MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008532	T	7	7	244923	244929	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
3502	NC_008532	GAG	2	6	244930	244935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627171
3503	NC_008532	CTG	2	6	245021	245026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
3504	NC_008532	ATTGA	2	10	245071	245080	40 %	40 %	20 %	0 %	116627171
3505	NC_008532	T	6	6	245107	245112	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
3506	NC_008532	AAT	2	6	245113	245118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627171
3507	NC_008532	TAT	2	6	245121	245126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
3508	NC_008532	A	6	6	245168	245173	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
3509	NC_008532	TC	3	6	245191	245196	0 %	50 %	0 %	50 %	116627171
3510	NC_008532	AGA	2	6	245238	245243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
3511	NC_008532	GCT	2	6	245257	245262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
3512	NC_008532	TTTGA	2	10	245344	245353	20 %	60 %	20 %	0 %	116627171
3513	NC_008532	TTTTGA	2	12	245385	245396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116627171
3514	NC_008532	TGT	2	6	245403	245408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627171
3515	NC_008532	GAT	2	6	245704	245709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3516	NC_008532	TGA	2	6	245790	245795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3517	NC_008532	GCC	2	6	245878	245883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116627171
3518	NC_008532	CT	3	6	245898	245903	0 %	50 %	0 %	50 %	116627171
3519	NC_008532	AGA	2	6	245931	245936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
3520	NC_008532	AAGA	2	8	246023	246030	75 %	0 %	25 %	0 %	116627171
3521	NC_008532	TGG	2	6	246069	246074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
3522	NC_008532	CGA	2	6	246084	246089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627171
3523	NC_008532	A	6	6	246208	246213	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
3524	NC_008532	CTC	2	6	246218	246223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627171
3525	NC_008532	TGA	2	6	246264	246269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3526	NC_008532	AGA	2	6	246279	246284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
3527	NC_008532	ATT	3	9	246292	246300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
3528	NC_008532	GAA	2	6	246387	246392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
3529	NC_008532	TTG	2	6	246478	246483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627171
3530	NC_008532	A	6	6	246601	246606	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
3531	NC_008532	TTC	2	6	246614	246619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627171
3532	NC_008532	TATT	2	8	246681	246688	25 %	75 %	0 %	0 %	116627171
3533	NC_008532	CAA	2	6	246709	246714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627171
3534	NC_008532	TCG	2	6	246747	246752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
3535	NC_008532	T	6	6	246902	246907	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
3536	NC_008532	GTC	2	6	247001	247006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
3537	NC_008532	G	7	7	247069	247075	0 %	0 %	100 %	0 %	116627171
3538	NC_008532	TGG	2	6	247123	247128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
3539	NC_008532	GAAGA	2	10	247225	247234	60 %	0 %	40 %	0 %	116627171
3540	NC_008532	AAG	2	6	247247	247252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
3541	NC_008532	ACA	2	6	247270	247275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627171
3542	NC_008532	GAC	2	6	247522	247527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627172
3543	NC_008532	CGGA	2	8	247543	247550	25 %	0 %	50 %	25 %	116627172
3544	NC_008532	CTTG	2	8	247555	247562	0 %	50 %	25 %	25 %	116627172
3545	NC_008532	TTTC	2	8	247649	247656	0 %	75 %	0 %	25 %	116627172
3546	NC_008532	GAA	2	6	247746	247751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
3547	NC_008532	ACGT	2	8	247774	247781	25 %	25 %	25 %	25 %	116627172
3548	NC_008532	AAG	2	6	247807	247812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
3549	NC_008532	TCAA	2	8	247814	247821	50 %	25 %	0 %	25 %	116627172
3550	NC_008532	GCT	2	6	247848	247853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627172
3551	NC_008532	TGA	2	6	247930	247935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627172
3552	NC_008532	CAA	2	6	248070	248075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627172
3553	NC_008532	CTT	2	6	248120	248125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627172
3554	NC_008532	AGA	2	6	248210	248215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
3555	NC_008532	GGCTTT	2	12	248299	248310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116627173
3556	NC_008532	TAC	2	6	248360	248365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627173
3557	NC_008532	TCCT	2	8	248403	248410	0 %	50 %	0 %	50 %	116627173
3558	NC_008532	A	7	7	248418	248424	100 %	0 %	0 %	0 %	116627173
3559	NC_008532	ATTG	2	8	248443	248450	25 %	50 %	25 %	0 %	116627173
3560	NC_008532	AAC	2	6	248474	248479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627173
3561	NC_008532	TGA	2	6	248803	248808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
3562	NC_008532	GAT	2	6	248825	248830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
3563	NC_008532	TAT	3	9	248912	248920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
3564	NC_008532	GAA	2	6	248927	248932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627173
3565	NC_008532	ATG	2	6	248934	248939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
3566	NC_008532	ATT	2	6	248957	248962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
3567	NC_008532	ATG	2	6	248997	249002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
3568	NC_008532	GTC	2	6	249039	249044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627173
3569	NC_008532	TGTA	2	8	249081	249088	25 %	50 %	25 %	0 %	116627173
3570	NC_008532	CGT	2	6	249146	249151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627173
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3572	NC_008532	ATC	2	6	249182	249187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627173
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3574	NC_008532	ATT	2	6	249215	249220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
3575	NC_008532	GCA	2	6	249233	249238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627173
3576	NC_008532	TTG	2	6	249264	249269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627173
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3578	NC_008532	CTAT	2	8	249492	249499	25 %	50 %	0 %	25 %	116627173
3579	NC_008532	AT	3	6	249580	249585	50 %	50 %	0 %	0 %	116627173
3580	NC_008532	CTG	2	6	250264	250269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
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3589	NC_008532	CGT	2	6	250662	250667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
3590	NC_008532	AT	3	6	250718	250723	50 %	50 %	0 %	0 %	116627174
3591	NC_008532	AAG	2	6	250765	250770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
3592	NC_008532	AAG	2	6	250825	250830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
3593	NC_008532	CAT	2	6	250845	250850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
3594	NC_008532	AGTA	2	8	250853	250860	50 %	25 %	25 %	0 %	116627174
3595	NC_008532	TCAG	2	8	250883	250890	25 %	25 %	25 %	25 %	116627174
3596	NC_008532	TGA	2	6	250916	250921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627174
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3601	NC_008532	TCG	2	6	251081	251086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
3602	NC_008532	CAT	2	6	251108	251113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
3603	NC_008532	TCT	2	6	251116	251121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
3604	NC_008532	TCTTA	2	10	251126	251135	20 %	60 %	0 %	20 %	116627174
3605	NC_008532	TTA	2	6	251209	251214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627174
3606	NC_008532	GTT	2	6	251258	251263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627174
3607	NC_008532	ATT	2	6	251382	251387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627174
3608	NC_008532	A	6	6	251400	251405	100 %	0 %	0 %	0 %	116627174
3609	NC_008532	AAG	2	6	251452	251457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
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3611	NC_008532	A	6	6	251508	251513	100 %	0 %	0 %	0 %	116627174
3612	NC_008532	CTT	2	6	251549	251554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
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3614	NC_008532	TTG	2	6	251610	251615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627174
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3990	NC_008532	AG	3	6	272578	272583	50 %	0 %	50 %	0 %	116627202
3991	NC_008532	GAT	2	6	272607	272612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627202
3992	NC_008532	TTTA	2	8	272627	272634	25 %	75 %	0 %	0 %	116627202
3993	NC_008532	TGC	2	6	272651	272656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627202
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