MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008532	GCT	2	6	102152	102157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627050
1502	NC_008532	TTA	2	6	102207	102212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627050
1503	NC_008532	TAAAGT	2	12	102290	102301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116627050
1504	NC_008532	TGA	2	6	102631	102636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627051
1505	NC_008532	AAATG	2	10	102646	102655	60 %	20 %	20 %	0 %	116627051
1506	NC_008532	GAC	2	6	102661	102666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627051
1507	NC_008532	AAC	2	6	102668	102673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627051
1508	NC_008532	GAT	2	6	102791	102796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627051
1509	NC_008532	ATG	2	6	102813	102818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627051
1510	NC_008532	CT	3	6	102829	102834	0 %	50 %	0 %	50 %	116627051
1511	NC_008532	CGA	2	6	102897	102902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627051
1512	NC_008532	ATA	2	6	102936	102941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627051
1513	NC_008532	ATC	3	9	102942	102950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627051
1514	NC_008532	TAT	2	6	102953	102958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627051
1515	NC_008532	TGA	2	6	102970	102975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627051
1516	NC_008532	GTT	2	6	103055	103060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627051
1517	NC_008532	TAGT	2	8	103087	103094	25 %	50 %	25 %	0 %	116627051
1518	NC_008532	GTG	2	6	103269	103274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627052
1519	NC_008532	GCT	2	6	103294	103299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627052
1520	NC_008532	GGT	2	6	103376	103381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627052
1521	NC_008532	ATCA	2	8	103386	103393	50 %	25 %	0 %	25 %	116627052
1522	NC_008532	AGA	2	6	103441	103446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627052
1523	NC_008532	CGAA	2	8	103510	103517	50 %	0 %	25 %	25 %	116627052
1524	NC_008532	TTC	2	6	103526	103531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627052
1525	NC_008532	GAAT	2	8	103557	103564	50 %	25 %	25 %	0 %	116627052
1526	NC_008532	AATC	2	8	103585	103592	50 %	25 %	0 %	25 %	116627052
1527	NC_008532	GAT	2	6	103727	103732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627052
1528	NC_008532	ATA	2	6	103745	103750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627052
1529	NC_008532	CTGA	2	8	103784	103791	25 %	25 %	25 %	25 %	116627052
1530	NC_008532	T	6	6	103795	103800	0 %	100 %	0 %	0 %	116627052
1531	NC_008532	TCA	2	6	103836	103841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627052
1532	NC_008532	AATT	2	8	103917	103924	50 %	50 %	0 %	0 %	116627052
1533	NC_008532	CTC	2	6	103962	103967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627052
1534	NC_008532	TGA	2	6	103978	103983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627052
1535	NC_008532	CAGA	2	8	104069	104076	50 %	0 %	25 %	25 %	116627052
1536	NC_008532	AACAA	2	10	104409	104418	80 %	0 %	0 %	20 %	116627053
1537	NC_008532	AGT	2	6	104501	104506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627053
1538	NC_008532	A	6	6	104525	104530	100 %	0 %	0 %	0 %	116627053
1539	NC_008532	CACAC	2	10	104543	104552	40 %	0 %	0 %	60 %	116627053
1540	NC_008532	TTA	2	6	104578	104583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627053
1541	NC_008532	A	6	6	104610	104615	100 %	0 %	0 %	0 %	116627053
1542	NC_008532	CTA	2	6	104630	104635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627053
1543	NC_008532	CACT	2	8	104636	104643	25 %	25 %	0 %	50 %	116627053
1544	NC_008532	GGT	2	6	104655	104660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627053
1545	NC_008532	CAG	2	6	104674	104679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627053
1546	NC_008532	CA	3	6	104740	104745	50 %	0 %	0 %	50 %	116627053
1547	NC_008532	CAA	2	6	104814	104819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627053
1548	NC_008532	GCACAA	2	12	104883	104894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116627054
1549	NC_008532	A	6	6	104973	104978	100 %	0 %	0 %	0 %	116627054
1550	NC_008532	AGA	2	6	104984	104989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627054
1551	NC_008532	CAAC	2	8	105023	105030	50 %	0 %	0 %	50 %	116627054
1552	NC_008532	ACG	2	6	105061	105066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627054
1553	NC_008532	GGT	2	6	105084	105089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627054
1554	NC_008532	CTT	2	6	105138	105143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627054
1555	NC_008532	CTT	2	6	105186	105191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627054
1556	NC_008532	TGG	2	6	106328	106333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627055
1557	NC_008532	GTT	2	6	106348	106353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627055
1558	NC_008532	A	8	8	106416	106423	100 %	0 %	0 %	0 %	116627056
1559	NC_008532	GAT	2	6	106452	106457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627056
1560	NC_008532	AAAC	2	8	106488	106495	75 %	0 %	0 %	25 %	116627056
1561	NC_008532	CTT	2	6	106540	106545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627056
1562	NC_008532	GAA	2	6	106571	106576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627056
1563	NC_008532	TAT	2	6	106577	106582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627056
1564	NC_008532	ATC	2	6	106591	106596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627056
1565	NC_008532	TTA	2	6	106633	106638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627056
1566	NC_008532	GGGA	2	8	106763	106770	25 %	0 %	75 %	0 %	116627056
1567	NC_008532	CTT	2	6	106771	106776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627056
1568	NC_008532	ATC	2	6	106793	106798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627056
1569	NC_008532	TCA	2	6	106805	106810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627056
