
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33589	NC_008533	GGAT	2	8	2008064	2008071	25 %	25 %	50 %	0 %	116515580
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33967	NC_008533	ATG	2	6	2026888	2026893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516624
33968	NC_008533	CAT	2	6	2026974	2026979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516624
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33971	NC_008533	ATA	2	6	2027045	2027050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516624
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33986	NC_008533	GTTT	2	8	2027803	2027810	0 %	75 %	25 %	0 %	116516624
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33989	NC_008533	AAT	2	6	2027891	2027896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516624
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33996	NC_008533	CTG	2	6	2028230	2028235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515448
33997	NC_008533	TCAA	2	8	2028271	2028278	50 %	25 %	0 %	25 %	116515448
33998	NC_008533	GATT	2	8	2028283	2028290	25 %	50 %	25 %	0 %	116515448
33999	NC_008533	AAC	2	6	2028304	2028309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515448
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