MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008533	GAT	2	6	301852	301857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515442
5002	NC_008533	A	6	6	301996	302001	100 %	0 %	0 %	0 %	116516218
5003	NC_008533	A	6	6	302005	302010	100 %	0 %	0 %	0 %	116516218
5004	NC_008533	TAC	2	6	302020	302025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516218
5005	NC_008533	TAT	2	6	302108	302113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516218
5006	NC_008533	GAAAA	2	10	302178	302187	80 %	0 %	20 %	0 %	116516218
5007	NC_008533	CAAG	2	8	302204	302211	50 %	0 %	25 %	25 %	116516218
5008	NC_008533	GAAA	2	8	302243	302250	75 %	0 %	25 %	0 %	116516218
5009	NC_008533	TAT	2	6	302401	302406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517037
5010	NC_008533	T	7	7	302425	302431	0 %	100 %	0 %	0 %	116517037
5011	NC_008533	ATT	2	6	302448	302453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517037
5012	NC_008533	GAAG	2	8	302486	302493	50 %	0 %	50 %	0 %	116517037
5013	NC_008533	AAG	2	6	302496	302501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5014	NC_008533	TCA	2	6	302504	302509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517037
5015	NC_008533	ACC	2	6	302511	302516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116517037
5016	NC_008533	TGA	2	6	302609	302614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517037
5017	NC_008533	A	6	6	302653	302658	100 %	0 %	0 %	0 %	116517037
5018	NC_008533	GAA	2	6	302706	302711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5019	NC_008533	AG	3	6	302721	302726	50 %	0 %	50 %	0 %	116517037
5020	NC_008533	CAAG	2	8	302747	302754	50 %	0 %	25 %	25 %	116517037
5021	NC_008533	ATG	2	6	302796	302801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517037
5022	NC_008533	A	6	6	302808	302813	100 %	0 %	0 %	0 %	116517037
5023	NC_008533	GATT	2	8	302840	302847	25 %	50 %	25 %	0 %	116517037
5024	NC_008533	AGCTC	2	10	302909	302918	20 %	20 %	20 %	40 %	116517037
5025	NC_008533	ATT	2	6	303006	303011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517037
5026	NC_008533	GAACA	2	10	303049	303058	60 %	0 %	20 %	20 %	116517037
5027	NC_008533	AACG	2	8	303067	303074	50 %	0 %	25 %	25 %	116517037
5028	NC_008533	GATG	2	8	303137	303144	25 %	25 %	50 %	0 %	116517037
5029	NC_008533	CAA	2	6	303217	303222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517037
5030	NC_008533	CGAC	2	8	303228	303235	25 %	0 %	25 %	50 %	116517037
5031	NC_008533	AAG	2	6	303253	303258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5032	NC_008533	TTTG	2	8	303273	303280	0 %	75 %	25 %	0 %	116517037
5033	NC_008533	TGA	2	6	303331	303336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517037
5034	NC_008533	GCT	3	9	303342	303350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517037
5035	NC_008533	ATA	3	9	303355	303363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517037
5036	NC_008533	AGG	2	6	303371	303376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116517037
5037	NC_008533	TAG	2	6	303389	303394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517037
5038	NC_008533	TGG	2	6	303452	303457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517037
5039	NC_008533	ATG	2	6	303462	303467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517037
5040	NC_008533	CCT	2	6	303512	303517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116517037
5041	NC_008533	ATA	2	6	303628	303633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517037
5042	NC_008533	TTA	2	6	303745	303750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517037
5043	NC_008533	CACAG	2	10	303897	303906	40 %	0 %	20 %	40 %	116517037
5044	NC_008533	AACTGT	2	12	303914	303925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116517037
5045	NC_008533	TGG	2	6	303983	303988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517037
5046	NC_008533	CAA	2	6	304077	304082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517037
5047	NC_008533	ATT	2	6	304090	304095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517037
5048	NC_008533	CT	3	6	304157	304162	0 %	50 %	0 %	50 %	116517037
5049	NC_008533	ACA	2	6	304173	304178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517037
5050	NC_008533	AAGT	2	8	304195	304202	50 %	25 %	25 %	0 %	116517037
5051	NC_008533	CAA	2	6	304203	304208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517037
5052	NC_008533	AGA	2	6	304259	304264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5053	NC_008533	CTG	2	6	304327	304332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517037
5054	NC_008533	AAG	2	6	304333	304338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5055	NC_008533	GAA	2	6	304340	304345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517037
5056	NC_008533	CTTAT	2	10	304368	304377	20 %	60 %	0 %	20 %	116517037
5057	NC_008533	AGG	2	6	304390	304395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116517037
5058	NC_008533	CTG	2	6	304426	304431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517037
5059	NC_008533	A	7	7	304533	304539	100 %	0 %	0 %	0 %	116517037