1570	NC_008532	AGC	2	6	106826	106831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627056
1571	NC_008532	A	7	7	106878	106884	100 %	0 %	0 %	0 %	116627056
1572	NC_008532	GTAGT	2	10	106900	106909	20 %	40 %	40 %	0 %	116627056
1573	NC_008532	CAT	2	6	106969	106974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627056
1574	NC_008532	TAAT	2	8	106993	107000	50 %	50 %	0 %	0 %	116627056
1575	NC_008532	AAT	2	6	107024	107029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627056
1576	NC_008532	GGTTG	2	10	107033	107042	0 %	40 %	60 %	0 %	116627056
1577	NC_008532	TGG	2	6	107054	107059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627056
1578	NC_008532	ACTC	2	8	107068	107075	25 %	25 %	0 %	50 %	116627056
1579	NC_008532	GAT	2	6	107144	107149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627056
1580	NC_008532	TGG	2	6	107150	107155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627056
1581	NC_008532	ATT	2	6	107160	107165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627056
1582	NC_008532	ATT	2	6	107175	107180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627056
1583	NC_008532	TTA	2	6	107200	107205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627056
1584	NC_008532	ATA	2	6	107206	107211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627056
1585	NC_008532	A	6	6	107325	107330	100 %	0 %	0 %	0 %	116627056
1586	NC_008532	TAA	2	6	107363	107368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627056
1587	NC_008532	TCT	2	6	107370	107375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627056
1588	NC_008532	TCTA	2	8	107378	107385	25 %	50 %	0 %	25 %	116627056
1589	NC_008532	A	7	7	107424	107430	100 %	0 %	0 %	0 %	116627056
1590	NC_008532	A	7	7	107474	107480	100 %	0 %	0 %	0 %	116627056
1591	NC_008532	CAA	2	6	107482	107487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627056
1592	NC_008532	ATG	2	6	107557	107562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627056
1593	NC_008532	TAC	2	6	107576	107581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627056
1594	NC_008532	TTG	2	6	107836	107841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627056
1595	NC_008532	TGA	2	6	107921	107926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627056
1596	NC_008532	ATA	2	6	107995	108000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627056
1597	NC_008532	AGT	2	6	108021	108026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627056
1598	NC_008532	AAT	2	6	108027	108032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627056
1599	NC_008532	AAG	2	6	108067	108072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627056
1600	NC_008532	TGT	2	6	109982	109987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627057
1601	NC_008532	ATCA	2	8	110008	110015	50 %	25 %	0 %	25 %	116627057
1602	NC_008532	T	7	7	110036	110042	0 %	100 %	0 %	0 %	116627057
1603	NC_008532	TAT	2	6	110130	110135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627057
1604	NC_008532	GACGA	2	10	110136	110145	40 %	0 %	40 %	20 %	116627057
1605	NC_008532	ATT	2	6	110196	110201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627057
1606	NC_008532	GAAG	2	8	110249	110256	50 %	0 %	50 %	0 %	116627057
1607	NC_008532	GTT	3	9	110310	110318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627057
1608	NC_008532	AGG	2	6	110396	110401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627057
1609	NC_008532	A	6	6	110433	110438	100 %	0 %	0 %	0 %	116627057
1610	NC_008532	ATTT	2	8	110523	110530	25 %	75 %	0 %	0 %	116627057
1611	NC_008532	ATTAT	2	10	110532	110541	40 %	60 %	0 %	0 %	116627057
1612	NC_008532	CAT	2	6	110542	110547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627057
1613	NC_008532	TTAG	2	8	110562	110569	25 %	50 %	25 %	0 %	116627057
1614	NC_008532	TAA	2	6	110603	110608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627057
1615	NC_008532	TGA	2	6	110612	110617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627057
1616	NC_008532	GGA	2	6	110640	110645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627057
1617	NC_008532	TTAC	2	8	110708	110715	25 %	50 %	0 %	25 %	116627057
1618	NC_008532	AT	4	8	110736	110743	50 %	50 %	0 %	0 %	116627057
1619	NC_008532	GTT	2	6	110748	110753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627057
1620	NC_008532	TA	3	6	110767	110772	50 %	50 %	0 %	0 %	116627057
1621	NC_008532	CTA	2	6	110843	110848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627058
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1623	NC_008532	ATG	2	6	111038	111043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627059
1624	NC_008532	TGA	2	6	111046	111051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627059
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1626	NC_008532	ATGA	2	8	111179	111186	50 %	25 %	25 %	0 %	116627059
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1987	NC_008532	CA	3	6	133420	133425	50 %	0 %	0 %	50 %	116627081
1988	NC_008532	GATT	2	8	133459	133466	25 %	50 %	25 %	0 %	116627081
1989	NC_008532	TTG	2	6	133578	133583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627081
1990	NC_008532	TGA	2	6	133609	133614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627081
1991	NC_008532	GTC	2	6	133631	133636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627081
1992	NC_008532	GCG	2	6	133682	133687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627081
1993	NC_008532	GCT	2	6	133693	133698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627081
1994	NC_008532	CAG	2	6	133719	133724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627081
1995	NC_008532	CAGTT	2	10	133836	133845	20 %	40 %	20 %	20 %	116627081
1996	NC_008532	CTC	2	6	133959	133964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627081
1997	NC_008532	TTTG	2	8	134008	134015	0 %	75 %	25 %	0 %	116627081
1998	NC_008532	AAGGT	2	10	134058	134067	40 %	20 %	40 %	0 %	116627081
1999	NC_008532	GAT	2	6	134156	134161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627081
2000	NC_008532	GAA	2	6	134195	134200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627081

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