5060	NC_008533	TAG	2	6	304610	304615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515948
5061	NC_008533	CAG	2	6	304663	304668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515948
5062	NC_008533	GGTTT	2	10	304723	304732	0 %	60 %	40 %	0 %	116515948
5063	NC_008533	CTTT	2	8	304757	304764	0 %	75 %	0 %	25 %	116515948
5064	NC_008533	TAG	2	6	304776	304781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515948
5065	NC_008533	AAT	2	6	304792	304797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515948
5066	NC_008533	TCT	2	6	304934	304939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515948
5067	NC_008533	CTGT	2	8	304969	304976	0 %	50 %	25 %	25 %	116515948
5068	NC_008533	TTC	2	6	305014	305019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515948
5069	NC_008533	GTTT	2	8	305105	305112	0 %	75 %	25 %	0 %	116515948
5070	NC_008533	TTC	2	6	305153	305158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515948
5071	NC_008533	TGG	2	6	305178	305183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515948
5072	NC_008533	TTC	2	6	305194	305199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515948
5073	NC_008533	CCA	2	6	305289	305294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515948
5074	NC_008533	CT	3	6	305303	305308	0 %	50 %	0 %	50 %	116515948
5075	NC_008533	AAC	2	6	305337	305342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515948
5076	NC_008533	ATG	2	6	305350	305355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515948
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5080	NC_008533	TAA	2	6	306115	306120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515968
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5082	NC_008533	GAT	2	6	306134	306139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515968
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5084	NC_008533	CAA	2	6	306290	306295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515968
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5088	NC_008533	GAA	2	6	306611	306616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515968
5089	NC_008533	AAG	2	6	306645	306650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515968
5090	NC_008533	CTT	2	6	306667	306672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515968
5091	NC_008533	TGA	2	6	306673	306678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515968
5092	NC_008533	TGG	2	6	306709	306714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515968
5093	NC_008533	CT	4	8	306756	306763	0 %	50 %	0 %	50 %	116515968
5094	NC_008533	CAA	2	6	306789	306794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515968
5095	NC_008533	GAA	2	6	306823	306828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515968
5096	NC_008533	TGC	2	6	306829	306834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515968
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5103	NC_008533	GCT	2	6	307043	307048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515968
5104	NC_008533	GGC	2	6	307054	307059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116515968
5105	NC_008533	CAAG	2	8	307117	307124	50 %	0 %	25 %	25 %	116515968
5106	NC_008533	AGA	2	6	307141	307146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515968
5107	NC_008533	AGC	2	6	307153	307158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515968
5108	NC_008533	GGAAA	2	10	307189	307198	60 %	0 %	40 %	0 %	116515968
5109	NC_008533	CA	3	6	307208	307213	50 %	0 %	0 %	50 %	116515968
5110	NC_008533	TGA	2	6	307414	307419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515968
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5114	NC_008533	TTA	2	6	307701	307706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515968
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5119	NC_008533	CTT	2	6	307873	307878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515968
5120	NC_008533	AAGA	2	8	307994	308001	75 %	0 %	25 %	0 %	116515968
5121	NC_008533	AGTC	2	8	308014	308021	25 %	25 %	25 %	25 %	116515968
5122	NC_008533	AGA	2	6	308044	308049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515968
5123	NC_008533	ACG	2	6	308055	308060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515968
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5131	NC_008533	GTA	2	6	309106	309111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516184
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5154	NC_008533	GAA	2	6	310275	310280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516184
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5232	NC_008533	A	7	7	315731	315737	100 %	0 %	0 %	0 %	116516159
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5494	NC_008533	AAAG	2	8	325961	325968	75 %	0 %	25 %	0 %	116516033
5495	NC_008533	TA	3	6	325987	325992	50 %	50 %	0 %	0 %	116516033
5496	NC_008533	A	6	6	326007	326012	100 %	0 %	0 %	0 %	116516033
5497	NC_008533	AAG	2	6	326045	326050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516033
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